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猪萨佩罗病毒VP1基因重组质粒实时荧光定量PCR标准曲线的建立
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作者 刘熠凡 张静雯 王平利 《河南畜牧兽医》 2024年第3期7-9,18,共4页
为建立用实时SYBRGreenI荧光定量PCR方法检测PSVVP1基因表达量的标准曲线,试验根据目的基因在NCBI上CDS区的序列设计合成引物,用T4连接酶将目的片段与pMD18-T载体连接,构建重组质粒,采用real-time RT-PCR的检测方法,建立了检测猪萨佩罗... 为建立用实时SYBRGreenI荧光定量PCR方法检测PSVVP1基因表达量的标准曲线,试验根据目的基因在NCBI上CDS区的序列设计合成引物,用T4连接酶将目的片段与pMD18-T载体连接,构建重组质粒,采用real-time RT-PCR的检测方法,建立了检测猪萨佩罗病毒VP1基因表达量的标准曲线。试验结果显示,线性回归系数为0.9981,且熔解曲线只有一个峰值,表明由VP1目的基因所建立的标准曲线线性关系良好。试验成功建立了用SYBRGreenI荧光定量RT-PCR方法检测猪萨佩罗病毒VP1基因表达量的标准曲线,为后续检测基因表达量的变化奠定了基础。 展开更多
关键词 PSV 重组质粒 实时荧光定量pcr 标准曲线
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希特林蛋白缺乏症实时荧光PCR解链曲线快速基因分型的建立与应用 被引量:1
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作者 丁瑞敏 《微量元素与健康研究》 CAS 2022年第3期90-91,共2页
目的:探究希特林蛋白缺乏症(CD)快速基因分型的方法。方法:常见突变靶点为SLC25A13基因中的c.851-854delGTAT、c.1638-1660dup23、IVS6+5G>A,根据突变点相应位置设计的PCR扩增引物、荧光标记和淬灭探针,使用双盲法检测40例编号后的... 目的:探究希特林蛋白缺乏症(CD)快速基因分型的方法。方法:常见突变靶点为SLC25A13基因中的c.851-854delGTAT、c.1638-1660dup23、IVS6+5G>A,根据突变点相应位置设计的PCR扩增引物、荧光标记和淬灭探针,使用双盲法检测40例编号后的已知基因型血斑标本,评估其应用效果。结果:所有干血斑中gDNA样本检测出的结果与靶基因型存在较高的相符度,灵敏度及特异度均为100%。结论:建立实时荧光PCR解链曲线快速基因分型的方法具有较好的应用效果,具有准确性高、简单实用等优势,可将其作为CD中SLC25A13基因常规分子诊断及筛查的方法。 展开更多
关键词 希特林蛋白缺乏症 实时荧光pcr解链曲线 基因突变 基因分型
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实时荧光定量PCR构建奶牛生殖系统PrP基因标准品质粒和标准曲线 被引量:7
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作者 张太翔 宁章勇 +3 位作者 赵德明 周向梅 杨建民 尹晓敏 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期1-4,共4页
为阐释PrP基因在奶牛生殖系统的正常表达和正常的生理功能,以及为确定生殖系统在疯牛病垂直传播中的地位和其分子机理奠定基础,采用实时荧光定量RT-PCR的方法构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线。对含有目的基因质粒的EcoR... 为阐释PrP基因在奶牛生殖系统的正常表达和正常的生理功能,以及为确定生殖系统在疯牛病垂直传播中的地位和其分子机理奠定基础,采用实时荧光定量RT-PCR的方法构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线。对含有目的基因质粒的EcoRⅠ酶切鉴定表明所插入的片段大小为302 bp,与预期的结果一致。所构建的标准曲线的相关系数r2=0.999,系统生成的回归方程为y=-0.29x+9.48,说明成功构建了奶牛生殖系统PrP基因的标准质粒和标准曲线,为研究PrP基因在奶牛其他组织的定量奠定基础。 展开更多
关键词 PRP RT—pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 奶牛生殖系统 BSE
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分子信标实时荧光定量PCR构绵羊PrP基因质粒和标准曲线 被引量:6
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作者 王川 吴润 +3 位作者 李发弟 刁小龙 赵春林 王芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期708-711,共4页
