基于多重实时荧光PCR技术快速检测海产品异尖线虫

【目的】构建简单异尖线虫(Anisakis simplex)、费氏宫脂线虫(Hysterothylacium fabri)、内弯宫脂线虫(Hysterothylacium aduncum)、拟地新线虫(Pseudoterranova decipiens)、典型异尖线虫(Anisakis typica)、带鱼针蛔线虫(Raphidascaris trichiuri)、厦门宫脂线虫(Hysterothylacium amoyense)和中华宫脂线虫(Hysterothylacium sinense)的快速检测方法,实现对以上8种异尖线虫的高通量检测及准确分型。【方法】采集8种异尖线虫核酸进行凝胶电泳,测序并进行序列对比,设计引物和TaqMan荧光探针;通过优化体系及退火温度,建立多重实时荧光PCR检测体系,并添加海产品核酸背景验证其特异性和灵敏度。【结果】建立了基于多重实时荧光PCR技术针对海产品中异尖线虫的快速检测鉴定方法,可在一个反应体系里同时检测鉴定4种异尖线虫,双通道反应体系可一次性检测鉴定8种异尖线虫。体系中,引物和探针的终浓度分别为0.60、0.20μmol/L,DNA灵敏度为103拷贝/mL;对带鱼(Trichiurus lepturus)、鳕鱼(Gadus)、舟山宫脂线虫(Hysterothylacium zhoushanensis)、棘颚口线虫(Gnathostoma spinigerum)均无荧光信号;针对等量混合的4种异尖线虫模拟样本均可检出,检出限为1.0%。【结论】建立的海产品异尖线虫多重实时荧光PCR快速检测方法操作简便、灵敏度高、特异性强、重复性好,可应用于日常食品检验和异尖线虫分型鉴别研究。

蜂蜜中转基因成分启动子和终止子的多重实时荧光PCR法检测

为能高效率定位蜂蜜中的转基因可疑阳性样品,以10种转基因启动子和终止子(花椰菜花叶病毒35S启动子(pCaMV35S)、农杆菌的胭脂碱合成酶基因终止子(tNOS)、玄参花叶病毒的35S启动子(p FMV35S)、农杆菌的胭脂碱合成酶基因启动子(pNOS)、玉米泛素基因的启动子(pUbi)、烟草的花蕊特异性TA29的基因发育调节启动子(pTA29)、豌豆二磷酸核酮糖羧化酶基因的终止子(tE9)、章鱼碱合成酶终止子(t OCS)、谷氨酰胺转移酶7终止子(tg7)、花椰菜花叶病毒终止子(tCaMV35S))为研究靶标,进行10种启动子和终止子的引物和探针组合筛选、反应条件优化、灵敏度测定、质控品测试比对等实验,建立3组多重实时荧光PCR反应体系,并将其应用于市售蜂蜜的检测。结果表明:建立的3组多重实时荧光PCR反应体系能精准检出目的基因,其灵敏度分别为0.01、0.04、0.04 ng/μL;14种转基因质控品的测试显示多重实时荧光PCR和单重实时荧光PCR的检测结果一致;40份市售蜂蜜的筛查中,有两份蜂蜜检出pCaMV35S和tNOS,其余未检出,该方法大大提高了检测效率。该方法为蜂蜜中转基因成分的检测提供了快筛快检技术,同时也适用其它产品转基因成分的检测。

基于多重实时荧光定量PCR技术检测高危型人乳头瘤病毒E6/E7 mRNA的临床研究

目的 研究基于多重实时荧光定量PCR技术检测高危型人乳头瘤病毒(HPV)E6/E7 mRNA的价值。方法 选择2022年1月至2022年7月我院进行宫颈癌筛查的患者60例,分别采取多重实时荧光定量PCR技术测定高危型人乳头瘤病毒E6/E7 mRNA情况,并将病理学检查结果作为金标准,分析基于多重实时荧光定量PCR技术检测高危型人乳头瘤病毒E6/E7 mRNA的价值。结果 HPV 16、18、31、33等九类型的最低检测为10 copies/μL,但HPV 51、52、56、58等五类型最低检测是100 copies/μL。另外通过多重实时荧光定量PCR检测高危HPV E6/E7 mRNA和生殖道内常见病原菌例如大肠埃希菌、取淋病奈瑟菌、梅毒螺旋体、金黄色葡萄球菌等,其结果均显示阴性,且检测结果的特异性良好。薄层液基细胞学的检查结果与病理学检查并无差别(P>0.05)。多重实时荧光定量PCR技术的符合率91.67%(55/60),灵敏度83.33%(15/18),特异度95.24%(40/42)。结论 基于多重实时荧光定量PCR技术在HPV E6/E7 mRNA检测中意义重大,存在较高的灵敏度及特异度,可成为宫颈病变筛查的主要方式。

