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自行构建人类白细胞抗原DQA1位点基因分型寡核苷酸芯片性能评价:100例样本与PCR-SSP法的比较
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作者 王彤 王天骄 +1 位作者 彭莉 王杰 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2010年第44期8245-8248,共4页
背景:人类白细胞抗原等位基因分型对器官移植和法医鉴定等有重要意义。目前的分型方法难以实现高通量和集成化,准确性和重复性也不理想。目的:比较自行构建的寡核苷酸芯片与序列特异性引物-聚合酶链反应(polymerase chain reaction with... 背景:人类白细胞抗原等位基因分型对器官移植和法医鉴定等有重要意义。目前的分型方法难以实现高通量和集成化,准确性和重复性也不理想。目的:比较自行构建的寡核苷酸芯片与序列特异性引物-聚合酶链反应(polymerase chain reaction with sequence-specific primers,PCR-SSP)两种方法用于人类白细胞抗原DQA1基因分型的结果,以评价寡核苷酸芯片的性能。方法:纳入2006-01/2009-03于中国医科大学附属第一医院血液科门诊就诊的患者100例。分别用等位基因特异的PCR-SSP和自行构建的寡核苷酸芯片对患者的人类白细胞抗原DQA1进行分型。寡核苷酸芯片分型采用荧光标记的组间特异性引物扩增基因组DNA,扩增后的产物与分型芯片的探针杂交,由杂交产生的荧光信号确定人类白细胞抗原DQA1位点基因型。比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本经第三方测序验证。结果与结论:100例临床样本经寡核苷酸芯片和PCR-SSP分型全部成功。分型结果的吻合率为94%。不吻合样本6例,其中4例PCR-SSP定型为杂合子,芯片分型全部为纯合子。经第三方验证,证实芯片的分型全部正确。另外2例不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误1例,芯片分型错误1例。芯片的重复率为95%。说明自行构建的寡核苷酸芯片的特异性和灵敏度都能满足基因分型的需要,且稳定性较好。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原DQA1 寡核苷酸芯片 序列异性引物-聚合反应 基因分型 细胞移植
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一种新的特异性DNA放大技术—PCR
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作者 吴炯 朱德熙 《自然杂志》 1989年第3期174-176,240,共4页
多聚酶催化的链反应(PCR)是一种在体外将特异性DNA进行引物介导的酶促放大方法。该方法的建立是分子生物学研究中的一大突破。它有许多优点,并有广阔的应用前景。《一种新的特异性DNA放大技术——PCR》对此种方法的原理、操作和应用作... 多聚酶催化的链反应(PCR)是一种在体外将特异性DNA进行引物介导的酶促放大方法。该方法的建立是分子生物学研究中的一大突破。它有许多优点,并有广阔的应用前景。《一种新的特异性DNA放大技术——PCR》对此种方法的原理、操作和应用作了介绍,可供有兴趣的读者参考。 展开更多
关键词 DNA PCR 异性 放大技术 反应 多聚 序列 聚合 POLYMERASE 分子克隆技术
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沈阳汉族群体HLA Ⅰ类基因座PCR-序列特异性寡核苷酸探针分型研究 被引量:3
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作者 韩世新 尚英彬 +4 位作者 李久宏 耿龙 翟宁 曹凯 宋芳吉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期665-667,共3页
目的检测和分析沈阳汉族HLA-A、-B、-Cw位点等位基因的多态性。方法采用聚合酶链反应-寡核苷酸探针杂交分型方法对108名沈阳籍健康献血员进行HLA-A、-B、-Cw等位基因分型。结果检出等位基因HLA-A位点21个,B位点43个,Cw位点23个;所有位... 目的检测和分析沈阳汉族HLA-A、-B、-Cw位点等位基因的多态性。方法采用聚合酶链反应-寡核苷酸探针杂交分型方法对108名沈阳籍健康献血员进行HLA-A、-B、-Cw等位基因分型。结果检出等位基因HLA-A位点21个,B位点43个,Cw位点23个;所有位点的等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论从基因水平分析了HLAⅠ类基因的群体分布特征,提供了沈阳汉族群体HLAⅠ类基因座更准确的基因频率。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原-A -B -Cw 聚合反应-序列异性寡核苷酸探针 沈阳汉族
