猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析

为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒（EMCV）基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒（GX0601和GX0602）进行了全基因组序列测定和比较分析。结果显示,2个分离毒株的基因组全长（包含poly A）分别为7 729和7 725 nt,核苷酸和氨基酸同源性均在99.8%以上。与国外毒株及国内已报道的分离株的序列比较结果表明,2个毒株与BJC3和HB1的核苷酸同源性为98.18%~99.41%,推导的氨基酸序列同源性为99.5%~99.7%,与国外分离株的核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别介于80.53%~99.57%和93.1%~99.5%。基于基因组开放阅读框推导的氨基酸序列的系统进化分析表明,我国分离毒株与国外毒株PEC9、CBNU、BEL-2887A/91和EMCV-R的同源性较高,位于同一个亚群。研究结果提示,猪源与鼠源毒株的基因组具有很高的同源性,鼠是猪场EMCV感染的传染来源。

3株脑心肌炎病毒河南分离株VP1基因的序列测定与遗传进化分析

为研究野猪家养在猪场脑心肌炎（EMC）发生发展过程中可能扮演的角色和鼠在不同猪源脑心肌炎病毒（EMCV）交叉感染中的作用，应用 RT-PCR和测序技术，对分离自河南省同一发病猪场的良种猪源、家养野猪源和鼠源EMCV 等3株病毒的VP1基因进行序列比较和遗传进化分析，发现 EMCV可分为G1、G2和G33个群。3株分离病毒的遗传距离较近，核苷酸序列同源性高达99．6％～99．8％，并与国内猪源EMCV亲缘关系最近，同属于G1群，而与欧美毒株的亲缘关系较远，存在较大的地域差异。研究结果证实，野猪家养可传播EMCV并引起良种猪感染发病，鼠在不同猪源 EMCV的交叉感染、传播与流行中起到重要媒介作用；分离自同一猪场的良种猪源EMCV和家养野猪源 EMCV应是同一株病毒对不同猪种的感染，因而需要在野生动物家养活动中充分考虑自然疫源性疾病传播的生态学因素。

不同猪源副猪嗜血杆菌河南分离株16S rRNA基因的遗传进化分析

为研究来自河南省不同猪源的副猪嗜血杆菌（Hps）的遗传演化关系,应用PCR方法扩增所分离的良种猪源、家养野猪源和地方土猪源等3株Hps（KF0901、JZ0801和XY0501）的16S r RNA基因,并进行序列比较分析。结果 3株Hps的16S r RNA基因全长均为822 bp,彼此间核苷酸序列同源性为99.3%~99.6%,与参考菌株的核苷酸序列同源性为97.1%~99.4%;基于16S r RNA基因序列绘制的系统进化树显示,本研究中家养野猪源Hps和地方土猪源Hps均属于血清5型,而良种猪源血清5型Hps却与血清12型和血清14型的亲缘关系更近。表明Hps在良种猪、家养野猪和地方土猪之间彼此交叉感染或具有共同来源;并非所有血清5型Hps分离株都属同一分支。