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实时荧光定量PCR标准品的制备及应用 被引量:37
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作者 罗勇军 刘昕 《重庆医学》 CAS CSCD 2005年第3期414-415,共2页
目的 探讨并建立快速而准确用于实时荧光定量PCR标准品的方法。方法 通过培养细胞,提取总RNA并逆转录为cDNA后做PCR,电泳,胶回收,T A克隆,测序后,大量提取质粒,送公司定量。结果 获得了预期希望的质粒。结论 该方法能大量制备质粒... 目的 探讨并建立快速而准确用于实时荧光定量PCR标准品的方法。方法 通过培养细胞,提取总RNA并逆转录为cDNA后做PCR,电泳,胶回收,T A克隆,测序后,大量提取质粒,送公司定量。结果 获得了预期希望的质粒。结论 该方法能大量制备质粒标准品,在实验中取得较满意的效果。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 标准 TAQMAN探针
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小尾寒羊瘦素长型受体基因实时荧光定量PCR标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:5
2
作者 张桂山 徐晶 +2 位作者 娄玉杰 张善鹏 姜怀志 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第3期111-114,共4页
本试验旨在制备用于小尾寒羊瘦素长型受体(leptin receptor long form)基因实时荧光定量PCR的标准品质粒和标准曲线。提取初情期前小尾寒羊下丘脑弓状核组织总RNA,进行反转录合成第1链cDNA,然后进行PCR和目的基因片段的回收;通过T-A克... 本试验旨在制备用于小尾寒羊瘦素长型受体(leptin receptor long form)基因实时荧光定量PCR的标准品质粒和标准曲线。提取初情期前小尾寒羊下丘脑弓状核组织总RNA,进行反转录合成第1链cDNA,然后进行PCR和目的基因片段的回收;通过T-A克隆将该基因片段插入pMD18-T载体中,构建回收产物的重组质粒;大量提取质粒,定量后进行标准曲线的制作和实时荧光定量PCR。重组质粒经PCR扩增和测序,结果表明,瘦素长型受体基因已成功克隆。提示,所构建的瘦素长型受体基因实时荧光定量标准曲线线性关系好,灵敏度和特异性高,准确可靠,此方法可作为实时荧光定量PCR检测瘦素长型受体基因的标准方法。 展开更多
关键词 瘦素长型受体 实时荧光定量pcr 标准质粒
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db/db2型糖尿病模型小鼠肠道多形拟杆菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的比较研究 被引量:6
3
作者 易金阳 王烨 +8 位作者 朱明 韩雪 杨珍珍 姬凤彩 郑树涛 毛新民 王丽风 马晓丽 李琳琳 《新疆医科大学学报》 CAS 2012年第6期716-720,724,共6页
目的比较研究db/db 2型糖尿病模型小鼠肠道多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)实时荧光定量PCR 2种标准品制备方法。方法收集2型糖尿病小鼠db/db模型组和db/m对照组肠道内容物,同时以多形拟杆菌ATCC29148为标准菌株,提取微生物D... 目的比较研究db/db 2型糖尿病模型小鼠肠道多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)实时荧光定量PCR 2种标准品制备方法。方法收集2型糖尿病小鼠db/db模型组和db/m对照组肠道内容物,同时以多形拟杆菌ATCC29148为标准菌株,提取微生物DNA,用16SrRNA V6区多形拟杆菌引物,采用实时荧光定量PCR标准品制备中标准菌株法和正常组高阳性法2种标准品制备方式进行定量检测,比较2种方法的差异性。结果标准菌株法与正常组高阳性法测定db/m对照组和db/db模型组小鼠肠道多形拟杆菌的数量分别为(5.23×106±2.30×106)、(1.52×107±3.23×106)和(5.23×106±2.25×106)、(1.45×107±3.39×106),与db/m对照组相比,db/db模型组多形拟杆菌数量多,差异有统计学意义(P<0.05);标准菌株法与正常组高阳性法对检测多形拟杆菌的差异无统计学意义(P>0.05)。结论实时荧光定量PCR的标准品制备中标准菌株法与正常组高阳性法均可检测出较多的多形拟杆菌,并且2种检测方式都可以对肠道菌群进行检测。 展开更多
关键词 db/db鼠 2型糖尿病 多形杆菌 实时荧光定量pcr
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小鼠Bax基因实时荧光定量PCR标准品质粒的构建 被引量:2
