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藏猪天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因克隆及变异研究 被引量:4
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作者 郑王山 程箫 赵生国 《畜牧兽医杂志》 2015年第6期1-6,9,共7页
采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779... 采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779bp,其中包含14个内含子、15外显子,编码区全长1614bp,编码538个氨基酸。5'端非编码区存在2个核苷酸突变,3'端非编码区存在有10个核苷酸突变和1个碱基缺失,14个内含子存在11个变异位点。外显子有18个碱基突变,仅有4个有义突变位点(T2551G、A2552T、C4881A、T12113C),分别导致四个氨基酸(100(V→G)、100(V→G)、137(P→T)、471(L→P))的改变,有可能引起NRAMP1基因编码所蛋白质的跨膜结构域、三级结构或更高级结构以及其空间排列发生变化,导致藏猪和其他猪种抗病性存在差异,为揭示猪NRAMP1基因抗病性的分子机理奠定了理论基础。 展开更多
关键词 天然相关细胞蛋白 藏猪 分子机理
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草鱼天然抗性相关巨噬蛋白基因全长cDNA的克隆与表达分析 被引量:4
2
作者 范玉顶 徐进 +3 位作者 罗晓松 周勇 肖艺 曾令兵 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期38-47,共10页
天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp... 天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp家族的特征序列:包含12个跨膜区(TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运结构域(CTM)。草鱼Nramp同其他16个物种的Nramp氨基酸序列同源性在62.5%~90.2%之间。草鱼Nramp基因cDNA的独特结构是其3′末端非翻译区(UTR)和5′UTR各有1个脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(IRE)。系统进化分析表明,草鱼Nramp和所有鱼类Nramp聚为一簇,与哺乳类Nramp2的亲缘关系较近。Nramp基因在草鱼头肾和脾脏中的表达量最高,在肌肉和皮肤中的表达量最低,在草鱼呼肠孤病毒(GCRV)感染的草鱼肾脏细胞系(CIK)中的表达量明显升高。 展开更多
关键词 草鱼 天然蛋白基因(nramp) CDNA 表达 RT-PCR RACE
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真鲷天然抗性相关巨噬蛋白全长cDNA的克隆与序列分析 被引量:2
3
作者 徐美瑜 陈松林 +1 位作者 沙珍霞 季相山 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期128-132,共5页
Natural resistance associated macrophage protein (Nramp) is an innate resistance protein to intracellular parasites, which is expressed plentifully in macrophage cells. Nramp has been studied in mouse, human, cattle, ... Natural resistance associated macrophage protein (Nramp) is an innate resistance protein to intracellular parasites, which is expressed plentifully in macrophage cells. Nramp has been studied in mouse, human, cattle, rainbow trout and channel catfish. However, little was known about the structure of Pagrus major Nramp. In order to get the complete sequence of Pagrus major Nramp, a pair of primer is designed according to a 200bp known sequence of Pagrus major Nramp cDNA. By the use of SMART RACE, the full Nramp of Pagrus major cDNA about 5 000 bp was obtained, including about 200 bp 5′ terminal region (UTR), complete encoding region and 3′ terminal region. There were 3 ployA signals, which showed many possibilities of cutting at 3′ terminal region. The character of Pagrus major Nramp nucleotide sequence and deduced amino acid sequence are analyzed. 