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天料木属植物叶绿体基因组密码子使用偏性分析
1
作者
尹为治
李佳灵
+1 位作者
黄良鸿
方正
《热带林业》
2022年第3期4-10,共7页
为揭示天料木属4种植物叶绿体基因组密码子偏性特征及偏性特征的影响因素,对4种植物叶绿体基因组进行分析,结果显示:天料木属4种植物叶绿体基因组GC含量均不足50%;GC12与GC3双尾检验均呈显著相关(p<0.05);超过60%的基因ENc实际值围...
为揭示天料木属4种植物叶绿体基因组密码子偏性特征及偏性特征的影响因素,对4种植物叶绿体基因组进行分析,结果显示:天料木属4种植物叶绿体基因组GC含量均不足50%;GC12与GC3双尾检验均呈显著相关(p<0.05);超过60%的基因ENc实际值围绕在期望值曲线附近;密码子第3位均存在T/C偏倚;第1轴与CAI值均呈现不同程度的相关性;斯里兰卡天料木、广南天料木和狭叶天料木的亲缘关系较天料木更近。因此得出:突变压力在影响4种植物叶绿体基因组密码子偏性因素中比重较大,但自然选择等因素仍发挥着主要作用。天料木属4种植物有13个相同的最优密码子UUU、UUA、UUG、AUU、GUA、CCU、ACU、GCU、CAA、AAA、GAA、UGU、GGU。但天料木多出4个:GUU、UCU、CCA、AGU。天料木叶绿体基因组密码子偏性不同于其他天料木属3种植物。
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关键词
天料木属植物
叶绿体基因组
密码子偏好性
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职称材料
题名
天料木属植物叶绿体基因组密码子使用偏性分析
1
作者
尹为治
李佳灵
黄良鸿
方正
机构
海南热带雨林国家公园管理局五指山分局
海南大学生态环境学院
出处
《热带林业》
2022年第3期4-10,共7页
文摘
为揭示天料木属4种植物叶绿体基因组密码子偏性特征及偏性特征的影响因素,对4种植物叶绿体基因组进行分析,结果显示:天料木属4种植物叶绿体基因组GC含量均不足50%;GC12与GC3双尾检验均呈显著相关(p<0.05);超过60%的基因ENc实际值围绕在期望值曲线附近;密码子第3位均存在T/C偏倚;第1轴与CAI值均呈现不同程度的相关性;斯里兰卡天料木、广南天料木和狭叶天料木的亲缘关系较天料木更近。因此得出:突变压力在影响4种植物叶绿体基因组密码子偏性因素中比重较大,但自然选择等因素仍发挥着主要作用。天料木属4种植物有13个相同的最优密码子UUU、UUA、UUG、AUU、GUA、CCU、ACU、GCU、CAA、AAA、GAA、UGU、GGU。但天料木多出4个:GUU、UCU、CCA、AGU。天料木叶绿体基因组密码子偏性不同于其他天料木属3种植物。
关键词
天料木属植物
叶绿体基因组
密码子偏好性
Keywords
Homalium plants
Chloroplast genome
Codon usage bias
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
天料木属植物叶绿体基因组密码子使用偏性分析
尹为治
李佳灵
黄良鸿
方正
《热带林业》
2022
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