实时荧光定量PCR检测不同结核标本及其联合玻璃珠磨菌法检测的价值

目的研究实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)与玻璃珠磨菌法联合用于不同结核标本检测中的价值。方法以回顾性分析为法,收集并分析2021年1月至2022年6月在上海交通大学医学院附属仁济医院住院与门诊诊治的疑似结核病患者1200份不同临床标本的qRT-PCR测定结果,其中血液样本469份,胸腔积液标本322份,心包积液标本16份,尿液标本25份,气管(支气管)肺泡灌洗液标本8份,腹腔积液标本34份,脑脊液标本143份,脓液标本31份,痰液标本152份;同时,对41份痰液标本予以玻璃珠振荡磨菌前后qRT-PCR定量检测效果分析。结果1200份不同结核标本的总检测阳性率为15.83%(190/1200),其中检出率最高的为气管(支气管)肺泡灌洗液标本,占比为37.50%(3/8),且门诊患者阳性率最高,占比为40.00%(2/5);脓液标本检出率第二,占比为35.48%(11/31),且住院患者阳性率最高,占比为38.46%(10/26);痰液标本检出率第三,占比为30.26%(46/152)。41份痰液标本经玻璃珠磨菌处理5 min之后,qRT-PCR检测核酸浓度明显高于处理前,差异有统计学意义(P<0.05);其中,14份痰液标本提升了菌株数量级,且11份含菌量为10^(2)拷贝/mL痰液标本于振荡研磨处理之后,7份痰液标本提升至了10^(3)拷贝/mL菌量数量级,磨菌处理后阳性检出率明显高于磨菌处理前,差异有统计学意义(P<0.05)。结论气管(支气管)肺泡灌洗液标本、脓液标本、痰液标本检测中qRT-PCR的检出率较高,而qRT-PCR在其他结核标本检测中的检出率较低,qRT-PCR联合玻璃珠磨菌法检测可有效提升临床结核标本阳性检出率。

酶联免疫吸附测定法和实时荧光定量PCR法对乙型肝炎的诊断价值比较

目的比较酶联免疫吸附测定法和实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)法在乙型肝炎诊断中的应用价值。方法选取120例疑似乙型肝炎患者作为本次研究对象,分别进行酶联免疫吸附测定法以及实时荧光定量PCR法检验。以病理检查为金标准,分析酶联免疫吸附测定法和实时荧光定量PCR法的检查结果,对比两种检查方法的诊断效能,包括特异度、灵敏度以及准确度。结果120例疑似患者经病理检查确诊75例为乙型肝炎。酶联免疫吸附测定法检出阳性74例,阴性46例;实时荧光定量PCR法检出阳性75例,阴性45例。实时荧光定量PCR法检测乙型肝炎的特异度、灵敏度以及准确度分别为93.33%、96.00%、95.00%,均明显高于酶联免疫吸附测定法的73.33%、82.67%、79.17%,差异有统计学意义(χ^(2)=6.4800、6.9963、13.3724,P<0.05)。结论采用实时荧光定量PCR法进行乙型肝炎的检测具有较高的准确率,可以为医生诊断和治疗方案的制定及调整提供良好的依据。

胶体硒法HIV快速检测与实时荧光定量PCR法检验的一致性研究

目的:探究胶体硒法人类免疫缺陷病毒(HIV)快速检测与实时荧光定量PCR法检验的一致性。方法:选取2020年1月—2021年1月到艾滋病自愿咨询检测(VCT)门诊就诊的987例患者为研究对象,均接受胶体硒法、实时荧光定量PCR法检验,以免疫印迹法为金标准,比较不同检测方式的诊断效能、不同检测方式之间检验的一致性,对比不同方式对“窗口期”弱阳性抗体检测情况及不同检测方式的一致性。结果:987例疑似HIV高感染风险患者中,经免疫印迹法检测发现,373例阳性,614例为阴性;胶体硒法与实时荧光定量PCR法比较无统计学差异(P>0.05)。胶体硒法诊断结果与免疫印迹法诊断结果之间具有一致性(Kappa值=0.539),等级为中度;实时荧光定量PCR法与免疫印迹法诊断结果之间具有一致性(Kappa值=0.872),等级为高度;经免疫印迹法检测45份“窗口期”弱阳性抗体实时荧光定量PCR法检测43例阳性,胶体硒法检测42例阳性,实时荧光定量PCR法的灵敏度、准确度均显著高于胶体硒法(P<0.05)。胶体硒法与实时荧光定量PCR法胶在“窗口期”弱阳性抗体诊断结果中的一致性较差(Kappa值=0.357)。结论:胶体硒法与实时荧光定量PCR法对HIV检测的效果具有一致性,实时荧光定量PCR法准确性略高;胶体硒法与实时荧光定量PCR法在“窗口期”弱阳性抗体诊断结果中的一致性较差,实时荧光定量PCR法在“窗口期”弱阳性抗体血清检测中具有较高的检测价值。