12 putative transmembrane(TM) regions, a consensus transport motif (CTM), a predicted protein kinase C phosphroylation site and three predicted N-link glycosylation sites are indicated in its deduced amino acid sequence. The ’consense transport motif’ CTM is located between TM8 and TM9. Furthermore, a protein kinase C phosphroylation site and three N-link glycosylation sites were predicted. The alignment of amino acid sequences between Pagrus major Nramp cDNA and several animals is analyzed and the deduced amino acid sequence of Pagrus major Nramp had 77.8%, 83.0%, 82.3%, 80.0%, 81.1%, 60.4%, 70.3%, 58.5%, 69.5% identity with rainbow trout α(AAD20721), rainbow trout β (AAD20722), channel catfish(AF400108), fathead minnow (AAF01778), common carp (CAB60196), mouse 1(AAA39838), mouse 2(AAC42051), human 1(D50403), human 2(NP-000608), respectively. The alignment reveals high conservation in TM and CTM regions. Analysis result makes us get familiar with the structure and character of fish Nramp, furthermore, offers some information for the enhancement of immunity of fish and genetic amelioration on fish breeding. 展开更多
关键词 真鲷 天然相关蛋白 CDNA末端快速扩增 序列分析
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烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析 被引量:1
4
作者 陈邦兰 翟梦倩 +6 位作者 龙涛 赵顺程 刘娟 尹茂灵 万心言 王治杰 刘继恺 《安徽农业科学》 CAS 2021年第3期100-104,109,共6页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信... 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 自然相关细胞蛋白 烟草 基因家族 表达分析
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因与云南汉族人肺结核易感性的相关性研究
5
作者 高学祯 孙凯琳 +2 位作者 陆霓虹 沈莉 王毅鹏 《蚌埠医学院学报》 CAS 2019年第10期1301-1304,共4页
目的:探究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因D543N、INT4位点多态性与肺结核易感的相关性。方法:采用病例-对照研究,挑选122例痰涂片阳性的云南汉族活动性肺结核病人为病例组,另选同期101名与病例组民族、年龄、性别相匹配的健康... 目的:探究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因D543N、INT4位点多态性与肺结核易感的相关性。方法:采用病例-对照研究,挑选122例痰涂片阳性的云南汉族活动性肺结核病人为病例组,另选同期101名与病例组民族、年龄、性别相匹配的健康体检者为对照组。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对2组入选者NRAMP1基因D543N、INT4位点多态性进行分型。结果:INT4位点野生纯合子(G/G)、杂合子(G/C)、突变纯合子(C/C)在病例组和对照组的分布频率分别为66.4%、32.0%、1.6%和86.1%、12.9%、1.0%,2组差异有统计学意义(P<0.01),其中杂合型(G/C)携带者肺结核的患病风险为野生纯合型(G/G)的3.22倍(95%CI:1.61~6.47)。而D543N位点野生纯合子(G/G)、杂合子(G/A)、突变纯合子(A/A)在病例组和对照组的分布频率分别为61.5%、36.9%、1.6%和70.3%、29.7%、0%,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:基因INT4位点多态性可能影响云南汉族人群对肺结核的易感性。 展开更多
关键词 肺结核 自然相关细胞蛋白1基因 多态
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因多态性与肺结核易感性的研究 被引量:10
6
作者 刘玮 张翠英 +7 位作者 田磊 李春芝 吴晓明 赵秋敏 张泮河 杨淑梅 杨红 曹务春 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期408-411,共4页