4
作者 潘博 蔡青 +3 位作者 鲁强 付文卓 王继宏 潘耀谦 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第12期64-68,共5页
为了能够快速、准确定量小鼠Bax基因的mRNA,构建了小鼠Bax基因的标准品质粒和标准曲线。根据GenBank中小鼠基因编码区保守序列,设计特异性引物,从N2a细胞中提取总RNA,利用RTPCR技术扩增该基因162bp的核苷酸片段,经纯化、连接和转化后,... 为了能够快速、准确定量小鼠Bax基因的mRNA,构建了小鼠Bax基因的标准品质粒和标准曲线。根据GenBank中小鼠基因编码区保守序列,设计特异性引物,从N2a细胞中提取总RNA,利用RTPCR技术扩增该基因162bp的核苷酸片段,经纯化、连接和转化后,提取质粒并进行酶切、测序鉴定;将阳性重组质粒10倍递减稀释作为标准模板,通过SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,建立了Bax标准曲线及直线回归方程。结果表明产物熔解曲线峰值单一,引物特异性高;标准曲线相关系数R2=0.999,表明线性关系好。本试验成功构建了目的基因Bax的标准品质粒和标准曲线。 展开更多
关键词 BAX基因 实时荧光定量pcr 标准质粒 标准曲线
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草菇冷诱导Cor3基因实时荧光定量PCR标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:22
5
作者 汪虹 陈明杰 《食用菌学报》 2007年第3期16-19,共4页
构建草菇冷诱导Cor3基因实时荧光定量PCR的标准品和标准曲线。通过培养草菇菌丝,提取总RNA并逆转录为cDNA后进行PCR扩增,电泳后纯化产物,T-A克隆,测序,获得了预期质粒,提取质粒,梯度稀释构建标准曲线,取得了满意结果。为利用实时荧光定... 构建草菇冷诱导Cor3基因实时荧光定量PCR的标准品和标准曲线。通过培养草菇菌丝,提取总RNA并逆转录为cDNA后进行PCR扩增,电泳后纯化产物,T-A克隆,测序,获得了预期质粒,提取质粒,梯度稀释构建标准曲线,取得了满意结果。为利用实时荧光定量PCR技术研究草菇冷诱导Cor3基因的表达奠定了基础。 展开更多
关键词 草菇 冷诱导 Cor3基因 定量pcr 质粒标准 标准曲线
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结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的比较研究 被引量:3
6
作者 郭世奎 包维民 +3 位作者 龚昆梅 邵剑春 陈弟 王昆华 《中国现代普通外科进展》 CAS 2009年第11期939-942,共4页
目的:比较结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的优缺点及获得DNA的质与量。方法:以粪肠球菌作为试验菌株,分别采用标准菌株法、PCR扩增产物纯化法和PCR扩增目的片段割胶纯化法制备标准品,比较三者用于细菌实时荧光定量... 目的:比较结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的优缺点及获得DNA的质与量。方法:以粪肠球菌作为试验菌株,分别采用标准菌株法、PCR扩增产物纯化法和PCR扩增目的片段割胶纯化法制备标准品,比较三者用于细菌实时荧光定量PCR标准曲线制作的好坏及用核酸蛋白检测仪Biophotmeter测定获得DNA的质与量。并将PCR扩增产物纯化法得到的产物进行测序。结果:PCR扩增目的片段割胶纯化法获得DNA的量及纯度均较低,为29.9±3.2和2.8±0.2,标准菌株法和PCR扩增产物纯化法的量及纯度均较高,分别为62.9±2.7及1.7±0.1,59.1±2.7及1.8±0.1;PCR扩增目的片段割胶纯化法与标准菌株法和PCR扩增产物纯化法相比,差异有统计学意义(P<0.05),标准菌株法和PC R扩增产物纯化法相比,差异无统计学意义(P>0.05),但以标准菌株法为佳。采用标准菌株法及PCR扩增产物纯化法,能获得很好的标准曲线(r=-1.00)。并且纯化产物序列与目的片段序列完全相同。结论:标准菌株法及PCR扩增产物纯化法制备标准品作荧光定量PCR检测比PCR扩增目的片段割胶纯化法更适合肠道相关分子微生态的研究。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 粪便 细菌 实时荧光定量pcr
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小鼠脑脊髓炎病毒非编码蛋白片段实时荧光定量PCR标准品的构建 被引量:2
7
作者 袁文 张钰 +2 位作者 王静 刘香梅 黄韧 《实验动物与比较医学》 CAS 2012年第1期8-13,共6页
