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氨基酸描述子VHSEH用于多肽定量序效建模研究 被引量:8
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作者 杨善彬 夏之宁 +5 位作者 舒茂 梅虎 吕凤林 张梅 吴玉乾 李志良 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第11期2213-2217,共5页
从20种天然氨基酸的171个物化性质出发,按照疏水、立体和电性特征及氢键贡献将其分类后,分别进行主成分分析,得到一个新描述子VHSEH(Principal component score vector of hydrophobic,steric,electronic properties and,hydrogen bonds... 从20种天然氨基酸的171个物化性质出发,按照疏水、立体和电性特征及氢键贡献将其分类后,分别进行主成分分析,得到一个新描述子VHSEH(Principal component score vector of hydrophobic,steric,electronic properties and,hydrogen bonds contributions).对后叶催产素的结构进行了表征,并以偏最小二乘法及D-优化划分样本建立了PLS定量序效关系模型,得到复相关系数R2分别为0.958和0.957,Q2分别为0.903和0.845,约高于VHSE描述子模型值;对抗菌肽进行了结构表征,建立了PLS和OSC-PLS模型,其R2分别为0.84和0.995,Q2分别为0.546和0.926,较SZOTT描述子结果好;对58个血管紧张素转化酶抑制剂进行QSAM研究,得到R2,Q2及RMS分别为0.877,0.838和0.361.研究结果表明,VHSEH描述子信息量大,物化意义明确,结果更易解释. 展开更多
关键词 氨基酸描述子(VHSEH) 定量(qsam) 偏最小二乘法
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氨基酸描述子SZOTT用于多肽定量序效建模研究 被引量:3
2
作者 梁桂兆 梅虎 +3 位作者 周原 杨善彬 吴世容 李志良 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1900-1902,共3页
A new descriptor,namely scores vector of zero dimension,one dimension,two dimension and three dimension(SZOTT),was derived from principle components analysis of a matrix of 1 369 structural variables including 0D,1D,2... A new descriptor,namely scores vector of zero dimension,one dimension,two dimension and three dimension(SZOTT),was derived from principle components analysis of a matrix of 1 369 structural variables including 0D,1D,2D and 3D information for 20 coded amino acids.SZOTT scales were then employed to express structures of 20 thromboplastin inhibitors and 34 bactericidal peptides.The correlation coefficients of both whole calibration(%R%2=%R%2cu)and of cross validation(%Q%2=%R%2cv)for the multiple-variable models by classical partial least squares(PLS)and orthogonal signal correction-partial least squares(OSC-PLS)of 20 thromboplastin inhibitors were 0.989 and 0.748,0.994 and 0.936,respectively.