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多肽色谱保留预测及其在蛋白质组学中的应用
被引量:
1
1
作者
陈可
李翠翠
李博
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期422-430,共9页
基于串联质谱的蛋白质组学分析方法往往依赖于实际谱图和理论谱图的匹配打分,而大量共洗脱肽的干扰会降低多肽和蛋白的鉴定及定量的准确性。多肽保留时间预测可将多肽色谱保留行为转变为稳定独立的特征时间属性,作为多肽鉴定的辅助和验...
基于串联质谱的蛋白质组学分析方法往往依赖于实际谱图和理论谱图的匹配打分,而大量共洗脱肽的干扰会降低多肽和蛋白的鉴定及定量的准确性。多肽保留时间预测可将多肽色谱保留行为转变为稳定独立的特征时间属性,作为多肽鉴定的辅助和验证指标,改善多肽鉴定的准确性。复杂体系中多肽色谱保留预测也对优化蛋白质组学测定条件、提高数据非依赖采集中质谱数据的检出率和重复性具有重要意义。本文针对未修饰多肽及修饰多肽常用的色谱保留预测方法(包括基于标准化索引、多肽分子模型、氨基酸残基参数和机器学习等)进行了综述,总结各种方法的原理及其特点,并对其在蛋白质组学中的应用及发展方向进行了展望。
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关键词
多肽保留时间预测
多肽
保留
时间
数据非依赖采集
蛋白质组学
下载PDF
职称材料
题名
多肽色谱保留预测及其在蛋白质组学中的应用
被引量:
1
1
作者
陈可
李翠翠
李博
机构
中国药科大学药物分析系
中国药科大学
中国药科大学(杭州)创新药物研究院
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期422-430,共9页
文摘
基于串联质谱的蛋白质组学分析方法往往依赖于实际谱图和理论谱图的匹配打分,而大量共洗脱肽的干扰会降低多肽和蛋白的鉴定及定量的准确性。多肽保留时间预测可将多肽色谱保留行为转变为稳定独立的特征时间属性,作为多肽鉴定的辅助和验证指标,改善多肽鉴定的准确性。复杂体系中多肽色谱保留预测也对优化蛋白质组学测定条件、提高数据非依赖采集中质谱数据的检出率和重复性具有重要意义。本文针对未修饰多肽及修饰多肽常用的色谱保留预测方法(包括基于标准化索引、多肽分子模型、氨基酸残基参数和机器学习等)进行了综述,总结各种方法的原理及其特点,并对其在蛋白质组学中的应用及发展方向进行了展望。
关键词
多肽保留时间预测
多肽
保留
时间
数据非依赖采集
蛋白质组学
Keywords
peptide retention time prediction algorithm
peptide retention time
data independent acquisition
proteomics
分类号
R917 [医药卫生—药物分析学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多肽色谱保留预测及其在蛋白质组学中的应用
陈可
李翠翠
李博
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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