实时荧光定量PCR法在儿童巨细胞病毒感染诊断中的应用分析

目的分析实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)法在人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)感染诊断中的应用价值。方法选取2021年1月至2023年3月我院收治的88例疑似HCMV感染患儿,于清晨采集患儿空腹静脉血5ml及新鲜晨尿的中段尿5ml,采用ELISA法测定HCMV-IgM,采用FQ-PCR法测定HCMV-DNA。统计病毒培养法诊断结果;以病毒培养法诊断结果作为金标准,计算HCMV-IgM、HCMV-DNA诊断HCMV感染结果,并计算诊断HCMV感染结果与病毒培养法诊断结果的一致性。结果88例疑似HCMV感染患儿中经病毒培养法诊断HCMV感染60例;以病毒培养法诊断结果作为金标准,HCMV-IgM诊断阳性34例,阴性54例,其中漏诊28例,误诊2例,HCMV-IgM诊断结果与病毒培养法诊断结果一致性差(Kappa=0.370,P=0.000);HCMV-DNA诊断阳性52例,阴性36例,其中漏诊9例,误诊1例,HCMV-DNA诊断结果与病毒培养法诊断结果一致性极好(Kappa=0.757,P=0.000);HCMV-DNA诊断灵敏度、准确度均高于HCMV-IgM,差异有统计学意义(P<0.05);HCMV-DNA与HCMV-IgM诊断特异度比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论FQ-PCR法诊断HCMV感染灵敏度、准确度及特异度均较高,FQ-PCR法诊断结果与病毒培养法结果一致性较为理想,能够降低误诊、漏诊风险。

基于实时荧光定量PCR的番木瓜多重PCR高效检测方法

以pCaMV35S基因核酸检测试剂盒反应体系为基础,添加多重PCR反应所需的目标基因引物和番木瓜(Carica papaya L.)DNA,进行多重PCR反应,同时考察不合成荧光探针的情况下对目标基因进行实时荧光定量检测。结果表明,在实时荧光定量PCR反应体系中,多重PCR扩增的基因条带比常规PCR扩增的基因条带更亮,在不合成荧光探针的情况下实现目标基因的实时荧光定量PCR反应,以期建立一种基于实时荧光定量PCR的多重PCR检测方法。

荧光染色与实时荧光定量PCR法检测在肺结核辅助诊断中的应用效果分析

探究肺结核辅助诊断中最有效的方式。方法 样本选取时间:(2021年1月-2022年6月);样本选取对象:疑似肺结核患者800例;以肺结核基层诊疗指南(实践版·2018)为金标准。分析诊断结果。结果 诊断结果:800例疑似患者中,阳性324例,阴性476例。荧光染色检测:真阳304例、假阳29例、真阴447例、假阴20例;实时荧光定量PCR法:真阳305例、假阳25例、真阴451例、假阴19例;联合:真阳314例、假阳1例、真阴475例、假阴10例。与荧光染色、实时荧光定量PCR法检测相比,联合方式诊断准确性、诊断灵敏性、特异性更高(P<0.05)。结论 荧光染色与实时荧光定量PCR法检测联合诊断肺结核具有较高的诊断效能,可实现早诊断、早治疗,临床应用价值显著,可继续推广及应用。

烟草花叶病毒实时荧光定量PCR检测体系的构建

[目的]防止隐症携带烟草花叶病毒(TMV)的烟苗移栽到大田造成产量损失。[方法]根据TMV的外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列设计引物及探针,通过绘制标准曲线、重复性、特异性及灵敏性分析,建立了一种TMV的TaqMan-qPCR检测方法。[结果]该方法特异性好,与其他常见的烟草病毒无交叉反应;灵敏度高,检测下限可达到4.53×10^(1) copies/μL,比常规RT-PCR检测灵敏度提高了10倍;建立的标准曲线斜率为-3.299,决定系数(R^(2))为0.9933,扩增效率为100.97%,且循环阈值(Ct)与质粒标准品浓度之间线性关系良好,重复性试验结果可靠。[结论]利用建立的TaqMan-qPCR检测方法与常规RT-PCR检测方法同时检测烟苗样品,检测结果一致,进一步验证了荧光定量PCR方法的可靠性。

