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基于高通量测序分析天麻种植土壤的真菌变化
1
作者
陈瑞
杨德强
赵长林
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第2期362-372,共11页
【目的】揭示天麻种植土壤真菌群落组成结构、天麻种植前后土壤真菌群落结构的变化及天麻种方竹[Chimonobambusa quadrangularis(Fenzi)Makino]种植结束后土壤真菌群落结构的变化,为研究天麻根际土壤微生态提供理论依据并为解决天麻连...
【目的】揭示天麻种植土壤真菌群落组成结构、天麻种植前后土壤真菌群落结构的变化及天麻种方竹[Chimonobambusa quadrangularis(Fenzi)Makino]种植结束后土壤真菌群落结构的变化,为研究天麻根际土壤微生态提供理论依据并为解决天麻连作障碍提供技术支持。【方法】基于高通量测序方法对采集的3组土样(原壤charlle001、一麻壤charlle002、方竹壤charlle006)进行基因组DNA提取,PCR扩增,产物检测、纯化和定量,建库测序,数据分析,物种组成多样性分析及差异分析。【结果】3组土样中真菌主要类群为Ascomycota、Basidiomycota和Mortierellomycota 3门真菌,其中Ascomycota真菌丰度普遍最大;3组样本特有真菌OTU:一麻壤>方竹壤>原壤;种水平下分析原壤charlle001中主要优势真菌为Clitocybe sp.、Solicoccozyma sp.和Spirosphaera sp.,一麻壤charlle002中主要优势真菌为Clavulinopsis sp.和Rosellinia sp.,方竹壤charlle006中主要优势真菌为Trichoderma sp.;Clavuli⁃nopsis和Rosellinia在一麻壤charllle002中丰度极大,在charllle001和charllle006中丰度极小;charlle001和charlle002组间真菌Mor⁃tierella相对丰度差异显著,charlle001和charlle006组间真菌Penicillium相对丰度差异显著;charlle002和charlle006组间真菌Peni⁃cillium相对丰度差异显著。种植收获一茬天麻后土壤中真菌种类数量递增,群落结构发生变化,一麻壤中真菌ASV、特有真菌数目明显增大;一麻壤种植方竹后木霉菌显著增多;Clavulinopsis和Rosellinia部分真菌易引起天麻病害,而方壤中Trichoderma多用于病原菌生物防治。【结论】天麻不同种植土壤的真菌群落结构不同,种植一年天麻后土壤中病原菌增多,再种植方竹呈现修复作用,但具体修复机制还有待后续深入研究。
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关键词
高通量测序
物种丰度
病原真菌
天麻土壤
连作障碍
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职称材料
云南昭通地区天麻种植土壤中重金属元素差异性分析
2
作者
徐建家
曾静
+4 位作者
董维俊
陈金磊
胡亚东
徐应垚
高旭红
《土壤科学》
2018年第4期115-124,共10页
云南昭通具有得天独厚的自然地理条件,所产天麻质量优良,是中国人工种植天麻最早地区之一和全国天麻重要产地。本研究从云南昭通地区大关、镇雄、盐津、彝良四个种植基地采集天麻种植土壤样品,采用电感耦合等离子发射光谱(ICP)法对土壤...
