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多肽抑制剂抑制淀粉质多肽42构象转换的分子动力学模拟和结合自由能计算 被引量:10
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作者 董晓燕 都文婕 刘夫锋 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2735-2744,共10页
应用分子动力学模拟和结合自由能计算方法研究了多肽抑制剂KLVFF、VVIA和LPFFD抑制淀粉质多肽42(Aβ42)构象转换的分子机理.结果表明,三种多肽抑制剂均能够有效抑制Aβ42的二级结构由α-螺旋向β-折叠的构象转换.另外,多肽抑制剂降低了A... 应用分子动力学模拟和结合自由能计算方法研究了多肽抑制剂KLVFF、VVIA和LPFFD抑制淀粉质多肽42(Aβ42)构象转换的分子机理.结果表明,三种多肽抑制剂均能够有效抑制Aβ42的二级结构由α-螺旋向β-折叠的构象转换.另外,多肽抑制剂降低了Aβ42分子内的疏水相互作用,减少了多肽分子内远距离的接触,有效抑制了Aβ42的疏水塌缩,从而起到稳定其初始构象的作用.这些抑制剂与Aβ42之间的疏水和静电相互作用(包括氢键)均有利于它们抑制Aβ42的构象转换.此外,抑制剂中的带电氨基酸残基可以增强其和Aβ42之间的静电相互作用(包括氢键),并降低抑制剂之间的聚集,从而大大增强对Aβ42构象转换的抑制能力.但脯氨酸的引入会破坏多肽的线性结构,从而大大降低其与Aβ42之间的作用力.上述分子模拟的结果揭示了多肽抑制剂KLVFF、VVIA和LPFFD抑制Aβ42构象转换的分子机理,对于进一步合理设计Aβ的高效短肽抑制剂具有非常重要的理论指导意义. 展开更多
关键词 分子动力学模拟 阿尔茨海默病 淀粉质多肽 多肽抑制剂 构象转换
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HIV蛋白酶多肽抑制剂的理论研究 被引量:4
2
作者 高慧 高维娜 +5 位作者 李云 徐为人 李娜 蒋志勤 杜奇石 魏冬青 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期6-10,共5页
艾滋病病毒的发现距今已有二十多年的历史了.它仍然以很快的速度在全球范围速蔓延.研发抗艾滋病药物是当代药学的重大课题之一.在以往研究的基础上,我们利用分子叠合和分子对接这两种分子模拟手段,把从PDB数据库中得到的与HIV蛋白酶结合... 艾滋病病毒的发现距今已有二十多年的历史了.它仍然以很快的速度在全球范围速蔓延.研发抗艾滋病药物是当代药学的重大课题之一.在以往研究的基础上,我们利用分子叠合和分子对接这两种分子模拟手段,把从PDB数据库中得到的与HIV蛋白酶结合的12个肽类分子和已经上市的抗艾滋病的药物Saquinavir做比较.根据结构相同或相近的分子具有相同的活性原理,运用分子叠合初部判断分子活性,特别是药效团的特征比对揭示了分子活性的原因,为进一步的药物设计奠定了良好的基础.进而采用分子对接的分子模拟方法对这12个肽类分子的活性构象进行了深入的分析,预测出了这12个分子对HIV病毒蛋白酶的不同抑制作用.研究发现:P01、P05、P09、P12可能与已知药物Saquinavir在与HIV蛋白酶结合时具有相似的活性,其中P9的活性最强,有望成为抗HIV药物的理想前体,为下一步的HIV药物的设计研究提供了理论依据. 展开更多
关键词 HIV 蛋白酶 多肽抑制剂 分子模拟
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APC/Asef多肽抑制剂结构的优化及生物学活性研究 被引量:1
3
作者 钱金星 张健 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1139-1144,共6页
目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)/鸟苷酸交换因子(APC-stimulated guanine nucleotide exchange factor,Asef)多肽抑制剂,探讨该抑制剂不同构效之间的关系。方法·基于APC-MAI-150复合... 目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)/鸟苷酸交换因子(APC-stimulated guanine nucleotide exchange factor,Asef)多肽抑制剂,探讨该抑制剂不同构效之间的关系。