%R%2 and %Q%2 for the models by PLS and OSC-PLS of 34 bactericidal peptides were 0.619 and 0.406,0.910 and 0.503,respectively.Satisfactory results obtained showed that structural information related to biological activity in both data sets could be described by SZOTT which included plentiful information related to biological activity,and which was conveniently operated and easy interpreted.,also predictive capability of models were relative robust.There is a high prospect for SZOTT wide applications on quantitative sequence-activity modeling(QSAM)of peptides. 展开更多
关键词 氨基酸描述子(SZOTF) 定量(qsam) 偏最小二乘(PLS)
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用自适应偏最小二乘回归为药物定量构效关系建模 被引量:11
3
作者 颜学峰 陈德钊 胡上序 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第5期536-539,共4页
提出了一种自适应偏最小二乘回归 (APLSR)方法。对于指定的预测对象 ,APLSR将根据样本在结构参数空间中的分布 ,分析它们对预测对象的预报能力 ,自适应地为各个样本分配权值 ,并从样本数据中提取和选用PLS成分 ,从而实施自适应加权PLSR ... 提出了一种自适应偏最小二乘回归 (APLSR)方法。对于指定的预测对象 ,APLSR将根据样本在结构参数空间中的分布 ,分析它们对预测对象的预报能力 ,自适应地为各个样本分配权值 ,并从样本数据中提取和选用PLS成分 ,从而实施自适应加权PLSR ,以获得预报性能良好的模型。作者将APLSR应用于含硫苯衍生物的QSAR建模 ,取得了令人满意的效果。 展开更多
关键词 自适应 偏最小二乘回归 药物 定量关系 含硫苯衍生物 加权回归
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优化的径向基-循环子空间网络为药物定量构效关系建模 被引量:6
4
作者 李剑 陈德钊 +1 位作者 吴晓华 叶子清 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期767-771,共5页
径向基循环子空间回归(RBFCSR)网络,保留了径向基偏最小二乘(RBFPLS)网络的优点,且可在更广的范围内选择最优模型,但仍存在着参数难以确定,计算量大等问题。对此,本研究兼顾网络模型的拟合与预测性能,采用具有高效全局搜优能力的优进遗... 径向基循环子空间回归(RBFCSR)网络,保留了径向基偏最小二乘(RBFPLS)网络的优点,且可在更广的范围内选择最优模型,但仍存在着参数难以确定,计算量大等问题。对此,本研究兼顾网络模型的拟合与预测性能,采用具有高效全局搜优能力的优进遗传算法(EGA)优化网络参数,构建为EGARBFCSR方法,并将其成功应用于苯乙酰胺类除草剂的构效关系(QSAR)建模,效果良好,显示出很强的学习能力,所建模型具有良好的预报性能和稳定性,并优于其他方法。 展开更多
关键词 定量关系 径向基 空间网络 优化 循环子空间回归 药物 酰胺类除草剂 偏最小二乘 最优 预测性能 网络 网络参数 遗传算法 学习能力 预报性能 计算量 稳定性
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基于粒子群优化算法的神经网络在农药定量构效关系建模中的应用 被引量:1
5
作者 张丽平 俞欢军 +1 位作者 陈德钊 胡上序 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1590-1594,共5页
神经网络模型能有效模拟非线性输入输出关系,但其常规训练算法为BP或其它梯度算法,导致训练时间较长且易陷入局部极小点。本实验探讨用粒子群优化算法训练神经网络,并应用到苯乙酰胺类农药的定量构效关系建模中,对未知化合物的活性进行... 神经网络模型能有效模拟非线性输入输出关系,但其常规训练算法为BP或其它梯度算法,导致训练时间较长且易陷入局部极小点。本实验探讨用粒子群优化算法训练神经网络,并应用到苯乙酰胺类农药的定量构效关系建模中,对未知化合物的活性进行预测来指导新药的设计和合成。仿真结果表明,粒子群优化算法训练的神经网络不仅收敛速度明显加快,而且其预报精度也得到了较大的提高。 展开更多
关键词 神经网络 粒子群优化算法 局部极小 仿真结果 梯度算法 收敛速度 新药 乙酰胺 定量关系
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自适应模糊偏最小二乘方法在药物构效关系建模中的应用 被引量:7
6
作者 成忠 陈德钊 +1 位作者 吴晓华 叶子青 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第7期972-976,共5页
