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噬菌体与宿主细菌的攻防机制 被引量:5
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作者 张庆 商延 +10 位作者 朱见深 刘晓文 宋胜敏 柳林 由佳 朱应民 齐静 李璐璐 胡明 戴美学 刘玉庆 《山东农业科学》 2018年第7期48-54,共7页
噬菌体是侵袭细菌的病毒,也是病毒中最普遍、分布最广的类群。为了防止噬菌体侵染,细菌进化出多种多样的防御机制;而为了突破这些防御机制,噬菌体也进化得到了相对应的反制策略。本文即综述了这一领域的研究进展,有助于理解噬菌体与宿... 噬菌体是侵袭细菌的病毒,也是病毒中最普遍、分布最广的类群。为了防止噬菌体侵染,细菌进化出多种多样的防御机制;而为了突破这些防御机制,噬菌体也进化得到了相对应的反制策略。本文即综述了这一领域的研究进展,有助于理解噬菌体与宿主细菌的共存共进化机制,合理利用噬菌体。 展开更多
关键词 噬菌体 细菌宿主 防御机制 反防御机制
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细菌降解宿主组织模型行波解的局部渐近行为
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作者 彭叠 易亚婷 《理论数学》 2022年第11期1966-1970,共5页
本文针对一类细菌降解宿主组织模型的行波解,为了研究行波解的局部稳定性,我们需要研究其渐近行为。我们将竞争系统转化为合作系统,讨论平衡点的类型和稳定性,并利用比较原理和渐近分析的方法,研究了它在不稳定点的渐近行为。
关键词 细菌降解宿主组织 行波解 渐近分析
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噬菌体与细菌基于群体感应的双向互作 被引量:1
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作者 孙舒扬 吴胜波 +2 位作者 张欣乔 梁畅畅 乔建军 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期107-117,共11页
在长期的共同进化过程中,噬菌体与细菌宿主之间产生了复杂的相互作用关系。群体感应(quorum sensing,QS)机制在噬菌体和细菌的双向相互作用中扮演了重要角色。综述细菌宿主对群体感应机制的利用,群体感应对生物被膜调节、噬菌体吸附过... 在长期的共同进化过程中,噬菌体与细菌宿主之间产生了复杂的相互作用关系。群体感应(quorum sensing,QS)机制在噬菌体和细菌的双向相互作用中扮演了重要角色。综述细菌宿主对群体感应机制的利用,群体感应对生物被膜调节、噬菌体吸附过程以及调控CRISPR-Cas系统等方面所起到的效果,从噬菌体对群体感应机制的介入,总结群体感应机制在噬菌体溶原-裂解性调节以及噬菌体对群体感应机制的抑制,探讨对噬菌体QS机制的挖掘和解析,以期为群体感应机制在噬菌体治疗等领域的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 群体感应 噬菌体-细菌宿主 溶原-裂解 微生物相互作用
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Causal role of Helicobacter pylori infection in gastric cancer 被引量:29
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作者 Takafumi Ando Yasuyuki Goto +3 位作者 Osamu Maeda Osamu Watanabe Kazuhiro Ishiguro Hidemi Goto 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2006年第2期181-186,共6页
Gastric cancer is the second most frequent cancer in the world, accounting for a large proportion of all cancer cases in Asia, Latin America, and some countries in Europe. Helicobacter pylori(H pylori) is regarded a... Gastric cancer is the second most frequent cancer in the world, accounting for a large proportion of all cancer cases in Asia, Latin America, and some countries in Europe. Helicobacter pylori(H pylori) is regarded as playing a specific role in the development of atrophic gastritis, which represents the most recognized pathway in multistep intestinal-type gastric carcinogenesis. Recent studies suggest that a combination of host genetic factors, bacterial virulence factors, and environmental and lifestyle factors determine the severity of gastric damage and the eventual clinical outcome of H pylori infection. The seminal discovery of Hpylori as the leading cause of gastric cancer should lead to effective eradication strategies. Prevention of gastric cancer requires better screening strategies to identify candidates for eradication. 展开更多
关键词 Gastric cancer Host genetic factors HPYLORI Bacterial virulence factors
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双功能乙醛/乙醇脱氢酶AdhE参与细菌与宿主互作的机制研究进展 被引量:1