方法·基于APC-MAI-150复合物结构,一方面在MAI-150多肽N端用3-苯基丙酰(3-phenylpropane)、Glu-Glu(GG)和β-Ala-Ala(β-AA)取代连氨基基团苄氧羰基(carbobenzoxy,CBZ),另一方面尝试将MAI-150中N端第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基替换为-CN、-NO_2、-NH_2和-F,设计合成新的7条多肽。荧光偏振活性检测多肽亲和力,并根据活性结果将多肽MDL-3、MDL-4和MDL-5对接到APC蛋白中,联合计算机对接的多肽和APC蛋白的结合模式,探讨该3条多肽的构效关系。结果·新合成的7条多肽中,多肽MDL-5的N端3-phenylpropane连氨基亲和力最高,其半数有效抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)为2.35μmol/L;与MDL-5相比,多肽N端用GG(MDL-6)和β-AA(MDL-7)连接氨基亲和力明显降低;MDL-3和MDL-4的N端第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基替换为-NH_2和-F亲和力相比较于替换为-CN(MDL-1)和-NO_2 (MDL-2)要明显提高;但新合成的多肽亲和力均低于MAI-150。结论·改造多肽N端连氨基基团和第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基无助于提高多肽的亲和力。 展开更多
关键词 结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子 多肽抑制剂 构效关系
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APC/Asef多肽抑制剂的设计、合成及构效关系研究
4
作者 阮聪 钟杰 +1 位作者 杨秀岩 张健 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期692-697,共6页
目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子(APC/Asef)多肽抑制剂,探讨构效关系,为后续的抑制剂改造提供基础。方法·基于已有的多肽抑制剂MAI-400,在此基础上重新设计合成11条多肽,包括对N端封端、第1位丙氨酸、第... 目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子(APC/Asef)多肽抑制剂,探讨构效关系,为后续的抑制剂改造提供基础。方法·基于已有的多肽抑制剂MAI-400,在此基础上重新设计合成11条多肽,包括对N端封端、第1位丙氨酸、第5位亮氨酸以及第7位谷氨酸的改造。通过荧光偏振活性检测体系测定新合成多肽的活性,联合该结果与分子对接结果对其进行构效关系研究。结果·新设计的11条多肽中,MPI-11亲和力最高,其半数抑制浓度(IC50)为0.9731mmol/L。多肽N端封端维持苄氧羰基最为合适;丙氨酸替换为色氨酸、组氨酸以及苏氨酸都会显著降低活性,替换为酪氨酸或者苯丙氨酸对活性的影响较小,5位氨基酸引入苯环也对活性的影响不大,C端的谷氨酸将侧链羧基替换成酰胺对活性影响不大。结论·N端封端不宜改为小基团,1位丙氨酸不能轻易改变。 展开更多
关键词 结肠腺瘤息肉易感基因 鸟苷酸交换因子 多肽抑制剂 优化 构效关系
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靶向HIV-1跨膜蛋白gp41的多肽类融合抑制剂的研究进展
5
作者 刘川铭 曾点点 +2 位作者 李谢 卢熙奎 陈洁 《抗感染药学》 2023年第7期677-681,728,共6页
跨膜蛋白gp41是治疗获得性免疫缺陷综合征的重要靶点。恩夫韦肽是首个被FDA批准的以gp41为靶点的多肽类融合抑制剂。然后,恩夫韦肽较短的半衰期、较低的耐药遗传屏障和较低的效力限制了它的临床应用。近年来,以gp41为作用靶点开发出来... 跨膜蛋白gp41是治疗获得性免疫缺陷综合征的重要靶点。恩夫韦肽是首个被FDA批准的以gp41为靶点的多肽类融合抑制剂。然后,恩夫韦肽较短的半衰期、较低的耐药遗传屏障和较低的效力限制了它的临床应用。近年来,以gp41为作用靶点开发出来的多肽类融合抑制剂表现出了较好的效力和稳定性。为此,笔者主要对靶向跨膜蛋白gp41的多肽类融合抑制剂的研究状况进行了综述。 展开更多
关键词 HIV-1 GP41 多肽类融合抑制
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多肽抑制剂阻断乙脑和寨卡病毒感染
6
《科学中国人》 2017年第6期11-11,共1页
