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台湾海峡南部海域好氧不产氧光合异养细菌对上升流的响应 被引量:1
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作者 陈瑶 张瑶 焦念志 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期98-107,共10页
国内外关于好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)和上升流之间关系的研究甚少。本文采用“基于蓝细菌校正的时序红外显微技术”研究了台湾海峡南部近岸上升流中心区AAPB对上升流变化的响应。研究结果发现,在上升流涌升的初始阶段,AAPB和总异养... 国内外关于好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)和上升流之间关系的研究甚少。本文采用“基于蓝细菌校正的时序红外显微技术”研究了台湾海峡南部近岸上升流中心区AAPB对上升流变化的响应。研究结果发现,在上升流涌升的初始阶段,AAPB和总异养细菌丰度较低;随着上升流的发展,两者丰度均增加并在上升流的成熟期达到最高值;而当上升流衰退时,AAPB和总异养细菌丰度开始下降。在上升流发展过程中,AAPB丰度与叶绿素a浓度在一定范围内呈显著正相关,但同时受环境低磷浓度的限制,总异养细菌丰度与氮、磷、硅营养盐均有显著正相关,表明叶绿素a指示的浮游植物所释放的溶解有机碳和环境中的磷限制可能对AAPB起着更为直接和重要的作用,而营养盐则可能在总异养细菌对上升流的响应中起着重要作用。本研究有助于我们理解AAPB在碳及其他生源要素循环中的作用及其调控机制。 展开更多
关键词 好氧不产光合细菌 台湾海峡 上升流
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舟山海域好氧不产氧光合异养细菌群落结构分析 被引量:4
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作者 赵本宣 赵晟 +2 位作者 李汝伟 刘强 吴常文 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期171-183,共13页
好氧不产氧光合异养细菌(aerobic anoxygenic phototrophic bacteria,AAPB)是广泛分布在各种海洋环境中并在微生物生态学、海洋碳汇和海洋生态系统的生物地球化学循环的过程中具有潜在的重要作用的一类光合异养微生物。于2016年4月份在... 好氧不产氧光合异养细菌(aerobic anoxygenic phototrophic bacteria,AAPB)是广泛分布在各种海洋环境中并在微生物生态学、海洋碳汇和海洋生态系统的生物地球化学循环的过程中具有潜在的重要作用的一类光合异养微生物。于2016年4月份在舟山群岛不同海洋功能区海域的八个站点采集表层海水,基于编码光合反应复合中心小亚基的puf M基因进行高通量测序,对测序结果进行分析,结果发现:除了岱山的样品测序失败以外,其它七个站点共得到192633条序列,我们进行了OTU聚类分析,相似性设为97%,可以看到,所有的数据最后一共分成4051个OTU。属于Proteobacteria的AAPB占明确分类的各细菌门的97%。Rhodobacteraceae科的Loktanella和Roseobacter两个属的AAPB在所有的采样站点中都处于优势地位。Desulfocapsa属在朱家尖站位(ZJJ)的发现非常具有研究价值,在以往的研究中还没有出现过。研究结果表明,在舟山群岛不同功能海域AAPB的群落结构和分布情况也是有差别的,而且与很多环境因素有关,这可以解释为什么目前很难准确预测水生环境总AAPB分布的问题。 展开更多
关键词 好氧不产光合细菌(aapb) 高通量测序 多样性
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水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展 被引量:5
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作者 张海涵 王燕 +7 位作者 刘凯文 黄廷林 李楠 杨尚业 司凡 苗雨甜 黄鑫 张梦瑶 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1585-1598,共14页
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光... 好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光合作用产能但不合成氧气,在物质循环与能量流动中扮演着重要角色.近年,越来越多的AAPB种属被陆续报道,基于光合基因,例如光合反应中心M亚基(pufM)的分子系统发育分析显示,大部分AAPB属于α-、β-及γ-变形菌,且丰度及多样性随生境的不同而呈现时空地理格局异质性.本文对AAPB的栖息环境与生长特性、丰度与分布、生态功能以及环境驱动因子等方面的研究进展进行了回顾和综述.目前,针对水库生态系统AAPB的研究鲜见报道,作者建议开展水库生境中AAPB多样性分布、环境驱动因素及生态功能研究,丰富对于水生生态系统中功能微生物种群生态结构与代谢功能的认识. 展开更多