转基因烟草中外源基因实时荧光定量PCR检测方法的建立

【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以烟草单拷贝的内源核糖核酸还原酶基因(RNR2)作为内参基因,建立相对定量的双标准曲线法检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法。【结果】构建RNR2基因、GFP基因实时荧光定量PCR的标准曲线,分别为y=-0.2858x+5.6695和y=-0.2826x+2.1048,R2分别为0.9994和0.9989,相关性较高。在检测的5株转基因烟草中GFP基因的拷贝数分别为5、8、19、28和45,非转基因烟草植株的GFP基因拷贝数为0。【结论】建立的转基因烟草中外源基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法具有简单、快速、准确等优点,可用于基因工程中对优良转化植株的筛选及外源基因表达量的快速检测和定量分析。

TaqMan探针法实时荧光定量PCR检测西瓜潜隐病毒

【目的】西瓜潜隐病毒(Citrullus lanatus cryptic virus,CiLCV)是近年来新发生的一种重要种传病害,研究旨在建立基于TaqMan探针法的实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR with TaqMan probes,TaqMan-qPCR)检测技术,为开展种子、种苗带毒鉴定和病害防控提供技术支撑。【方法】通过基于小RNA高通量测序技术在北京西瓜产地发现了CiLCV,并克隆CiLCV的dsRNA1和dsRNA2全长序列,设计特异性引物建立RT-PCR和TaqMan-qPCR检测方法。以黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottled mosaic virus)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus)、甜瓜内源病毒(Cucumis melo endornavirus)、瓜类褪绿病毒(cucurbit chlorotic yellows virus)、南瓜花叶病毒(squash mosaic virus)、番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus)、西瓜花叶病毒(watermelon mosaic virus)、小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus)8种常见病毒为对照进行检测方法特异性分析;利用建立的实时荧光定量标准曲线对方法灵敏度进行评价;进一步利用TaqMan-qPCR和RT-PCR技术监测我国葫芦科作物主产区的西瓜、黄瓜、甜瓜和南瓜(砧木)种苗带毒情况。【结果】通过分析获得的高质量小RNA数据,发现17条组装的contig与CiLCV基因组有较好同源性。进一步克隆获得CiLCV的dsRNA1和dsRNA2序列全长(分别为1603和1466 nt),发现其与河南省鉴定出的CiLCV同源性高达99.4%和99.8%(GenBank number KY081285、KY081284)。建立的RT-PCR检测技术对CiLCV有单一扩增条带;建立的TaqMan-qPCR检测技术具有较好特异性和灵敏度,且能够检测到最低拷贝数为2×10^(3)的病毒,灵敏度是RT-PCR的100倍。同时,发现有1份来自北京的西瓜种苗检出了CiLCV,而其余地区的西瓜、黄瓜、甜瓜和南瓜(砧木)种苗均未检出该病毒,表明我国葫芦科作物主产区种苗带毒情况总体不高。【结论】建立的TaqMan-qPCR检测CiLCV技术特异性强、灵敏度高,适用于口岸和实验室开展CiLCV快速检测和精准鉴定。鉴于CiLCV可以通过种子、种苗等传播方式快速扩散,我国应重视种子、种苗的带毒检测,防止带毒种子、种苗流入生产环节进而调运扩散至全国,给产业造成重大经济损失。

牛奶β-乳球蛋白质实时荧光定量PCR检测方法的建立

建立一种快速、特异、灵敏的Taqman实时荧光定量PCR（real-time PCR）方法,用于牛奶主要过敏原β-乳球蛋白质的检测。根据Gen Bank登录的牛β-乳球蛋白质的DNA序列设计,合成一对特异性引物和探针。将扩增产物连接到p MD19-T载体上,制备质粒标准品并测序鉴定,10倍梯度稀释含有β-乳球蛋白质基因的重组质粒,进行实时荧光定量PCR扩增,绘制标准曲线,检测该方法的特异性、稳定性、灵敏性,同时将建立的方法用于10种市售食品的检测。成功建立了β-乳球蛋白质的实时荧光定量PCR检测方法,标准曲线的Ct值与模板浓度在3.18×103~3.18×107copies范围内线性关系良好,R2值为0.997 8;检测灵敏度高（318 copies/μL）;特异性强,对羊奶、豆浆DNA均无扩增反应;稳定性好,组内、组间的变异系数均在5%以内。对10种食品牛奶过敏原的检测结果与标签相符。表明所建立的实时荧光定量PCR方法可应用于食品中牛奶过敏原β-乳球蛋白质的检测并可推广到其它过敏原的检测。