目的构建小鼠脑脊髓炎病毒(TMEV)非编码蛋白(UTR)片段标准品,用于实时荧光定量PCR检测小鼠脑脊髓炎病毒。方法RT-PCR扩增TMEVuTR片段上80-1094nt之间长度为1014bp的片段,将目的片段连接至pMD18-T载体,转化至DH5α感受态细胞。分... 目的构建小鼠脑脊髓炎病毒(TMEV)非编码蛋白(UTR)片段标准品,用于实时荧光定量PCR检测小鼠脑脊髓炎病毒。方法RT-PCR扩增TMEVuTR片段上80-1094nt之间长度为1014bp的片段,将目的片段连接至pMD18-T载体,转化至DH5α感受态细胞。分别经PCR鉴定和序列测定验证重组质粒。分光光度计测量重组质粒的吸光值,换算成拷贝数浓度后作10倍梯度稀释制得质粒标准品。然后进行实时荧光定量PCR分析,绘制标准曲线。结果TMEVUTR片段成功克隆至pMD18-T载体中,测序结果表明重组质粒中插入的UTR序列正确,实时荧光定量PCR分析10倍梯度系列稀释的质粒标准品所得到的标准曲线良好,统计学分析显示α值与标准品浓度的对数存在良好线性关系,回归系数在0.99以上。结论成功构建了TMEVUTR片段实时荧光定量PCR标准品,为今后TMEV实时荧光定量PCR检测打下了基础。 展开更多
关键词 小鼠脑脊髓炎病毒 实时荧光定量pcr 标准
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人B细胞激活因子受体-BAFF-R基因mRNA实时荧光定量PCR标准品的构建
8
作者 赵丽 张冬雷 +1 位作者 孙竹华 鞠少卿 《医学检验与临床》 2006年第2期9-10,25,共3页
目的构建实时荧光定量PCR(RFQ,-PCR的标准品以定量检测人B细胞激活因子受体。BAFF-R基因mRNA的表达。方法在BAFF-R基因高保守区设计了特异性的引物和荧光探针,用RT-PCR法从人外周血单个核细胞的总mR-NA中逆转录扩增BAJFF-R的cDNA,将纯化... 目的构建实时荧光定量PCR(RFQ,-PCR的标准品以定量检测人B细胞激活因子受体。BAFF-R基因mRNA的表达。方法在BAFF-R基因高保守区设计了特异性的引物和荧光探针,用RT-PCR法从人外周血单个核细胞的总mR-NA中逆转录扩增BAJFF-R的cDNA,将纯化的BAFF-R cDNA与PGEM-T载体进行连接,转化宿主菌DH-5α,然后提取重组质粒DNA,用限制性核酸内切酶EcoR I进行酶切鉴定并测序分析,最后对质粒标推进行实时荧光定量PCR检测。纯化质粒并检测260nm吸光度,确定原被的重组质粒拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品。结果酶切鉴定、PCR扩增及测序分析均证实TNF-αcDNAn重组到PGEM-T载体上。结论成功克隆了BAFF-R实时荧光PCR定量标准。 展开更多
关键词 人外周血单个核细胞 激活因子受体 基因 实时荧光定量 标准 构建 重组质粒 酶切鉴定 测序分析 定量检测 逆转录扩增 核酸内切酶 载体 荧光探针 梯度浓度 高保守区 定量标准 纯化 限制性 吸光度
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实时荧光定量PCR构建奶牛生殖系统PrP基因标准品质粒和标准曲线 被引量:7
9
作者 张太翔 宁章勇 +3 位作者 赵德明 周向梅 杨建民 尹晓敏 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期1-4,共4页
为阐释PrP基因在奶牛生殖系统的正常表达和正常的生理功能,以及为确定生殖系统在疯牛病垂直传播中的地位和其分子机理奠定基础,采用实时荧光定量RT-PCR的方法构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线。对含有目的基因质粒的EcoR... 为阐释PrP基因在奶牛生殖系统的正常表达和正常的生理功能,以及为确定生殖系统在疯牛病垂直传播中的地位和其分子机理奠定基础,采用实时荧光定量RT-PCR的方法构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线。对含有目的基因质粒的EcoRⅠ酶切鉴定表明所插入的片段大小为302 bp,与预期的结果一致。所构建的标准曲线的相关系数r2=0.999,系统生成的回归方程为y=-0.29x+9.48,说明成功构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线,为研究PrP基因在奶牛其他组织的定量奠定基础。 展开更多
关键词 PRP RT—pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 奶牛生殖系统 BSE
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实时荧光定量PCR检测PrP基因表达标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:12
10
