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草鱼天然抗性相关巨噬蛋白基因全长cDNA的克隆与表达分析 被引量:4
1
作者 范玉顶 徐进 +3 位作者 罗晓松 周勇 肖艺 曾令兵 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期38-47,共10页
天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp... 天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp家族的特征序列:包含12个跨膜区(TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运结构域(CTM)。草鱼Nramp同其他16个物种的Nramp氨基酸序列同源性在62.5%~90.2%之间。草鱼Nramp基因cDNA的独特结构是其3′末端非翻译区(UTR)和5′UTR各有1个脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(IRE)。系统进化分析表明,草鱼Nramp和所有鱼类Nramp聚为一簇,与哺乳类Nramp2的亲缘关系较近。Nramp基因在草鱼头肾和脾脏中的表达量最高,在肌肉和皮肤中的表达量最低,在草鱼呼肠孤病毒(GCRV)感染的草鱼肾脏细胞系(CIK)中的表达量明显升高。 展开更多
关键词 草鱼 天然抗性巨噬蛋白基因(Nramp) CDNA 表达 RT-PCR RACE
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真鲷天然抗性相关巨噬蛋白全长cDNA的克隆与序列分析 被引量:2
2
作者 徐美瑜 陈松林 +1 位作者 沙珍霞 季相山 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期128-132,共5页
Natural resistance associated macrophage protein (Nramp) is an innate resistance protein to intracellular parasites, which is expressed plentifully in macrophage cells. Nramp has been studied in mouse, human, cattle, ... Natural resistance associated macrophage protein (Nramp) is an innate resistance protein to intracellular parasites, which is expressed plentifully in macrophage cells. Nramp has been studied in mouse, human, cattle, rainbow trout and channel catfish. However, little was known about the structure of Pagrus major Nramp. In order to get the complete sequence of Pagrus major Nramp, a pair of primer is designed according to a 200bp known sequence of Pagrus major Nramp cDNA. By the use of SMART RACE, the full Nramp of Pagrus major cDNA about 5 000 bp was obtained, including about 200 bp 5′ terminal region (UTR), complete encoding region and 3′ terminal region. There were 3 ployA signals, which showed many possibilities of cutting at 3′ terminal region. The character of Pagrus major Nramp nucleotide sequence and deduced amino acid sequence are analyzed. 