期刊文献+
共找到32篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
Toll样受体信号通路的3条途径在大鼠肝再生中抑制库普弗细胞免疫反应 被引量:1
1
作者 何玉贵 常翠芳 +6 位作者 耿直 许果果 和婷婷 梅金鑫 周晓春 杨亚娟 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第4期100-105,共6页
为从基因转录水平了解大鼠肝再生中Toll样受体信号通路调节库普弗细胞免疫反应的途径和方式,首先建立大鼠2/3肝切除(partial hepatectomy,PH)模型,从中分离库普弗细胞进行基因微阵列分析.发现Toll样受体信号通路的23个基因及其调节免疫... 为从基因转录水平了解大鼠肝再生中Toll样受体信号通路调节库普弗细胞免疫反应的途径和方式,首先建立大鼠2/3肝切除(partial hepatectomy,PH)模型,从中分离库普弗细胞进行基因微阵列分析.发现Toll样受体信号通路的23个基因及其调节免疫反应的62个基因与大鼠肝再生相关.基因协同作用(Ep(t)值)和同类提取法分析表明,大鼠肝再生进展阶段,Toll样受体信号通路通过TLR/NF-κB,TLR/MAPK,TLR/IRF等3条途径和TLR4,MAL,UNC93B1,AP1S2,IRF1等5个关键基因抑制库普弗细胞免疫反应. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 TOLL样受体信号通路 库普弗细胞 免疫反应 基因表达谱 关键基因
下载PDF
基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择 被引量:1
2
作者 王小玉 陈留院 +3 位作者 刘云卿 杨云 李钧涛 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第5期26-28,共3页
针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证... 针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证了所选基因的生物合理性. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 弹性网络 基因选择
下载PDF
NF-κB信号通路在大鼠肝再生中调节肝细胞增殖的机理研究 被引量:1
3
作者 王彬彬 常翠芳 +2 位作者 鲁艳平 贾艺峰 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第6期167-171,共5页
为了解大鼠肝再生中肝细胞NF-κB信号通路对肝细胞增殖的调节作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中NF-κB信号通路相关基因表达变化发现,芯片含138个NF-κB信号通路基因,其中46个基因与大鼠肝再生相关.用Ingenuity Pathway An... 为了解大鼠肝再生中肝细胞NF-κB信号通路对肝细胞增殖的调节作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中NF-κB信号通路相关基因表达变化发现,芯片含138个NF-κB信号通路基因,其中46个基因与大鼠肝再生相关.用Ingenuity Pathway Analysis 9.0(IPA)软件解析上述基因表达变化预示的该信号通路调节肝细胞增殖作用发现,该通路的白细胞介素-1(IL-1)途径在大鼠肝再生起始阶段促进肝细胞增殖,生长因子(GF)途径在进展阶段促进肝细胞增殖,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)途径在起始阶段促进肝细胞增殖,终止阶段抑制肝细胞增殖. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 细胞增殖 NF-ΚB信号通路 通路创建与分析
下载PDF
建立基因协同作用算法解析大鼠肝再生中基因表达丰度预示的细胞增殖活动 被引量:2
4
作者 徐存拴 黄荧 +2 位作者 江云 李钧涛 周运 《河南科学》 2013年第10期1615-1619,共5页
随着生物高通量分析技术的发展,获得基因组/蛋白组数据已较易实现.然而解析这些数据的生物学意义尚有不少困难,亟待克服.从生理反应的多样性、多步骤性、可逆性、循环性、重复性、网络性、可控性、适应性等特点入手,以基因表达丰... 随着生物高通量分析技术的发展,获得基因组/蛋白组数据已较易实现.然而解析这些数据的生物学意义尚有不少困难,亟待克服.从生理反应的多样性、多步骤性、可逆性、循环性、重复性、网络性、可控性、适应性等特点入手,以基因表达丰度为基础,根据时间序列分析原理,应用皮尔森相关系数建立了两种描述基因协同作用的谱函数E。(£)和巨,用它们分析基因表达丰度、表达变化预示的大鼠肝再生中肝细胞的增殖活动.结果显示,大鼠肝再生的进展阶段,即PH后12~72h肝细胞的增殖活动显著强于对照.进一步分析相关文献资料发现,上述结果与文献报道一致,表明在解析生物高通量分析数据的生物学意义方面,基因协同作用算法有一定应用价值. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 基因芯片 基因表达丰度 基因协同作用 细胞增殖
下载PDF
同类提取法结合序列向前法预测大鼠肝再生的关键基因 被引量:1
5
作者 刘云卿 黄荧 +2 位作者 周运 李钧涛 徐存拴 《河南科学》 2013年第7期964-967,共4页