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一例白血病患者及家系HLA-B基因全长序列及18个点突变分析 被引量:2
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作者 钟艳平 邹红岩 +2 位作者 全湛柔 邓志辉 洪文旭 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2020年第1期77-82,共6页
背景:人类白细胞抗原HLA经过长期进化形成丰富的多态性,近几年由于受检人数增加及HLA分型技术快速发展,HLA新基因不断被发现。目的:采用下一代测序技术对1例白血病患者及家系HLA-B基因的全长序列及18个点突变进行分析。方法:应用序列特... 背景:人类白细胞抗原HLA经过长期进化形成丰富的多态性,近几年由于受检人数增加及HLA分型技术快速发展,HLA新基因不断被发现。目的:采用下一代测序技术对1例白血病患者及家系HLA-B基因的全长序列及18个点突变进行分析。方法:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-SSOP)及聚合酶链反应-直接测序法(PCR-SBT)发现患者的HLA-B结果异常。为了鉴定该基因,采用下一代测序技术对该基因全长进行测序,同时采集患者父亲、母亲及2位同胞姐妹的血样进行HLA基因的遗传学分析。结果与结论:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交及聚合酶链反应-直接测序法均提示该样本HLA-B无完全匹配的基因型。应用下一代测序技术分析发现,与同源性最高的等位基因B*15:09:01相比,该基因在外显子、内含子和3′UTR共存在18个碱基突变。5个外显子碱基突变位于第3,4外显子,分别为:第486位G→C、第583位T→C、第636位T→C、第652位A→G和第756位C→T,导致5个相应密码子发生改变,其中2个碱基替换为错义突变,第171位酪氨酸(Tyr)→组氨酸(His)、第194位异亮氨酸(Ile)→缬氨酸(Val)。家系调查显示患者HLA-B新基因来源于父亲。新基因序列已递交给Genbank数据库(MG595995)。应用下一代测序技术鉴定了1个HLA-B新等位基因,该基因于2017年12月被WHOHLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*15:435。 展开更多
关键词 白血病 人类白细胞抗原 新等位基因 下一代测序技术 家系调查 碱基突变 序列异性寡核苷酸探针杂交 聚合反应-直接测序法
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河北汉族HLA-A基因多态性及其分布特征 被引量:1
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作者 王振雷 何路军 +6 位作者 刘艳平 乔芳 张飒 赵倩 王远花 谢续 李茵 《河北医药》 CAS 2007年第9期907-909,共3页
目的了解河北省汉族人群人类白细胞抗原HLA-A等位基因多态性及分布特征。方法采用序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应(PCR-Sequence Specific Oligonucleotide Probing,PCR-SSOP)方法,对5908名河北汉族捐献造血干细胞健康志愿者的HLA-... 目的了解河北省汉族人群人类白细胞抗原HLA-A等位基因多态性及分布特征。方法采用序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应(PCR-Sequence Specific Oligonucleotide Probing,PCR-SSOP)方法,对5908名河北汉族捐献造血干细胞健康志愿者的HLA-A等位基因作低分辨基因分型检测,采用方根法计算HLA-A基因频率,并进行群体比较。结果河北汉族人群中共检出18个HLA-A基因,呈现较高的基因多态性,包括过去很少被检测到的HLA-A25,A74,其中A座位最常见基因依次为:A*02、A*11、A*24、A*01、A*30、A*03、A*33。结论河北汉族人群HLA-A基因分布有自己的特点,各等位基因频率介于南北汉族之间,但更接近于中国北方汉族人群,符合地域分布特征。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 河北汉族 基因频率 序列异性核苷酸探针-聚合反应技术
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云南汉族与链球菌感染有关的银屑病患者HLA-DR易感基因研究 被引量:2
6
作者 吴颖 吕昭萍 魏彩霞 《中国麻风皮肤病杂志》 2005年第10期760-763,共4页