作为一种局部逼近方法,自适应神经模糊推理系统(ANFIS)适于为药物定量构效关系(QSAR)建模。描述药物分子结构的参数较多,常存在耦合关系,会增加建模难度,并影响模型的预报性能。为此,将ANFIS和偏最小二乘(PLS)相结合,先由PLS从样本数据... 作为一种局部逼近方法,自适应神经模糊推理系统(ANFIS)适于为药物定量构效关系(QSAR)建模。描述药物分子结构的参数较多,常存在耦合关系,会增加建模难度,并影响模型的预报性能。为此,将ANFIS和偏最小二乘(PLS)相结合,先由PLS从样本数据中提取成分,再由ANFIS实现每对成分间的非线性映射,并基于输出误差进一步修正所提取的成分,使之对因变量具有最优的解释能力,由此构建为EBAFPLS方法。该法已成功地应用于HIV-1蛋白酶抑制剂的QSAR建模,效果良好,显示出很强的学习能力,所建模型的预报性能也优于其它方法。 展开更多
关键词 偏最小二乘方法 药物 自适应神经糊推理系统 应用 ANFIS 定量关系 蛋白酶抑制剂 预报性能 非线性映射 PLS方法 HIV-1 逼近方法 分子结构 耦合关系 影响 样本数据 输出误差 QSAR 学习能力 成分 提取
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循环子空间回归为喹喏酮N_1位构效关系建模 被引量:5
7
作者 孙卫国 陈德钊 +2 位作者 陈亚秋 叶宁 胡上序 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1999年第6期861-865,共5页
拟从线性泛函的角度分析循环子空间回归(CSR).CSR方法将从自变量参数矩阵和因变量向量中提取成分,循环地构造并扩张Krylov子空间,且以此作为源空间,运用最小二乘准则解得映射到因变量实空间的线性泛函.整个求解过程... 拟从线性泛函的角度分析循环子空间回归(CSR).CSR方法将从自变量参数矩阵和因变量向量中提取成分,循环地构造并扩张Krylov子空间,且以此作为源空间,运用最小二乘准则解得映射到因变量实空间的线性泛函.整个求解过程包容了最小二乘回归(LSR)、主成分回归(PCR)、偏最小二乘回归(PLS)以及其它中间的回归方法.然后由预报能力的强弱,从中确定最佳回归模型.本文应用CSR方法为喹喏酮N1位抗菌构效关系建模。 展开更多
关键词 循环子空间回归 抗菌药 喹喏酮 N1位 药物定量关系
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醛酮化合物色谱保留指数的集成全息定量构效关系模型 被引量:4
8
作者 雷斌 臧芸蕾 +4 位作者 薛志伟 葛懿擎 李伟 翟倩 焦龙 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期331-337,共7页
色谱保留指数(retention index,RI)是色谱分析中的重要参数,不同化合物在不同极性固定相上具有不同的保留行为。醛酮化合物种类众多,实验测定其RI值的时间和经济成本高。该论文采用集成建模(ensemble modeling)结合全息定量构效关系(HQS... 色谱保留指数(retention index,RI)是色谱分析中的重要参数,不同化合物在不同极性固定相上具有不同的保留行为。醛酮化合物种类众多,实验测定其RI值的时间和经济成本高。该论文采用集成建模(ensemble modeling)结合全息定量构效关系(HQSAR)方法研究了醛酮化合物在2种固定相(DB-210和HP-Inno w ax)上色谱保留指数的定量构效关系(QSAR)模型。用外部测试集验证法和留一交叉验证法评估了所建立模型的预测能力。首先建立了34种被研究化合物的个体HQSAR模型。在固定相DB-210上,片段特性(FD)为"供体/受体原子(DA)"且片段尺寸(FS)为1~9时可得到最优个体模型,在固定相HP-Innow ax上,FD为"DA"且FS为4~7时可得到最优个体模型,这两个模型的交叉验证相关系数(qcv2)分别为0.935和0.909,外部验证相关系数(qext2)分别为0.925和0.927,一致性相关系数(CCC)分别为0.953和0.960,预测平方相关系数F2 (QF22)分别为0.922和0.918,预测平方相关系数F3(QF32)分别为0.931和0.927。研究结果表明醛酮化合物的分子结构与RI值之间存在定量关系,用HQSAR方法可以建立二者之间的QSAR模型。其次,以4个预测准确度最高的个体HQSAR模型作为子模型通过算术平均建立了集成HQSAR模型。建立的集成HQSAR模型预测被研究化合物在DB-210和HPInno wax固定相上RI值的qcv2分别为0.927和0.919,qext2分别为0.929和0.963,CCC分别为0.956和0.979,Q2F2分别为0.927和0.958,Q2F3分别为0.935和0.963。与个体HQSAR模型相比,建立的集成HQSAR模型预测准确度更高。这说明集成建模是提高HQSAR模型预测能力的有效方法,HQSAR与集成建模方法相结合可以用于研究和预测醛酮化合物的RI值。 展开更多