从生物高通量检测数据中挖掘关键基因/蛋白是生物信息学的重要研究内容.用大鼠基因组表达谱芯片Rat Genome 230 2.0检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度和计算它们与对照的比值(ratio值),用F检验发现,Ccne1、Eg f、Met等8419个基因与... 从生物高通量检测数据中挖掘关键基因/蛋白是生物信息学的重要研究内容.用大鼠基因组表达谱芯片Rat Genome 230 2.0检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度和计算它们与对照的比值(ratio值),用F检验发现,Ccne1、Eg f、Met等8419个基因与大鼠肝再生相关.用过滤法从中筛选出3202个差异基因,用同类提取法从差异基因筛选出1000个特征基因.取前100个特征基因作为初选基因,进一步用序列向前法计算发现,Ccnd1、Grin2a、Spsb4等7个基因满足肝再生候选关键基因的条件.再用同类提取法分析发现,上述7个基因中,Ccnd1和Agtr1的关联度≥100,且文献报道与肝再生相关,当属关键基因.用机器学习法检验关键基因的正确性发现,同类提取法结合序列向前法预测的关键基因正确率达97%以上.因此,用该方法预测关键基因切实可行,值得推广应用. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 基因表达丰度 序列向前法 同类提取法 关键基因
下载PDF
大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究
6
作者 张亚磊 秦丹 +1 位作者 王改平 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第6期172-177,共6页
为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再... 为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12h(PH后12h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Genome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控. 展开更多
关键词 大鼠细胞 大鼠肝再生 裸露DNA 基因转录
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的葡萄糖代谢基因转录谱预示的代谢活动 被引量:6
7
作者 张丽君 常翠芳 徐存拴 《河南科学》 2010年第2期167-171,共5页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的葡萄糖代谢基因转录谱及其预示的葡萄糖代谢活动,用percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测上述细胞的葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中的表达变化,... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的葡萄糖代谢基因转录谱及其预示的葡萄糖代谢活动,用percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测上述细胞的葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中的表达变化,用H-Cluster软件分析基因表达模式,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的生理活动.结果表明,48个葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,其中上调、下调和上/下调的基因数分别为20、14、14,上述细胞的相应基因数为14、8和0,11、6和0,6、4和0,7、11和0,11、6和2,6、5和1,12、5和0,9、9和1,呈现21种表达相关性.上述葡萄糖代谢基因转录谱预示,肝细胞和库普弗细胞的3-磷酸甘油醛合成增多,肝细胞和胆管上皮细胞的烯醇式丙酮酸合成增多,肝星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞的通过三羧酸循环产生ATP活动增强.结论:大鼠肝再生与葡萄糖代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome2302.0芯片 基因表达谱分析 葡萄酸代谢
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的一碳代谢相关基因转录谱研究
8
作者 张春艳 于亚男 +2 位作者 宗慧 李静雯 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期181-184,共4页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动在肝再生启动阶段增强.胆管上皮细胞的S-腺苷甲硫氨酸转化为S-腺苷高半胱氨酸、N5-甲基四氢叶酸将甲基转移给甲硫氨酸活动在进展阶段增强.肝细胞、陷窝细胞、树突状细胞的聚谷氨酸水解、四氢叶酸与N5-甲酰基四氢叶酸相互转化在肝再生3个阶段增强.结论:大鼠肝再生与一碳代谢相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 一碳代谢
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱预示的生化活动
9
作者 郭学强 秦波 徐存拴 《河南科学》 2010年第5期542-546,共5页