荧光定量PCR技术在猪病防治中的应用

生猪感染疾病时会直接对养殖场或养殖户的经济造成巨大损失,因此,做好生猪疾病预防工作显得尤其重要。利用实时荧光定量PCR技术(FQ-PCR技术)能有效利用微量的DNA进行扩增,提高检测精度,对猪病诊治和防治具有重要作用。一、猪病的诊断和防治现状猪病预防成效能直接影响养殖效益,在我国农村有大量的个体户进行生猪养殖,但个体农户往往缺乏足够的养殖经验,文化水平普遍偏低.

3种常见金银花致病菌多重实时荧光定量PCR检测方法研究

为了建立可同时检测炭疽病病原菌(Colletotrichum gloeosporioides)、白粉病病原菌(Erysiphe lonicera)和褐斑病病原菌(Cercospora rhamni)3种金银花重要叶部病原菌的多重实时荧光定量PCR快速检测方法,本试验基于3种病原菌ITS片段序列分别设计特异引物和TaqMan荧光探针,并制备重组质粒建立标准曲线;对建立的多重实时荧光定量PCR检测方法进行特异性、灵敏度、准确性验证。结果表明,本研究建立的多重实时荧光定量PCR快速检测方法仅针对金银花炭疽病、白粉病和褐斑病病原菌有特异性扩增;最低检测限为2.94×10^(2)copies/μL,比普通PCR法高100倍;利用本方法检测15份有叶部病害症状的金银花病叶,与DNA测序结果完全一致。综之,本研究建立的多重实时荧光PCR检测方法特异性强、灵敏度高,为金银花炭疽病、白粉病和褐斑病的早期诊断提供了技术支持。

多重耐药基因lsa(E)实时荧光定量PCR检测方法的创新

【目的】创新多重耐药基因lsa(E)实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)的检测方法,为lsa(E)基因流行和传播的监测提供参考。【方法】根据GenBank中lsa(E)基因的参考序列设计特异性引物,通过纯化、连接和转化等步骤,提取含有lsa(E)基因片段的重组质粒DNA为标准品进行检测,绘制标准曲线,验证其特异性和重复性,从而对多重耐药基因lsa(E)qRT-PCR检测方法进行创新;使用该检测方法对牛场粪便、土壤、淤泥和卧料等环境样品中lsa(E)基因的拷贝数量和相对丰度进行检测。【结果】该多重耐药基因lsa(E)qRT-PCR检测方法熔解曲线均为平滑单峰,特异性强;扩增效率良好(101.56%);标准曲线呈现良好的线性关系(r^(2)≥0.997);检测拷贝数量范围广(1.71×10^(2)~1.71×10^(8) copies·μL^(-1))且灵敏度高,组内组间变异系数范围为0.45%~1.66%,重复性强;使用该方法检测牛场环境样品,lsa(E)基因拷贝数量范围为2.54×10^(4)~1.52×10^(8) copies·μL^(-1),相对丰度范围为9.39×10^(-4)~1.20×10^(3),而普通PCR方法仅能在拷贝数量大于1×10^(6) copies·μL^(-1)的环境样品中检测到lsa(E)基因。【结论】本研究创新了多重耐药基因lsa(E)的qRT-PCR检测方法,特异性强,灵敏度高,检测范围广,且能应用于不同养殖环境样品(粪便、土壤和淤泥等)中lsa(E)基因的定量检测,为lsa(E)基因流行和传播的监测提供技术支持和理论指导。