关键词 集成 全息定量关系 醛酮化合物 色谱保留指数
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循环子空间回归的一种快速算法及其在定量构效关系中的应用 被引量:6
9
作者 庄凌 陈德钊 +1 位作者 陈亚秋 胡上序 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1999年第12期1386-1390,共5页
循环子空间回归(CSR)通过改变解空间的维数,可以获取一系列的回归模型,其中包括最小二乘回归(LSR)、主成分回归(PCR)、偏最小二乘回归(RLSR)和许多中间回归,从中可挑选最优回归模型.本文将分析CSR的原理,给出一种可行的快速的CSR算法(RC... 循环子空间回归(CSR)通过改变解空间的维数,可以获取一系列的回归模型,其中包括最小二乘回归(LSR)、主成分回归(PCR)、偏最小二乘回归(RLSR)和许多中间回归,从中可挑选最优回归模型.本文将分析CSR的原理,给出一种可行的快速的CSR算法(RCSR),以提高计算速率和精度。 展开更多
关键词 循环子空间回归 快速算法 定量关系
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QSAR建模方法及其应用于化学物质毒性预测的研究进展 被引量:6
10
作者 陈雅菲 钟儒刚 《轻工科技》 2017年第2期29-31,共3页
定量构效关系(QSAR)是通过运用统计学方法建立化合物的化学结构与活性之间数学模型的一种方法,其在生物学、药学及毒理学等领域有着广泛的应用。介绍多元线性回归(MLR)、遗传算法(GA)、主成分分析(PCA)、偏最小二乘法(PLS)、人工神经网... 定量构效关系(QSAR)是通过运用统计学方法建立化合物的化学结构与活性之间数学模型的一种方法,其在生物学、药学及毒理学等领域有着广泛的应用。介绍多元线性回归(MLR)、遗传算法(GA)、主成分分析(PCA)、偏最小二乘法(PLS)、人工神经网络(ANN)和支持向量机(SVM)六种QSAR建模方法及其应用领域,比较其优缺点,并分析其在预测化学物质毒性方面的可行性,为不同建模方法在预测化合物毒性研究的应用提供了参考。 展开更多
关键词 定量关系 方法 毒性预测
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核酸与分子建模及结构表达启动子强度预测
11
作者 李波 仇亮加 +2 位作者 李劲为 叶楠 李志良 《重庆大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第7期63-65,共3页
从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活... 从核酸分子的一级结构出发 ,基于分子中原子间距离及各原子电负性 ,构建了能描述核酸分子结构的系列参数 :分子电性边数矢量简称分子电边矢量。据此对 38个脱氧核糖核酸 (DNA)启动子序列的强度进行定量结构活性相关 (QSAR)及定量序列活性模型 (QSAM)研究 ,取得良好结果。与其它方法相比 ,分子电边矢量具结构分辨率高、活性相关性好、计算简便等特点 。 展开更多
关键词 定量相关 定量 qsam 分子电边矢量 脱氧核糖核酸 启动子 DNA链结构 生物大分子
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HMG-CoA还原酶阻滞剂的多维多元定量构效关系
12
作者 王远强 叶楠 +3 位作者 李志良 白石Y 宫下Y 佐佐木S 《重庆大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期154-158,共5页
采用比较分子场 (CoMFA)分析法和偏最小二乘回归 (PLS)法对十多种HMG -CoA还原酶阻滞剂的构效关系进行了多维定量建模研究。在描述变量数远远超过样本数的情况下 ,经典的Hansch方法等均不适应 ,而笔者的方法可给出良好结果。
关键词 HMG-COA 多维多元定量关系 比较分子场分析 分子 药物 还原酶阻滞剂
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演化自适应建模在QSAR研究中的应用
13
作者 张海月 郑绍辉 +1 位作者 张明涛 林少凡 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期72-78,共7页
演化自适应建模利用自然选择的方法处理建模和模型优化问题,通过在模型空间中搜索问题的解来揭示输入与输出数据间存在的相关关系并以此来估计和外推系统的行为,该方法用于QSAR研究,具有稳定、适应性强、无需问题的背景知识等优点,可以... 演化自适应建模利用自然选择的方法处理建模和模型优化问题,通过在模型空间中搜索问题的解来揭示输入与输出数据间存在的相关关系并以此来估计和外推系统的行为,该方法用于QSAR研究,具有稳定、适应性强、无需问题的背景知识等优点,可以获得多个较为准确描述药物构效关系的模型,既可以是线性模型,也可以是非线性模型,但对于自变量较多的问题,该方法的编码方式可能使效率下降。 展开更多