12 putative transmembrane(TM) regions, a consensus transport motif (CTM), a predicted protein kinase C phosphroylation site and three predicted N-link glycosylation sites are indicated in its deduced amino acid sequence. The ’consense transport motif’ CTM is located between TM8 and TM9. Furthermore, a protein kinase C phosphroylation site and three N-link glycosylation sites were predicted. The alignment of amino acid sequences between Pagrus major Nramp cDNA and several animals is analyzed and the deduced amino acid sequence of Pagrus major Nramp had 77.8%, 83.0%, 82.3%, 80.0%, 81.1%, 60.4%, 70.3%, 58.5%, 69.5% identity with rainbow trout α(AAD20721), rainbow trout β (AAD20722), channel catfish(AF400108), fathead minnow (AAF01778), common carp (CAB60196), mouse 1(AAA39838), mouse 2(AAC42051), human 1(D50403), human 2(NP-000608), respectively. The alignment reveals high conservation in TM and CTM regions. Analysis result makes us get familiar with the structure and character of fish Nramp, furthermore, offers some information for the enhancement of immunity of fish and genetic amelioration on fish breeding. 展开更多
关键词 真鲷 天然抗性相关巨噬蛋白 CDNA末端快速扩增 序列分析
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藏猪天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因克隆及变异研究 被引量:4
3
作者 郑王山 程箫 赵生国 《畜牧兽医杂志》 2015年第6期1-6,9,共7页
采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779... 采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779bp,其中包含14个内含子、15外显子,编码区全长1614bp,编码538个氨基酸。5'端非编码区存在2个核苷酸突变,3'端非编码区存在有10个核苷酸突变和1个碱基缺失,14个内含子存在11个变异位点。外显子有18个碱基突变,仅有4个有义突变位点(T2551G、A2552T、C4881A、T12113C),分别导致四个氨基酸(100(V→G)、100(V→G)、137(P→T)、471(L→P))的改变,有可能引起NRAMP1基因编码所蛋白质的跨膜结构域、三级结构或更高级结构以及其空间排列发生变化,导致藏猪和其他猪种抗病性存在差异,为揭示猪NRAMP1基因抗病性的分子机理奠定了理论基础。 展开更多
关键词 天然抗性相关巨噬细胞蛋白 藏猪 分子机理
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Mycogen开发出对玉米根蠕虫具有天然抗性的杂种
4
作者 朱遐 《生物技术通报》 CAS CSCD 1994年第1期32-32,共1页