中科院武汉病毒所王薇等证实多肽P5在体内和体外均能有效抑制JEV和ZIKV感染,有效浓度达到纳摩尔级别。基于其明确的作用靶点,高效的病毒抑制率以及多肽抑制剂良好的生物相容性,该研究提供了一个新型高效的临床治疗JEV和ZIKV感染的先... 中科院武汉病毒所王薇等证实多肽P5在体内和体外均能有效抑制JEV和ZIKV感染,有效浓度达到纳摩尔级别。基于其明确的作用靶点,高效的病毒抑制率以及多肽抑制剂良好的生物相容性,该研究提供了一个新型高效的临床治疗JEV和ZIKV感染的先导药物,相关论文发表于《抗病毒研究》。乙脑病毒(Japaneseencephalitisvirus.JEV)和寨卡病毒(zikavirus,zIKV)属于黄病毒科黄病毒属.是通过蚊虫进行传播的虫媒病毒。 展开更多
关键词 多肽抑制剂 病毒感染 乙脑病毒 生物相容性 有效浓度 临床治疗 论文发表 虫媒病毒
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Caspase抑制剂研究进展 被引量:9
7
作者 方强 宋波 《国外医学(生理病理科学与临床分册)》 2001年第6期459-461,共3页
细胞凋亡与许多疾病密切相关。半胱氨酸酶 Caspase家族是细胞凋亡过程中的关键分子 ,Caspase抑制剂能够有效地抑制Caspase的活性 ,阻止细胞凋亡。来源于病毒的CrmA ,p35以及内源性的IAP分子能够抑制多种Caspase的活性 ,但缺乏特异性 ;... 细胞凋亡与许多疾病密切相关。半胱氨酸酶 Caspase家族是细胞凋亡过程中的关键分子 ,Caspase抑制剂能够有效地抑制Caspase的活性 ,阻止细胞凋亡。来源于病毒的CrmA ,p35以及内源性的IAP分子能够抑制多种Caspase的活性 ,但缺乏特异性 ;而人工合成的针对不同Caspase底物结合区的多肽抑制剂则可特异地抑制相应的Caspase。这些新抑制剂的发现及研制将对攻克凋亡相关疾病起重要作用。 展开更多
关键词 细胞凋亡 CASPASE 多肽抑制剂 CrmA IAP
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双功能抑制剂SK10对Cu2+存在下Aβ聚集的抑制和解聚作用
8
作者 董晓燕 董旭婷 孟杰 《天津大学学报(自然科学与工程技术版)》 EI CSCD 北大核心 2019年第10期999-1007,共9页
由于β-淀粉样蛋白(amyloidβ-protein,Aβ)的聚集是阿尔茨海默症(Alzheimer’sdisease,AD)发病机制中的关键过程,而金属离子Cu2+存在下的Aβ的聚集速率加快,且Cu2+本身会促进活性氧(ROS)的产生,增加神经毒性,因此开发既能螯合Cu2+又能... 由于β-淀粉样蛋白(amyloidβ-protein,Aβ)的聚集是阿尔茨海默症(Alzheimer’sdisease,AD)发病机制中的关键过程,而金属离子Cu2+存在下的Aβ的聚集速率加快,且Cu2+本身会促进活性氧(ROS)的产生,增加神经毒性,因此开发既能螯合Cu2+又能抑制Aβ聚集的双功能抑制剂非常重要.本文将金属螯合三肽(SSH)和Aβ聚集七肽抑制剂Ac-LVFFARK-NH2(LK7)相组合,设计合成了新的双功能Aβ聚集十肽抑制剂SSHLVFFARK-NH2(SK10).通过硫代黄素T(ThT)荧光实验、聚集动力学实验、原子力显微镜检测(AFM)、等温滴定量热和MTT细胞毒性测定等研究了SK10对Cu2+存在下Aβ聚集的抑制和解聚作用以及细胞毒性的抑制作用.实验结果表明:SK10不仅可以抑制Cu2+存在下的Aβ40聚集(ThT荧光强度降低了60%),随着SK10浓度的提高使Aβ40纤维逐渐减少,还能降低Cu2+存在下Aβ40聚集产生的细胞毒性,使细胞活性恢复至90%以上;同样,SK10对Cu2+存在下的Aβ42聚集也有抑制作用.由于SK10对Cu2+具有较强的特异性亲和力(Kd=0.03μmol/L),能够螯合Cu2+-Aβ40复合物中的Cu2+,因此能抑制由Cu2+催化产生的活性氧(ROS)对细胞的毒性.进一步研究表明SK10还可解聚形成的Cu2+-Aβ40聚集体,使已形成的Cu2+-Aβ40聚集体消失,缓解其产生的细胞毒性,使细胞活性提高到90%.以上研究结果不但体现了SK10的药用潜力,也为今后设计和开发金属螯合Aβ聚集双功能抑制剂提供了思路. 展开更多
关键词 阿尔茨海默症 β-淀粉样蛋白 Cu2+螯合 金属螯合多肽抑制剂
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SAE1与SAE2蛋白相互作用肽抑制剂的多种体外筛选体系的构建与评价
9
作者 胡晨阳 陆绍永 杨秀岩 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS 2024年第5期567-575,共9页