目的:发现云南汉族与链球菌感染相关的银屑病患者易感基因,探讨银屑病与感染和遗传的关系。方法:用多聚酶链反应技术及序列特异性引物(PCR-SSP),对36例咽部致病性链球菌培养阳性银屑病患者进行HLA-DR基因分型,并与28例云南汉族正常人HLA... 目的:发现云南汉族与链球菌感染相关的银屑病患者易感基因,探讨银屑病与感染和遗传的关系。方法:用多聚酶链反应技术及序列特异性引物(PCR-SSP),对36例咽部致病性链球菌培养阳性银屑病患者进行HLA-DR基因分型,并与28例云南汉族正常人HLA-DR分型结果比较。结果:银屑病患者HLA-DR7基因频率比正常人显著增高,HLA-DR15基因频率也增高;20例HLA-DR15阳性患者有19例与HLA-DR7连锁,而正常组无DR7与DR15连锁。结论:云南汉族与链球菌感染有关银屑病患者易感基因与HLA-DR7及DR15关联,推测这两个位点的等位基因连锁以共同对链球菌感染相关银屑病易感性发挥作用。 展开更多
关键词 云南汉族 银屑病 球菌感染 HLA-DR HLA-DR分型 银屑病患者 易感基因 基因研究 多聚反应技术 序列异性引物
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PCR-SSP技术检测乳腺癌易感基因
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作者 周冬仙 徐红先 +1 位作者 熊文 邵超鹏 《中国肿瘤》 CAS 2005年第1期46-48,共3页
[目的]建立简易的PCR方法检测BRCA1及其等位基因。[方法]根据BRCA1基因(EMBL/GenBank/DDBJU14680)和在中国人乳腺癌患者中高频存在的BRCA1-2201T2430C2731T3232G3667G等位基因(AY304547)序列,设计二对特异性引物,分别针对正常BRCA1和上... [目的]建立简易的PCR方法检测BRCA1及其等位基因。[方法]根据BRCA1基因(EMBL/GenBank/DDBJU14680)和在中国人乳腺癌患者中高频存在的BRCA1-2201T2430C2731T3232G3667G等位基因(AY304547)序列,设计二对特异性引物,分别针对正常BRCA1和上述等位基因,同时引入一对内对照引物,建立简易的序列特异性引物-PCR技术(PCR-SSP),并用于检测30份已知BRCA1序列的乳腺癌患者DNA样本,以及67名未知的健康女性捐血者样本。[结果]30份已知的患者DNA样本的PCR-SSP检测结果与样本的序列完全相符。67名健康女性检测结果显示6名个体(9.0%)为等位基因纯合体,32人(47.8%)携带正常BRCA1,其余29名个体(43.3%)为杂合体。[结论]PCR-SSP方法能特异性检测BRCA1基因和BRCA1-2201T2430C2731T3232G3667G等位基因,可作为检测该等位基因以及判断个体在这一突变热点位点是否发生变异的简易手段。 展开更多
关键词 BRCA1 等位基因 序列异性引物-多聚反应
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应用PCR-SSOP技术进行大样本脐血HLA基因分型的探讨 被引量:1
8
作者 梁晓岚 杨丛林 +3 位作者 燕丽 谢云富 王晓静 邱录贵 《临床血液学杂志》 CAS 2003年第5期199-200,共2页
目的:探讨一种高效、快速、准确、省力并能批量检测HLA基因分型的方法。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)反向杂交技术对天津地区汉族健康新生儿脐血HLA-A、B、DR位点进行中低分辨基因分型。结果:共检出72种HLA... 目的:探讨一种高效、快速、准确、省力并能批量检测HLA基因分型的方法。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)反向杂交技术对天津地区汉族健康新生儿脐血HLA-A、B、DR位点进行中低分辨基因分型。结果:共检出72种HLA-Ⅰ、Ⅱ类特异性抗原,其中A位点抗原检出19种;B位点抗原检出40种;DR位点抗原检出13种。结论:PCR-SSOP是一种结果相对准确稳定、操作简便快速、适用于脐血库等进行大样本分型检测HLA多态性的分子生物学技术。 展开更多
关键词 HLA抗原 HLA基因分型 脐血 聚合反应-序列异性寡核苷酸探针
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新等位基因HLA-A^*0323的认定
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作者 王中梅 单小燕 +9 位作者 王丽君 何小枚 倪蕾 崔爽 王琳 李伟 刘娜 赵波涛 龚治尹 张志欣 《北京医学》 CAS 2008年第6期363-365,共3页
目的认定一个人类白细胞抗原(HLA)新等位基因。方法应用多聚酶链反应-序列特异性寡核苷酸技术(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide,PCR-SSO)基因分型发现可能的HLA新等位基因,用PCR直接测序及针对组特异性扩... 目的认定一个人类白细胞抗原(HLA)新等位基因。方法应用多聚酶链反应-序列特异性寡核苷酸技术(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide,PCR-SSO)基因分型发现可能的HLA新等位基因,用PCR直接测序及针对组特异性扩增产物测序,确认与最同源HLA等位基因序列的差异。结果发现一个样本的HLA-A位点结果异常,其核苷酸序列与已知所有HLA-A位点等位基因序列不一致,与同源性最高的等位基因A*030103差异是在第2外显子区域的256位碱基发生了C→G的替换,257位碱基发生了A→G的替换,270位碱基发生了T→A的替换,导致相应的62位密码子由CAG→GGG,编码的氨基酸由谷氨酰胺(Gln)→甘氨酸(Gly),导致相应的66位密码子由AAT→AAA,编码的氨基酸由天冬氨酸(Asn)→赖氨酸(Lys)。结论该等位基因为HLA-A位点的一个新等位基因,2006年7月13日被WHOHLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*0323。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 新等位基因 多聚酶链反应-序列特异性寡核苷酸技术 序列分析
