宏基因组的二代测序技术在初治失败社区获得性肺炎患者病原菌检测中的应用价值

目的探讨基于宏基因组的二代测序技术(mNGS)在初治失败社区获得性肺炎(CAP)患者病原菌检测中的应用价值。方法回顾分析2019年5月1日至2020年12月31日安徽医科大学第四附属医院呼吸与危重症医学科收治初治失败CAP患者87例,统计其病原菌分布情况,并比较mNGS与传统检测方法对初治失败CAP病原菌诊断差异。结果87例初治失败CAP患者中,非重症CAP患者75例,重症CAP患者12例。在75例非重症CAP患者分离到的31种微生物中,细菌感染最常见,其次为结核,再次为真菌、病毒;在12例重症CAP患者分离到的14种微生物中,真菌感染最常见,其次为非典型病原体。mNGS检测出病原菌的阳性率为(85.06%),高于传统检测方法(8.04%)。差异有统计学意义(P<0.05)。结论mNGS对病原菌鉴定具有较高的灵敏度,为初治失败CAP患者提供了快速准确的病原菌检测方法,有助于更早识别病原体和指导用药,提高临床诊治水平。

经mNGS诊断的CNS诺卡菌感染三例

中枢神经系统(CNS)诺卡菌感染在临床上罕见且诊断较困难。该文报道了3例经基于宏基因组学的二代基因测序技术(mNGS)诊断的CNS诺卡菌感染病例。1例头颅MRI示脑膜脑炎,1例头颅MRI示右侧额顶枕叶、左侧大脑脚脑桥及小脑半球、脑膜多发病灶,1例头颅MRI示脑膜脑炎并双侧额叶、左侧侧脑室后角多发脓肿。3例脑脊液涂片均未发现病原体,2例脑脊液培养阴性。最后3例均经脑脊液mNGS被确诊为诺卡菌脑膜脑炎,1例予磺胺甲口恶唑、米诺环素口服,联合利奈唑胺静脉滴注抗感染后好转出院,随访无复发;1例予磺胺甲口恶唑口服,美罗培南、利奈唑胺静脉滴注等治疗,曾出现急性脑积水,先后行侧脑室外引流术、脑室腹腔分流术,其后病情逐渐好转并出院,随访无复发;1例予磺胺甲口恶唑口服,利奈唑胺、美罗培南静脉滴注,曾出现脑积水,行侧脑室外引流术,其后病情好转并出院,随后失访。该文提示在传统检测方法的基础上,将脑脊液mNGS作为常规的检测手段有助于提高该病的确诊率。