大鼠睾丸限制性表达新基因Rtap2a的生物信息学分析

目的为进一步研究我们克隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示。方法应用B1ast、ORFFinder、ScanProsite、TMpredServer和UniGene等软件或数据库,进行序列的相似性比较,开放读码框预测、染色体定位、电子表达谱和编码蛋白质的功能等分析。结果我们得到的Rtap2a序列是该基因的全长cDNA序列,在多物种间高度保守,该基因编码的蛋白可能为一N端在胞内的单次跨膜蛋白;其小鼠同源基因的电子表达谱提示Rtap2a特异地高表达于睾丸组织,在成年小鼠的睾丸中表达量最高。结论大鼠新基因Rtap2a是一睾丸限制性表达的新基因,其编码蛋白单次跨膜,进化上高度保守,可能在哺乳动物的睾丸发育和精子发生过程中具有重要功能,也有可能参与肿瘤的发生、发展等过程。因此,新基因Rtap2a有进一步研究的价值。