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36380名河北汉族HLA供者基因多态性及其分布特征 被引量:17
10
作者 王振雷 何路军 +6 位作者 刘艳平 乔芳 张飒 赵倩 王远花 谢续 李茵 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2008年第3期169-171,共3页
目的了解河北省汉族人群人类白细胞抗原HLA-A、B、DRB1基因多态性及分布特征。方法采用序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应(PCR-Sequence Specific Oligonueleotide Probing,PCR-SSOP)方法,对36 380名河北汉族捐献造血干细胞健康志愿者... 目的了解河北省汉族人群人类白细胞抗原HLA-A、B、DRB1基因多态性及分布特征。方法采用序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应(PCR-Sequence Specific Oligonueleotide Probing,PCR-SSOP)方法,对36 380名河北汉族捐献造血干细胞健康志愿者的HLA-A、B、DRB1基因作低分辨基因分型检测,采用方根法计算HLA-AB、DRB1基因频率,并进行群体比较。结果河北汉族人群中共检出18个HLA-A基因43个HLA-B基因和14个HLA-DRB1基因,呈现较高的基因多态性,包括过去很少被检测到的HLA-A*25,A*74,B*42,B*53,B*73,DR*18。,其中A座位最常见基因依次为:A*02、A*11、A*24、A*30、A*01、A*03、A*33 B座位最常见基因依次为:B*13、B*1501(B62)、B*51、B*4002(B61)、B*4001(B60)、B35,B46DRB1座位最常见基因依次为DRB1*15、DRB1*07、DRB1*09、DRB1*12、DRB1*04、DRB1*11和DRB1*14,结论河北汉族人群HLA-A、B、DRB1基因分布有自己的特点,各基因频率介于南北汉族之间,但更接近于中国北方汉族人群,符合地域分布特征。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 河北汉族 基因频率 序列异性寡核苷酸探针聚合反应技术
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HLA-DR基因多态性与广东汉族泛发型白癜风患者的相关性研究 被引量:5
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作者 刘玉梅 黄振明 +3 位作者 何伟强 田歆 毕超 师晋平 《热带医学杂志》 CAS 2008年第11期1125-1127,共3页
目的研究广东籍汉族泛发型白癜风患者与HLA-DR的相关性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术,对30例广东籍汉族泛发型白癜风患者和30例健康对照者静脉血样本HLA-DR等位基因多态性进行研究。结果泛发型白癜风患者DRB1*070... 目的研究广东籍汉族泛发型白癜风患者与HLA-DR的相关性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术,对30例广东籍汉族泛发型白癜风患者和30例健康对照者静脉血样本HLA-DR等位基因多态性进行研究。结果泛发型白癜风患者DRB1*0701等位基因频率显著升高(RR=5.216,Pc<0.05),DRw52(DRB3*0101/02DRB3*0201DRB3*0301)、DRw53(DRB4*0101/03/05)和DRw51(DRB5*0101/02DRB5*0202)基因频率明显低于正常组,以上三者两组间比较均有显著性差异(Pc<0.05)。结论HLA-DRB1*0701等位基因可能与广东籍汉族泛发型白癜风的发病有关,而DRw52(DRB3*0101/02DRB3*0201DRB3*0301)、DRw53(DRB4*0101/03/05)和DRw51(DRB5*0101/02DRB5*0202)对泛发型白癜风发病可能有一定保护作用。 展开更多
关键词 泛发型白癜风 聚合反应-序列异性引物技术 HLA—DR
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人类白细胞抗原-DQB1与儿童十二指肠溃疡和幽门螺杆菌感染的相关性研究 被引量:6