目的为能够用实时荧光定量PCR研究消化系统PrP mRNA的表达水平,构建目的基因PrP的标准品质粒和标准曲线。方法根据GenBank中绵羊基因编码区保守序列,设计特异性引物和分子信标探针;提取总RNA,经反转录、RT-PCR后,提取质粒,PCR-SSCP及测... 目的为能够用实时荧光定量PCR研究消化系统PrP mRNA的表达水平,构建目的基因PrP的标准品质粒和标准曲线。方法根据GenBank中绵羊基因编码区保守序列,设计特异性引物和分子信标探针;提取总RNA,经反转录、RT-PCR后,提取质粒,PCR-SSCP及测序鉴定,获得ARQ质粒;将质粒梯度稀释,进行荧光定量PCR,获得标准曲线及回归方程。结果结果显示,本实验设计的分子信标具有特异性强、灵敏度高和结果准确的特性;标准曲线相关系数r2=0.999,表明线性关系好,成功构建了目的基因的标准品质粒和标准曲线。 展开更多
关键词 PRP RT-pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 质粒 绵羊
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实时荧光定量PCR检测PrP基因表达标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:12
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作者 宁章勇 赵德明 +5 位作者 杨建民 崔亚利 孟丽平 吴长德 秦秀慧 马李颖 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期611-613,共3页
对金黄地鼠PrP基因序列进行分析,选择其高度保守区域设计引物,对金黄地鼠各组织提取mRNA,经RTPCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明PrP基因... 对金黄地鼠PrP基因序列进行分析,选择其高度保守区域设计引物,对金黄地鼠各组织提取mRNA,经RTPCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明PrP基因保守区段已经成功克隆.将107~102拷贝/反应的重组标准品质粒进行荧光定量PCR,10次重复Ct值平均分别为17.50±0.5、21.38±0.2、25.29±0.7、29.12±0.7、31.34±0.4、33.89±0.1,系统自动分析软件显示Ct值与标准品浓度的对数之间存在良好的线性关系,回归系数为0.998.对动力学曲线分析表明,在该反应体系和反应条件下,该标准曲线的灵敏度为102拷贝/反应.荧光PCR PrP基因表达检测标准品质粒和标准曲线的建立,为检测PrP基因的组织特异性表达和动物传染性海绵状脑病发生的分子机理奠定了基础. 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr PrP基因 标准曲线 重组质粒 动物传染性海绵状脑病
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猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒2型基因重组质粒实时荧光定量PCR标准曲线的构建 被引量:8
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作者 施开创 郭鑫 +4 位作者 杨汉春 李焕荣 盖新娜 陈艳红 查振林 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第4期10-12,共3页
根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7和猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1的核苷酸序列设计特异性引物,经RT-PCR/PCR扩增,分别扩增出大小为308 bp和417 bp的部分基因片段。用T4连接酶将目的片段与pGEM-Teasy载体系统连接,并转化到大肠杆菌DH-... 根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7和猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1的核苷酸序列设计特异性引物,经RT-PCR/PCR扩增,分别扩增出大小为308 bp和417 bp的部分基因片段。用T4连接酶将目的片段与pGEM-Teasy载体系统连接,并转化到大肠杆菌DH-5α株感受态细胞。提取的质粒经PCR、酶切和测序鉴定,证实为PRRSV和PCV2的阳性重组质粒。将重组标准质粒10倍系列稀释后作为模板,通过实时荧光定量PCR方法(Real-time PCR),建立了PRRSV、PCV2的标准曲线及其直线回归方程,并确定其最佳读板温度。该方法具有线性关系好、特异性强、敏感性高、重复性好等特点,为分析PRRSV和PCV2共感染猪体内病毒的绝对含量提供了必要的技术平台。 展开更多