目的·构建用于发现小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-like modifier,SUMO)的活化酶亚基1(SUMO-activating enzyme subunit 1,SAE1)与亚基2(SUMO-activating enzyme subunit 2,SAE2)相互作用的肽抑制剂的多种体外筛选体系,并对不... 目的·构建用于发现小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-like modifier,SUMO)的活化酶亚基1(SUMO-activating enzyme subunit 1,SAE1)与亚基2(SUMO-activating enzyme subunit 2,SAE2)相互作用的肽抑制剂的多种体外筛选体系,并对不同筛选体系的优势与不足进行评价。方法·将编码SAE1和SAE2的目的基因分别插入pET-28a载体以构造原核蛋白表达质粒,在大肠埃希菌中表达并纯化人源SAE1和SAE2蛋白;利用纯化的蛋白先后构建等温滴定量热检测(isothermal titration calorimetry,ITC)实验、荧光偏振(fluorescence polarization,FP)实验、表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)实验和基于SAE酶活的荧光实验等多种筛选体系。尝试利用不同的筛选体系检测候选多肽的抑制活性,基于检测结果,从灵敏度、稳定性、检测通量和检测成本等维度评价各筛选体系的优缺点与适用性。结果·经ITC测得SAE1和SAE2蛋白在体外相互作用的解离常数(K_(d))为0.96μmol/L,并将活性最好的多肽PEPT7改造为FP实验的示踪剂(tracer),但同SAE2的亲和力无法满足FP的要求;SPR测得SAE1和SAE2相互作用的K_(d)值为1.13μmol/L,与ITC数据接近;基于SAE酶活的荧光实验筛选得到抑制活性最强的多肽HP1B[半数抑制浓度(half-maximalinhibitoryconcentration,IC_(50))达15.72μmol/L],SPR进一步确定其同SAE1的亲和力为34.4μmol/L。结论·尝试构建并比较了多种常见的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)抑制剂的筛选体系。其中,ITC的检测通量低,且难以准确评估结合热不显著的低亲和力多肽;FP体系的可行性高度依赖于示踪剂同靶点蛋白之间的强亲和力,同样无法用于低亲和力多肽的筛选与优化;SPR检测的灵敏度高,但检测成本较高;酶活实验兼具高灵敏度、稳健性、高通量和可接受的检测成本,是最适宜的筛选方法。 展开更多
关键词 SUMO活化酶亚基1 SUMO活化酶亚基2 多肽抑制剂 药物筛选 等温滴定量热检测实验 荧光偏振实验 表面等离子共振实验 基于酶活的荧光实验
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高效抗HIV-1膜融合多肽C22的光谱学研究
10
作者 史钧 何娇娟 +2 位作者 汪世龙 孙晓宇 陈庆榆 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1862-1865,共4页
艾滋病已给人类社会和经济带来了巨大影响。文章以HIV-1膜融合糖蛋白gp41的C端序列为参照,设计合成了C22多肽的基因序列,经PCR放大以后,通过pTMHa30-51质粒转导进E.coli BL21(DE3)中进行表达,纯化后得到了C22多肽,表达产物经SDS-PAGE电... 艾滋病已给人类社会和经济带来了巨大影响。文章以HIV-1膜融合糖蛋白gp41的C端序列为参照,设计合成了C22多肽的基因序列,经PCR放大以后,通过pTMHa30-51质粒转导进E.coli BL21(DE3)中进行表达,纯化后得到了C22多肽,表达产物经SDS-PAGE电泳分析和质谱验证。结果表明:C22多肽具有很好热稳定性,良好的HIV-1入侵细胞抑制活性和水溶性,在实验浓度下对细胞无毒性。通过圆二色谱技术对C22的二级结构进行了检测,C22溶液在37℃条件下,α螺旋比例增加,而在80℃条件下,α螺旋比例则呈下降趋势。在不同pH值条件下,C22峰值变化较大,在向酸碱两性方向变化时,C22的α螺旋结构比例均相对有所减少,无规则卷曲增加,结构趋向松散。这也表明,在pH 6条件下,C22可以保持相对稳定的结构。该研究为此类多肽的光谱学性质研究和设计新的HIV-1治疗药物提供了理论基础。 展开更多
关键词 HIV-1 GP41 多肽抑制剂 圆二色谱
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多肽在流感病毒研究中的应用 被引量:1
11
作者 马春喜 宋可可 +1 位作者 胡娇 刘秀梵 《中国家禽》 北大核心 2018年第24期39-44,共6页
