家养水牛催乳素基因编码区结构特征

催乳素具有促进生长发育及维持泌乳、进行免疫调节等生物学功能,但目前家养水牛PRL基因的变异特征及其与水牛性状间的关系还不清楚。本研究采用PCR-SSCP及PCR产物直接测序技术,检测不同沼泽型和河流型水牛群体PRL基因各外显子的遗传变异,将各外显子序列进行拼接得到编码区序列,对其进行生物信息学分析,结果表明:水牛成熟催乳素含199个氨基酸残基,其编码蛋白呈酸性,碱基使用率为A 25.96%,T 22.95%,C 28.14%,G22.95%,平均碱基组成差异较小,偏好性密码子占密码子使用总数的48.21%。在沼泽型水牛群体中检测到c.G192A、c.C427T和c.C606T共3种核苷酸替换,均为同义替换,产生8种单倍型,在河流型水牛群体中检测到c.C606T替换,为同义替换,产生2种单倍型,不同单倍型个体未产生表达差异。序列比对分析表明,水牛PRL基因编码区序列在进化过程中未受到人工选择的影响,可能是因为功能的约束使其编码区序列表现得十分保守。

家养水牛催乳素基因外显子2多态性及其群体遗传特征

催乳素基因(prolactin gene,PRL)被视为与水牛产奶性状相关的重要候选基因,目前还未见有水牛PRL基因外显子2遗传特征的报道。本研究采用PCR-SSCP及PCR产物直接测序技术,检测了12个沼泽型水牛群体和3个河流型水牛群体共581个样本PRL基因外显子2的遗传变异。结果:水牛PRL基因外显子2由182个核苷酸组成,编码61个氨基酸,在进化上高度保守,测序结果显示沼泽型水牛群体中PRL基因外显子2有c.G192A替换,为同义替换,与泌乳性状之间没有显著相关性。在12个沼泽型水牛群体中均检测到该多态位点,PG基因频率在0.719～0.897之间,群体平均值为0.785±0.015,该基因为优势等位基因。Hardy-Weinberg平衡检测显示,10个沼泽型水牛群体处于平衡状态,而德宏水牛群体和福安水牛群体处于不平衡状态。在3个河流型水牛群体中,第192位碱基均为G,未检测到G>A替换。