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大泰竹叶绿体全基因组及系统进化分析
1
作者
李傅达
黄欣
+5 位作者
韦波
毛纯
秦波
黄红宝
孙开道
周启华
《农业研究与应用》
2024年第1期7-13,共7页
大泰竹(Thyrsostachys oliveri)是一种在东亚地区广泛分布的竹子,具有重要的生态和经济价值。为获取大泰竹的叶绿体分子生物学特性及明确其系统发育位置,本研究采用高通量测序技术对其叶绿体基因组进行了测序和组装,获得了完整的大泰竹...
大泰竹(Thyrsostachys oliveri)是一种在东亚地区广泛分布的竹子,具有重要的生态和经济价值。为获取大泰竹的叶绿体分子生物学特性及明确其系统发育位置,本研究采用高通量测序技术对其叶绿体基因组进行了测序和组装,获得了完整的大泰竹叶绿体基因组序列,并对其进行基因组特征解析和系统发育分析。结果表明:(1)大泰竹的叶绿体基因组为一个典型的双环状结构,全长为139,454 bp,LSC区域的长度为82,986 bp,SSC区域的长度为12,878 bp,IR区域的长度为21,795 bp,全基因组的GC含量为38.90%,共编码了131个基因;(2)共检测到123个SSR位点,其中单核苷酸SSR最多,为102个,占总数的82.93%;(3)系统发育分析表明,大泰竹为禾本科竹亚科中的一个明确分支,与牡竹属(Dendrocalamus)的麻竹(D.latiflorus)和大叶慈(D.farinosus)亲缘关系较近。研究结果明确了大泰竹在竹类植物中的系统发育位置,同时可为竹类分类和鉴定提供新的分子依据。
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关键词
大泰竹
叶绿体基因组
系统发育
SSR
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职称材料
题名
大泰竹叶绿体全基因组及系统进化分析
1
作者
李傅达
黄欣
韦波
毛纯
秦波
黄红宝
孙开道
周启华
机构
广西壮族自治区国有七坡林场
广西壮族自治区林业科学研究院
凤山县国有凤山林场
出处
《农业研究与应用》
2024年第1期7-13,共7页
基金
广西林业科技项目(gl2020kt09)。
文摘
大泰竹(Thyrsostachys oliveri)是一种在东亚地区广泛分布的竹子,具有重要的生态和经济价值。为获取大泰竹的叶绿体分子生物学特性及明确其系统发育位置,本研究采用高通量测序技术对其叶绿体基因组进行了测序和组装,获得了完整的大泰竹叶绿体基因组序列,并对其进行基因组特征解析和系统发育分析。结果表明:(1)大泰竹的叶绿体基因组为一个典型的双环状结构,全长为139,454 bp,LSC区域的长度为82,986 bp,SSC区域的长度为12,878 bp,IR区域的长度为21,795 bp,全基因组的GC含量为38.90%,共编码了131个基因;(2)共检测到123个SSR位点,其中单核苷酸SSR最多,为102个,占总数的82.93%;(3)系统发育分析表明,大泰竹为禾本科竹亚科中的一个明确分支,与牡竹属(Dendrocalamus)的麻竹(D.latiflorus)和大叶慈(D.farinosus)亲缘关系较近。研究结果明确了大泰竹在竹类植物中的系统发育位置,同时可为竹类分类和鉴定提供新的分子依据。
关键词
大泰竹
叶绿体基因组
系统发育
SSR
Keywords
Thyrsostachys oliveri
chloroplast genome
phylogeny
SSR
分类号
S792.99 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大泰竹叶绿体全基因组及系统进化分析
李傅达
黄欣
韦波
毛纯
秦波
黄红宝
孙开道
周启华
《农业研究与应用》
2024
0
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