目的 探讨自然抗性相关巨噬细胞蛋白 1基因 (NRAMP1)多态性与中国汉族人群肺结核发病的关系。方法 采用以医院为基础的病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)法检测NRAMP1基因中INT4、D5 4 3N及 3′... 目的 探讨自然抗性相关巨噬细胞蛋白 1基因 (NRAMP1)多态性与中国汉族人群肺结核发病的关系。方法 采用以医院为基础的病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)法检测NRAMP1基因中INT4、D5 4 3N及 3′UTR 3个多态性位点的基因型 ,并对结核病相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件logistic回归分析。2 0 0 1年 4月至 2 0 0 2年 6月选择 110例肺结核病例 ,平均年龄为 (2 8± 13)岁 ;对照组为 180名健康体检者 ,平均年龄为 (2 7± 9)岁。对NRAMP1基因各多态性位点进行单因素分析。结果 病例组D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 2 2 2 (1 0 3~ 4 78)和 1 93(1 14~ 3 2 6 )。病例组和对照INT4各基因型频率比较差异无显著性。多因素分析调整暴露史和疫苗接种史 2个因素后 ,D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型仍与结核病显著相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3 0 4 (1 12~ 8 2 7)和 2 36 (1 2 0~ 4 6 4 ) ,而病例和对照组INT4位点多态性比较差异未见显著性。结论 NRAMP1基因D5 4 3N及 3′UTR位点多态性可能是汉族人群肺结核的易感因素。 展开更多
关键词 自然相关细胞蛋白1基因 基因多态 肺结核 易感 中国 汉族人群
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青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性
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作者 曹雪平 王兆芬 +4 位作者 王玉清 李斌 李咏雪 王玲 韩晓茹 《中国高原医学与生物学杂志》 2022年第1期44-50,共7页
目的研究青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。方出采用病例一对照研究,收集世居青海地区的273例肺结核患者为结核组,另选289名与结核组年龄、性别、民族、世居地相匹配的非结核患者为对照组。采用聚合酶链反应(PCR)技术扩... 目的研究青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。方出采用病例一对照研究,收集世居青海地区的273例肺结核患者为结核组,另选289名与结核组年龄、性别、民族、世居地相匹配的非结核患者为对照组。采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增3'UTR、D543NJNT4位点基因并测定基因型,分析青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。结果(1)3'UTR位点TGTG/TGTG和TGTG/del+del/del基因型在结核组和对照组的分布频率分别为78.39%、21.61%和88.58%,11.42%,组间差异有统计学意义(P=0.001),TGTG/del+del/del基因型携带者患结核病的风险为野生纯合型TGTG/TGTG人群的2.139(1.354-3.440)倍,两组间TGTG.del等位基因频率有统计学差异(P=0.001);(2)D543N位点GG、GA基因型在结核组和对照组的分布频率分别为86.81%、13.19%和92.73%,7.27%,未见突变纯合子AA,组间差异有统计学意义(P<0.05),GA基因型携带者结核病的患病风险为野生纯合型GG的1.939(1.108~3.345)倍,两组间G、A等位基因频率有统计学差异(P<0.05);(3)INT4位点GG.GC+CC基因型在结核组和对照组的分布频率分别为8&64%、11.36%和90.66%、9.33%,无统计学差异(P>0.05),两组间G、C等位基因频率无统计学意义(P>0.05)o结论(l)NRAMPl基因3'UTR及D543N位点多态性可能与青海地区人群肺结核有关;(2)NRAMP1基因3'UTR-del及D543N-A等位基因可能与青海地区结核病易感性有关;(3)INT4位点多态性可能与青海地区人群对结核病的易感性无关。提示青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性相关。 展开更多
关键词 自然相关细胞蛋白1(nramp1) 多态 结核 易感
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因及其与结核病的关系
8
作者 李锋 李凫坚 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期319-320,共2页
结核病在世界范围内的卷土重来引起人们的再次关注。在感染人群中,发病个体仅占1/10,提示遗传背景差异可能与结核病易感性有关。自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1.NRAMP1)基因是目... 结核病在世界范围内的卷土重来引起人们的再次关注。在感染人群中,发病个体仅占1/10,提示遗传背景差异可能与结核病易感性有关。自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1.NRAMP1)基因是目前研究较多的结核病易感基因之一,我们就NRAMP1基因及其与结核病的关系作一综述。 展开更多
关键词 自然相关细胞蛋白1基因 结核病 nramp1基因 PROTEIN 世界范围 感染人群 遗传背景 易感基因
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HBV相关原发性肝癌患者外周血MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ的表达及意义 被引量:6
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作者 李欢 韩素桂 董宇曦 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第10期1171-1175,共5页