多肽在自然界中广泛存在,是α-氨基酸以肽链连接在一起而形成的化合物。自合成多肽技术发展以来,多肽被成功应用于各种领域,如肽疫苗、多肽抑制剂、多肽诊断试剂、多肽药物等。本文首先主要综述了多肽在流感病毒研究中的应用,包括(1)基... 多肽在自然界中广泛存在,是α-氨基酸以肽链连接在一起而形成的化合物。自合成多肽技术发展以来,多肽被成功应用于各种领域,如肽疫苗、多肽抑制剂、多肽诊断试剂、多肽药物等。本文首先主要综述了多肽在流感病毒研究中的应用,包括(1)基于流感病毒HA和M2e蛋白的多肽疫苗;(2)基于噬菌体展示库技术筛选流感病毒HA、NA多肽抑制剂以及多肽抗流感病毒的作用机制研究;(3)基于流感病毒M2和HA蛋白的多肽诊断试剂;其次,简单介绍了多肽在其他领域中的应用。最后,展望了多肽未来的应用前景及未来多肽应用中仍需要解决的问题。 展开更多
关键词 多肽 流感病毒 疫苗 多肽抑制剂 多肽诊断试
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蛋白质错误折叠相关疾病的多肽药物研究进展 被引量:1
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作者 吴思 张红 柯莎 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第1期159-170,共12页
蛋白质和多肽发生错误折叠形成不可溶的淀粉样纤维的过程,与阿尔茨海默病、帕金森病等多种神经退行性疾病密切相关。这些疾病可导致认知能力下降以及运动缺陷等症状。虽然已有多种相关治疗方案处于临床试验中,但目前仍无明确有效的方法... 蛋白质和多肽发生错误折叠形成不可溶的淀粉样纤维的过程,与阿尔茨海默病、帕金森病等多种神经退行性疾病密切相关。这些疾病可导致认知能力下降以及运动缺陷等症状。虽然已有多种相关治疗方案处于临床试验中,但目前仍无明确有效的方法可治愈或长期减缓疾病的进展。探寻和研究抑制淀粉样聚集、识别并促进毒性聚集物清除的抑制剂分子是药物研发的重要策略之一。在不同类型的抑制剂中,多肽类抑制剂因具有高特异性、低毒性、多样性,以及修饰后的抗水解稳定性和血脑屏障通透性,有望成为候选药物分子。本文总结了针对阿尔茨海默病相关的Aβ和Tau蛋白以及帕金森病相关的α-synuclein蛋白淀粉样纤维化的多肽抑制剂研究进展。基于淀粉样纤维化核心序列及纤维核心结构进行合理设计,或通过随机筛选,均可获得多肽抑制剂。这些天然和非天然的多肽分子大多具有抑制淀粉样纤维化、解聚成熟纤维和降低细胞毒性的作用,其中一些多肽在退行性疾病动物模型实验中,显示出降低脑损伤和缓解认知及运动障碍的效果。这些研究揭示了多肽作为蛋白质错误折叠和聚集相关疾病药物的特点,为研发一类新的有效药物奠定了基础。 展开更多
关键词 多肽抑制剂 淀粉样纤维 神经退行性疾病 蛋白质错误折叠
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非标记型检测基质金属蛋白酶-14电化学发光生物传感器的研究
13
作者 段宇宏 徐璐 马芬 《聊城大学学报(自然科学版)》 2023年第1期66-72,84,共8页
基质金属蛋白酶-14(Matrix metalloproteinase-14,MMP-14)是癌症和炎症的重要生物标志物。以聚多巴胺功能化的钴钼碳纳米纤维修饰的玻碳电极作为传感平台,以钌复合物和多肽抑制剂分别作为信号探针和捕获探针,制备了电化学发光(ECL)生物... 基质金属蛋白酶-14(Matrix metalloproteinase-14,MMP-14)是癌症和炎症的重要生物标志物。以聚多巴胺功能化的钴钼碳纳米纤维修饰的玻碳电极作为传感平台,以钌复合物和多肽抑制剂分别作为信号探针和捕获探针,制备了电化学发光(ECL)生物传感器用于检测MMP-14。结果表明,在最佳实验条件下,该电化学发光生物传感器具有较高的灵敏度,其线性范围为1~10 pg·mL^(-1),检测限为0.55 pg·mL^(-1)。利用功能化纳米纤维制备的无标记ECL生物传感器为研究MMPs和抑制剂的作用机制提供了前景。 展开更多
关键词 电化学发光生物传感器 基质金属蛋白酶-14 多肽抑制剂
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多肽类HIV-1融合抑制剂早期临床研究策略考虑要点
14
作者 杨琬秋 赵建中 杨劲 《中国艾滋病性病》 CAS 北大核心 2016年第12期1015-1018,1021,共5页
艾滋病病毒1型(HIV-1)融合抑制剂是继反转录酶和蛋白酶抑制剂后的新一类抗HIV感染药物。恩夫韦肽(T20)是目前唯一一个经美国食品药品管理局(FDA)批准上市的HIV-1融合抑制剂。通过综述T20早期临床试验,获取其临床开发策略,并结合国外指... 艾滋病病毒1型(HIV-1)融合抑制剂是继反转录酶和蛋白酶抑制剂后的新一类抗HIV感染药物。恩夫韦肽(T20)是目前唯一一个经美国食品药品管理局(FDA)批准上市的HIV-1融合抑制剂。通过综述T20早期临床试验,获取其临床开发策略,并结合国外指导原则,对多肽类HIV-1融合抑制剂早期临床开发过程中需要关注的问题进行探讨。包括药物临床定位、效应指标的选择、给药方案的选择、相互作用的考察、建模与仿真的应用、早期临床研究设计方法等。期望对中国从事多肽类HIV-1融合抑制剂研发人员有所帮助。 展开更多