12
作者 钟雪梅 许春娣 +3 位作者 奚容平 陈舜年 许玲娣 范丽安 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期692-694,共3页
目的探讨人类白细胞抗原(HLA)-DQB1等位基因与儿童十二指肠溃疡(DU)和幽门螺杆菌(H.pylori)感染的遗传关联性。方法采用非同位素标记的聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)杂交的方法,对上海地区汉族健康儿童80例、DU患儿58例... 目的探讨人类白细胞抗原(HLA)-DQB1等位基因与儿童十二指肠溃疡(DU)和幽门螺杆菌(H.pylori)感染的遗传关联性。方法采用非同位素标记的聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)杂交的方法,对上海地区汉族健康儿童80例、DU患儿58例的HLA-DQB1等位基因进行分型;并同时检测DU患儿H.pylori感染情况。结果在DU患儿中,HLA-DQB1×05031等位基因频率明显高于正常健康儿童(分别为:6.02%、0.63%,P<0.05,RR=9),而在H.pylori阳性和H.pylori阴性DU组之间差异无显著性。结论HLA-DQB1×05031与DU呈正相关,DU患儿与正常对照组儿童之间存在着遗传学的差异;虽然H.pylori感染是DU的重要致病因素,但HLA-DQB1×05031并不是通过H.pylori感染而影响DU的遗传易感性。 展开更多
关键词 十二指肠溃疡 人类白细胞抗原一DQBl等位基因 聚合反应-序列异性寡核苷酸探针杂交 幽门螺杆菌
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重症肌无力患者HLA-B易感基因研究 被引量:6
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作者 曲媛 谢琰臣 +6 位作者 王淑辉 赵媛 史慧静 王得新 孙亮 张华 李海峰 《中国神经免疫学和神经病学杂志》 CAS 2011年第6期415-419,共5页
目的探讨中国汉族重症肌无力(MG)患者及其不同亚型与人类白细胞抗原(HLA)-B等位基因的相关性。方法应用聚合酶链反应-序列特异性的寡核苷酸探针杂交法(PCR-SSOP)对91例中国汉族MG患者及171名健康对照者进行HLA-B等位基因分型,并采用病例... 目的探讨中国汉族重症肌无力(MG)患者及其不同亚型与人类白细胞抗原(HLA)-B等位基因的相关性。方法应用聚合酶链反应-序列特异性的寡核苷酸探针杂交法(PCR-SSOP)对91例中国汉族MG患者及171名健康对照者进行HLA-B等位基因分型,并采用病例-对照研究及显性遗传模式的方法系统分析HLA-B等位基因与MG患者不同临床亚型之间的相关性。结果按照性别、年龄、临床类型、抗乙酰胆碱受体(AChR)抗体及胸腺病变将患者组分为不同亚型后,结果显示HLA-B*46阳性率在男性、眼肌型、抗AChR抗体阴性及伴发胸腺瘤组中升高,HLA-B*08阳性率在早发型及全身型患者组中升高。与对照组比较,患者组HLA-B*35和B*38阳性率降低。结论 HLA-B*46基因可能是男性、眼肌型、抗AChR抗体阴性及伴发胸腺瘤的MG患者的易感基因或与易感基因相连锁;HLA-B*08可能是早发型及全身型MG患者的易感基因或与易感基因相连锁。HLA-B*35和B*38可能是MG的保护基因或与保护基因相连锁。 展开更多
关键词 重症肌无力 HLA—B抗原 聚合反应-序列异性寡核苷酸探针杂交法
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流式磁珠PCR-SSOP方法HLA基因分型可疑结果的确认分析 被引量:3
14
作者 康轶青 刘铮 +5 位作者 张丽 马茹 杜鹃 杨贺才 胡迎春 张伯伟 《中国输血杂志》 CAS 北大核心 2016年第7期756-758,共3页
目的对PCR-SSOP方法未明确HLA分型结果的可疑样本进一步分型,并分析原因。方法对采用PCRSSOP方法进行HLA分型出现的131例可疑样本采用LABScan3D分型方法进行检测。对于3D分型仍不能确定的样本采用PCR-SBT分型方法进行检测。结果 131例... 目的对PCR-SSOP方法未明确HLA分型结果的可疑样本进一步分型,并分析原因。方法对采用PCRSSOP方法进行HLA分型出现的131例可疑样本采用LABScan3D分型方法进行检测。对于3D分型仍不能确定的样本采用PCR-SBT分型方法进行检测。结果 131例可疑样本分析,其中87例LABScan3D分型方法可确定分型结果,余下的44例采用PCR-SBT获得分型结果,3种分型方法检测结果在低分水平上是完全一致的。结论 LABScan3D分型方法在PCR-SSOP的基础上进一步发展,可代替其进行大量样本的HLA分型,但是仍有引物探针的局限,不能代替SBT的地位。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 LABScan3D 多聚反应序列异性寡核苷酸探针杂交法 DNA直接测序法