关键词 PRRSV PCV2 实时荧光定量pcr 重组质粒 标准曲线
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实时荧光定量PCR构建绵羊PrP基因标准品质粒和标准曲线 被引量:3
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作者 韩彩霞 赵德明 +4 位作者 吴长德 宁章勇 杨建民 刘美丽 马李颖 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1363-1366,共4页
Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid wa... Here we report the construction of sheep PrP gene standard plasmid DNA and curve using real-time RT-PCR.Total RNA was extracted from each sample and the fragments of target gene were amplified by RT-PCR.The plasmid was constructed for calibrating unknown samples.In this study,the constructed plasmid containing only the target gene was used to construct a calibration curve.The absolute standard curve method was shown to be of high linearity,sensitivity and reproducibility.The purpose of this study is to investigate the quantification of PrP mRNA expression for knowing the scrapie pathogenesis and providing powerful tool for further studies on prion diseases pathogenesis. 展开更多
关键词 PRP RT—pcr 实时荧光定量pcr 标准曲线 绵羊
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实时荧光PCR结合融解曲线分析快速鉴定临床常见曲霉菌 被引量:1
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作者 史俊艳 郭莉娜 +3 位作者 徐英春 王瑶 王贺 刘文静 《中国真菌学杂志》 2012年第6期330-334,338,共6页
目的采用实时荧光PCR结合融解曲线分析的方法快速将临床常见曲霉菌鉴定到种的水平。方法①普通PCR扩增真菌ITS区后进行序列比对,准确鉴定菌种并设计种特异性引物和探针。②采用实时荧光PCR的方法及融解曲线分析,根据不同的解链温度将5... 目的采用实时荧光PCR结合融解曲线分析的方法快速将临床常见曲霉菌鉴定到种的水平。方法①普通PCR扩增真菌ITS区后进行序列比对,准确鉴定菌种并设计种特异性引物和探针。②采用实时荧光PCR的方法及融解曲线分析,根据不同的解链温度将5种临床常见曲霉菌鉴定到种的水平。③特异性、敏感性、重复性试验。结果①解链曲线分析显示,不同种曲霉菌的种特异性探针有特异的Tm值,根据Tm值的不同可以将5种曲霉菌区分开来:烟曲霉Tm=61.4℃,黄曲霉Tm=57.4℃,黑曲霉Tm=67.7℃,土曲霉Tm=55.2℃和64.5℃,构巢曲霉Tm=65.8℃。其中小孢根霉和疣状瓶霉与烟曲霉探针发生交叉反应,阴性对照不出现特异性的解链曲线。②该方法对5种曲霉菌的检测下限分别为:烟曲霉56.8 fg,黄曲霉1 110 fg,黑曲霉13.7 fg,土曲霉123 fg,构巢曲霉780 fg。③重复性试验结果显示,同一种曲霉菌的Tm值波动范围不超过0.5℃。结论采用实时荧光PCR结合融解曲线分析的方法可以快速准确地将临床常见曲霉菌鉴定到种的水平,具有良好的敏感性、特异性和可重复性,有助于临床侵袭性曲霉感染的诊断和指导抗真菌药物使用。 展开更多
关键词 实时荧光pcr 曲霉菌 融解曲线
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实时荧光定量PCR检测多鳍鱼Shh基因表达标准品质粒和标准曲线的构建 被引量:1
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作者 张昌盛 王俊杰 +2 位作者 李湘涛 翟红 刘群 《科技导报》 CAS CSCD 2007年第13期41-44,共4页
