一种新型脱氧核糖核酸序列表征子及其应用于E.coli启动子对RNA转录启动强度的QSAM研究

从天然碱基的36种性质参数出发,通过主成分分析(PCA)技术处理得到了1个显著的主成分得分,并将该得分作为单个碱基的信息描述子———VBPV。进而使用VBPV对38个大肠杆菌(E.coli)启动子序列一级结构进行表征,并结合多元统计方法将表征参数与转录启动强度(PS)成功地建立了定量序列活性模型(QSAM),该模型拟合复相关系数Rcum与交叉检验复相关系数Qcum分别为0.97和0.95。