Allexivirus属的一个新成员——大蒜病毒E的基因组全序列测定和系统树分析

测定了一个从浙江余杭大蒜中分离到的Allexivirus属成员的基因组全序列. 单链正性病毒基因组含8451个核苷酸, 6个ORF. 与其他Allexivirus属成员的基因组全序列的核苷酸同源性仅为62.8%～64.8%; ORF1～ORF6编码蛋白的氨基酸同源性分别为67.6%～78.5%, 55.4%～66.2%, 56.7%～66.4%, 40.3%～55.6%, 66.3%～79.7%和52.2%～68.8%. 进一步分析显示, 此病毒与其他病毒的差异和该属中远缘病毒间的差异相似, 外壳蛋白核心区域氨基酸序列同源性仅为63.9%～79.8%, 远低于该属不同病毒的国际分类标准, 应归类为Allexivirus属的新成员, 命名为大蒜病毒E. 病毒不同编码蛋白序列的进化树分析也进一步证明了该病毒与其他病毒的亲缘关系.

大蒜E病毒外壳蛋白基因的原核表达及抗血清制备

设计特异性引物PCR扩增了余杭大蒜病样中的大蒜E病毒 (GarV E)的全长CP基因 ,构建原核表达载体并在大肠杆菌中过量表达 ,纯化表达产物后免疫家兔制备抗血清。Westernblot检测结果表明 ,抗血清与GarV E的CP起强的特异性反应。 7个大蒜样品中 ,内蒙古赤峰市、宁夏银川和甘肃天水等 4个样品受到GarV E的侵染。试验也证明了田间GarV E编码的CP分子量为 35kD ,不同于已报道的其他葱X病毒属成员的 2