关键词 自适应 定量关系分析 卡巴醌
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定量构效关系应用于水中有机污染物降解过程的研究进展 被引量:5
14
作者 张丹 晁聪 +2 位作者 李玉坤 炊衣琦 杨凯峰 《化工环保》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期418-426,共9页
基于化合物分子结构与反应活性之间的定量构效关系(QSAR)研究在化工、环境、医药等领域受到广泛关注,对于模拟预测未知化合物的反应活性和作用机制具有重要意义。本文介绍了QSAR的原理及常用的建模方法,综述了QSAR在水中有机污染物光降... 基于化合物分子结构与反应活性之间的定量构效关系(QSAR)研究在化工、环境、医药等领域受到广泛关注,对于模拟预测未知化合物的反应活性和作用机制具有重要意义。本文介绍了QSAR的原理及常用的建模方法,综述了QSAR在水中有机污染物光降解、高级氧化降解、生物降解过程中反应活性模拟预测以及机理解释研究领域的应用,最后对QSAR在有机污染物降解过程研究领域的发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 定量关系 方法 多元线性回归 分子结构描述符 高级氧化过程
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支持向量机用于定量构效关系建模的研究 被引量:28
15
作者 梅虎 梁桂兆 +1 位作者 周原 李志良 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第16期1703-1708,共6页
运用支持向量机,偏最小二乘和BP人工神经网络3种方法对苦味二肽和血管紧张素转化酶抑制剂2个肽体系进行了定量构效关系建模研究.为了验证模型的外部预测能力,样本集经D-optimal设计被分成训练集和测试集两部分,通过对测试集的预测结果... 运用支持向量机,偏最小二乘和BP人工神经网络3种方法对苦味二肽和血管紧张素转化酶抑制剂2个肽体系进行了定量构效关系建模研究.为了验证模型的外部预测能力,样本集经D-optimal设计被分成训练集和测试集两部分,通过对测试集的预测结果来判断模型的外部预测能力.结果显示支持向量机在2个体系中均表现出了较强的建模和预测能力.在对苦味二肽的构效关系建模中,支持向量机的建模和预测结果明显优于偏最小二乘,与BP人工神经网络相比,虽然在建模能力上支持向量机略逊于BP神经网络,但其预测能力却明显优于BP神经网络;而对于血管紧张素转化酶抑制剂,支持向量机的建模和预测结果则略优于偏最小二乘和BP人工神经网络.其中采用线性核和径向基核的支持向量机模型在两个肽体系中建模和预测结果相当.研究显示支持向量机在药物的定量构效关系研究中具有广阔的应用前景. 展开更多
关键词 支持向量机 偏最小二乘 BP人工神经网络 定量关系 研究 血管紧张素转化酶抑制剂 BP神经网络 预测能力 预测结果 机用
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将潜因多元建模技术与遗传虚拟筛选模式相结合:改善定量构效关系 被引量:1
16
作者 李志良 田菲菲 +8 位作者 吴世容 杨善彬 杨胜喜 张巧霞 周原 覃仁辉 梅虎 陈刚 李根容 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 2008年第3期259-268,共10页
提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活... 提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活性考察,采用遗传算法(GA)筛选虚拟受体结合靶点及相互作用模式,结合偏最小二乘(PLS)潜因多元建模技术,通过交互检验均方根误差(RMSCV)作适应度评价函数筛选变化位点和受体残基,完成种群进化以最优个体为最终确定模型,得到一种新颖QSAR方法(mmQSAR):基于功能肽/蛋白质作用模式的遗传虚拟筛选(暂称GVSPPC).该法成功解决了诸多QSAR研究难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解的配基与之结合方式.分别使用生物功能寡肽和多肽体系对GVSPPC加以检验,其结果表明,GVSPPC得到了优于传统方法QSAR结果(R2cu>0.75~0.91,Q2cv>0.71~0.86,ERMS为0.19~0.95)且深入阐明配基与受体间作用机理,物理意义较为明确;同时计算选中模式作用能并与样本活性建立PLS模型,以其交互检验均方根误差(ERMScv)作评价函数完成种群进化.通过大规模迭代直到规定的终止条件或到达最大繁殖代数,以该过程最优个体作为最终确定QSAR模型. 展开更多