目的分析乙型肝炎病毒(HBV)相关原发性肝癌患者外周血巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、高尔基体糖蛋白73(GP73)、维生素K缺乏或拮抗诱导的异常蛋白Ⅱ(VPIKA-Ⅱ)的水平及意义。方法选取2019年3月至2020年4月该院收治的72例HBV相关原发性肝癌... 目的分析乙型肝炎病毒(HBV)相关原发性肝癌患者外周血巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、高尔基体糖蛋白73(GP73)、维生素K缺乏或拮抗诱导的异常蛋白Ⅱ(VPIKA-Ⅱ)的水平及意义。方法选取2019年3月至2020年4月该院收治的72例HBV相关原发性肝癌患者纳入HBV相关原发性肝癌组,同时选取于该院进行健康体检的72例志愿者纳入健康对照组,选取72例无HBV感染原发性肝癌患者作为无HBV感染原发性肝癌组。采用酶联免疫吸附试验检测MIF、VPIKA-Ⅱ、GP73水平。结果HBV相关原发性肝癌组MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ水平明显高于无HBV相关原发性肝癌组和健康对照组。HBV相关原发性肝癌组中,有淋巴结转移患者MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ水平高于无淋巴结转移患者,Ⅲ~Ⅳ期患者MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ水平高于Ⅰ~Ⅱ期患者,肿瘤最大径>5 cm患者MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ水平高于肿瘤最大径≤5 cm患者,肿瘤数量>2个患者MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ水平高于肿瘤数量≤2个患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。MIF与GP73呈正相关(r=0.240,P=0.042),MIF与VPIKA-Ⅱ呈正相关(r=0.368,P=0.002),GP73与VPIKA-Ⅱ呈正相关(r=0.240,P=0.042)。结论MIF、GP73、VPIKA-Ⅱ与HBV相关原发性肝癌患者有无淋巴结转移、TNM分期、肿瘤最大径和肿瘤数量关系密切。 展开更多
关键词 细胞移动抑制因子 高尔基体糖蛋白73 维生素K缺乏或拮诱导的异常蛋白 乙型肝炎病毒相关原发肝癌
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抗结核病基因及相关因子的研究进展
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作者 陈元圆 马勋 +2 位作者 薄新文 黄新 贾文俊 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第6期28-30,共3页
结核病以其高传染性和高死亡率受到世界各国的普遍关注。尽管,结核病的治疗还是以药物为主,但抗结核病基因Ipr1、SP110以及相关因子的发现,将结核病的治疗与研究推上了一个新的台阶。文章就抗结核基因和相关因子的研究概况以及今后的发... 结核病以其高传染性和高死亡率受到世界各国的普遍关注。尽管,结核病的治疗还是以药物为主,但抗结核病基因Ipr1、SP110以及相关因子的发现,将结核病的治疗与研究推上了一个新的台阶。文章就抗结核基因和相关因子的研究概况以及今后的发展趋势进行综述,旨在为有效控制结核病的发生、发展提供帮助。 展开更多
关键词 结核基因 相关因子 天然细胞蛋白(nramp) Ipr1 Sp110
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苦荞NRAMP家族全基因组鉴定
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作者 李明锴 《生物化工》 CAS 2024年第2期11-17,33,共8页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组... 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组中鉴定出11个NRAMP基因,并通过TBtools、Cell-PLoc、MEGA、SWISS-MODEL、SOPMA等工具对该家族成员的理化性质、保守基序、基因结构、系统发育关系、三维结构、顺式作用元件等方面进行了系统分析。结果发现,苦荞NRAMP基因家族在相同亚族下的保守基序和基因结构高度一致。此外,苦荞NRAMP基因的启动子区域中含有大量植物激素响应元件及胁迫响应元件,亚族间的元件分布存在明显差异。对苦荞NRAMP基因编码蛋白的三维结构、亚细胞定位以及顺式作用元件分析发现,FtNRAMP4、FtNRAMP10、FtNRAMP11三个成员和其他FtNRAMP具有差异。苦荞NRAMP蛋白的二级结构以α-螺旋为主,占比为35.37%~63.00%。本研究结果为深入挖掘苦荞NRAMP基因家族功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 天然相关细胞蛋白(nramp) 苦荞 基因家族 生物信息学
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半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选 被引量:4