关键词 好氧不产光合细菌(aapb) 水域生境 丰度与分布 pufM基因 驱动因子
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光合细菌在水产养殖的应用展望 被引量:1
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作者 战培荣 《黑龙江水产》 1993年第4期35-38,共4页
光合细菌(Photosynthetic Bacteria简称PSB)系指一群具有能够进行光合作用的细菌,它在20亿年前就已栖息在地球上,早在1838年首先为Ehrenbery所描述,当时他称为紫色细菌(Pwrple Bcateria)。在此基础上。
关键词 光合细菌 Bacteria 光能 有机废水处理 低级脂肪酸 循环过滤 光能自 红螺菌科
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好氧不产氧光合异养细菌及其在海洋生态系统中的作用 被引量:11
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作者 焦念志 Michael E Sieracki +1 位作者 张瑶 杜海莲 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第6期530-534,共5页
海洋生态系统中好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)有着独特的生理特征和生态功能. AAPB具有罕见的3裂方式, 形成Y形细胞, 并常集合成自由漂浮的群体. 绝大多数AAPB是专性好氧的. AAPB以细菌叶绿素(BChl a)为惟一的光合色素, 且细胞BChl a含... 海洋生态系统中好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)有着独特的生理特征和生态功能. AAPB具有罕见的3裂方式, 形成Y形细胞, 并常集合成自由漂浮的群体. 绝大多数AAPB是专性好氧的. AAPB以细菌叶绿素(BChl a)为惟一的光合色素, 且细胞BChl a含量(分子数)明显比典型的厌氧光合菌低, 但其胡萝卜素含量很高且种类繁多. 除了普遍存在的含Mg的BChl a外, 有的AAPB 还有含Zn的BChl a. AAPB具光捕获系统Ⅰ, 但常缺少光捕获系统Ⅱ. 尽管AAPB可利用光进行光合作用, 但其生长对光无依赖性, 它们具有控制自身光合作用的机制. AAPB分布广泛, 在海洋特别是贫营养的大洋环境的生物量中占有重要份额, 在碳及其他生源要素生物地球化学循环中扮演着独特的角色. 同时AAPB对重金属的矿化作用、解毒以及在生物除污方面有着巨大潜力. AAPB研究对于光合作用的起源与进化、环境调控, 以及海洋生态系统的结构与功能的深入认识具有重要意义. 展开更多
关键词 好氧不产光合细菌 海洋生态系统 细菌叶绿素 微型生物 aapb 光合作用
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好氧不产氧光合异养细菌定量方法研究 被引量:1
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作者 张瑶 焦念志 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第24期2549-2552,共4页
好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)生态功能的发现,使人们认识到AAPB可能在全球碳循环中占有重要地位.本文研究发现,目前对AAPB定量所用的荧光显微-红外摄像(EFM-IRP)技术,由于同时将聚球藻计数在内,造成对AAPB定量的明显误差.这种误差在我... 好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)生态功能的发现,使人们认识到AAPB可能在全球碳循环中占有重要地位.本文研究发现,目前对AAPB定量所用的荧光显微-红外摄像(EFM-IRP)技术,由于同时将聚球藻计数在内,造成对AAPB定量的明显误差.这种误差在我国近海可高达约30%,而在大洋则更高.这将影响到基于EFM-IRP的数据对全球AAPB生物量估计及其碳循环中的作用等方面的结论或推论.本文提出了解决方案. 展开更多
关键词 好氧不产光合细菌 定量研究 表面荧光显微镜 聚球藻 光合作用 碳循环
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锡林河流域潜在不产氧光合细菌陆向分异特征及影响因素
7
作者 范敬阳 王红越 +4 位作者 王泽铭 王润博 徐爽 程安宁 于景丽 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期2353-2371,共19页