作者 宁章勇 赵德明 +5 位作者 杨建民 崔亚利 孟丽平 吴长德 秦秀慧 马李颖 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期611-613,共3页
对金黄地鼠PrP基因序列进行分析,选择其高度保守区域设计引物,对金黄地鼠各组织提取mRNA,经RTPCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明PrP基因... 对金黄地鼠PrP基因序列进行分析,选择其高度保守区域设计引物,对金黄地鼠各组织提取mRNA,经RTPCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明PrP基因保守区段已经成功克隆.将107~102拷贝/反应的重组标准品质粒进行荧光定量PCR,10次重复Ct值平均分别为17.50±0.5、21.38±0.2、25.29±0.7、29.12±0.7、31.34±0.4、33.89±0.1,系统自动分析软件显示Ct值与标准品浓度的对数之间存在良好的线性关系,回归系数为0.998.对动力学曲线分析表明,在该反应体系和反应条件下,该标准曲线的灵敏度为102拷贝/反应.荧光PCR PrP基因表达检测标准品质粒和标准曲线的建立,为检测PrP基因的组织特异性表达和动物传染性海绵状脑病发生的分子机理奠定了基础. 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr PrP基因 标准曲线 重组质粒 动物传染性海绵状脑病
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实时荧光定量PCR构建绵羊PrP基因标准品质粒和标准曲线 被引量:3
11
作者 韩彩霞 赵德明 +4 位作者 吴长德 宁章勇 杨建民 刘美丽 马李颖 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1363-1366,共4页
Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid wa... Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid was constructed for calibrating unknown samples.In this study,the constructed plasmid containing only the target gene was used to construct a calibration curve.The absolute standard curve method was shown to be of high linearity,sensitivity and reproducibility.The purpose of this study is to investigate the quantification of PrP mRNA expression for knowing the scrapie pathogenesis and providing powerful tool for further studies on prion diseases pathogenesis. 展开更多
关键词 PRP RT—pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 绵羊
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铜绿假单胞菌荧光实时定量PCR标准品的构建 被引量:3
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作者 孙飞龙 邱志刚 +4 位作者 金敏 郭向飞 王新为 吴道澄 李君文 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期181-184,188,共5页
构建了荧光实时定量PCR标准品以检测水中的铜绿假单胞菌。利用所报道的铜绿假单胞菌gyrA基因为目的基因设计引物,通过培养细胞,煮沸法裂解细胞后做PCR,电泳,胶回收,然后与pMD19-TVector连接并转化到感受态大肠杆菌中;氨苄青霉素筛选出... 构建了荧光实时定量PCR标准品以检测水中的铜绿假单胞菌。利用所报道的铜绿假单胞菌gyrA基因为目的基因设计引物,通过培养细胞,煮沸法裂解细胞后做PCR,电泳,胶回收,然后与pMD19-TVector连接并转化到感受态大肠杆菌中;氨苄青霉素筛选出白色菌落,菌落PCR及测序鉴定其特异性,根据OD值确定浓度,制备梯度浓度参考标准品,制作标准曲线,检测水样品中铜绿假单胞菌的菌量。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 克隆 标准 荧光实时定量pcr 检测
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血管内皮生长因子(VEGF)实时荧光定量PCR质粒标准品的构建 被引量:2