应用实时荧光定量PCR方法检测血小板制品细菌污染

目的应用实时荧光定量PCR方法检测血小板制品中细菌的探讨。方法选取金黄色葡萄球菌及大肠埃希氏杆菌,用改良的Chelex-100法抽提细菌基因组DNA,进行荧光定量PCR检测。并应用过滤法去除反应体系中潜在的细菌及其基因组DNA污染。结果针对16srRNA基因保守序列进行扩增的荧光定量PCR方法具有较高的特异性和灵敏度,与人类淋巴细胞及病毒等的基因组无交叉反应。在金黄色葡萄球菌检测中,应用过滤法后最低含菌量组与阴性对照组Ct值有极显著差异(P<0.001)。该方法对金黄色葡萄球菌的最低检出量为0.3CFUs/PCR,与阴性对照Ct值有显著差异(P<0.01),在大肠埃希氏杆菌中该法可检测出0.1CFUs/PCR,与阴性对照Ct值有显著性差异(P<0.01)。结论改良Chelex-100法抽提细菌基因组及后续的荧光定量PCR分析用于检测血小板制品中的细菌污染,检测实验缩短到3-4h,操作简单,灵敏性高,特异性好,为在临床标本大规模检测中的应用提供理论基础和实验数据。

一种简便、高效的实时荧光PCR相对定量方法的建立

目的建立一种简便、高效的实时荧光PCR相对定量方法。方法采用严格一致的引物参数,对Fabp5、Ppar-α及β-Actin三个基因分别设计特异性扩增引物,制备相应的质粒标准品,10倍梯度稀释后制作标准曲线。并以这三个标准曲线分别单独定量正常小鼠肝组织、H-ras12V转基因小鼠肝肿瘤周围组织和肿瘤组织中的Fabp5、Ppar-α和β-Actin的表达水平,以β-Actin为内参,分别采用双标准曲线法、2-△△Ct法和单标准曲线法对Fabp5和Ppar-α的表达进行相对定量分析。结果单标准曲线法与双标准曲线法测定的Fabp5和Ppar-α差异性表达的相对定量值没有显著差异,而用2-△△Ct法获得的相对定量值与双标准曲线法相比,波动较大。结论在引物参数严格一致的基础上,单标准曲线法是一种可行、简便、高效的实时荧光PCR相对定量方法。

实时荧光定量PCR法检测HCV-RNA测量不确定度评价

目的探讨对实时荧光定量PCR法测HCV-RNA测量不确定度评定的合理方式。方法依据Nordtest准则,利用实时荧光定量PCR法检测HCV-RNA室内质控及室间质评标本,收集2012年4～9月的HCV-RNA室内质控数据及2010～2012年室间质评结果。计算其批内及批间变异系数、系统偏倚变异系数,确定其相应的标准不确定度分量,进而计算出其扩展不确定度。结果同一天内12次HCV-RNA室内质控的检测批内变异系数为2.55%,2012年4～9月共155个工作日的HCV-RNA检测批间变异系数为5.80%;2010～2012年卫生部临检中心室间质评共30个检测数据的系统偏倚变异系数为5.04%,剔除8个检测为零的数据后重新计算变异系数为5.97%。批内、批间及系统偏倚的因素合成后,扩展不确定度为16.18%,剔除8个检测为零的数据后为17.16%。结论对实时荧光定量PCR法测HCV-RNA测量不确定度的评价,利用现有室内外质控数据,无须额外测试,简单易行,是医学检验实验室较为实用的一种测量不确定度评价方式,但数据的纳入应考虑方法的特殊性。

改良多重实时荧光定量PCR法测定抑癌基因MGMT、p16、CDH13和RASSF1A甲基化在肺癌早期诊断中的作用

目的:建立改良多重实时荧光定量PCR法,检测抑癌基因MGMR、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,探讨其在肺癌早期诊断中的应用。方法:选取30例病理确诊为肺癌的患者作为肺癌组,30例病理确诊为良性病变的患者作为对照组。建立改良实时荧光定量PCR体系。检测受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,对比两组基因甲基化阳性率,计算四项基因甲基化单独及联合用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度。结果:肺癌组受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A显著高于对照组(P<0.05);MGMT、p16、CDH13和RASSF1A四项基因甲基化联合检测用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度显著高于单项指标检测(P<0.05)。结论:建立了多重实时荧光定量PCR法用于MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化检测,联合检测用于肺癌早期诊断具有较高的敏感度和特异度。

