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多重PCR检测猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒的研究——猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒多重PCR引物设计
被引量:
14
1
作者
余丽芸
刘建柱
+2 位作者
侯喜林
崔玉东
朴范泽
《动物医学进展》
CSCD
2004年第6期75-77,共3页
在GeneBank中查出CSFV、PPV、PRV的所有已知序列。对病毒各基因区进行同源性分析 ,确定CSFV的E2 基因 ,PPV的VP2 基因和PRV的 gⅡ基因为各病毒扩增的靶序列。利用DNAsis对上述保守区进行引物设计 ,对设计出来的 3种病毒引物利用DNAstar...
在GeneBank中查出CSFV、PPV、PRV的所有已知序列。对病毒各基因区进行同源性分析 ,确定CSFV的E2 基因 ,PPV的VP2 基因和PRV的 gⅡ基因为各病毒扩增的靶序列。利用DNAsis对上述保守区进行引物设计 ,对设计出来的 3种病毒引物利用DNAstar进行引物二聚体分析 ,以避免引物之间形成稳定的引物二聚体。选出扩增序列为CSFV 2 88bp、PPV575bp和PRV 70 0bp的 3对引物 ,并对每对引物扩增序列的同源性或互补性进行分析。避免它们之间有较高的同源性或互补性 ,从而确定了
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关键词
多重
pcr
检测
猪瘟病毒
猪细小病毒
猪伪狂犬病病毒
多重pcr引物设计
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职称材料
基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统的构建与应用
2
作者
李美婧
施江程
李建伟
《唐山学院学报》
2017年第6期14-17,共4页
PrimerHunter是一款多重PCR引物设计软件,该软件能够高效地设计出具有特异性的多重引物,但是只能在Linux系统的命令行中运行,而且没有考虑引物二聚体的问题。针对这些问题,文章建立了基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统,实现了Prime...
PrimerHunter是一款多重PCR引物设计软件,该软件能够高效地设计出具有特异性的多重引物,但是只能在Linux系统的命令行中运行,而且没有考虑引物二聚体的问题。针对这些问题,文章建立了基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统,实现了PrimerHunter的界面化,完成了C/S模式向B/S模式的转换,同时增加了原软件不具备的引物二聚体检测模块,能够有效检测引物对之间的二聚体情况,为相关生物学领域研究提供了一种高效的多重PCR引物设计工具。
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关键词
多重pcr引物设计
系统
PrimerHunter软件
二聚体检测
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职称材料
题名
多重PCR检测猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒的研究——猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒多重PCR引物设计
被引量:
14
1
作者
余丽芸
刘建柱
侯喜林
崔玉东
朴范泽
机构
黑龙江八一农垦大学动物科技学院
出处
《动物医学进展》
CSCD
2004年第6期75-77,共3页
基金
黑龙江省科委基金资助项目 (GB0 1B1 0 5 6 0 2 )
文摘
在GeneBank中查出CSFV、PPV、PRV的所有已知序列。对病毒各基因区进行同源性分析 ,确定CSFV的E2 基因 ,PPV的VP2 基因和PRV的 gⅡ基因为各病毒扩增的靶序列。利用DNAsis对上述保守区进行引物设计 ,对设计出来的 3种病毒引物利用DNAstar进行引物二聚体分析 ,以避免引物之间形成稳定的引物二聚体。选出扩增序列为CSFV 2 88bp、PPV575bp和PRV 70 0bp的 3对引物 ,并对每对引物扩增序列的同源性或互补性进行分析。避免它们之间有较高的同源性或互补性 ,从而确定了
关键词
多重
pcr
检测
猪瘟病毒
猪细小病毒
猪伪狂犬病病毒
多重pcr引物设计
Keywords
CSFV
PPV
PRV
primer design
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统的构建与应用
2
作者
李美婧
施江程
李建伟
机构
首都师范大学附属回龙观育新学校
河北工业大学计算机科学与软件学院
出处
《唐山学院学报》
2017年第6期14-17,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81672113)
文摘
PrimerHunter是一款多重PCR引物设计软件,该软件能够高效地设计出具有特异性的多重引物,但是只能在Linux系统的命令行中运行,而且没有考虑引物二聚体的问题。针对这些问题,文章建立了基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统,实现了PrimerHunter的界面化,完成了C/S模式向B/S模式的转换,同时增加了原软件不具备的引物二聚体检测模块,能够有效检测引物对之间的二聚体情况,为相关生物学领域研究提供了一种高效的多重PCR引物设计工具。
关键词
多重pcr引物设计
系统
PrimerHunter软件
二聚体检测
Keywords
pcr
PrimerHunter
multiplex primers
dimmer detect
分类号
TP319 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多重PCR检测猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒的研究——猪瘟病毒、猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒多重PCR引物设计
余丽芸
刘建柱
侯喜林
崔玉东
朴范泽
《动物医学进展》
CSCD
2004
14
下载PDF
职称材料
2
基于PrimerHunter的多重PCR引物设计系统的构建与应用
李美婧
施江程
李建伟
《唐山学院学报》
2017
0
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职称材料
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