为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的脂肪代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的代谢活动.结果表明,29个脂肪代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有... 为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的脂肪代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的代谢活动.结果表明,29个脂肪代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,8种细胞的相应基因个数为18、14、7、9、8、10、14、17.上调、下调和上/下调的基因个数为13、6和10,相应细胞的基因个数为10、8和0,12、2和0,5、2和0,5、3和1,5、2和1,8、2和0,8、6和0,10、7和0.8种肝脏细胞的脂肪分解相关基因表达增强.肝细胞、胆管上皮细胞、星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪合成相关基因表达增强.预示大鼠肝再生中脂肪代谢活动增强,与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 脂肪代谢
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱预示的生化活动
10
作者 郭学强 秦波 徐存拴 《河南科学》 2010年第3期296-300,共5页
为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的脂肪酸代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的生理活动.结果表明,44个脂肪酸代谢基因在大鼠肝再生中发生了有... 为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的脂肪酸代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的生理活动.结果表明,44个脂肪酸代谢基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为22、18、11、21、19、13、27、18,上调、下调和上/下调的基因个数为11、14和19,相应细胞的基因个数为6、15和1,7、8和3,3、8和0,16、3和2,12、7和0,8、5和0,6、21和0,9、5和4.肝细胞、胆管上皮细胞、星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪酸合成相关基因表达增强,肝细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪酸分解相关基因表达增强.上述结果预示大鼠肝再生中脂肪酸代谢活动增强,与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 脂肪酸代谢
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的嘌呤核苷酸代谢基因转录谱预示的代谢活动
11
作者 房连聪 常翠芳 徐存拴 《河南科学》 2010年第6期670-676,共7页
为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的嘌呤核苷酸代谢基因转录谱及预示的代谢活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠部分肝切除后10个恢复时间点大鼠... 为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的嘌呤核苷酸代谢基因转录谱及预示的代谢活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠部分肝切除后10个恢复时间点大鼠再生肝的上述8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测嘌呤核苷酸代谢基因在上述细胞中表达变化,用Excel等软件及生物信息学和系统生物学等方法分析它们的表达模式、预示的生理活动等.结果表明,85个嘌呤核苷酸代谢基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为40,43,30,42,22,26,36和48.上调、下调、上/下调的基因个数为49、11、31,相应细胞的基因数为27、20和1,31、4和1,15、7和3,12、10和0,23、15和3,19、7和2,39、3和1,33、6和0.其中,催化DNA合成的DNA聚合酶基因和催化RNA合成的RNA聚合酶基因在肝再生的多个时间点和多种细胞中表达增强,胆管上皮细胞和星形细胞的腺苷酸合成相关基因表达增强.肝细胞、卵圆细胞和星形细胞的核苷酸分解相关基因、肝细胞、星形细胞和树突状细胞的嘌呤核苷分解相关基因表达减弱.预示大鼠肝再生与嘌呤核苷酸代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Rat GENOME 2302.0芯片 基因表达谱分析 嘌呤核苷酸代谢
下载PDF
Caspase信号通路调控大鼠再生肝肝细胞的凋亡 被引量:5
12
作者 蒋文文 郝晓霞 +2 位作者 郭雅琼 赵卫明 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期359-365,共7页
目的从基因转录水平了解Caspase信号通路各途径对大鼠再生肝肝细胞凋亡的调节作用。方法将114只大鼠随机分为19组,包括9个部分肝切除组,9个假手术组和1个正常对照组。于手术后10个不同时间点用常规的两步灌流法和Percoll密度梯度离心法... 目的从基因转录水平了解Caspase信号通路各途径对大鼠再生肝肝细胞凋亡的调节作用。方法将114只大鼠随机分为19组,包括9个部分肝切除组,9个假手术组和1个正常对照组。于手术后10个不同时间点用常规的两步灌流法和Percoll密度梯度离心法分离大鼠肝细胞,用大鼠Genome 230 2.0芯片检测在大鼠肝再生(LR)中Caspase信号通路相关基因表达变化,用荧光定量PCR确定芯片结果的可靠性,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的Caspase信号通路在调控大鼠再生肝肝细胞凋亡中的作用。结果 Caspase信号通路涉及38条途径和123个基因,大鼠Genome 230 2.0芯片含其中的106个基因,38个基因在大鼠肝再生中与肝细胞相关。Caspase信号通路抑制细胞凋亡的21条途径中,途径1、2和11在大鼠部分肝切除(PH)后的30h,途径27、29和31在72h,途径15和16在2h和30h,途径3和4在30h和72h抑制肝细胞凋亡。促进细胞凋亡的17条途径中,途径14在2h,途径34在6h,途径7在30h,途径13在2h和30h,途径36在6h和30h促进肝细胞凋亡。同时,尚未发现其他途径参与肝细胞增殖和(或)凋亡调控。结论 Caspase信号通路的15条途径和38个基因调控大鼠再生肝的肝细胞凋亡。 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Caspase信号通路 GENOME 230 2.0芯片 荧光定量PCR 大鼠