Mycogen公司宣布,其Agrigenetics植物科学子公司开发出抗玉米蠕虫Diabrotica spp.(玉米生产中的主要害虫)的玉米植株。 Mycogen的总裁兼CEO Jerry Caulder指出:公司已对将天然玉米植物中的抗根蠕虫遗传物质导入其优质商商化杂种的方法... Mycogen公司宣布,其Agrigenetics植物科学子公司开发出抗玉米蠕虫Diabrotica spp.(玉米生产中的主要害虫)的玉米植株。 Mycogen的总裁兼CEO Jerry Caulder指出:公司已对将天然玉米植物中的抗根蠕虫遗传物质导入其优质商商化杂种的方法克发明申请专利保护。他预测种植对玉米根蠕虫具有天然抗性的种子将在4~5年内实现商品化。 展开更多
关键词 玉米根 Mycogen 天然抗性 玉米带 玉米植株 植物科学 玉米作物 美国玉米 杀昆虫剂 玉米地
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香蕉天然抗性淀粉测定方法的比较 被引量:14
5
作者 范媛媛 毛联凯 +2 位作者 夏雨 江东文 杨公明 《食品科技》 CAS 北大核心 2011年第5期256-259,共4页
目的:探求天然抗性淀粉最佳测定方法。方法:通过对抗性淀粉的多种测定方法进行筛选,选出其中3种方法,以抗性淀粉的含量为指标,进行体外实验和比较分析。结果:McCleary法检测到的抗性淀粉含量最高,稳定性最好。结论:测量天然抗性淀粉含... 目的:探求天然抗性淀粉最佳测定方法。方法:通过对抗性淀粉的多种测定方法进行筛选,选出其中3种方法,以抗性淀粉的含量为指标,进行体外实验和比较分析。结果:McCleary法检测到的抗性淀粉含量最高,稳定性最好。结论:测量天然抗性淀粉含量的体外测定方法还需要进一步的体内实验来验证。 展开更多
关键词 香蕉 天然抗性淀粉 测定方法
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几种纺织纤维的天然抗菌性 被引量:11
6
作者 席丽霞 覃道春 《上海纺织科技》 北大核心 2011年第5期9-11,共3页
以大肠杆菌(8099)、金黄色葡萄球菌(ATCC 6538)和白色念珠菌(ATCC10231)为代表菌株,以棉纤维为对照材料,参照我国纺织品测试标准GB/T 20944.3—2008,采用振荡法测试并比较了竹纤维、黄麻、亚麻和苎麻纤维以及竹浆粘胶纤维的抑菌率,研究... 以大肠杆菌(8099)、金黄色葡萄球菌(ATCC 6538)和白色念珠菌(ATCC10231)为代表菌株,以棉纤维为对照材料,参照我国纺织品测试标准GB/T 20944.3—2008,采用振荡法测试并比较了竹纤维、黄麻、亚麻和苎麻纤维以及竹浆粘胶纤维的抑菌率,研究结果表明:苎麻纤维对金黄色葡萄球菌具有一定的抑菌效果;竹浆粘胶纤维不利于细菌的生长和繁殖;竹原纤维不具有天然抗菌性,并通过不同形态竹材的抗菌性实验对此结论进行了验证。 展开更多
关键词 竹纤维 纺织纤维 天然 测试
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天然植物性抗柔嫩艾美耳球虫微粉制剂的效力试验 被引量:8
7
作者 孟新宇 赵枝新 +1 位作者 赵其平 金岭梅 《中兽医医药杂志》 2005年第3期39-40,共2页
关键词 天然植物柔嫩艾美耳球虫制剂 微粉制剂 效力试验 球虫病
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天然植物性抗氧化剂在食品工业中的应用 被引量:9
8
作者 吴京平 《北京联合大学学报》 CAS 2007年第2期63-66,共4页
简单概述了国内外天然植物性抗氧化剂的研究状况,具体分述了对茶叶、香辛料、果蔬类植物和中草药的抗氧化性能的研究进展和成果,介绍了3种新型天然食品抗氧化剂,并就植物性天然抗氧化剂与合成抗氧化剂的抗氧化性能做出比较,指出今后植... 简单概述了国内外天然植物性抗氧化剂的研究状况,具体分述了对茶叶、香辛料、果蔬类植物和中草药的抗氧化性能的研究进展和成果,介绍了3种新型天然食品抗氧化剂,并就植物性天然抗氧化剂与合成抗氧化剂的抗氧化性能做出比较,指出今后植物性天然抗氧化剂的研究方向,为开发、利用天然食品抗氧化剂提供信息和参考。 展开更多
关键词 天然植物氧化剂 天然食用植物 中草药 氧化
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大麻针织产品天然抗菌性的研究 被引量:5
9
作者 张一平 席宇 憨文轩 《针织工业》 2009年第12期38-40,共3页