为了快速、准确定量多鳍鱼Shh基因在机体组织中的表达水平,根据笔者克隆的Shh基因序列,选择其高度保守区域设计一对引物,对多鳍鱼各组织提取mRNA,经RT-PCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α。筛选后得到重组标准品质... 为了快速、准确定量多鳍鱼Shh基因在机体组织中的表达水平,根据笔者克隆的Shh基因序列,选择其高度保守区域设计一对引物,对多鳍鱼各组织提取mRNA,经RT-PCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α。筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明Shh基因保守区段已经成功克隆。将重组标准品质粒进行倍比稀释,然后以此为模板,进行荧光定量PCR,系统自动分析软件显示Ct值与标准品浓度的对数之间存在良好的线性关系。回归方程为y=-0.32x+10.47,回归系数为1.00。构建Shh基因表达检测标准品质粒和标准曲线,建立检测多鳍鱼Shh基因荧光定量PCR方法,为进一步研究Shh基因在组织中的动态分布和研究多鳍鱼系统发育奠定了基础。 展开更多
关键词 Shh基因 实时荧光定量pcr 标准曲线 多鳍鱼
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便携式实时荧光定量PCR仪数据处理方法研究
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作者 侯红渠 邓玉林 +2 位作者 樊云龙 吕雪飞 李晓琼 《生命科学仪器》 2023年第5期1-7,共7页
实时荧光定量PCR越来越多被用来定量核酸的表达水平,随着经济与社会的发展进步,个人的自我保护意识和自身健康都重视了起来,使得人们对健康有了更高的要求,适应于现场核酸分析技术的需求日渐显著,不同的仪器有不同稳健的、合适的测量分... 实时荧光定量PCR越来越多被用来定量核酸的表达水平,随着经济与社会的发展进步,个人的自我保护意识和自身健康都重视了起来,使得人们对健康有了更高的要求,适应于现场核酸分析技术的需求日渐显著,不同的仪器有不同稳健的、合适的测量分析方法。本研究针对一种基于转盘式荧光检测的便携式实时荧光定量PCR仪的数据进行处理分析,通过对比优化不同峰值拟合算法及扩增曲线拟合算法优化提升了光学系统检测性能。结果表明,针对该系统峰值拟合算法采用正弦拟合对原始数据进行处理有较好的效果,扩增曲线拟合算法采用4参数logistic拟合,标准品浓度梯度样本扩增结果线性拟合优度R^(2)>0.990,变异系数CV值小于5%,使得光学系统检测性能有所提升,为该类检测模型仪器的数据处理方法提供了一定参考。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 数据处理 曲线拟合 扩增曲线
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双链置换探针实时荧光定量PCR结合融解曲线特性分析检测高危型人乳头瘤病毒16、58亚型
11
作者 张金业 吴月平 +3 位作者 刘继斌 林兰 李明 吴晓燕 《交通医学》 2009年第5期493-496,共4页
目的:建立一种准确、快速、实用的检测人乳头瘤病毒(HPV)16、58亚型的方法。方法:根据HPV16和HPV58亚型的序列特异性各设计一对引物和一对型特异性双链置换探针,采用实时荧光PCR扩增后,通过非高分辨的融解曲线分析在同一荧光通道内有效... 目的:建立一种准确、快速、实用的检测人乳头瘤病毒(HPV)16、58亚型的方法。方法:根据HPV16和HPV58亚型的序列特异性各设计一对引物和一对型特异性双链置换探针,采用实时荧光PCR扩增后,通过非高分辨的融解曲线分析在同一荧光通道内有效区分两种HPVDNA基因亚型。结果:1ng/μl、0.1ng/μl和0.01ng/μlHPV16和HPV58模板荧光PCR扩增及融解曲线分析显示,融解曲线分析较定量扩增更灵敏、特异。HPV16和HPV58融解曲线对应的Tm值分别为83.5°C和87°C。结论:所建双链置换探针实时荧光定量PCR结合融解曲线分析检测HPV16、58亚型的方法灵敏、特异,有临床应用价值。 展开更多
关键词 双链置换探针 实时荧光定量pcr 人乳头瘤病毒(HPV) 融解曲线 宫颈癌
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实时荧光定量PCR构建牛源粪肠球菌esp标准曲线
12
作者 樊杰 孙康永杰 +4 位作者 魏亚琴 杨宇泽 万学瑞 丁巨财 王川 《中兽医学杂志》 2019年第11期13-15,共3页
