转录组测序在孟德尔遗传病临床诊断中的应用进展

目前常用基因panel和全外显子组测序(whole exome sequencing)检测孟德尔遗传病,但DNA测序诊断率仅35%~50%。近年来,转录组测序(RNA sequencing)这一技术不断发展,不仅具有检测新致病变异、分析等位基因特异性表达等优势,有望促进了解疾病基因型与表型的关系,还可与基因组测序优势互补,拓展孟德尔遗传病传统的基因组的诊断手段,有望成为诊断孟德尔遗传病的常规工具。该文对转录组测序在孟德尔遗传病临床诊断中的应用进展进行综述。

孟德尔细胞遗传学、染色体重排与孟德尔遗传病的关系

染色体异常、特定基因突变，不仅有助于绘制疾病基因定位图，而且在定位克隆策略下，是快速分离致病基因的关键。本文讨论了影响重排发生的因素及如何完善检测重排的方法，并探讨邻接基因综合征与孟德尔遗传病的相关性，染色体图谱中将基因组划分为可存活缺失和不可存活缺失两部分，不仅可得到孟德尔遗传病染色体重排频率及类型，而且可选择检测重排的策略；列举了Ｘ连锁病、印迹相关疾病等染色体缺失、重排特点。

精准理解和探究遗传致病因素:从孟德尔遗传病到遗传易感

随着高通量基因测序和大数据分析技术的推广应用,个体基因数据越来越容易获取,群体遗传学研究也已经进入了万人基因组时代。海量的数据积累及迅速增加的病例对照研究,为精准理解和探究遗传致病因素提供了良好的基础。本文介绍近年来的相关研究进展,并结合笔者的工作经验,提出遗传致病因素的冰山模型。

医学外显子组测序检测遗传病拷贝数变异的初步探索

【目的】评价医学外显子组高通量测序技术用于拷贝数变异(CNV)检测的可行性。【方法】两个不相关的遗传病家系案例,患者除了有智力障碍的类似症状外,无其他明显共同点。通过脆性X染色体综合征基因筛查、染色体G显带技术、染色体微阵列技术以及医学外显子组测序技术等对患者及其家属进行遗传学检测。【结果】在两个家系的患者中均发现染色体拷贝数变异,片段大小从11.4 kb到13.03 Mb不等。拷贝数变异得到了其他技术的验证。【结论】医学外显子组高通量测序技术用于拷贝数变异相关的遗传病临床辅助诊断是可行的,但其有效性和准确度有待进一步大量数据的评估和验证。

胎儿单基因遗传病的无创检测技术研究进展

1单基因病和NIPT技术（non-invasive prenatal test） 单基因疾病（monogenedisease）是指由一对等位基因控制的疾病或临床病理表现,即按照孟德尔方式传递的疾病,也称孟德尔遗传病（medeliandisease）。

编委推荐

Nature|基于多种族百万人样本的人类蛋白质编码变异目录构建外显子组测序技术推动了罕见编码变异的发现,为了解基因功能提供了新的视角,加速了孟德尔遗传病和常见疾病相关基因的发现。在"A deep catalogue of protein-coding variation in 983,578 individuals"这篇文章中,作者团队使用了来自Regeneron遗传中心百万外显子组计划(RGC-ME)的983,578个样本的全外显子组测序数据,其中包括来自非洲、欧洲、东亚、美洲原住民、中东和南亚等不同人群的个体,其中23%的样本来自非欧洲人群,构建了迄今为止最大规模的人类蛋白质编码变异目录,并对其进行深入分析。

启示

中国医学科学院阜外心血管病研究所中-德分子医学研究室基因定位中心是在中、德两国政府科技部门的关怀支持下合作创建的,成立该中心的目的是为了对单基因病和复杂疾病进行高通量的全基因组扫描,定位并克隆其致病基因。目前我们正致力于高血压病、糖尿病和脑卒中致病基因的精细位点扫描,并在全国范围征求合作伙伴,如果有罕见病、单基因病的家系或多基因病的大家系的资料或信息,请与我们联系。以此而发表的学术论文,将以合作方为共同作者。