【目的】为探明锡林河流域潜在不产氧光合细菌(anoxygenic photosynthetic bacteria,AnPB)的陆向分异特征及影响因素。【方法】本研究沿着陆向梯度依次采集水生湍流带、缓流带、滞流带、水偏湿生样带、湿偏旱生样带、旱生样带土壤样品... 【目的】为探明锡林河流域潜在不产氧光合细菌(anoxygenic photosynthetic bacteria,AnPB)的陆向分异特征及影响因素。【方法】本研究沿着陆向梯度依次采集水生湍流带、缓流带、滞流带、水偏湿生样带、湿偏旱生样带、旱生样带土壤样品。基于文献建立AnPB在科水平的数据库,运用16S rRNA基因高通量测序筛选科水平潜在AnPB类群及其组成丰度的陆向分异,运用皮尔逊相关性及冗余分析等研究土壤理化因子对潜在AnPB陆向分异的影响。【结果】紫色硫细菌(外硫红螺菌科)和紫色非硫细菌(红杆菌科、红环菌科、醋酸杆菌科、丛毛单胞菌科、全噬菌科)主要分布在水生及水偏湿生生境,其相对丰度与湿度呈显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)正相关关系;紫色非硫细菌(红螺菌科、慢生根瘤菌科、生丝微菌科、红菌科)、芽单胞菌科、酸杆菌科、绿色非硫细菌(蔷薇菌科)等主要分布在湿偏旱生和旱生环境中,其相对丰度与盐度和全氮含量呈显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)正相关关系;多元回归树分析显示,盐度、湿度、全氮对潜在AnPB陆向分异的总解释度分别为62.39%、14.01%、12.68%;结构方程模型拟合结果显示,盐度对红环菌科及全氮和湿度对红杆菌科均发挥正向直接作用。【结论】锡林河流域潜在AnPB具有明显的陆向分异规律,盐度、湿度、全氮是直接或间接驱动潜在AnPB陆向分异的主要环境因子。【意义】该研究结果有助于加深对锡林河流域AnPB生物多样性与生态系统功能的认识,为减少大气中CO_(2)排放和增加土壤固碳提供科学依据。 展开更多
关键词 锡林河流域 不产光合细菌 陆向分 环境影响因素
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分层型水库水体好氧不产氧光合细菌时空演替特征 被引量:1
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作者 张海涵 王燕 +7 位作者 黄廷林 王晨旭 路林超 司凡 李楠 刘凯文 闫苗苗 苗雨甜 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2188-2197,共10页
好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)以多样的群落结构及独特的代谢功能在水体物质循环中扮演着重要角色.基于实时荧光定量PCR及Illumina MiSeq高通量DNA测序技术研究金盆水库水体中AAPB丰度及群落结... 好氧不产氧光合细菌(aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB)以多样的群落结构及独特的代谢功能在水体物质循环中扮演着重要角色.基于实时荧光定量PCR及Illumina MiSeq高通量DNA测序技术研究金盆水库水体中AAPB丰度及群落结构时空演替特征,结合冗余分析揭示环境因子对其群落结构影响规律.结果表明,金盆水库水体AAPB丰度(以pufM基因计)变化范围为(6.70±0.43)×10^3^(2.69±0.15)×10^4 copies·mL^-1,最大值出现于10月,且随水深增加而减小.样本主要归为19个属(除未分类菌属外),优势AAPB菌属包括慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)和甲烷菌属(Methylobacterium sp.),两者隶属α-变形菌(α-Proteobacteria),其中慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)占比于11月最高,高达60%以上(除10 m外),此外也发现了以低比例存在的红长命菌属(Rubrivivax sp.),隶属β-变形菌(β-Proteobacteria).AAPB不同属间存在较强的互作关系,如红杆菌属(Rhodobacter sp.)与小红卵菌属(Rhodovulum sp.)呈正相关,噬氢菌属(Hydrogenophaga sp.)与慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium sp.)呈负相关等.AAPB种群结构组成及分布差异显著,主要受T、 TN、 NO-3-N和光照强度影响,且由环境因素综合调控.如10月水深0、 5和15 m水体AAPB种群结构受水温(T)、总氮(TN)和总磷(TP)显著影响, 12月水深5 m水体AAPB种群结构受光照强度、pH、溶解氧(DO)和叶绿素a(Chla)显著影响等.研究结果对解析分层型水库水体AAPB丰度和多样性的时空变化特征具有指导意义,并为探索AAPB种群结构的水环境驱动因素提供理论依据. 展开更多
关键词 分层型水库 好氧不产光合细菌(aapb) pufM基因 qPCR 高通量测序 种群结构
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原位PCR及其在海洋细菌检测中的应用
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作者 沈伟 焦念志 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期389-397,共9页
原位PCR技术在海洋生物研究中应用较少,尚无规范的方法步骤。将原位PCR技术应用于海洋细菌功能基因检测,通过实践探讨了影响原位PCR的关键因素,指出细胞的固定和消化是影响其成败的关键;探讨了有关的实验条件;并展望了在检测海洋细菌,... 原位PCR技术在海洋生物研究中应用较少,尚无规范的方法步骤。将原位PCR技术应用于海洋细菌功能基因检测,通过实践探讨了影响原位PCR的关键因素,指出细胞的固定和消化是影响其成败的关键;探讨了有关的实验条件;并展望了在检测海洋细菌,尤其是对目前尚无合适方法定量检测的典型海洋功能细菌等的检测方面,原位PCR有望发挥重要作用。 展开更多
