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大鼠睾丸限制性表达新基因Rtap2a的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
彭枫
杨寒朔
+4 位作者
邓洪新
王瑞
杨金亮
田聆
魏于全
《华西医学》
CAS
2007年第1期105-107,共3页
目的为进一步研究我们克隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示。方法应用B1ast、ORFFinder、ScanProsite、TMpredServer和UniGene等软件或数据...
目的为进一步研究我们克隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示。方法应用B1ast、ORFFinder、ScanProsite、TMpredServer和UniGene等软件或数据库,进行序列的相似性比较,开放读码框预测、染色体定位、电子表达谱和编码蛋白质的功能等分析。结果我们得到的Rtap2a序列是该基因的全长cDNA序列,在多物种间高度保守,该基因编码的蛋白可能为一N端在胞内的单次跨膜蛋白;其小鼠同源基因的电子表达谱提示Rtap2a特异地高表达于睾丸组织,在成年小鼠的睾丸中表达量最高。结论大鼠新基因Rtap2a是一睾丸限制性表达的新基因,其编码蛋白单次跨膜,进化上高度保守,可能在哺乳动物的睾丸发育和精子发生过程中具有重要功能,也有可能参与肿瘤的发生、发展等过程。因此,新基因Rtap2a有进一步研究的价值。
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关键词
大鼠新基因
生物信息学
基因
功能预测
下载PDF
职称材料
题名
大鼠睾丸限制性表达新基因Rtap2a的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
彭枫
杨寒朔
邓洪新
王瑞
杨金亮
田聆
魏于全
机构
生物治疗国家重点实验室
出处
《华西医学》
CAS
2007年第1期105-107,共3页
文摘
目的为进一步研究我们克隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示。方法应用B1ast、ORFFinder、ScanProsite、TMpredServer和UniGene等软件或数据库,进行序列的相似性比较,开放读码框预测、染色体定位、电子表达谱和编码蛋白质的功能等分析。结果我们得到的Rtap2a序列是该基因的全长cDNA序列,在多物种间高度保守,该基因编码的蛋白可能为一N端在胞内的单次跨膜蛋白;其小鼠同源基因的电子表达谱提示Rtap2a特异地高表达于睾丸组织,在成年小鼠的睾丸中表达量最高。结论大鼠新基因Rtap2a是一睾丸限制性表达的新基因,其编码蛋白单次跨膜,进化上高度保守,可能在哺乳动物的睾丸发育和精子发生过程中具有重要功能,也有可能参与肿瘤的发生、发展等过程。因此,新基因Rtap2a有进一步研究的价值。
关键词
大鼠新基因
生物信息学
基因
功能预测
Keywords
Rat novel gene
Bioinformatic analysis
Gene function prediction
分类号
R73-3 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大鼠睾丸限制性表达新基因Rtap2a的生物信息学分析
彭枫
杨寒朔
邓洪新
王瑞
杨金亮
田聆
魏于全
《华西医学》
CAS
2007
1
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职称材料
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参考文献
引证文献
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