关键词 多肽类人类免疫缺陷病毒Ⅰ型融合抑制 恩夫韦 早期临床研究策略
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Screening Peptide Inhibitors Using Phage Peptide Library with Isocitrate Lyase in Mycobacterium tuberculosis as Target 被引量:1
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作者 YIN Yu-he NIU Xue +3 位作者 SUN BO TENG Guo-sheng ZHAO Yun-hui WU Cong-mei 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2011年第4期635-640,共6页
When devoured by macrophages,Mycobacterium tuberculosis remains persistent in macrophages and gains energy through the glyoxylate bypass to maintain its long-term existence in host cells.Therefore it is possible to st... When devoured by macrophages,Mycobacterium tuberculosis remains persistent in macrophages and gains energy through the glyoxylate bypass to maintain its long-term existence in host cells.Therefore it is possible to stop persistent infections by interdicting the glyoxylate bypass in which the isocitrate lyase(ICL) is the key rate-limiting enzyme and a persistence factor.ICL is the target of anti-TB(TB:tubercular) drugs,which could screen ICL out and effectively inhibit the activity of ICL in Mycobacterium tuberculosis,and because of this,anti-TB drugs can be used to kill persistent Mycobacterium tuberculosis.In this study,the ICL gene of the Mycobacterium tuberculosis H37Rv was cloned successfully and recombinant protein with bioactivity was obtained through the enzyme characteristic appraisal.The specific activity of the recombined ICL is 24μmol·mg-1·min-1.The recombined ICL protein was used as the target,and phages which can specifically combine to ICL were screened in the phage 7 peptide library.According to the results of the ELISA and DNA sequence detection,eventually three 7-peptide chains were synthesized.Then the peptide chains were reacted with ICL,respectively,to detect their inhibitory effects on ICL.The results show that all the three 7-peptide chains possessed varying inhibitory effects on the activity of ICL.This study provided lead compounds for the research and development of new peptide anti-TB drugs. 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 异柠檬酸裂解酶 噬菌体 多肽抑制剂 筛选 合酶 抗结核病药物 重组蛋白