关键词 原位PCR(isPCR) 海洋细菌 功能基因 原位检测 好氧不产光合细菌(aapb) 变形菌视紫质细菌(PR)
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海洋微型生物碳泵——从微型生物生态过程到碳循环机制效应 被引量:26
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作者 焦念志 骆庭伟 +8 位作者 张瑶 张锐 汤凯 陈峰 曾永辉 张永雨 赵艳琳 郑强 李彦玲 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期387-401,共15页
微型生物是海洋生态系统中"看不见的主角",在资源环境以及全球变化中扮演着举足轻重的角色.本研究通过方法创新和大量现场调查,从一类特殊微型生物类群——好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)入手,展开了微型生物生态过程与机制的... 微型生物是海洋生态系统中"看不见的主角",在资源环境以及全球变化中扮演着举足轻重的角色.本研究通过方法创新和大量现场调查,从一类特殊微型生物类群——好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)入手,展开了微型生物生态过程与机制的系统研究,修正了国际同行AAPB计数方法的误差,获得了全球海洋AAPB的分布规律,解释了以往现场实测结果的分歧,澄清了以往理论上的偏颇认识;建立了包括不产氧光能利用途径的上层海洋碳循环模型,并通过大量现场实测揭示:细菌光能利用关系到海区碳循环的"源""汇"格局;在这些研究基础上探讨了新的海洋碳循环机制,提出了"微型生物碳泵"理论框架,为全面认识海洋储碳机制、促进学科交叉、研发海洋碳汇奠定了基础. 展开更多
关键词 微型生物 碳循环 好氧不产光合 时间序列红外荧光显微数字化技术 微型生物碳泵
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从微型生物功能类群研究到海洋储碳机制的新认识——方法创新带动科学发现的一个典型案例 被引量:4
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作者 张飞 刘纪化 +2 位作者 李强 邹丽洁 张瑶 《中国科学:地球科学》 CSCD 北大核心 2016年第1期9-17,共9页
海洋微型生物是海洋生物地球化学循环的主要驱动者,也是海洋能量代谢的主要参与者,在海洋生态系统中发挥着举足轻重的作用.好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)是海洋中一类重要的功能类群,在海洋中广泛分布,它们可以利用光能补充自身的能量代... 海洋微型生物是海洋生物地球化学循环的主要驱动者,也是海洋能量代谢的主要参与者,在海洋生态系统中发挥着举足轻重的作用.好氧不产氧光合异养细菌(AAPB)是海洋中一类重要的功能类群,在海洋中广泛分布,它们可以利用光能补充自身的能量代谢,在海洋碳循环中发挥着重要而特殊的作用.在21世纪初,由于微型生物显微荧光定量方法的弊端,人们对于AAPB分布规律的认识存在着一定的偏差."时间序列红外荧光显微数字化方法"(TIREM)的建立,修正了AAPB定量偏差,揭示了海洋中AAPB分布的真正规律.之后,对AAPB生态分布调控因素的进一步研究表明:相对于光照,溶解有机碳(DOC)对AAPB绝对丰度和相对丰度的影响更重要.此认识推翻了"AAPB通过利用光能就可以赢得与普通异养细菌竞争"这一"想当然"的理论推测.而对AAPB碳源利用特点的研究表明,此功能类群具有重要的碳分馏作用,即AAPB在碳代谢过程中,部分碳源并非简单的沿着传统生物泵方向传递.在此基础上的海洋微型生物与DOC相互作用关系研究,最终导致海洋储碳新机制—微型生物碳泵(MCP)的提出,它解释了海洋中巨大溶解有机碳库存在的原因和机制,实现了海洋储碳机制理论上的新突破. 展开更多
关键词 海洋微型生物 好氧不产光合细菌 时间序列红外荧光显微数字化技术 微型生物碳泵 海洋碳循环
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赤杆菌科微生物分类研究进展 被引量:12
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作者 吴月红 许学伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1082-1094,共13页
赤杆菌科微生物隶属于细菌域(Bacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)。依据16S rRNA基因序列的系统发育分析结果,2005年赤杆菌科被提议建立,成立之初由3个属5个种组... 赤杆菌科微生物隶属于细菌域(Bacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)。依据16S rRNA基因序列的系统发育分析结果,2005年赤杆菌科被提议建立,成立之初由3个属5个种组成;在过去10年中,该科的物种数量增加迅速;截止2015年10月,赤杆菌科合格发表6个属44个种。赤杆菌科微生物在土壤、热泉、海水和沉积物等环境中广泛分布,其在环境修复、食品工程及生物医药等领域具有重要的应用前景。此外,部分菌株具有细菌叶绿素a,营好氧异养生长兼具光合作用功能,是好养不产氧光合异养菌的一个重要类群,近年来其在全球海洋碳循环和能量代谢过程中的重要作用日益凸显,得到了国内外学者的关注。本文综述了赤杆菌科微生物的分类特征、生态分布和应用基础等方向的研究进展,并对其分类研究趋势做了分析。 展开更多