为了快速检测牛源粪肠球菌,本实验建立了粪肠球菌esp基因实时荧光定量PCR标准曲线。首先参照esp基因在Genbank中的序列进行引物的设计与合成,利用PCR扩增目的基因并将其连接到pMD18-T载体上,并转化进入大肠埃希菌TOP10感受态细胞,经测... 为了快速检测牛源粪肠球菌,本实验建立了粪肠球菌esp基因实时荧光定量PCR标准曲线。首先参照esp基因在Genbank中的序列进行引物的设计与合成,利用PCR扩增目的基因并将其连接到pMD18-T载体上,并转化进入大肠埃希菌TOP10感受态细胞,经测序鉴定成功后,提取重组质粒并以10倍系列稀释后作为标准模板,进行实时荧光定量PCR。成功建立了牛源粪肠球菌esp基因荧光定量PCR标准曲线及其直线回归方程,所得熔解曲线峰值单一,表明引物具有很好的特异性;标准曲线相关系数r^2=0.9998,说明线性关系良好,目的基因的荧光定量PCR的标准曲线构建成功。本研究为快速检测牛源粪肠球菌奠定了基础。 展开更多
关键词 粪肠球菌 ESP 实时荧光定量pcr 标准曲线
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一种基于熔解曲线的实时荧光定量PCR仪校准方法 被引量:5
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作者 崔宏恩 张超 姚绍卫 《中国测试》 CAS 北大核心 2018年第A01期22-28,共7页
针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光... 针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光定量PCR仪校准方法进行分析。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 熔解曲线 熔解温度
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实时荧光PCR熔解曲线法快速鉴定嗜肺军团菌 被引量:2
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作者 戈立秀 赵利伟 +2 位作者 陈文聪 朱庆义 吴尚为 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期187-189,共3页
目的建立特异、快速、敏感的实时荧光PCR熔解曲线基因分型方法,并探讨该法在鉴定嗜肺军团菌中的应用价值。方法根据嗜肺军团菌16S rRNA基因保守序列设计引物和猝灭FRET探针建立实时荧光PCR熔解曲线方法,优化引物与探针浓度,用15株嗜肺... 目的建立特异、快速、敏感的实时荧光PCR熔解曲线基因分型方法,并探讨该法在鉴定嗜肺军团菌中的应用价值。方法根据嗜肺军团菌16S rRNA基因保守序列设计引物和猝灭FRET探针建立实时荧光PCR熔解曲线方法,优化引物与探针浓度,用15株嗜肺军团菌、30株非嗜肺军团菌及7株其他病原菌标准菌株验证该方法的特异性、敏感性和重复性,用该法检测117例临床痰标本并进行基因测序。结果 15株不同血清型的嗜肺军团菌Tm值均为57℃;7株非嗜肺军团菌Tm值为43℃,1株Tm值为45℃;其余22株非嗜肺军团菌和7株其他病原菌均无明显Tm值。该方法最低检出限可达0.1 pg/μL。检测117例痰标本发现3株嗜肺军团菌,与PCR基因测序法检测结果一致。结论实时荧光PCR熔解曲线法可特异、快速和敏感地检测嗜肺军团菌,适用于临床痰标本的嗜肺军团菌检测。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 实时荧光pcr熔解曲线 猝灭FRET探针
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实时荧光PCR熔解曲线法在β地中海贫血基因诊断和产前诊断中的临床应用评价 被引量:2
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作者 严提珍 罗世强 +5 位作者 唐宁 钟青燕 聂昌君 李伍高 王秋华 蔡稔 《柳州医学》 2014年第1期10-15,共6页
目的对荧光PCR熔解曲线法用于β地中海贫血(β地贫)基因诊断和产前诊断进行临床评价。方法收集2011年1至8月柳州市妇幼保健院优生遗传实验室外周血标本451份,其中经血液学表型分析为β地贫阳性表型标本372份,β地贫阴性表型标本79... 目的对荧光PCR熔解曲线法用于β地中海贫血(β地贫)基因诊断和产前诊断进行临床评价。方法收集2011年1至8月柳州市妇幼保健院优生遗传实验室外周血标本451份,其中经血液学表型分析为β地贫阳性表型标本372份,β地贫阴性表型标本79份。同时收集2011年6—9月夫妇双方经PCR—RDB针法确诊为β地贫基因携带者,在我院行β地贫产前诊断的胎儿绒毛、羊水及脐带血标本共84份,其中孕10~β周胎儿绒毛标本16份、孕16—24周羊水标本64份、孕17周以上胎儿脐血标本4份。按双盲对照试验,分别采用荧光PCR熔解曲线法(可检测24种β珠蛋白基因突变)、PCR-反向点杂交(RDB探针法(可检测17种β-珠蛋白基因突变)和DNA测序法同时对451份外周血标本和84份胎儿绒毛、羊水、脐带血产前诊断标本进行检测。计算荧光PCR熔解曲线法和RDBPCR探针法、DNA基因测序法检测结果的野生型符合率、突变型符合率和总符合率。