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First Anti-SARS Polypeptide Inhibitor Developed
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《Bulletin of the Chinese Academy of Sciences》 2003年第2期87-87,共1页
关键词 非典型肺炎 SARS病毒 抗非典多肽抑制剂 药理作用
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靶向阻断蛋白-蛋白相互作用的抗肿瘤药研发
17
作者 陈曦 蒋南 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期182-190,共9页
蛋白-蛋白相互作用(PPI)以及通过相互作用而形成的蛋白复合物是细胞完成各项基本功能的重要基础。大多数重要的生命活动,如DNA的复制与转录、蛋白质的合成与转运、细胞信号转导与物质代谢调节等,都是通过密集的PPI网络维持的。基因突变... 蛋白-蛋白相互作用(PPI)以及通过相互作用而形成的蛋白复合物是细胞完成各项基本功能的重要基础。大多数重要的生命活动,如DNA的复制与转录、蛋白质的合成与转运、细胞信号转导与物质代谢调节等,都是通过密集的PPI网络维持的。基因突变、表观遗传学改变、细胞微环境变化能够干扰PPI模式或者直接诱导蛋白结合,形成新的、肿瘤特有的相互作用,导致肿瘤的发生、发展、侵袭以及转移。近年来,以PPI为靶点进行的抗肿瘤药研发取得了显著进展,有些药物正处于临床试验阶段或已获得批准上市。越来越多的证据表明,靶向特异性PPI的药物可能比抑制原癌基因蛋白活性的药物具有更高的特异性和疗效,为治愈特定肿瘤提供了治疗机遇。该综述系统总结了靶向PPI的抗肿瘤药研究进展,阐述其研发所面临的挑战及对策,以期为靶向PPI的抗肿瘤药研发提供参考。 展开更多
关键词 蛋白-蛋白相互作用 抗肿瘤药 小分子抑制 多肽抑制剂 靶向
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Atomistic characterization of binding modes and affinity of peptide inhibitors to amyloid-β protein 被引量:4
18
作者 Fufeng LIU Wenjie DU +2 位作者 Yan SUN Jie ZHENG Xiaoyan DONG 《Frontiers of Chemical Science and Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2014年第4期433-444,共12页
淀粉的蛋白质(A) 的聚集紧被连接到 Alzheimers 疾病的致病。以前的研究发现了那三个肽禁止者(即, KLVFF, VVIA,和 LPFFD ) 能禁止聚集并且减轻导致 A 的 neurotoxicity。然而,有约束力的模式的原子详情和与这些肽禁止者和 A 的有... 淀粉的蛋白质(A) 的聚集紧被连接到 Alzheimers 疾病的致病。以前的研究发现了那三个肽禁止者(即, KLVFF, VVIA,和 LPFFD ) 能禁止聚集并且减轻导致 A 的 neurotoxicity。然而,有约束力的模式的原子详情和与这些肽禁止者和 A 的有约束力的亲密关系没被披露。这里,使用分子的动力学模拟和分子的力学泊松 Boltzmann 表面区域(MM/PBSA ) 分析,我们在他们和 A 和他们的抑制的分子的基础的顺序特定的相互作用上检验了三个肽禁止者(KLVFF, VVIA,和 LPFFD ) 的效果。所有禁止者展出改变的有约束力的亲密关系到 A, KLVFF 在有最高有约束力的亲密关系,而 LPFFD 有最少。MM/PBSA 分析进一步表明不同的肽禁止者有和 A 的相互作用的不同模式,因而热点绑定残余,和内在的驱动力。在禁止者和 A 之间的特定的基于残余的相互作用为说明不同绑定和抑制机制坚定、比较。这个工作提供基于结构的有约束力的信息让这三个肽禁止者的进一步的修正和优化对聚集提高他们的有约束力、禁止的能力。 展开更多
关键词 多肽抑制剂 淀粉样蛋白 结合亲和力 原子特性 合模 蛋白质 阿尔茨海默氏症 分子动力学模拟
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