实时荧光PCR检测技术在沙门菌血清鉴定中的应用

目的 探究实时荧光PCR检测技术在沙门菌血清分型中的应用。方法 选取2010—2015年无锡市健康从业人员肠道分离得到的144株沙门菌,分别采用传统玻片凝集法和实时荧光PCR法进行血清分型,以前者为金标准,比较两种方法的一致性。结果 144株沙门菌利用传统玻片凝集法均可分型,共鉴定出28个型别。两种方法鉴定结果一致的有134株菌,符合率为93.06%,Kappa值为0.68,具有高度一致性。结论 实时荧光PCR法对沙门菌进行血清分型与玻片凝集法鉴定结果一致性高,且检测时间较短,操作简单;对不常见血清型或存在交叉情况时,建议两种方法联合使用,可提高沙门菌血清分型检测效率。

多重实时荧光PCR TaqMan-MGB杂交探针标记法快速鉴定转基因玉米MIR162

为对转基因玉米MIR162的进口实行监测、规范转基因玉米在国内市场中的流通,建立一种转基因玉米MIR162准确快速的检测方法,通过设计转基因玉米MIR162品系特异性序列的引物和探针,摸索和优化多重荧光PCR体系和参数,开发建立多重实时荧光PCR TaqMan-MGB杂交探针标记法快速鉴定转基因玉米MIR162。结果表明,转基因玉米MIR162品系标准品和平行样品中内标基因和品系特异性基因均出现明显扩增曲线,其他转基因玉米品系标准品仅内标基因有扩增曲线,空白对照无扩增曲线,说明该TaqMan-MGB探针对转基因玉米MIR162品系具有扩增特异性。该方法可作为鉴定筛查转基因玉米MIR162品系及其转化体成分的有效方法,用于规范管理转基因产品在市场上的流通。

基于实时荧光定量PCR的番木瓜多重PCR高效检测方法

以pCaMV35S基因核酸检测试剂盒反应体系为基础,添加多重PCR反应所需的目标基因引物和番木瓜(Carica papaya L.)DNA,进行多重PCR反应,同时考察不合成荧光探针的情况下对目标基因进行实时荧光定量检测。结果表明,在实时荧光定量PCR反应体系中,多重PCR扩增的基因条带比常规PCR扩增的基因条带更亮,在不合成荧光探针的情况下实现目标基因的实时荧光定量PCR反应,以期建立一种基于实时荧光定量PCR的多重PCR检测方法。

实时荧光PCR技术在高危型人乳头瘤病毒检测中的价值

目的 分析实时荧光PCR技术在高危型人乳头瘤病毒(HPV)检测中的价值。方法 选取本院行病理诊断检查的66例高危型HPV感染者及68例健康女性为研究对象,均实施实时荧光PCR技术和第二代杂交捕获试验(HC-Ⅱ)技术行HPV检测,比较两种检测技术的诊断效能。结果 以病理检验结果为金标准,实时荧光PCR技术的准确度、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、诊断符合率分别为94.03%、96.97%、91.18%、91.43%、96.88%、94.03%,高于HC-Ⅱ技术的76.12%、81.82%、70.59%、72.97%、80.00%、76.12%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 高危型HPV检测中应用实时荧光PCR技术,能够保证疾病检测结果的准确性和可靠性,进而为后续的临床治疗提供支持,应用价值较高。

实时荧光PCR技术质量控制影响因素探讨

实时荧光PCR技术在分子生物学研究和临床诊断中发挥着重要作用。然而,实时荧光PCR结果的准确性和可靠性受到多种因素的影响。本文旨在探讨实时荧光PCR技术质量控制的影响因素,并提供相应的控制策略。首先讨论了实时荧光PCR技术的质量控制指标和方法。接下来,详细分析了影响实时荧光PCR技术质量的因素,包括实验设计与操作技巧、样本质量与处理方法、试剂与仪器选择与使用、反应条件与参数设置。通过案例研究和讨论,验证了这些影响因素对实时荧光PCR结果的影响,并提出了相应的控制策略。