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作者 邢贺飞 高峰涛 +2 位作者 张永珍 董忠典 陈松林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第4期116-127,共12页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表... 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表达分析,并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点进行了筛选。该基因c DNA序列全长3717 bp,其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)1677 bp,所编码蛋白含有558个氨基酸,该蛋白具有Nramp家族的典型特征,包括10个跨膜区(Transmembrane,TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运蛋白特征结构域(Consensus Transport Motif,CTM)。半滑舌鳎Nramp的ORF末端有1个类似于脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(Iron-responsive regulatory protein-binding site,IRE)。半滑舌鳎Nramp与其他14个物种的Nramp氨基酸序列同源性在63%-91%之间,系统进化分析表明,半滑舌鳎Nramp和所有鱼类Nramp聚集为一簇,与其他物种Nramp2的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析显示,Nramp基因在半滑舌鳎脾脏和肾脏中的表达量最高,而在肌肉和性腺中的表达量最低;在哈维氏弧菌感染的半滑舌鳎肾脏、脾脏和肝脏中表达量呈升高趋势,而在鳃中则表现为下调趋势。利用直接测序法检测感染鳗弧菌后同一家系的233个个体(抗病个体165个,感病个体68个),共检测到15个SNP位点,对其中3个SNP位点即SNP-g.3113(T→C)、SNP-g.3125(A→G)和SNP-g.3164(A→T)进行测序分型后发现,SNPg.3125(A→G)的等位基因(G)频率和基因型(GG)频率与半滑舌鳎抗鳗弧菌疾病呈极显著相关(P<0.01)。研究结果表明,Nramp基因不同基因型对半滑舌鳎的抗病能力有着极其重要的影响,SNP-g.3125(A→G)可作为潜在的抗性遗传标记位点。本研究将为半滑舌鳎抗性品系培育提供技术支持。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 天然相关细胞蛋白(nramp) 基因克隆 RT-PCR 单核苷酸多态(SNP)
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甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析 被引量:6
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作者 卢婷婷 李艳玲 +1 位作者 李存法 李利红 《河南农业科学》 北大核心 2019年第2期40-47,共8页
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维... 为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300~549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。 展开更多
关键词 甘草 自然相关细胞蛋白基因家族 生物信息学分析
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水稻OsNramp4介导锰离子吸收和转运的功能分析 被引量:1
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作者 李少庄 莫伊凡 +3 位作者 郝小花 赵丹 胡爽 雷晗 《生命科学研究》 CAS 2023年第1期42-48,共7页
锰(Mn)是植物生长发育必需的矿质营养元素。水稻天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance-associated macrophage protein, OsNramp)家族有7个成员,其中4个具有Mn^(2+)转运活性。OsNramp4已被鉴定为一个铝离子转运蛋白,但尚未报道... 锰(Mn)是植物生长发育必需的矿质营养元素。水稻天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance-associated macrophage protein, OsNramp)家族有7个成员,其中4个具有Mn^(2+)转运活性。OsNramp4已被鉴定为一个铝离子转运蛋白,但尚未报道其是否具有Mn^(2+)转运活性。本文利用Mn^(2+)吸收突变株Δsmf1进行OsNramp4功能互补实验,分析OsNramp4对Mn^(2+)的响应,研究环境Mn^(2+)胁迫对敲除突变体nramp4的生长势以及Mn^(2+)吸收和转运的影响。结果显示:OsNramp4能互补Δsmf1的Mn^(2+)吸收缺陷表型;水稻根部OsNramp4的表达受Mn^(2+)的诱导;高Mn^(2+)胁迫下, nramp4的长势明显优于野生型对照,突变体地上部Mn^(2+)含量显著低于野生型,且根-茎Mn^(2+)转运率明显低于野生型,暗示OsNramp4可能作为一个低亲和性Mn^(2+)转运蛋白,具有在高Mn^(2+)环境下吸收Mn^(2+),并由根部向地上组织运输Mn^(2+)的功能。本研究结果对深入探讨植物Mn^(2+)吸收、转运和分配的分子机制具有重要意义。 展开更多
关键词 锰离子转运蛋白 水稻天然相关细胞蛋白4(Osnramp4) 水稻
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DMT1的结构及其基因表达调控 被引量:6
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作者 于鹏 钱忠明 +1 位作者 段相林 常彦忠 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期205-209,共5页
关键词 DMT1 结构 基因表达 调控 小鼠 细胞蛋白1 天然 铁代谢
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改良单克隆抗体特异性俘获血小板抗原技术的简化及其临床意义 被引量:3
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作者 齐爱萍 周虎 +5 位作者 周泽平 马丽 李慧媛 葛菁 隋涛 杨仁池 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期206-207,共2页