针对大麻纤维及其混纺产品,以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌为例,测试其抗菌性,分析了大麻纤维具有天然抗菌性的原因,以及混纺纱线中大麻纤维含量和不同染整工艺对大麻棉混纺针织罗纹试样抗菌性的影响。结果表明,纯大麻纤维对大肠杆菌和金... 针对大麻纤维及其混纺产品,以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌为例,测试其抗菌性,分析了大麻纤维具有天然抗菌性的原因,以及混纺纱线中大麻纤维含量和不同染整工艺对大麻棉混纺针织罗纹试样抗菌性的影响。结果表明,纯大麻纤维对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌有较高的抑菌效果,而大麻混纺纱线只对大肠杆菌有抑菌作用,且随大麻纤维含量的增加而增大;染整工艺对大麻棉混纺针织罗纹试样的抗菌性有一定的影响。 展开更多
关键词 大麻纤维 针织面料 混纺纱 天然 染整工艺
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新型天然植物性抗菌洗洁精及其抗菌试验 被引量:4
10
作者 江贵波 郑元滨 吴练彬 《廊坊师范学院学报(自然科学版)》 2012年第1期49-50,共2页
为了确定新型天然植物性抗菌洗洁精的杀菌效果,文中采用水蒸气蒸馏法提取了艾草地上部分的挥发油,将其挥发油与自制洗洁精复配,制成了天然植物性抗菌洗洁精,并以市售的洗洁精作对照,对天然植物性抗菌洗洁精的杀菌效果进行了研究。实验... 为了确定新型天然植物性抗菌洗洁精的杀菌效果,文中采用水蒸气蒸馏法提取了艾草地上部分的挥发油,将其挥发油与自制洗洁精复配,制成了天然植物性抗菌洗洁精,并以市售的洗洁精作对照,对天然植物性抗菌洗洁精的杀菌效果进行了研究。实验结果表明:添加了艾草挥发油的天然植物性抗菌洗洁精有明显的杀菌效果,具有很大的研究和利用潜力。 展开更多
关键词 天然植物菌洗洁精 艾草 挥发油 杀菌作用 葡萄糖酚红肉汤
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染整工艺对大麻纤维天然抗菌性能的影响 被引量:2
11
作者 邢江元 郑振荣 +3 位作者 黄胶 朱文双 吕兴倩 智伟 《现代纺织技术》 2020年第5期64-68,共5页
为保留大麻纤维的天然抗菌性能,分别采用传统化学法、化学-生物酶法和草酸铵-复合酶法对大麻纤维脱胶,并分别选用直接、活性和还原染料对大麻纤维进行染色,探索染色助剂对大麻纤维天然抗菌性能的影响规律。结果表明:采用草酸铵-复合酶... 为保留大麻纤维的天然抗菌性能,分别采用传统化学法、化学-生物酶法和草酸铵-复合酶法对大麻纤维脱胶,并分别选用直接、活性和还原染料对大麻纤维进行染色,探索染色助剂对大麻纤维天然抗菌性能的影响规律。结果表明:采用草酸铵-复合酶法对大麻纤维脱胶,其抑菌率优于传统化学法和化学-生物酶法,且大麻纤维的残胶率最低;采用活性染料或直接染料对大麻纤维染色,抑菌率分别为45.87%和44.73%,优于还原染料抑菌率0%;当分别采用15 g/L Na 2CO 3、NaOH和NaCl水溶液在60℃处理大麻纤维,发现大麻纤维的抑菌率分别下降39.55%、100%和21.67%,由此可知,NaOH对大麻纤维抗菌性能的影响最大,Na 2CO 3次之,NaCl最小。 展开更多
关键词 大麻纤维 染整工艺 天然 染色助剂 抑菌率
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脂溶性天然抗氧化剂对甲鱼油稳定性的影响 被引量:3
12
作者 宋恭帅 张蒙娜 +4 位作者 俞喜娜 王杰 王宏海 李诗言 沈清 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第10期184-191,202,共9页
为探究三种脂溶性天然抗氧化剂(脂溶性茶多酚(LTP)、维生素E(VE)、脂溶性迷迭香提取物(LRO))对甲鱼油稳定性的影响,以甲鱼油为原料,采用Schaal加速氧化法,添加不同浓度梯度(0.02%、0.04%、0.06%、0.08%)的LTP、VE、LRO,定期测定甲鱼油... 为探究三种脂溶性天然抗氧化剂(脂溶性茶多酚(LTP)、维生素E(VE)、脂溶性迷迭香提取物(LRO))对甲鱼油稳定性的影响,以甲鱼油为原料,采用Schaal加速氧化法,添加不同浓度梯度(0.02%、0.04%、0.06%、0.08%)的LTP、VE、LRO,定期测定甲鱼油的酸价(AV)、过氧化值(POV)及挥发性成分,确定最佳的抗氧化剂添加量;并在最佳添加量条件下,比较三种抗氧化剂对甲鱼油AV、POV、脂肪酸含量的差异。结果表明,LTP、LRO、V_E能有效减缓甲鱼油的氧化速率,当其添加量分别为0.06%、0.04%、0.08%时,随贮藏时间增加,甲鱼油中AV、POV增长速率最慢,且具有强烈鱼腥味等不良气味的壬醛、己醛、1-戊烯-3-醇及表征油脂氧化酸败程度的乙酸、丁酸的峰面积变化最小。对比三种抗氧化剂对甲鱼油中脂肪酸组成的作用效果,发现0.04%LRO的抗氧化性最强,0.06%LTP次之,0.08%VE最弱。本实验结果对抗氧化剂的选择、提高贮藏稳定性及延长货架期提供理论参考,对促进甲鱼加工过程中内脏和脂肪块的综合利用有工业化指导意义。 展开更多