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中国海南黎族群体HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因多态性研究 被引量:4
15
作者 洪坤学 褚嘉祐 +5 位作者 李冬娜 俞建昆 许绍斌 史磊 林克勤 陶玉芬 《国际遗传学杂志》 CAS 2006年第5期324-327,共4页
目的了解海南黎族群体HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因的遗传多态性。方法应用PCR- SSP方法对随机抽取的94名海南黎族无血缘关系的健康个体进行HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因分型。结果鉴定了海南黎族群体HLA-DRB1位点的16种等位基因,DQA1位点的1... 目的了解海南黎族群体HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因的遗传多态性。方法应用PCR- SSP方法对随机抽取的94名海南黎族无血缘关系的健康个体进行HLA-DRB1、DQA1、DQB1基因分型。结果鉴定了海南黎族群体HLA-DRB1位点的16种等位基因,DQA1位点的10种等位基因,DQB1位点的19种等位基因,包括了DR、DQ位点目前已知的全部血清学特异性,3个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.5)。结论提供了一套比较完整准确的海南黎族群体DRB1、DQA1、DQB1等位基因的基因频率和连锁不平衡参数。对群体遗传和疾病关联研究具有参考意义。 展开更多
关键词 多聚反应-序列异性引物 HLA 基因分型 遗传多态性
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湖南汉族人群HLA-DRB1位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性研究 被引量:2
16
作者 王志鹏 郭实士 余平 《实用预防医学》 CAS 2003年第2期129-131,共3页
目的 探讨湖南汉族人群HLA -DRB1位点基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间关系。 方法 用多聚酶链反应 -序列特异性寡核苷酸探针斑点杂交方法 ,对 93例湖南汉族鼻咽癌患者与 93例健康对照作HLA -DRB1位点基因分型 ,采用 χ2 检验比较... 目的 探讨湖南汉族人群HLA -DRB1位点基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间关系。 方法 用多聚酶链反应 -序列特异性寡核苷酸探针斑点杂交方法 ,对 93例湖南汉族鼻咽癌患者与 93例健康对照作HLA -DRB1位点基因分型 ,采用 χ2 检验比较两组各位点等位基因频率分布差异。 结果 鼻咽癌组DRB1 0 80 1较对照组高 (χ2 =4.2 2 ,P =0 .0 4 ,RR =1 .95) ,DRB1 1 1 0 1较对照组降低 (χ2 =5 .2 8,p =0 .0 2 ,RR =0 .33) ,但P值经Bonferoni校正后 ,差异无显著性(Pc >0 .0 5)。 结论 本研究结果未能证实HLA 展开更多
关键词 鼻咽癌 HLA-DRB1 等位基因多态性 多聚反应-序列异性寡核苷酸探针
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浙南地区汉族IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A多态性分布调查 被引量:2
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作者 王牡丹 许菲菲 +2 位作者 陈必成 章建娜 董芍芍 《浙江预防医学》 2008年第9期8-9,12,共3页
目的观察IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A多态性在中国浙南地区汉族人群分布特征。方法采用引物序列特异性-多聚酶链反应(SSP-PCR)方法,检测163名浙南地区正常人群IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A多态性分布特点,并与国外研究比较... 目的观察IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A多态性在中国浙南地区汉族人群分布特征。方法采用引物序列特异性-多聚酶链反应(SSP-PCR)方法,检测163名浙南地区正常人群IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A多态性分布特点,并与国外研究比较。结果浙南地区正常人群IL-10基因启动子区G-1082A、C-592A存在多态性,分别有GG、GA、AA和CC、CA、AA基因型;中国浙南地区人群IL-10基因启动子区G-1082A的G等位基因频率与韩国人相似(6.4%vs9%,P>0.05),较白种人显著降低(6.4%vs51.0%,P<0.05);C-592A的A等位基因频率与韩国人相似(67.5%vs62.0%,P>0.05),较白种人显著降低(67.5%vs79.0%,P<0.05)。结论IL-10基因启动子区域G-1082A、C-592A基因型的分布在不同种族间存在显著差异,这种差异可能与某些疾病在不同种族、地域间发病率和临床表现不同有关。 展开更多