关键词 赤杆菌科微生物 分类学 好氧不产光合 基因组
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Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria and their roles in marine ecosystems 被引量:5
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作者 JIAO Nianzhi Michael E. Sieracki +1 位作者 ZHANG Yao DU Hailian 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第11期1064-1068,共5页
Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria (AAPB) are characterized by the following physiological and ecological features. A mother AAPB cell can unusually divide into 3 daughter cells and looks like a 揧?during the di... Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria (AAPB) are characterized by the following physiological and ecological features. A mother AAPB cell can unusually divide into 3 daughter cells and looks like a 揧?during the division. AAPB cells sometimes adhere together forming a free-floating population. Most of the known AAPB species are obligately aerobic. Bacteriochlorophyll a (BChl a) is the only photosynthetic pigment in AAPB, and the number of BChl a molecules in an AAPB cell is much less than that in an anaerobic phototrophic bacterial cell, while the accessorial pigments carotenoids in AAPB are abundant in concentration and diverse in species. In addition to the common magnesium containing BChl a, a zinc-containing BChla was also seen in AAPB. AAPB have light harvesting complexⅠbut usually lack light harvesting complexⅡ. Although AAPB featur in photosynthesis, their growth is not necessarily light- dependent. There is a mechanism controlling the photosynthesis approach. AAPB are widely distributed in marine environments especially in oligotrophic oceans accounting for a substantial portion of the total biomass and playing a unique role in the cycle of carbon and other biogenic elements. Besides the contribution to primary production, AAPB also have great potentials in bioremediation of polluted environments. Studies on AAPB would be of great value in understanding the evolution of photosynthesis and the structure and function of marine ecosystems. 展开更多
关键词 光合作用 海洋生态系统 aapb 细菌 细菌叶绿素 母细胞 子细胞 色素 类胡萝卜素 菌分类
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