关键词 脂溶天然氧化剂 甲鱼油 脂肪酸组成 挥发成分 稳定
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东方田鼠天然抗日本血吸虫感染相关蛋白质的分离和纯化 被引量:7
13
作者 邬国军 胡维新 +4 位作者 秦志强 罗赛群 俞远京 王勇 彭兴华 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第8期688-692,共5页
目的从东方田鼠血清中分离纯化与其天然抗日本血吸虫感染特性相关的蛋白质。方法以分子筛色谱及高效液相色谱技术对东方田鼠血清蛋白质进行分离和纯化,以体外日本血吸虫童虫杀伤实验确定具有抗日本血吸虫童虫活性蛋白质,并对活性蛋白质... 目的从东方田鼠血清中分离纯化与其天然抗日本血吸虫感染特性相关的蛋白质。方法以分子筛色谱及高效液相色谱技术对东方田鼠血清蛋白质进行分离和纯化,以体外日本血吸虫童虫杀伤实验确定具有抗日本血吸虫童虫活性蛋白质,并对活性蛋白质进行N端氨基酸序列测定,通过检索蛋白质数据库以确定活性蛋白质的性质和种类。结果利用分子筛色谱及高效液相色谱技术从东方田鼠血清中获得了三个对日本血吸虫童虫具有明显杀伤活性的蛋白质组份1-1、4-1、6-3,经对4-1的N末端氨基酸序列进行测定,其序列为DAHKSEIAHR,检索蛋白质数据库,该蛋白质为白蛋白样蛋白质,但与人或其它动物的白蛋白进行比较,存在较大程度的氨基酸残基变。结论东方田鼠血清中的白蛋白是东方田鼠天然抗日本血吸虫感染的重要效应分子。 展开更多
关键词 东方田鼠 日本血吸虫 天然抗性 感染
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东方田鼠天然抗日本血吸虫病机制研究进展 被引量:5
14
作者 邬国军 胡维新 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期227-229,共3页
东方田鼠在分类学上是属于哺乳动物纲、啮齿目、仓鼠科、田鼠亚科、田鼠属的一种有害鼠类,在我国广泛分布,在与我国接壤的朝鲜、韩国及俄罗斯等地的沼泽地带也可见其踪迹。该鼠在我国的分布主要集中在长江流域,特别是日本血吸虫病流... 东方田鼠在分类学上是属于哺乳动物纲、啮齿目、仓鼠科、田鼠亚科、田鼠属的一种有害鼠类,在我国广泛分布,在与我国接壤的朝鲜、韩国及俄罗斯等地的沼泽地带也可见其踪迹。该鼠在我国的分布主要集中在长江流域,特别是日本血吸虫病流行区洞庭湖湖洲,是该地域的一个优势鼠种。该鼠是分布地农作物的一种主要鼠害,同时也是日本血吸虫的非适宜宿主,具有天然完全抗日本血吸虫病的特性,它的这一特性为消灭日本血吸虫病带来了新希望, 展开更多
关键词 血吸虫病 日本 田鼠亚科 天然抗性
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新型L-谷氨酸噬菌体广谱抗性菌的选育途径
15
《发酵科技通讯》 CAS 1991年第1期58-58,共1页
噬菌体业已成为味精行业的一大公害。为消除噬菌体污染,人们进行了不懈努力。传统的方法是以生产菌本身(目前国内普通使用 T<sub>6-13</sub>或其衍生株)为亲株,通过诱变或融合处理选育噬菌体抗性株,这类菌株虽具有噬菌体抗... 噬菌体业已成为味精行业的一大公害。为消除噬菌体污染,人们进行了不懈努力。传统的方法是以生产菌本身(目前国内普通使用 T<sub>6-13</sub>或其衍生株)为亲株,通过诱变或融合处理选育噬菌体抗性株,这类菌株虽具有噬菌体抗性,但因其细胞外层结构已不可避免地遭受损伤,导致产酸和提取性状恶化,难以在工业生产中推广应用。 展开更多
关键词 L-谷氨酸 广谱 味精行业 亲株 噬菌体菌 工业生产 乳糖发酵短杆菌 天然抗性 味精厂 生物化学制药
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天然抗氧化剂在食品加工中的应用
16
作者 黄娜 《中国化工贸易》 2012年第11期121-121,共1页
本文对国内外研究天然植物性抗氧化剂的状况进行了阐述,对植物香辛料、茶叶、果蔬类植物的抗氧化性能进行了具体的研究,介绍了3种新型天然食品抗氧化剂,并指出今后研究植物性天然杭氧化剂的方向,为利用、开发天然食品抗氧化剂提供... 本文对国内外研究天然植物性抗氧化剂的状况进行了阐述,对植物香辛料、茶叶、果蔬类植物的抗氧化性能进行了具体的研究,介绍了3种新型天然食品抗氧化剂,并指出今后研究植物性天然杭氧化剂的方向,为利用、开发天然食品抗氧化剂提供参考和信息。 展开更多