云南昭通具有得天独厚的自然地理条件,所产天麻质量优良,是中国人工种植天麻最早地区之一和全国天麻重要产地。本研究从云南昭通地区大关、镇雄、盐津、彝良四个种植基地采集天麻种植土壤样品,采用电感耦合等离子发射光谱(ICP)法对土壤样品中As、Cd、Cr、Cu、Pb、Ni 6种重金属元素进行了测定与分析。结果表明:不同种植基地中重金属元素含量差异明显,总体表现出根部重金属含量高于表面重金属含量,主成分分析说明Pb的因子载荷量在主成分中最大,体现出Pb在影响天麻表面土壤重金属元素富集评价的指标中起主要影响因子。
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关键词
天麻土壤
重金属元素
主成份分析
贡献率
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职称材料
题名
基于高通量测序分析天麻种植土壤的真菌变化
1
作者
陈瑞
杨德强
赵长林
机构
西南林业大学生物多样性保护学院
云南国诚农业发展有限公司
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第2期362-372,共11页
基金
云南省科技厅重点基础研究项目(202001AS070043)
科技创新基金项目(KY21008)。
文摘
【目的】揭示天麻种植土壤真菌群落组成结构、天麻种植前后土壤真菌群落结构的变化及天麻种方竹[Chimonobambusa quadrangularis(Fenzi)Makino]种植结束后土壤真菌群落结构的变化,为研究天麻根际土壤微生态提供理论依据并为解决天麻连作障碍提供技术支持。【方法】基于高通量测序方法对采集的3组土样(原壤charlle001、一麻壤charlle002、方竹壤charlle006)进行基因组DNA提取,PCR扩增,产物检测、纯化和定量,建库测序,数据分析,物种组成多样性分析及差异分析。【结果】3组土样中真菌主要类群为Ascomycota、Basidiomycota和Mortierellomycota 3门真菌,其中Ascomycota真菌丰度普遍最大;3组样本特有真菌OTU:一麻壤>方竹壤>原壤;种水平下分析原壤charlle001中主要优势真菌为Clitocybe sp.、Solicoccozyma sp.和Spirosphaera sp.,一麻壤charlle002中主要优势真菌为Clavulinopsis sp.和Rosellinia sp.,方竹壤charlle006中主要优势真菌为Trichoderma sp.;Clavuli⁃nopsis和Rosellinia在一麻壤charllle002中丰度极大,在charllle001和charllle006中丰度极小;charlle001和charlle002组间真菌Mor⁃tierella相对丰度差异显著,charlle001和charlle006组间真菌Penicillium相对丰度差异显著;charlle002和charlle006组间真菌Peni⁃cillium相对丰度差异显著。种植收获一茬天麻后土壤中真菌种类数量递增,群落结构发生变化,一麻壤中真菌ASV、特有真菌数目明显增大;一麻壤种植方竹后木霉菌显著增多;Clavulinopsis和Rosellinia部分真菌易引起天麻病害,而方壤中Trichoderma多用于病原菌生物防治。【结论】天麻不同种植土壤的真菌群落结构不同,种植一年天麻后土壤中病原菌增多,再种植方竹呈现修复作用,但具体修复机制还有待后续深入研究。
关键词
高通量测序
物种丰度
病原真菌
天麻土壤
连作障碍
Keywords
High⁃throughput sequencing
Species abundance
Pathogenic fungi
Gastrodia elata soil
Continuous cropping obstacle
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
云南昭通地区天麻种植土壤中重金属元素差异性分析
2
作者
徐建家
曾静
董维俊
陈金磊
胡亚东
徐应垚
高旭红
机构
云南师范大学能源与环境科学学院
出处
《土壤科学》
2018年第4期115-124,共10页
基金
国家自然科学基金项目(41661069)
云南省大学生创新创业项目2016年。
文摘
云南昭通具有得天独厚的自然地理条件,所产天麻质量优良,是中国人工种植天麻最早地区之一和全国天麻重要产地。本研究从云南昭通地区大关、镇雄、盐津、彝良四个种植基地采集天麻种植土壤样品,采用电感耦合等离子发射光谱(ICP)法对土壤样品中As、Cd、Cr、Cu、Pb、Ni 6种重金属元素进行了测定与分析。结果表明:不同种植基地中重金属元素含量差异明显,总体表现出根部重金属含量高于表面重金属含量,主成分分析说明Pb的因子载荷量在主成分中最大,体现出Pb在影响天麻表面土壤重金属元素富集评价的指标中起主要影响因子。
关键词
天麻土壤
重金属元素
主成份分析
贡献率
分类号
F2 [经济管理—国民经济]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序分析天麻种植土壤的真菌变化
陈瑞
杨德强
赵长林
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
云南昭通地区天麻种植土壤中重金属元素差异性分析
徐建家
曾静
董维俊
陈金磊
胡亚东
徐应垚
高旭红
《土壤科学》
2018
0
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职称材料
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