下载PDF
大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:4
13
作者 杨莹 张丽君 +1 位作者 刘焕之 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期176-180,共5页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等8种细胞,用Rat Genome2302.0芯片等检测生物氧化相关基因在上述细胞中表达变化,用H-Cluster等软件及生物信息学和系统学生物等方法分析它们的表达模式及预示的生理活动.结果表明:38个生物氧化相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,相应细胞的基因数为6,32,0,2,3,1,3,2个.肝再生启动阶段和进展阶段的NAD+合成增强,从NADH到O2的电子传递及ATP合成增强.终止阶段的FADH2分解减弱,从FADH2到O2的电子传递减弱.结论:大鼠肝再生与生物氧化密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Rat GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 生物氧化
下载PDF
JNK信号通路调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡 被引量:2
14
作者 申亚慧 陆琼 +2 位作者 杨彦杰 樊晋宇 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期189-197,共9页
目的从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠再生肝8种细胞中的作用。方法用密度梯度离心和免疫磁珠等方法分离肝细胞(HC)、胆管上皮细胞(BEC)、卵圆细胞(OC)、肝星形细胞(HSC)、窦内皮细胞(SEC)、库普弗细胞(KC)、陷窝细胞(PC)、树突状细... 目的从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠再生肝8种细胞中的作用。方法用密度梯度离心和免疫磁珠等方法分离肝细胞(HC)、胆管上皮细胞(BEC)、卵圆细胞(OC)、肝星形细胞(HSC)、窦内皮细胞(SEC)、库普弗细胞(KC)、陷窝细胞(PC)、树突状细胞(DC)等8种肝脏细胞,用大鼠Genome 230 2.0芯片检测大鼠再生肝8种细胞的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的JNK信号通路在调控大鼠再生肝8种细胞增殖、凋亡中的作用。用实时荧光定量PCR方法验证了芯片结果的可靠性。结果 JNK信号通路涉及240个基因和42条途径,其中,225个基因与大鼠肝再生相关。基因协同作用分析显示,在大鼠肝再生启动阶段,JNK信号通路启动HC和KC增殖,促进OC凋亡,启动部分PC和SEC增殖和促进部分PC和SEC凋亡;在进展阶段,JNK信号通路促进HC、BEC、KC和DC增殖,促进部分PC增殖、部分PC凋亡。在终止阶段,JNK信号通路促进HC、OC和PC凋亡,促进部分KC增殖、部分KC凋亡。结论大鼠肝再生中JNK信号通路的42条途径和225个基因参与调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡。 展开更多
关键词 大鼠肝再生 JNK信号通路 再生8种细胞 GENOME 230 2.0芯片检测 基因协同作用 大鼠
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:1
15
作者 王撒 房连聪 +1 位作者 袁美玲 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期185-188,共4页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为25、33、16、24、15、15、21和18.肝细胞、胆管上皮细胞、窦内皮细胞的通过嘧啶核苷酸前体合成嘧啶核苷酸活动增强,除树突状细胞外其他7种细胞的嘧啶核苷酸分解代谢减弱.结论:大鼠肝再生与嘧啶核苷酸代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 脏细胞 RAT Genome2302.0芯片 基因转录谱 嘧啶核苷酸代谢
下载PDF
建立同类提取法从基因芯片检测数据中挖掘大鼠肝细胞的肝再生关键基因 被引量:1
16
作者 徐存拴 闫春玲 +3 位作者 江云 周运 黄荧 李钧涛 《河南科学》 2013年第6期762-767,共6页
为解析基因芯片检测数据的生物学意义,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度,用F检验大鼠2/3肝切除组(PH)与假手术组(SO)的基因表达差异性和获得大鼠肝细胞的肝再生相关基因,用同类提取法从过滤法计算的差异... 为解析基因芯片检测数据的生物学意义,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度,用F检验大鼠2/3肝切除组(PH)与假手术组(SO)的基因表达差异性和获得大鼠肝细胞的肝再生相关基因,用同类提取法从过滤法计算的差异基因中筛选特征基因,根据特征基因的关联度、参与的生理活动和他人研究结果确认其中的关键基因.结果表明,Ccne1、Egf、Met等57个特征基因在大鼠肝再生中起关键作用. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 过滤法 同类提取法 差异基因 特征基因 关键基因