关键词 IL-10基因启动子区域多态性 基因多态性 引物序列异性-多聚反应 地域 种族
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PCR-SSP检测HLA-B_(27)基因分型诊断强直性脊柱炎 被引量:1
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作者 董魁 吴俊柱 沈云青 《山东医药》 CAS 北大核心 2004年第25期61-61,共1页
关键词 HLA-B27 基因分型 诊断 PCR-SSP技术 强直性脊柱炎 序列异性引物 患者 寡核苷酸探针 聚合反应
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郑州地区献血者人群中HLA-A、B基因多态性与HBV相关性分析 被引量:1
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作者 康轶青 刘铮 张伯伟 《河南医学高等专科学校学报》 2020年第4期394-397,共4页
目的探讨郑州地区献血者人群中人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)A、B基因多态性与乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)的关联性。方法将郑州地区2遍酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HBV抗体为阳性的129名献血者作为乙肝组,健... 目的探讨郑州地区献血者人群中人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)A、B基因多态性与乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)的关联性。方法将郑州地区2遍酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HBV抗体为阳性的129名献血者作为乙肝组,健康对照组为3874名郑州地区造血干细胞志愿者,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SS0)技术分别对2组血样进行HLA-A、B位点的基因分型。经过统计分析2组间HLA-A、B基因型频率分布差异,进一步分析HLA-A、B基因型多态性与HBV间的相关性。结果A*11、A*29、A*31、B*56的频率在乙肝组中高于健康对照组,B*07在乙肝组中频率低于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在HBV感染机体时,A*11、A*29、A*31、B*56可能促使感染发生,为易感基因,而B*07则可能为保护基因,保护机体抵抗HBV感染。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 献血者 人类白细胞抗原 聚合反应-序列异性寡核苷酸探针
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Flow-rSSO与PCR-SSP方法在骨髓库HLA基因分型中的应用比较 被引量:2
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作者 金士正 程曦 +4 位作者 李桢 周丹 邹红岩 唐斯 王大明 《江西医学检验》 2006年第4期309-311,320,共4页
目的比较流式反向序列特异性寡核苷酸探针方法(Flow-rSSO)与聚合酶链式反应-序列特异性引物方法(PCR-SSP)在骨髓库人类白细胞抗原(HLA)分型中的应用价值。方法4769例中华骨髓库质控样本中,已采用PCR-SSP方法分型的3509例标本应用FLOW-r... 目的比较流式反向序列特异性寡核苷酸探针方法(Flow-rSSO)与聚合酶链式反应-序列特异性引物方法(PCR-SSP)在骨髓库人类白细胞抗原(HLA)分型中的应用价值。方法4769例中华骨髓库质控样本中,已采用PCR-SSP方法分型的3509例标本应用FLOW-rSSO方法复检,而1260例已采用FLOW-rSSO方法分型样本则应用PCR-SSP方法复检,结果不一致样本采用PCR-测序分型方法(SBT)进行确认。结果PCR-SSP方法HLA分型错误率(6.84‰)明显高于Flow-rSSO方法(1.59‰),其中PCR-SSP方法中75%的错误结果是由于漏检造成;PCR-SSP方法的模棱两可分型结果比例(2.56‰)明显低于Flow-rSSO方法(16.67‰)。结论PCR-SSP方法和FLOW-rSSO方法均适合应用于中华骨髓库供者的HLA分型,但HLA分型实验室有必要同时建立两种HLA分型方法。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 异性寡核苷酸探针 聚合反应-序列异性引物
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