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作者 蔡瑶 龚双燕 +4 位作者 陈瑛琪 李幽幽 李小璟 徐志文 朱玲 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1530-1536,共7页
双功能乙醛/乙醇脱氢酶AdhE具有乙醛脱氢酶和乙醇脱氢酶的催化活性,是细菌乙醇厌氧发酵途径中的关键酶之一。近年,有关细菌与宿主相互作用的研究表明,AdhE在细菌适应宿主内环境变化和发挥毒力时具有重要的调控作用。本文对AdhE参与调控... 双功能乙醛/乙醇脱氢酶AdhE具有乙醛脱氢酶和乙醇脱氢酶的催化活性,是细菌乙醇厌氧发酵途径中的关键酶之一。近年,有关细菌与宿主相互作用的研究表明,AdhE在细菌适应宿主内环境变化和发挥毒力时具有重要的调控作用。本文对AdhE参与调控细菌感染宿主的致病机制和参与细菌对宿主免疫功能调节的作用机制进行综述,以期为AdhE的功能研究提供新的思路。 展开更多
关键词 乙醛/乙醇脱氢酶 细菌-宿主互作 致病机制
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Advances on the Molecular Mechanism of the Interaction between Ralstonia solanacearum and Hosts
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作者 Dousheng WU Gaofei JIANG +2 位作者 Yanmei YU Ying LIU Wei DING 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第12期1698-1701,1718,共5页
Ralstonia solanacearum is an important model phytopathogenic bacterium that causes bacterial wilt disease on many plant species and leads to serious economic losses. The interactions between R. solanacearum and host p... Ralstonia solanacearum is an important model phytopathogenic bacterium that causes bacterial wilt disease on many plant species and leads to serious economic losses. The interactions between R. solanacearum and host plants have become a model system for the study of plants and pathogens interactions. This paper reviews the advances on the molecular mechanisms between R. solanacearum and hosts interaction including the formation of plant innate immunity, the suppression of plant innate immunity by this pathogen and the activation of effector-triggered immunity. Furthermore, we made a prospect on how to utilize the interaction mechanism between R. solanacearum and hosts to control the disease. 展开更多
关键词 Ralstonia solanacearum Host plants Interaction Plant immunity
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裂解或溶源-细菌遭遇噬菌体后的命运抉择 被引量:2
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作者 商俊杰 张春婷 +1 位作者 谢立国 魏云林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期3380-3387,共8页
噬菌体是地球上数量最丰富的有机体,其在自然生态系统的塑造和细菌进化驱动中发挥着至关重要的作用。在与宿主的相互斗争中,噬菌体可以选择以下2种方式决定其与宿主的命运:(1)裂解:通过裂解宿主细胞最终大量释放噬菌体颗粒;(2)溶源:将... 噬菌体是地球上数量最丰富的有机体,其在自然生态系统的塑造和细菌进化驱动中发挥着至关重要的作用。在与宿主的相互斗争中,噬菌体可以选择以下2种方式决定其与宿主的命运:(1)裂解:通过裂解宿主细胞最终大量释放噬菌体颗粒;(2)溶源:将其染色体整合到宿主细胞基因组中,与宿主建立一种潜在的互存关系。对于一些温和的噬菌体,这种倾向进一步受到感染多样性的调节,其中单一感染主要是裂解性的,而多重感染则多是溶源性的。溶源性的噬菌体不仅可以根据外界环境的理化因子,还可以通过细菌自身的群体感应系统来启动裂解-溶源开关,进而决定其宿主菌的命运。与此同时,宿主细菌在与噬菌体长时间的斗争中也进化出了针对噬菌体的手段。总而言之,噬菌体深刻影响着细菌的群落动态、基因组进化和生态系统等,而这一切都取决于噬菌体与宿主间的斗争模式(裂解/溶源性感染)。本文探讨了导致温和噬菌体对宿主菌进行裂解-溶源命运抉择的影响因素并系统性总结了细菌在面对噬菌体侵染时的应对策略的最新研究进展,以期能为噬菌体与宿主的研究提供建议和帮助。 展开更多
关键词 噬菌体 裂解-溶源 细菌宿主 群体感应 进化
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解糖微小寄生菌的研究进展 被引量:5
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作者 聂杰 陈宇星 +3 位作者 姜淞 王晓燕 陈峰 何雪松 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第11期1523-1531,共9页
候选门级辐射类群(candidate phyla radiation,CPR)所包含的细菌种类约占已知细菌种类总数的1/4,然而该类细菌中只有解糖微小寄生菌(Saccharibacteria,又名TM7)的少数菌株被成功分离培养.研究发现,解糖微小寄生菌具有许多独特的生物学性... 候选门级辐射类群(candidate phyla radiation,CPR)所包含的细菌种类约占已知细菌种类总数的1/4,然而该类细菌中只有解糖微小寄生菌(Saccharibacteria,又名TM7)的少数菌株被成功分离培养.研究发现,解糖微小寄生菌具有许多独特的生物学性状:该类细菌需要寄生在宿主细菌表面生长,这是一种全新的"细菌-细菌"寄生生存方式;细菌尺寸及基因组均较小,缺乏代谢相关基因,不能合成氨基酸和维生素;对宿主细菌表现出杀伤作用或保护其躲避免疫系统的攻击.此外,解糖微小寄生菌与牙周病等疾病存在紧密的联系.同时,宏基因组学研究表明,其他CPR细菌与解糖微小寄生菌具有相似的生物学特性.本文通过介绍解糖微小寄生菌的研究概况、形态特征、生理特性、基因特点以及与疾病的相关关系,以期对目前研究进展有更全面的了解,为未来解糖微小寄生菌及CPR细菌的研究提供参考,这对于发现新物种、发掘新基因、改进疾病的预防和治疗方式以及研究细菌的进化有着重要的生物学意义和社会意义. 展开更多