关键词 功能肽与蛋白质结合 遗传虚拟筛选 潜因多元 定量关系 偏最小二乘 遗传算法 交互检验 评价函数
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催化剂定量构效关系建模方法应用进展 被引量:1
17
作者 王继叶 项曙光 《计算机与应用化学》 CAS 2016年第10期1045-1049,共5页
从近十多年的应用进展情况来看,常用的催化剂定量构效关系(QSAR)建模方法包括以多元线性回归(MLR)、主成分回归(PCR)和偏最小二乘法(PLS)为主的线性方法和以基于反向传播算法(BP)和径向基函数神经网络(RBFNN)为主的人工神经网络(ANN)非... 从近十多年的应用进展情况来看,常用的催化剂定量构效关系(QSAR)建模方法包括以多元线性回归(MLR)、主成分回归(PCR)和偏最小二乘法(PLS)为主的线性方法和以基于反向传播算法(BP)和径向基函数神经网络(RBFNN)为主的人工神经网络(ANN)非线性方法两种。最有效的线性方法是PLS法,其优点是模型机理明确,缺点是有时不如RBFNN模型的预测能力强;最有效的非线性方法是RBFNN法,其优点是模型的预测能力往往比PLS模型强,但缺点是机理不够明确。最成功的也是最具应用前景的方法是综合采用PLS法和RBFNN法同时建立某一具体催化剂的PLS线性模型和RBFNN非线性模型。用PLS模型指导新型高效催化剂的结构设计,而用RBFNN模型来预测所设计催化剂的性能,反过来修正所设计催化剂的结构,从而减少催化剂合成实验的工作量。 展开更多
关键词 方法 定量关系(QSAR) 催化剂 应用进展
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几种QSAR建模方法在化学中的应用与研究进展 被引量:12
18
作者 周喜斌 韩文静 +2 位作者 陈晶 薛中华 卢小泉 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期761-764,共4页
定量构效关系(quantitative structure activity relationship,QSAR)是对化合物结构与其活性之间关系的定量描述研究,它是目前国际上1个比较活跃的研究领域。定量构效关系研究最初应用在生物领域,是定量药物设计的1个研究分支领域,为了... 定量构效关系(quantitative structure activity relationship,QSAR)是对化合物结构与其活性之间关系的定量描述研究,它是目前国际上1个比较活跃的研究领域。定量构效关系研究最初应用在生物领域,是定量药物设计的1个研究分支领域,为了适应合理设计生物活性分子的需要而发展起来的。由于计算机技术的发展和应用,QSAR的研究提高到了1个新的水平,日益成熟。QSAg的研究对象包括化合物的各种生物活性、毒性、药物的各种药代动力学参数和生物利用度以及分子的各种物理化学性质和环境行为等,研究领域涉及化学、药物以及环境等诸多学科。本文简单介绍了几种2D-QSAR和3D-QSAR建模方法:多元线性回归(MLR)、主成分分析(PCA)、偏最小二乘法(PLS)、人工神经网络(ANN)、支持向量机(SVM)、比较分子力场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数(CoMSLA),并对这几种不同的建模方法在实际中的应用进行举例。综述了定量构效关系在环境化学、农业化学、药物化学中的应用,并对定量构效关系研究的发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 定量关系 方法 应用
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一种新型氨基酸拓扑结构信息矢量及在肽定量构效关系研究中的应用 被引量:6
19
作者 李志良 李根容 +9 位作者 舒茂 孙家英 杨善彬 梅虎 张梦军 周萍 吴世容 陈国华 吕凤林 吕廷亭 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 2008年第8期745-754,共10页
从表征分子的66个结构参量和拓扑指数出发,经主成分分析(PCA)得到一种包含134个氨基酸体系的特征描述子:氨基酸拓扑与结构信息矢量(VTSA).将其应用于58个血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)和88个弹性蛋白酶模拟底物催化动力体系(ESCK)的定... 从表征分子的66个结构参量和拓扑指数出发,经主成分分析(PCA)得到一种包含134个氨基酸体系的特征描述子:氨基酸拓扑与结构信息矢量(VTSA).将其应用于58个血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)和88个弹性蛋白酶模拟底物催化动力体系(ESCK)的定量构效关系(QSAR)或定量序效模拟(QSAM)研究中,结合遗传偏最小二乘(GPLS)、支持向量机回归(SVMR)以及本文设计的免疫神经网络(INN)技术,成功建立了上述两个肽类似物样本集定量预测模型,并取得优于已有文献报道的结果:ACEI,Rcu2≥0.82,Rcu2≥0.77,Ermse≤0.44(GPLS+SVM);ESCK,Rcu2≥0.84,Rcu2≥0.82,Ermse≤0.20(GPLS+INN). 展开更多