实时荧光定量PCR技术在转基因食品检测领域中的实践分析

当前,随着我国科技的不断发展,科研领域创新不断增加,使我国食品工程技术进入到了一个新的阶段,在当前时代背景下,食品工程科技创新催生了转基因工程等一系列高精尖技术体系,使我国食品产业发展规模不断壮大。随着近几年我国转基因食品种植面积不断扩大,食品质量控制难度也明显提高,如果不能实现对转基因食品具体质量情况的有效检测,会对人体健康产生较为负面的影响。而实时荧光定量PCR技术则是当前我国转基因食品检测过程中经常应用的技术,因此,想要实现对转基因食品质量的有效确定,应该灵活应用此项检测技术。基于此,本文对实时荧光定量PCR技术在转基因食品检测领域中的应用进行了分析。

实时荧光定量PCR技术在肉及肉制品中的运用

文章首先介绍了实时荧光定量PCR的技术原理,随后选取83份肉及肉制品的样品,设计了对照试验。对照组采用常规的细菌培养法,实验组采用了实时荧光定量PCR技术,测定样品中沙门菌、金黄色葡萄球菌等4种致病细菌的数量。结果表明,实验组检测出沙门菌17株,阳性率为20.48%,明显高于对照组(阳性率7.23%);其他3种细菌方面,实验组的检出率也明显超过了对照组,说明实时荧光定量PCR技术在肉及肉制品的污染物检测中有着更高的特异性和灵敏度。在应用这一技术时,还要注意做好肉及肉制品的前处理,以及正确选用Real-time Q-PCR检测试剂盒,才能保证检测结果的可靠性。

金黄色葡萄球菌及毒素多重实时荧光PCR检测技术及其试剂盒性能测试

[目的]本文基于自筛的金黄色葡萄球菌特异性靶基因ASL18_04625(sa19)以及2种重要的毒素基因(A型和U型肠毒素,sea344和seu222),建立一种同时检测金黄色葡萄球菌及其肠毒素的多重实时荧光PCR检测方法。[方法]通过优化引物浓度等因素,确定最适多重实时荧光PCR反应体系,并将此检测体系组装成试剂盒,对人工污染样品和实际样品进行检测。[结果]选用1.5×Syto9 Green作为荧光染料,优化后的反应体系为0.015 U·μL^(-1)Taq酶,0.10 mmol·L^(-1)dNTP,终浓度分别为0.05、0.10和0.20μmol·L^(-1)的3对引物。sa19的基因组灵敏度为40.7 pg·μL^(-1),sea344、seu222的基因组灵敏度均为4.07 pg·μL^(-1);sa19的菌液浓度灵敏度为1.19×10^(3)CFU·mL^(-1),sea344、seu222的菌液浓度灵敏度均为1.19×10^(4)CFU·mL^(-1)。构建的试剂盒组内和组间重复率均为100%。在经历60次反复冻融、72 h泡沫箱储藏、-20℃储藏90 d、4℃储藏45 d后,试剂盒检测结果仍没有显著变化,同时具有良好的特异性与抗干扰能力。[结论]本研究针对食源性金黄色葡萄球菌建立的多重实时荧光PCR法,具有快速、特异性强、灵敏度高的优点,并组建成适用于实际检测应用的商品化试剂盒,在食品安全检测方面具有广阔的应用前景。

多重实时荧光串联PCR技术高通量检测生蚝中9种致病菌

大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、溶藻弧菌、副溶血弧菌、铜绿假单胞菌、产气荚膜梭菌、单增李斯特菌和创伤弧菌是贝类食品中常见的食源性致病菌。该文通过设计特异性引物,优化反应参数以建立多重实时荧光串联PCR(multiplexed tandem PCR,MT-PCR)方法,进一步评估方法的特异性和灵敏度,并用于检测生蚝样品。优化后的MT-PCR方法与常规qPCR具有相同定量能力,可同时检测上述9种致病菌。在对混合菌液的检测中,MT-PCR方法的检测灵敏度最低可达10~2 CFU/mL,且此法对其中6种致病菌的检测灵敏度高于qPCR。应用该技术检测人工染菌的生蚝样品,检测灵敏度为10~2~10~3CFU/g。该研究建立的MT-PCR方法可实现高通量、快速准确地检测生蚝中这9种常见的食源性致病菌,对保障食品安全和评估食源性致病菌污染风险具有重要意义。