结果利用荧光熔解曲线法在451份外周血标本中共检出β种突变类型、19种基因型,其中有447份标本与PCR—RDB针法的基因型检测结果相符,符合率为99.1%(447/451),902个等位基因位点检出符合率为99.6%(898/902),有4份标本与PCR—RDB针法的基因型检测结果不相符,经DNA测序法验证,有3份标本与荧光熔解曲线法的检测结果完全一致,1份标本的β珠蛋白基因突变不在荧光熔解曲线法检测范围而未被检出。450份外周血标本的荧光熔解曲线法检测结果与DNA测序法相符,符合率为99.8%(450/451)。利用荧光熔解曲线法在84份产前诊断胎儿标本中共检出8种突变类型、18种基因型,168个等位基因位点的检测结果与PCR—RDB针法和DNA基因测序法检测结果符合率为100%。结论荧光PCR熔解曲线法可同时检测多份待测标本,并可准确检出多种基因突变类型,可用于β地中海贫血的基因诊断和产前诊断。 展开更多
关键词 Β-地中海贫血 实时荧光pcr 熔解曲线分析 基因诊断 产前诊断
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实时荧光定量PCR特异性监测曲线的表述方式探析
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作者 陈燕 《新闻研究导刊》 2022年第10期219-221,共3页
实时荧光定量PCR技术已广泛应用于医疗、制药、农业、食品安全等多个领域,各科技期刊涌现相关研究报道,但对该技术生成的特异性监测曲线表述方式存在分歧。文章对该曲线的表述方式进行统计分析,并结合英文翻译,借助各类词典、高等教育... 实时荧光定量PCR技术已广泛应用于医疗、制药、农业、食品安全等多个领域,各科技期刊涌现相关研究报道,但对该技术生成的特异性监测曲线表述方式存在分歧。文章对该曲线的表述方式进行统计分析,并结合英文翻译,借助各类词典、高等教育教科书及全国科学技术名词审定委员会的术语在线进行探析,结果发现,该曲线在中文科技期刊中主要有两种表述方式,分别为“熔解曲线”“溶解曲线”,且大多数期刊均使用过这两种表述方式,经分析推测“熔解曲线”为规范表述,由于“熔”和“溶”的拼音均为róng,字形相似,词意相近,且作者和编辑对专业术语缺乏关注等,很多期刊将其误写成“溶解曲线”,对此提出相应建议,为规范专业术语表达提供参考。 展开更多
关键词 监测曲线 熔解曲线 溶解曲线 实时荧光定量pcr 规范表述
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水稻低丰度表达基因OsAMT1;3实时荧光定量PCR方法的建立及其应用 被引量:17
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作者 孙淑斌 李宝珍 +1 位作者 胡江 徐国华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期8-12,共5页
采用实时荧光定量PCR技术,通过使用特异引物,对水稻中的低丰度表达基因OsAMT1;3进行了转录水平上的定量分析,成功建立了可检测低丰度表达基因的SYBR Green实时荧光定量PCR技术平台。该方法具有很好的准确性和实用性。获得的荧光定量... 采用实时荧光定量PCR技术,通过使用特异引物,对水稻中的低丰度表达基因OsAMT1;3进行了转录水平上的定量分析,成功建立了可检测低丰度表达基因的SYBR Green实时荧光定量PCR技术平台。该方法具有很好的准确性和实用性。获得的荧光定量PCR扩增曲线,基线平整,指数区明显,斜率大且固定;线性范围广,17~36个循环都能测出;稳定性、重复性好,变异系数仅为0.47%;标准曲线表明,循环阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系,可对基因表达进行相对定量;缺氮条件下OsAMT1;3与纯NH4^+处理相比表达量增加4倍以上。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 扩增曲线 标准曲线 铵转运蛋白基因 基因表达 研究方法
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SYBR Green实时荧光PCR快速鉴定枣实蝇技术 被引量:7
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作者 程晓甜 阿地力·沙塔尔 +2 位作者 张伟 李新泉 玛依拉 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第4期60-65,共6页