实时荧光定量PCR法快速测定水中微囊藻

以铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)16S rRNA基因片段为靶序列设计一对特异性引物,采用Real-time PCR法,对铜绿微囊藻进行定性、定量检测。试验表明,仅含铜绿微囊藻DNA模板的样品有特异性扩增,扩增产物熔解曲线平稳,峰尖且窄,熔解温度为(87±1)℃。以重组质粒pMD-18T-16S为标准品,检测区间为1.1×102copies/mL～1.1×108copies/mL,所得标准曲线符合制备实时定量PCR标准曲线的要求,对标准品进行测定,方法检出限为11 copies/mL。用该标准曲线对实验室培养获得的铜绿微囊藻DNA样品进行定量检测,与显微镜计数结果基本一致。

实时荧光定量PCR法检测淋病奈瑟菌感染的效果

①目的 应用实时荧光定量聚合酶链反应 (FQ PCR)技术准确定量检测临床标本中淋病奈瑟菌基因 ,同时与金标准———细菌培养法比较其灵敏度和特异度 ,为临床淋病的诊疗提供依据。②方法 采集 173例病人临床标本 ,以PE5 70 0全自动PCR扩增分析仪和淋病奈瑟菌实时荧光定量PCR检测试剂盒进行核酸检测。同时 ,用含PolyViteX的巧克力板对淋病奈瑟菌进行分离 ,用ATBExpression自动细菌鉴定仪及配套的APINH进行鉴定。③结果 173份临床标本中 ,荧光定量PCR法示 4 7例淋病奈瑟菌阳性 ,阳性率为 2 7.2 % ;细菌培养法示 4 1例淋病奈瑟菌阳性 ,阳性率为 2 3.7%。与细菌培养法相比 ,荧光定量PCR法的灵敏度为 10 0 % ,特异度为 95 .5 % ,两者的符合率为 96 .5 %。④结论 荧光定量PCR技术具有简便、快捷、灵敏度高、特异度高、定量准确等优点 。

实时荧光定量PCR法在结核性脑膜炎诊断中的应用

结核性脑膜炎（以下简称结脑）是最常见和最严重的肺外结核病之一，由于结核杆菌（TB）的变异和耐药菌的增多，本病的临床表现可不典型，导致诊断难度加大。

实时荧光定量PCR检测巨细胞病毒两种白细胞提取方法对比分析

目的比较实时荧光定量PCR技术检测巨细胞病毒两种白细胞提取处理方法。方法对51例新生儿黄疸患者外周血分别进行淋巴细胞分离液法提取白细胞和0.8%氯化胺裂解红细胞法提取白细胞,然后同时进行实时荧光定量PCR检测。结果51例样本中两种方法均阳性5例,白细胞抽提液法阳性、氯化胺裂解红细胞法阴性2例;白细胞抽提液法阴性、氯化胺裂解红细胞法阳性4例;两者均阴性40例;氯化胺裂解红细胞阳性率法17.64%,淋巴细胞分离液法阳性率13.72%。经统计学分析,两方法阳性率差异无显著性(χ2=0.5,P>0.05)。结论氯化胺裂解红细胞法提取白细胞方法简便、可靠,可用于荧光定量PCR检测巨细胞病毒。

实时荧光定量PCR法检测乙肝病毒DNA的价值分析与研究

目的探讨选择实时荧光定量PCR法对乙肝病毒DNA实施检测的临床价值。方法 250例乙型肝炎患者作为此次实验对象,临床选择血清学标志物的方法实施疾病检测后最终有效确诊。对所有乙型肝炎患者临床均选择实时荧光定量PCR法实施疾病检测,对最终检测结果进行分析。结果乙型肝炎患者分别选择荧光PCR法以及血清学标志物方法实施疾病检测,最终获得的检测结果基本表现一致。临床选择实时荧光定量PCR法完成疾病检测后,最终获得的病毒DNA数据更为准确。实时荧光定量PCR法对大三阳临床最终检测阳性率达到了96%;对小三阳,临床最终检测阳性率达到了69%;而对Hbs Ag(-)、乙型肝炎表面抗体(Hbs Ab)(-)以及Hbe Ab(-)以及乙型肝炎E抗原(Hbe Ag)(-)最终检测阳性率只为2.21%。对于大三阳患者以及小三阳患者的血清PCR检测结果进行观察发现,均表现出较高的拷贝数。结论乙型肝炎患者临床选择实时荧光定量PCR法实施疾病检测,针对乙肝病毒以及相关数据完成检测后可以获得准确结果 ,从而证明对乙型肝炎患者在实施疾病检测的过程中,选择实时荧光定量PCR法以及乙肝病毒DNA方法均可以获得较为理想的效果,临床均可以广泛普及应用。