利用多重实时荧光定量PCR技术检测新生儿高胆红素血症患者UGT1A1基因多态性研究

目的利用多重实时荧光定量PCR技术检测新生儿高胆红素血症患者UGT1A1基因多态性,探讨UGT1A1基因多态性与新生儿胆红素水平的关系。方法选取2015年1月至2016年1月深圳市第三人民医院新生儿高胆红素血症组165例(总胆红素≥257μmol/L)及对照组150例(总胆红素<257μmol/L),提取全血DNA,选取UGT1A1基因常见的四个突变位点,启动子的A(TA)7TAA盒以及编码区Pro229Gln、Try486Asp、Gly71Arg,合成引物及探针,对样本进行多重实时荧光定量PCR检测并采集荧光,对PCR检测阳性结果的样本回收提纯,送基因测序鉴定。结果多重实时荧光定量PCR结果与基因测序结果一致,A(TA)7TAA突变在高胆红素血症及对照组检出率分别为7.8%、23.3%,Gly71Arg位点突变在高胆红素血症组及对照组分别为52.7%、19.3%,差异有统计学意义。Try486Asp及Pro229Gln点突变在两组检出率均较低,无统计学意义。在高胆红素血症组Gly71Arg纯合子突变者胆红素水平比杂合子突变及野生型高,有统计学意义。结论利用多重实时荧光定量PCR技术检测基因突变方便高效、经济准确,新生儿高胆红素血症与Gly71Arg突变有关。

禽流感H5、H7、H9亚型多重实时荧光RT-PCR检测方法的建立

为了对致病性强、危害性大的H5、H7、H9亚型禽流感病毒进行同时集成化快速检测,通过对GenBank已报道的禽流感病毒的HA基因进行序列分析比较,设计了H5、H7、H9 3个亚型的特异性引物和分别用3个荧光基团标记的Taqman MGB核酸探针。将各个亚型引物与探针优化组合,筛选出能够同时检测禽流感病毒H5、H7、H9 3个亚型、且对Ct值和扩增效率影响不大的3组引物和探针,建立了三重实时荧光RT-PCR方法。该方法特异性好,在我们检测的样品中,没有发现假阳性和假阴性现象。同时敏感性高,检测禽流感病毒H5、H7、H9亚型的敏感性分别达到1 0001、000、500个模板拷贝数;此外抗干扰能力强,对禽流感H5、H7、H9 3个亚型的不同模板浓度进行组合,仍可有效地同时检测3个病毒亚型。所建立的方法对保存的89个禽流感病毒样品进行检测,结果与经典检测方法(病毒分离鉴定、HA、HI)的符合率达100%。用上述建立的方法与鸡胚分离法同时对新鲜采集的4 000多份临床样品进行检测,两种方法的检测结果符合率为100%。

实时荧光定量PCR技术在转基因玉米检测中的应用研究

采用实时荧光定量PCR技术 ,通过使用特异的引物和探针 ,对玉米中的内源基因Invertase和转基因玉米Mon810、Event 176中的外源基因进行了定量检测 ,建立了商业化转基因玉米Mon 810 (YieldGard)和Event 176 (Maximizer)的定量PCR检测方法。该方法的检测灵敏度小于 0 .0 1% ,是国际上设定的转基因最低限量的 10

实时荧光定量PCR技术检测转基因大豆方法的建立

采用实时荧光定量PCR技术 ,通过使用特异的引物和探针 ,对大豆中的内源基因Lectin和转基因大豆中的外源基因EPSPS进行了定量检测 ,建立了Monsanto公司生产的商业化转基因大豆Roundup Ready○R的定量PCR检测方法。该方法的检测灵敏度 <0 0 1% ,是国际上设定的转基因最低限量的 10

PRRSV和PCV-2以及PRV多重SYBR Green-Ⅰ实时荧光PCR检测方法的建立

根据GenBank中登录的猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)N蛋白基因、猪圆环病毒2型(PCV-2)rep蛋白基因和猪伪狂犬病病毒(PRV)gE基因的核苷酸序列分别设计了3对特异性引物,成功建立了同时检测PRRSV、PCV-2、PRV的多重SYBR Green-Ⅰ实时荧光PCR方法。敏感性试验结果显示,PRRSV、PCV-2的敏感性可达250拷贝/μL,PRV的敏感性可达500拷贝/μL。表明,该方法具有较好的特异性、重复性和敏感性,可以用于PRRSV、PCV-2和PRV的快速检测。