关键词 天然植物氧化剂 氧化 食用植物
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抗结核病基因及相关因子的研究进展
17
作者 陈元圆 马勋 +2 位作者 薄新文 黄新 贾文俊 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第6期28-30,共3页
结核病以其高传染性和高死亡率受到世界各国的普遍关注。尽管,结核病的治疗还是以药物为主,但抗结核病基因Ipr1、SP110以及相关因子的发现,将结核病的治疗与研究推上了一个新的台阶。文章就抗结核基因和相关因子的研究概况以及今后的发... 结核病以其高传染性和高死亡率受到世界各国的普遍关注。尽管,结核病的治疗还是以药物为主,但抗结核病基因Ipr1、SP110以及相关因子的发现,将结核病的治疗与研究推上了一个新的台阶。文章就抗结核基因和相关因子的研究概况以及今后的发展趋势进行综述,旨在为有效控制结核病的发生、发展提供帮助。 展开更多
关键词 结核基因 相关因子 天然抗性巨噬细胞蛋白(NRAMP) Ipr1 Sp110
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洗洁精抗菌效果比较 被引量:1
18
作者 江贵波 吴练彬 郑元滨 《深圳职业技术学院学报》 CAS 2012年第1期35-36,47,共3页
采用水蒸气蒸馏法提取艾草和三裂叶蟛蜞菊地上部分的挥发油,研究了它们的挥发油和自制洗洁精复配制成的天然植物性抗菌洗洁精与市售洗洁精抑菌效果.结果表明,添加挥发油的天然植物性抗菌洗洁精比市售白猫洗洁精抑菌效果好,含挥发油的天... 采用水蒸气蒸馏法提取艾草和三裂叶蟛蜞菊地上部分的挥发油,研究了它们的挥发油和自制洗洁精复配制成的天然植物性抗菌洗洁精与市售洗洁精抑菌效果.结果表明,添加挥发油的天然植物性抗菌洗洁精比市售白猫洗洁精抑菌效果好,含挥发油的天然植物性抗菌洗洁精具有很好的开发和实用价值. 展开更多
关键词 天然植物挥发油 天然植物菌洗洁精 菌作用 分光光度法
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转基因小鼠产生全人抗体
19
作者 朱遐 《生物技术通报》 CAS CSCD 1994年第6期24-24,共1页
GenPharm International Inc.和Cell Genesys Inc.分别研究、但几乎同时报道它们在转基因小鼠中生产了全人抗体。这一成果为利用单克隆抗体(Mab)治疗慢性病开辟了途径,而过去因小鼠的致免疫性、嵌合和“人化”Mab很难考虑这一疗法。
关键词 全人 转基因小鼠 单克隆 天然抗性 传染病研究所 LILLY 过敏症 研究与开发 IGG GENETICS
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苦荞NRAMP家族全基因组鉴定
20
作者 李明锴 《生物化工》 CAS 2024年第2期11-17,33,共8页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组... 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组中鉴定出11个NRAMP基因,并通过TBtools、Cell-PLoc、MEGA、SWISS-MODEL、SOPMA等工具对该家族成员的理化性质、保守基序、基因结构、系统发育关系、三维结构、顺式作用元件等方面进行了系统分析。结果发现,苦荞NRAMP基因家族在相同亚族下的保守基序和基因结构高度一致。此外,苦荞NRAMP基因的启动子区域中含有大量植物激素响应元件及胁迫响应元件,亚族间的元件分布存在明显差异。对苦荞NRAMP基因编码蛋白的三维结构、亚细胞定位以及顺式作用元件分析发现,FtNRAMP4、FtNRAMP10、FtNRAMP11三个成员和其他FtNRAMP具有差异。苦荞NRAMP蛋白的二级结构以α-螺旋为主,占比为35.37%~63.00%。本研究结果为深入挖掘苦荞NRAMP基因家族功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP) 苦荞 基因家族 生物信息学
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