目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系。方法 :运用ClustalW 1.83和MEGA5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图;采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438...目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系。方法 :运用ClustalW 1.83和MEGA5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图;采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438与子宫珠蛋白典型序列P11684之间抗原性差异;利用Swiss-Model程序模拟并比较P11684、P30438和P30440的三级结构。结果 :分泌球蛋白家族充斥着大量冗余数据,经逐步聚类收缩至13个代表性序列进一步分析发现,整个分泌球蛋白家族划分成两个大家族三个亚家族,而子宫珠蛋白典型序列与猫主要过敏原Fel d 1的一个亚基P30438之亲缘关系最近,两者均具有与HLA高亲和力结合位点,而且三级结构相似。结论:子宫珠蛋白具有潜在的过敏原性。展开更多
文摘目的:分析人子宫珠蛋白与猫主要过敏原Fel d 1之间关系。方法 :运用ClustalW 1.83和MEGA5.1 Beta3软件比较人分泌球蛋白家族序列及猫过敏原Fel d 1两个亚基P30438和P30440之间的进化树形图;采用在线软件平台NetMHCII 2.2比较分析P30438与子宫珠蛋白典型序列P11684之间抗原性差异;利用Swiss-Model程序模拟并比较P11684、P30438和P30440的三级结构。结果 :分泌球蛋白家族充斥着大量冗余数据,经逐步聚类收缩至13个代表性序列进一步分析发现,整个分泌球蛋白家族划分成两个大家族三个亚家族,而子宫珠蛋白典型序列与猫主要过敏原Fel d 1的一个亚基P30438之亲缘关系最近,两者均具有与HLA高亲和力结合位点,而且三级结构相似。结论:子宫珠蛋白具有潜在的过敏原性。
基金supported by the National Natural Science Foundation of China(No.3067077030870916+3 种基金81100057)Precision Instruments Sharing Foundation of Central South UniversityChina(No.2012-022012-12)
基金supported by the National Natural Science Foundation of China(No.3087091681100057)+2 种基金the Natural Science Foundation of Hunan ProvinceChina(No.09JJ305712JJ2049)