13
作者 刘丽仙 霍金龙 +3 位作者 李颖 赵跃 霍海龙 曾养志 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期328-333,共6页
应用SYBR Green荧光染料检测方法构建VEGF基因质粒标准品,能快速、灵敏、可靠的检测与临床多种疾病密切相关的重要候选基因血管内皮生长因子(VEGF)的表达情况。本研究利用版纳微型猪近交系4~6月龄猪,提取皮肤创面总RNA,设计特异引物,进... 应用SYBR Green荧光染料检测方法构建VEGF基因质粒标准品,能快速、灵敏、可靠的检测与临床多种疾病密切相关的重要候选基因血管内皮生长因子(VEGF)的表达情况。本研究利用版纳微型猪近交系4~6月龄猪,提取皮肤创面总RNA,设计特异引物,进行RT-PCR扩增。纯化目的片段并与pMD18-T载体连接,转化宿主菌DH5α,提取重组质粒DNA,并经酶切、PCR和测序鉴定,计算重组质粒原液拷贝数浓度并制备梯度浓度标准品,进行实时荧光定量PCR。建立的VEGF基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法特异性较好,检测灵敏度可达1.0×103拷贝,线性范围达1.0×103~1.0×108拷贝,阈值循环数(Ct)与PCR体系中起始模板量的对数值之间存在良好的线性关系(r2=0.982),扩增效率高(E=96.92%)。通过构建版纳微型猪近交系VEGF基因质粒标准品,为探讨VEGF基因在临床多种疾病中所发挥的分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 实时荧光定量 VEGF基因 质粒标准
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荧光实时定量PCR检测铜绿假单胞菌外膜蛋白oprI基因的标准品的构建 被引量:2
14
作者 钟礼立 张兵 +4 位作者 贺蓉 林小娟 张爱民 蔡瑞云 段贞 《实用预防医学》 CAS 2006年第2期265-268,共4页
目的构建荧光实时定量PCR(FQ-PCR)标准品测定铜绿假单胞菌oprI基因,以此测定铜绿假单胞菌菌量。方法以铜绿假单胞菌的oprI基因为目的基因设计探针引物,提取细菌基因组DNA,与pMD 18-T Vector连接并转化到大肠杆菌中。用氨卞青霉素筛选出... 目的构建荧光实时定量PCR(FQ-PCR)标准品测定铜绿假单胞菌oprI基因,以此测定铜绿假单胞菌菌量。方法以铜绿假单胞菌的oprI基因为目的基因设计探针引物,提取细菌基因组DNA,与pMD 18-T Vector连接并转化到大肠杆菌中。用氨卞青霉素筛选出白色菌落,提取含目的基因质粒,并用HindⅢ限制酶进行线性化处理,通过直接PCR、OD值测定及DNA片段测序鉴定其特异性。根据OD值确定浓度,制备FQ-PCR梯度浓度参考标准品,做出标准曲线,检测各样品菌菌量。结果铜绿假单胞菌oprI基因的目的片段成功制备,获得稳定的重组质粒,保持了目的片段的特异性和序列完整性,并获得很好的标准曲线(相关系数0.994),成功检测了铜绿假单胞菌标准菌株、培养株的菌量,而大肠杆菌及阴性对照无扩增。结论成功构建FQ-PCR检测铜绿假单胞菌oprI基因的定量参考标准,荧光实时定量法可以快速检测铜绿假单胞菌。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 oprI基因 荧光实时定量pcr 标准
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古DNA实时荧光定量PCR实验中标准品的制备 被引量:2
15
作者 盛桂莲 吴恋娟 赖旭龙 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期386-391,共6页
实时荧光定量PCR技术通过对PCR每一循环扩增产物的实时检测,可对模板的精确拷贝数进行绝对定量,从而用于古DNA实验中提取和扩增条件的比较和优化.本研究采用异硫氰酸胍碱裂解-SiO2吸附的方法,从采自黑龙江省的晚更新世斑鬣狗化石材料中... 实时荧光定量PCR技术通过对PCR每一循环扩增产物的实时检测,可对模板的精确拷贝数进行绝对定量,从而用于古DNA实验中提取和扩增条件的比较和优化.本研究采用异硫氰酸胍碱裂解-SiO2吸附的方法,从采自黑龙江省的晚更新世斑鬣狗化石材料中提取得到了斑鬣狗线粒体基因组古DNA.经常规PCR扩增后,将纯化的扩增产物克隆到微生物体内使其大量复制,再用M13通用引物扩增出含少量外源DNA的古DNA目标片段,从而建立了适用于古DNA荧光定量PCR扩增的标准品的制备方法.经检测分析,运用该方法制备的标准品性质稳定,能够准确地指示反应体系中较为精确的古DNA模板拷贝数,从而反映古DNA的提取和扩增效率,用于比较并优化古DNA提取和扩增条件. 展开更多
关键词 古DNA 实时荧光定量pcr 标准
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实时荧光定量PCR检测鳜IgM mRNA标准品质粒的构建 被引量:2