关键词 解糖微小寄生菌 TM7 候选门级辐射类群 寄生 宿主细菌
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活性炭对城市有机固废厌氧消化过程抗生素抗性基因行为特征的影响 被引量:4
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作者 马佳莹 王盼亮 +2 位作者 汪冰寒 苏应龙 谢冰 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期2413-2421,共9页
城市有机固废是抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的来源和储存库之一,其生物处理过程中ARGs的赋存变化规律需深入研究.采用定量PCR方法分析城市有机固废厌氧消化过程中多种类型ARGs和整合子基因的变化特征,探究了不同... 城市有机固废是抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的来源和储存库之一,其生物处理过程中ARGs的赋存变化规律需深入研究.采用定量PCR方法分析城市有机固废厌氧消化过程中多种类型ARGs和整合子基因的变化特征,探究了不同粒径的活性炭对目标基因行为特征的影响以及ARGs变化的潜在微生物机制.结果表明,无论是否添加活性炭,厌氧消化过程对初始体系中的总ARGs均具有削减作用,总ARGs绝对丰度的削减率为29.95%~63.40%.城市有机固废厌氧消化最终体系中,粉末活性炭(powered activated carbon,PAC)添加组中总ARGs丰度显著高于对照组(P <0.05),即PAC削弱了ARGs的削减效果,颗粒活性炭对ARGs变化无显著影响.厌氧消化过程中,ARGs的潜在宿主细菌主要属于梭菌纲(Clostridia)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和互营养菌纲(Synergistia). PAC添加时,潜在宿主细菌的富集是目标基因增殖的重要原因,且Clostridia可能是厌氧消化过程中ARGs消长的主要驱动因子.本研究结果将为了解城市有机固废厌氧消化过程中ARGs的转归特征以及外源添加活性炭对ARGs的影响机制提供参考. 展开更多
关键词 城市有机固废 厌氧消化 抗生素抗性基因(ARGs) 活性炭 宿主细菌
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Cytotoxicity of HIV-gp41 segments expressed in E.coli 被引量:1
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作者 YUANYuhua BIChanghao LIJu WANGXueqian GENGYunqi CHENQimin 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2004年第7期668-671,共4页
The failed attempt to express HIV-gp41 in E. coli led to the investigation of HIV-gp41 segments, which is responsible for the toxicity to E. coli cells. A series of dele-tion mutants containing different regions of gp... The failed attempt to express HIV-gp41 in E. coli led to the investigation of HIV-gp41 segments, which is responsible for the toxicity to E. coli cells. A series of dele-tion mutants containing different regions of gp41 gene were constructed and expressed in E. coli BL21(DE3) strain. After IPTG induction, the high mortality of host bacteria was ob-served in host bacteria carrying the deletion mutants of gp41 gene except for those transformed with pET-HN2; coordi-nately, the mRNA transcripts of the gp41 was rapidly de-creased; and the release of [3H]uridine increased upon in-duction. All these data suggested that GP41 protein has a cytotoxic effect on E. coli, and it is the cytotoxicity of the gp41 gene product that contributes to the high mortality when expressed in E. coli. 展开更多
关键词 HIV-gp41 基因表达 细胞毒素 E.COLI 宿主细菌 横跨膜蛋白
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一种无诱导高效蛋白表达体系及其构建方法
11
《药物生物技术》 CAS CSCD 2010年第6期537-537,共1页
本发明主要用于高效的表达目的蛋白。 本发明旨在提供一种无需诱导,能在多种不同的宿主细菌中高效表达目的蛋白的表达体系。
关键词 表达体系 蛋白 高效表达 宿主细菌
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发现结核杆菌噬菌体中含抗菌肽
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《中华肺部疾病杂志(电子版)》 CAS 2013年第3期42-42,共1页
