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融合信息量差异和聚类精炼的多Motif识别
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作者 王迎国 钟诚 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2017年第9期1971-1976,共6页
采用信息量差异扩展采样Markov链的排斥力函数,使排斥力的值增加,推动两条相互靠近的采样Markov链向不同的区域探索,使motif位置概率矩阵元素值得到更新,避免motif识别算法过早陷入局部最优解,以发现更多的候选motif;利用信息量对motif... 采用信息量差异扩展采样Markov链的排斥力函数,使排斥力的值增加,推动两条相互靠近的采样Markov链向不同的区域探索,使motif位置概率矩阵元素值得到更新,避免motif识别算法过早陷入局部最优解,以发现更多的候选motif;利用信息量对motif聚类精炼,以减少假阳性motif对算法结果的影响,提高识别结果的精度和召回率.模拟启动子序列和真实数据集ENCODE TF Chip-seq上的实验结果表明,与同类的多motif识别算法相比,本文算法获得更高的召回率和精度、识别出保守性高的motif和匹配更多真实的motif. 展开更多
关键词 生物序列 多motif识别 排斥力 聚类精炼 GIBBS采样
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