原发免疫性血小板减少症(hnmune thrombocytopenic purpura,ITP)患者体内存在的抗血小板自身抗体与自身血小板结合后介导其在单核巨噬细胞系统中被吞噬破坏,使得循环血小板数下降,导致全身广泛皮肤黏膜、甚至内脏出血。目前该病仍... 原发免疫性血小板减少症(hnmune thrombocytopenic purpura,ITP)患者体内存在的抗血小板自身抗体与自身血小板结合后介导其在单核巨噬细胞系统中被吞噬破坏,使得循环血小板数下降,导致全身广泛皮肤黏膜、甚至内脏出血。目前该病仍为排除性诊断。既往血小板相关免疫球蛋白的检测因为缺乏特异性,已经基本上没有临床鉴别诊断价值。 展开更多
关键词 改良单克隆体特异俘获血小板原技术 临床意义 血小板相关免疫球蛋白 免疫血小板减少症 单核细胞系统 血小板自身 自身血小板 排除诊断
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亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉NRAMP基因家族的鉴定和进化分析 被引量:2
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作者 卢婷婷 王文佳 +1 位作者 李存法 侯春彬 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期2077-2085,共9页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花NRAMP基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三... 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花NRAMP基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三个棉种中的NRAMP家族成员进行鉴定,分析了NRAMP家族的种类、理化性质、进化关系、基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系和选择压力。结果显示,在二倍体亚洲棉基因组(A)中确定12个成员,在二倍体雷蒙德棉基因组(D)中确定15个成员,在四倍体陆地棉基因组(At, Dt)中确定23个成员。按照进化关系的远近将这50个成员分为3个亚类,进化关系较近的成员之间具有更为相似的理化性质、基因结构和蛋白质基序;通过和其他植物的进化关系分析发现,NRAMP基因在单子叶和双子叶植物分离前已经产生;染色体定位发现NRAMP在染色体上的分布并不规律;共线性分析和选择压力分析表明,片段复制在棉花NRAMP基因的遗传进化过程中发挥主导作用,同源基因对在进化过程中处于纯化选择。 展开更多
关键词 自然相关细胞蛋白(nramp) 基因家族 鉴定 进化分析 棉花(Gossypium)
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中国汉族人群肺结核易感基因的病例对照研究 被引量:15
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作者 刘玮 张翠英 +7 位作者 田磊 李春芝 吴晓明 赵秋敏 张泮河 杨淑梅 杨红 曹务春 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2003年第6期409-412,451,共5页
目的 :探讨VDR ,NRAMP1基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关联。方法 :采用病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应_限制性片段长度多态性分析 (PCR_RFLP)法检测VDR基因FoKⅠ和TaqⅠ位点 ,NRAMP1基因中INT4 ,D5 4 3N及 3'UTR位点... 目的 :探讨VDR ,NRAMP1基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关联。方法 :采用病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应_限制性片段长度多态性分析 (PCR_RFLP)法检测VDR基因FoKⅠ和TaqⅠ位点 ,NRAMP1基因中INT4 ,D5 4 3N及 3'UTR位点的基因型别 ,并对肺结核相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析。结果 :2 0 0 1年 4月到 2 0 0 2年 6月 ,共有 110名肺结核病例 [平均年龄 (2 7.6 5± 12 .72 )岁 ]和 180名对照 [平均年龄 (2 7.2 6± 9.2 1)岁 ]纳入本研究 ,单因素分析表明病例组中FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 3.36 (1.4 3~ 7.89) ,2 .2 2 (1.0 3~ 4 .78)和 1.93(1.14~ 3.2 6 ) ,TaqⅠ与INT4位点各基因型在病例和对照中的分布无显著性差异。多因素分析中调整了接触史和卡介苗接种史两个因素后 ,FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型仍与肺结核发病显著性相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3.15 (1.0 6~ 9.33) ,3.0 4 (1.12~ 8.2 7)和 2 .36 (1.2 0~ 4 .6 4 ) ,而TaqⅠ和INT4位点多态性与肺结核发病仍无显著关联。结论 :中国汉族人群VDR_FoKⅠ ,NRAMP1_D5 4 3N和NRAMP1_3′UTR位点多态性可? 展开更多
关键词 肺结核 维生素D受体基因 自然相关细胞蛋白1基因 病例对照研究
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