基于转录组序列的叶用芥菜奶奶青菜EST-SSR标记开发与遗传多样性分析

为了探究叶用芥菜奶奶青菜资源的多样性水平,基于转录组数据研究了奶奶青菜简单重复序列标记(EST-SSR)特征,筛选了适合奶奶青菜的EST-SSR引物,并分析了奶奶青菜的遗传多样性。转录组测序分析共获得46386条非冗余基因(unigene),其中13544条unigene序列中含有18720个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点,SSR的发生频率为29.20%,平均每2.73 kb出现1个SSR,分布频率为40.36%。优势重复序列为单核苷酸,占总SSR数量的49.39%,其次为三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR数量的25.44%和24.13%。AT、AGCT和AAG/CTT分别是单核苷酸、二核苷酸以及三核苷酸的优势重复基元。以30份奶奶青菜和5份其他芸薹属蔬菜为材料,从37对引物中筛选出17对多态性引物,扩增得到135条多态性条带,多态性比例达88.2%。遗传多样性分析结果显示,平均等位基因数(N_(a))为5.7059,平均有效等位基因数(N_(e))为2.3978,平均多样性指数(I)为1.0361,平均观察杂合度(H_(o))为0.3121,平均期望杂合度(H_(e))为0.5300,平均Nei's期望杂合度为0.5219,表明筛选出的17对SSR引物具有较好的遗传多样性。通过非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类分析,在相似系数为0.677处可将30份叶用芥菜奶奶青菜材料分为3类。试验结果可为叶用芥菜奶奶青菜的种质资源鉴定、亲缘关系分析和分子标记辅助育种等研究提供引物支持和技术参考。

叶用芥菜‘奶奶青菜’的营养品质分析

叶用芥菜‘奶奶青菜’是中国西南地区特有的地方芥菜类型,其品种繁多,以农家自留种和地方常规种为主,但关于它营养品质的研究仍然有限。本试验以25个‘奶奶青菜’品种为材料,测定其可溶性蛋白、叶绿素、类胡萝卜素、维生素C、原花青素、类黄酮和总多酚的含量及抗氧化能力,探究不同品种‘奶奶青菜’之间营养品质的差异,评测出营养价值较高的品种。结果显示‘,奶奶青菜’不同品种之间营养差异显著。25个品种的可溶性蛋白含量为4.26~168.45 mg/g、叶绿素含量为3.24~17.15 mg/g、类胡萝卜素含量为0.15~1.88 mg/g、维生素C含量为1.26~4.98 mg/g、原花青素含量为2.64~6.68 mg/g、类黄酮含量为2.06~17.95 mg/g、总多酚含量为6.56~15.70 mg/g,ABTS和FRAP测定的抗氧化能力分别是23.92%~47.17%和28.82~125.79 mg/g。25个‘奶奶青菜’品种中,CCB-4各项指标均显著高于其他品种(可溶性蛋白除外),是营养品质最好的品种。相关性分析结果表明,抗氧化能力与可溶性蛋白、类胡萝卜素、维生素C、类黄酮、总多酚均呈显著或极显著正相关。本研究结果可为‘奶奶青菜’营养评价和开发利用提供理论依据。