下载PDF
大鼠再生肝8种细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱预示脂类代谢活动 被引量:1
17
作者 秦波 郭学强 徐存拴 《河南科学》 2010年第7期786-790,共5页
为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱及其预示的脂类代谢活动,按本卷2期张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,... 为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱及其预示的脂类代谢活动,按本卷2期张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的PPARγ信号通路基因表达谱,分析其预示的生理活动.结果表明,41个PPARγ信号通路相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,其中上调、下调和上/下调的基因为9、9、23个,呈现15种表达相关性.相应细胞的基因数为10、6和1,10、12和2,7、7和0,16、8和3,18、7和1,10、6和1,11、20和0,13、9和4.它们的转录谱预示,胆管上皮细胞和星形细胞的脂肪合成、星形细胞和树突状细胞的胆固醇代谢、8种肝脏细胞的脂肪酸运输和脂肪细胞分化、星形细胞、窦内皮细胞和树突状细胞的脂肪酸氧化和糖异生、胆管上皮细胞和树突状细胞的能量代谢增强.上述结果表明,PPARγ信号通路与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome2302.0芯片 PPARγ信号通路 基因表达谱分析
下载PDF
新基因BM390716、BI274487和AA963863与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢
18
作者 王泽 文园园 +3 位作者 程振朝 郭学强 张新胜 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期378-388,共11页
为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Exce... 为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Excel、BLAST等软件分析基因的共表达关系、序列同源性及参与的代谢活动。结果表明,BM390716与pparα同源和共表达,BI274487与timp2同源和共表达,AA963863与csgalnact1同源和共表达。根据上述基因的同源性和共表达推测,新基因BM390716、BI274487和AA963863参与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢。 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome 230 2.0芯片 基因的同源性和共表达 细胞外基质代谢
下载PDF
MSG-肝再生-大鼠下丘脑神经细胞凋亡及相关基因TGF-β_1的表达 被引量:19
19
作者 李瀚旻 杨木兰 +2 位作者 梅家俊 张六通 邱幸凡 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期46-47,93,共3页
目的 :探讨MSG 肝再生 大鼠下丘脑神经细胞凋亡的机理。方法 :光镜、电镜及原位末端标记技术观察MSG 肝再生 大鼠下丘脑弓状核神经细胞凋亡 ;免疫组织化学方法观察ARN的TGF β1的表达。结果 :随着ARN神经细胞凋亡指数 (AI)增高 ,其TGF... 目的 :探讨MSG 肝再生 大鼠下丘脑神经细胞凋亡的机理。方法 :光镜、电镜及原位末端标记技术观察MSG 肝再生 大鼠下丘脑弓状核神经细胞凋亡 ;免疫组织化学方法观察ARN的TGF β1的表达。结果 :随着ARN神经细胞凋亡指数 (AI)增高 ,其TGF β1表达亦相应增强。结论 :神经元胞浆钙离子过度负荷和TGF β1蛋白共同参与了MSG 肝再生 展开更多
关键词 MSG-再生-大鼠 细胞凋亡 ARN神经细胞 TGF-Β1
下载PDF
AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导
20
作者 郝晓霞 秦波 +2 位作者 陈晓光 张丽君 徐存拴 《河南科学》 2010年第9期1103-1107,共5页
为了解新基因AW915115在Notch信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片等检测上述细胞的Notch信号通路基因在大鼠肝再生中的表达变化,用BL... 为了解新基因AW915115在Notch信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片等检测上述细胞的Notch信号通路基因在大鼠肝再生中的表达变化,用BLAST、Microsoft Excel等软件分别分析新基因与已知基因的序列同源性和共表达关系,用生物信息学和系统生物学等方法分析上述基因参与的生理活动.结果表明,AW915115与活化Notch受体的N-乙酰葡糖基转移酶基因lfng同源,并且在2 h和12 h再生肝星形细胞中表达下调.根据上述基因的同源性和共表达关系推测,新基因AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 2302.0芯片 基因转录谱 Notch信号转导
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部