宽边黄粉蝶(Eurema hecabe)基因组Survey分析

宽边黄粉蝶(Eurema hecabe)是重要的传粉昆虫,广布于非洲热带区、东洋区、澳洲区及古北区东部,具有较高的学术价值和经济意义。为了深入研究其广泛适应性,确定适合该蝴蝶的全基因组的测序研究策略,我们首先做低覆盖度的基因组Survey测序,然后做大规模的全基因组深度测序。采用第二代高通量的测序技术作为该研究的研究方法,测定了宽边黄粉蝶基因组大小,并利用生物信息学方法估计该种的杂合率、重复序列和GC含量等基因组信息。结果表明:(1)宽边黄粉蝶的基因组大小估计为285.34 Mb,测序深度51×;(2)从K-mer分布曲线发现黄粉蝶基因组有明显的杂合峰,杂合率达1.97%,重复序列比例为35.37%。该研究结果对于揭示宽边黄粉蝶物种的起源和进化及适应性具有重要意义,为宽边黄粉蝶选择全基因组测序策略提供依据。

秋天里的宽边黄粉蝶

多年来,笔者在泰山只见过宽边黄粉蝶成虫,并为其鲜黄的体色所吸引。直到2017年9月,一个特别的机缘才让笔者找到了宽边黄粉蝶的卵、幼虫和蛹,开始饲养并记录其生活史,发现了一些鲜为人知的细节。“谜”蝶黄粉蝶是粉蝶科黄粉蝶属(furema)昆虫的统称,因双翅鲜黄的底色而著称(也有纯白色的),全球已知40种,中国记载7种,其中分布最广的便是宽边黄粉蝶(Eurema hecabe)了。宽边黄粉蝶也是目前在泰山唯一能见到的黄粉蝶。

宽边黄粉蝶与粉蝶绒茧蜂

宽边黄粉蝶(Euremahecabe)栖息于地面、繁育于树上。我常见它们在浆草和黄菜的花上吸蜜,不易被惊飞。在宽边黄粉蝶驻足的树荫或灌丛下,它们黄色的翅膀在绿色的草地中特别明亮且引人注意,就像一小片落地的黄叶,而蝶翅上散布的小褐斑是对黄叶上小斑点的模拟。