近日,中科院昆明动物所研究员赖仞领导的课题组,从结核杆菌噬茵体中识别出一小分子多肽。该抗茵肽有望成为一种治疗结核杆菌感染的辅助药物,或作为研发抗结核药物的模板。噬菌体作为一种真细菌的病毒,可有效地与宿主细菌相互作用。... 近日,中科院昆明动物所研究员赖仞领导的课题组,从结核杆菌噬茵体中识别出一小分子多肽。该抗茵肽有望成为一种治疗结核杆菌感染的辅助药物,或作为研发抗结核药物的模板。噬菌体作为一种真细菌的病毒,可有效地与宿主细菌相互作用。为此,赖仞课题组推测结核杆菌噬菌体可产生相关的功能物质,与结核杆菌相互作用,甚至直接抑制或杀灭结核杆菌。 展开更多
关键词 结核杆菌感染 噬菌体 抗菌肽 相互作用 宿主细菌 小分子多肽 抗结核药物 辅助药物
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幽门螺杆菌感染激活人蛋白相互作用子网的构建
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作者 黎宏章 徐燕君 +4 位作者 陈娇娥 张洪生 李非 伯晓晨 虞朝辉 《军事医学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期205-208,共4页
目的从整体水平探索幽门螺杆菌(Hp)感染后宿主的蛋白相互作用网络,挖掘其感染宿主细胞和导致宿主细胞病变的关键基因,为Hp感染的机制提供新的线索,可以为细菌-宿主联合靶向治疗提供基础。方法利用Hp感染的宿主细胞表达谱,基于激活子网... 目的从整体水平探索幽门螺杆菌(Hp)感染后宿主的蛋白相互作用网络,挖掘其感染宿主细胞和导致宿主细胞病变的关键基因,为Hp感染的机制提供新的线索,可以为细菌-宿主联合靶向治疗提供基础。方法利用Hp感染的宿主细胞表达谱,基于激活子网算法构建了Hp感染激活子网,并对子网中的基因进行基因本体(GeneOntology,GO)分类。结果通过GO分类发现,子网中主要涉及宿主免疫反应的基因、细胞骨架相关基因和细胞增殖相关基因。结论幽门螺杆菌侵染宿主主要引发宿主的免疫反应、细菌进入宿主细胞的反应和宿主增殖与病变的反应。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 基因表达谱 细菌-宿主相互作用 激活子网
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A novel copper-sensing two-component system for inducing Dsb gene expression in bacteria 被引量:1
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作者 Liang Yu Qiao Cao +6 位作者 Weizhong Chen Nana Yang Cai-Guang Yang Quanjiang Ji Min Wu Taeok Bae Lefu Lan 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2022年第2期198-212,M0004,共16页
In nature, bacteria must sense copper and tightly regulate gene expression to evade copper toxicity. Here,we identify a new copper-responsive two-component system named DsbRS in the important human pathogen Pseudomona... In nature, bacteria must sense copper and tightly regulate gene expression to evade copper toxicity. Here,we identify a new copper-responsive two-component system named DsbRS in the important human pathogen Pseudomonas aeruginosa;in this system, DsbS is a sensor histidine kinase, and DsbR, its cognate response regulator, directly induces the transcription of genes involved in protein disulfide bond formation(Dsb)(i.e., the dsbDEG operon and dsbB). In the absence of copper, DsbS acts as a phosphatase toward DsbR, thus blocking the transcription of Dsb genes. In the presence of copper, the metal ion directly binds to the sensor domain of DsbS, and the Cys82 residue plays a critical role in this process. The copperbinding behavior appears to inhibit the phosphatase activity of DsbS, leading to the activation of DsbR.The copper resistance of the dsbRS knock-out mutant is restored by the ectopic expression of the dsbDEG operon, which is a DsbRS major target. Strikingly, cognates of the dsbRS-dsbDEG pair are widely distributed across eubacteria. In addition, a DsbR-binding site, which contains the consensus sequence 5’-TTA-N8-TTAA-3’, is detected in the promoter region of dsbDEG homologs in these species. These findings suggest that the regulation of Dsb genes by DsbRS represents a novel mechanism by which bacterial cells cope with copper stress. 展开更多
关键词 Pseudomonas aeruginosa Two-component system Disulfide bond formation Gene regulation Copper resistance
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