16
作者 刘雨果 潘厚军 +3 位作者 陈偿 巩华 石存斌 吴淑勤 《广东海洋大学学报》 CAS 2008年第6期1-4,共4页
利用SYBR Green I荧光定量PCR技术,建立鳜IgM-DNA定量标准品的制备方法。从浸泡免疫后的鳜头肾中提取总RNA逆转录合成cDNA,对目的片段进行PCR扩增、电泳纯化、T-A克隆及测序鉴定。将所得预期质粒梯度稀释后构建标准曲线并进行融解曲线... 利用SYBR Green I荧光定量PCR技术,建立鳜IgM-DNA定量标准品的制备方法。从浸泡免疫后的鳜头肾中提取总RNA逆转录合成cDNA,对目的片段进行PCR扩增、电泳纯化、T-A克隆及测序鉴定。将所得预期质粒梯度稀释后构建标准曲线并进行融解曲线分析。结果表明,当标准品的浓度在3.29×102~3.29×108拷贝/μL时,模板浓度与循环阈值(Ct)间的线性关系良好,相关系数r2达到0.999;融解曲线分析显示具特异的单个峰,表明扩增产物特异性非常好。此法制备的重组质粒标准品可用于对鳜IgM基因的转录水平进行测定。 展开更多
关键词 IgM基因 实时荧光定量pcr
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实时荧光定量PCR构建BIM基因表达标准品质粒和标准曲线 被引量:1
17
作者 付文卓 潘博 +4 位作者 吴英婷 隋雷鸣 王利勇 武文琦 邹林樾 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第1期39-42,213,共5页
为了能够快速、准确定量BIM基因的mRNA,试验构建了小鼠BIM基因的标准品质粒和标准曲线,根据Gen Bank中鼠基因编码区保守序列,设计特异性引物,从N2a细胞中提取总RNA,利用RT-PCR技术扩增该基因122 bp的核苷酸片段,经纯化、连接和转化后,... 为了能够快速、准确定量BIM基因的mRNA,试验构建了小鼠BIM基因的标准品质粒和标准曲线,根据Gen Bank中鼠基因编码区保守序列,设计特异性引物,从N2a细胞中提取总RNA,利用RT-PCR技术扩增该基因122 bp的核苷酸片段,经纯化、连接和转化后,提取质粒并进行酶切、测序鉴定,然后将阳性重组质粒10倍递减稀释作为标准模板,通过SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,建立了BIM标准曲线及直线回归方程。结果表明:产物熔解曲线峰值单一,引物特异性高;标准曲线相关系数r2=0.998,线性关系好。说明成功构建了目的基因BIM的标准品质粒和标准曲线。 展开更多
关键词 BIM 实时荧光定量pcr 标准质粒 标准曲线
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基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR检测组织因子剪接异构体F3tv1及F3tv2 被引量:1
18
作者 穆原 周红 +2 位作者 胥亚 张晓蕾 王婷 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期485-488,共4页
目的建立基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR(qPCR)法检测人组织因子(TF)两种剪接异构体(F3tv1和F3tv2)。方法设计基因特异性上游引物与通用下游引物,通过引物末端延伸法将2种扩增产物进行序列简并,用于构建通用质粒标准品。用qPCR法... 目的建立基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR(qPCR)法检测人组织因子(TF)两种剪接异构体(F3tv1和F3tv2)。方法设计基因特异性上游引物与通用下游引物,通过引物末端延伸法将2种扩增产物进行序列简并,用于构建通用质粒标准品。用qPCR法检测人白血病细胞株THP-1、Jurkat及外周血单核细胞中F3tv1与F3tv2的表达,分析该法的线性范围与特异性。结果所建qPCR方法对F3tv1与F3tv2扩增特异,线性范围均为108~101copies/μL。THP-1与外周血单核细胞中F3tv1相对表达量分别为(5.70×10-4)±(2.62×10-5)与(1.79×10-4)±(4.37×10-5);F3tv2分别为(4.94×10-5)±(2.19×10-6)与(2.98±2.18)×10-6,Jurkat细胞株F3tv1与F3tv2均未检出。结论建立的qPCR方法可对TF两种剪接异构体同时进行精确、定量地检测,为深入研究TF的选择性剪接调控机制提供实验依据。 展开更多
关键词 组织因子 选择性剪接 引物末端延伸 实时荧光定量pcr
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稀释剂种类和冻融次数对质粒标准品实时荧光定量PCR检测的影响 被引量:2