应用SYBR Green实时荧光PCR技术,建立SYBR Green实时荧光PCR快速鉴定枣实蝇的方法。利用枣实蝇(mtDNA)中COⅠ基因序列,设计筛选出1对种的特异引物CarF/CarR。引物的特异性分别用桔小实蝇、瓜实蝇、南瓜实蝇、番石榴实蝇和桃果实蝇5种... 应用SYBR Green实时荧光PCR技术,建立SYBR Green实时荧光PCR快速鉴定枣实蝇的方法。利用枣实蝇(mtDNA)中COⅠ基因序列,设计筛选出1对种的特异引物CarF/CarR。引物的特异性分别用桔小实蝇、瓜实蝇、南瓜实蝇、番石榴实蝇和桃果实蝇5种实蝇来验证。SYBR Green PCR实时荧光反应的灵敏度用40,20,10,1,0.1,0.01,0.001 ng·μL^-1 7个浓度枣实蝇DNA模板来检测。结果表明:SYBR Green PCR的检测限度达0.01 ng·μL^-1以下,最适模板DNA浓度为1~20 ng·μL^-1。SYBR Green实时荧光PCR的可靠性可用枣实蝇不同虫态(幼虫、蛹、成虫)的扩增曲线、熔解曲线及PCR产物的琼脂糖凝胶电泳来检验。成虫、幼虫和蛹3种不同虫态的枣实蝇有一致的扩增曲线,熔解曲线分析和琼脂糖凝胶电泳条带分别用来确认实时荧光PCR产物的特异性;其平均熔解温度为(75.3±0.1)℃,并获得一段长为205 bp的特异性目标片段,说明在枣实蝇成虫为模板的基础上建立的SYBR Green实时荧光PCR方法同时适用于幼虫、蛹的快速鉴定,可将不同虫态的枣实蝇与近似种类区分开来。 展开更多
关键词 枣实蝇 SYBR Green 实时荧光pcr 溶解曲线 鉴定
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转基因烟草中外源基因实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:10
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作者 王盛 谢芝勋 +6 位作者 谢丽基 谢志勤 黄莉 罗思思 邓显文 黄娇玲 刘加波 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期745-749,共5页
【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以... 【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以烟草单拷贝的内源核糖核酸还原酶基因(RNR2)作为内参基因,建立相对定量的双标准曲线法检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法。【结果】构建RNR2基因、GFP基因实时荧光定量PCR的标准曲线,分别为y=-0.2858x+5.6695和y=-0.2826x+2.1048,R2分别为0.9994和0.9989,相关性较高。在检测的5株转基因烟草中GFP基因的拷贝数分别为5、8、19、28和45,非转基因烟草植株的GFP基因拷贝数为0。【结论】建立的转基因烟草中外源基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法具有简单、快速、准确等优点,可用于基因工程中对优良转化植株的筛选及外源基因表达量的快速检测和定量分析。 展开更多
关键词 转基因烟草 双标准曲线 外源基因 拷贝数 SYBR Green I实时荧光定量pcr
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实时荧光定量PCR技术快速检测志贺氏菌 被引量:10
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作者 戴陈伟 童琳 +4 位作者 武昌俊 许勇 李舜 朱倩云 蔡标 《食品安全质量检测学报》 CAS 2019年第23期8037-8041,共5页
目的建立实时荧光定量PCR法快速检测志贺氏菌。方法提取志贺氏菌基因组为模板扩增virA基因片段,将目的片段连接至pMD19-T载体得到重组质粒,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,验证所得到的重组质粒,以紫外分光光度计测量重组质粒吸光度值A260... 目的建立实时荧光定量PCR法快速检测志贺氏菌。方法提取志贺氏菌基因组为模板扩增virA基因片段,将目的片段连接至pMD19-T载体得到重组质粒,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,验证所得到的重组质粒,以紫外分光光度计测量重组质粒吸光度值A260,并换算为质粒拷贝数后作梯度稀释得到不同浓度的质粒标准品;进行荧光定量PCR分析并通过特异性、灵敏性实验以验证该方法的可行性。结果重组质粒标准品浓度在103~108 copies/μL范围内线性关系良好(r2>0.99),实时荧光定量PCR检测志贺氏菌时出现良好的扩增曲线,鼠伤寒沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和大肠杆菌均未出现扩增曲线。志贺氏菌的检出限为100CFU/m L。结论本方法便捷、高效、可靠,可用于志贺氏菌的快速定性定量检测。 展开更多
关键词 志贺氏菌 实时荧光定量pcr 标准曲线 特异性 灵敏性
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