关键词 氨基酸拓扑结构信息矢量(VTSA) 定量关系(QSAR) 定量拟(qsam) 分子结构与拓扑特征描述子(MSCD) 血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI) 弹性蛋白酶拟底物催化动力体系(ESCK)
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Spatio-Temporal Adaptive Super-Resolution Reconstruction Model Based on Zemike Moment for Spatial Video Sequences 被引量:1
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作者 Liang Meiyu Du Junping +2 位作者 JangMyung Lee Liu Honggang Zhang Yun 《China Communications》 SCIE CSCD 2012年第12期93-107,共15页
Video Super-Resolution (SR) reconstruction produces video sequences with High Resolution (HR) via the fusion of several Low-Resolution (LR) video frames. Traditional methods rely on the accurate estimation of su... Video Super-Resolution (SR) reconstruction produces video sequences with High Resolution (HR) via the fusion of several Low-Resolution (LR) video frames. Traditional methods rely on the accurate estimation of subpixel motion, which constrains their applicability to video sequences with relatively simple motions such as global translation. We propose an efficient iterative spatio-temporal adaptive SR reconstruction model based on Zemike Moment (ZM), which is effective for spatial video sequences with arbitrary motion. The model uses region correlation judgment and self-adaptive threshold strategies to improve the effect and time efficiency of the ZM-based SR method. This leads to better mining of non-local self-similarity and local structural regularity, and is robust to noise and rotation. An efficient iterative curvature-based interpolation scheme is introduced to obtain the initial HR estimation of each LR video frame. Experimental results both on spatial and standard video sequences demonstrate that the proposed method outperforms existing methods in terms of both subjective visual and objective quantitative evaluations, and greatly improves the time efficiency. 展开更多
关键词 video super-resolution fuzzy registration scheme Zemike moment non-local self-similarity self-adaptive threshold
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