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作者 雷杰 牛群 +4 位作者 王楠 杨瑜 谢贝 刘志辉 孟繁荣 《国际医药卫生导报》 2019年第10期1521-1525,共5页
目的探讨稀释剂种类和冻融次数这两种因素对实时荧光定量PCR检测中质粒标准品的影响。方法 分别采用ddH2O和TE缓冲液两种稀释剂将质粒标准品稀释为1×10^8、1×10^7、1×10^6、1×10^5、1×10^4拷贝/μl的5个浓度... 目的探讨稀释剂种类和冻融次数这两种因素对实时荧光定量PCR检测中质粒标准品的影响。方法 分别采用ddH2O和TE缓冲液两种稀释剂将质粒标准品稀释为1×10^8、1×10^7、1×10^6、1×10^5、1×10^4拷贝/μl的5个浓度检测液各5份,在冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次之后进行实时荧光定量PCR检测,比较其Ct值。结果 ①浓度1×10^8、1×10^7、1×10^6、1×10^5、1×10^4拷贝/μl时,冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次之后,质粒标准品在ddH2O和TE缓冲液两种稀释剂中,实时荧光定量PCR检测Ct值中位数分别为17.46和17.32(P>0.05),23.52和23.61(P>0.05),26.77和26.37(P>0.05),32.73和30.88(P<0.05),33.08和31.51(P<0.05)。②冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次,在ddH2O和TE缓冲液中,各浓度标准品Ct值中位数分别如下:1×108拷贝/μl:17.43、17.56、17.45、17.45、17.26、17.94(P>0.05)和17.38、17.36、17.47、17.31、17.30、17.62(P>0.05);1×10^7拷贝/μl:22.17、23.16、24.12、23.51、23.94、23.89(P<0.05)和22.40、24.09、24.07、23.54、23.68、24.05(P<0.05);1×10^6拷贝/μl:24.66、25.27、26.66、27.29、27.78、27.40(P<0.05)和24.92、26.22、26.31、26.59、26.93、26.53(P<0.05);1×10^5拷贝/μl:29.25、30.66、32.72、32.84、33.27、33.39(P<0.05)和29.21、30.10、30.97、30.87、31.72、32.44(P<0.05);1×10^4拷贝/μl:31.05、30.50、32.99、33.21、33.59、33.41(P<0.05)和31.22、31.28、31.49、31.52、32.37、32.31(P<0.05)。结论 相对于ddH2O,质粒标准品选择用TE缓冲液作为稀释剂更稳定。质粒标准品随着冻融次数增多,其稳定性越差,因此要避免反复冻融质粒标准品。 展开更多
关键词 冻融 稀释剂 质粒标准 实时荧光定量pcr
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实时荧光定量PCR检测多鳍鱼Shh基因表达标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:1
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作者 张昌盛 王俊杰 +2 位作者 李湘涛 翟红 刘群 《科技导报》 CAS CSCD 2007年第13期41-44,共4页
为了快速、准确定量多鳍鱼Shh基因在机体组织中的表达水平,根据笔者克隆的Shh基因序列,选择其高度保守区域设计一对引物,对多鳍鱼各组织提取mRNA,经RT-PCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α。筛选后得到重组标准品质... 为了快速、准确定量多鳍鱼Shh基因在机体组织中的表达水平,根据笔者克隆的Shh基因序列,选择其高度保守区域设计一对引物,对多鳍鱼各组织提取mRNA,经RT-PCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α。筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明Shh基因保守区段已经成功克隆。将重组标准品质粒进行倍比稀释,然后以此为模板,进行荧光定量PCR,系统自动分析软件显示Ct值与标准品浓度的对数之间存在良好的线性关系。回归方程为y=-0.32x+10.47,回归系数为1.00。构建Shh基因表达检测标准品质粒和标准曲线,建立检测多鳍鱼Shh基因荧光定量PCR方法,为进一步研究Shh基因在组织中的动态分布和研究多鳍鱼系统发育奠定了基础。 展开更多
关键词 Shh基因 实时荧光定量pcr 标准曲线 多鳍鱼
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