人类基因中约有94%发生选择性剪接,使同一前体 m R‐NA分子产生不同基因型,编码不同蛋白质,极大增加了基因表达复杂程度和蛋白质多样性[1]。不同组织出现疾病时显示特定模式剪接变异体,这些剪接模式依赖于剪接因子在细胞核中的...人类基因中约有94%发生选择性剪接,使同一前体 m R‐NA分子产生不同基因型,编码不同蛋白质,极大增加了基因表达复杂程度和蛋白质多样性[1]。不同组织出现疾病时显示特定模式剪接变异体,这些剪接模式依赖于剪接因子在细胞核中的相对表达,包括表达量或翻译后修饰[2]。富含丝氨酸/精氨酸剪接因子1(SRSF1),是1个典型富含丝氨酸/精氨酸SR蛋白家族成员,参与基因组成性剪接和选择性剪接[3]。SRSF1通过调节基因选择性剪接参与肿瘤形成发展。展开更多
目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7 m RNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36...目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7 m RNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36、48、60、72及84μmol/L),处理24 h后提取总RNA,进行RT-PCR检测SRSF7 m RNA剪接异构体,并选取NCBI中未确定的异构体进行TA克隆后测序并分析鉴定异构体类型;用56μmol/L的CDDP处理人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞24 h,提取总RNA后验证新发现的SRSF7 m RNA剪切异构体是否存在这些细胞中。结果:发现3种新的SRSF7 m RNA剪接异构体(分别标记为New1、New2及New3),在肺癌细胞A549、H1299,人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞等多种肿瘤细胞中均存在,根据NCBI的预测New1,New2,New3异构体均为非编码蛋白的m RNA异构体,随着处理CDDP浓度的增加,其比例明显上升;而编码蛋白的m RNA异构体a和(或)b所占比例明显下降;同时SRSF7的总m RNA水平逐渐降低。结论:新发现的3种非编码的m RNA异构体的变化揭示细胞可能通过SRSF7自身的m RNA选择性剪接来应对DNA损伤。展开更多
文摘人类基因中约有94%发生选择性剪接,使同一前体 m R‐NA分子产生不同基因型,编码不同蛋白质,极大增加了基因表达复杂程度和蛋白质多样性[1]。不同组织出现疾病时显示特定模式剪接变异体,这些剪接模式依赖于剪接因子在细胞核中的相对表达,包括表达量或翻译后修饰[2]。富含丝氨酸/精氨酸剪接因子1(SRSF1),是1个典型富含丝氨酸/精氨酸SR蛋白家族成员,参与基因组成性剪接和选择性剪接[3]。SRSF1通过调节基因选择性剪接参与肿瘤形成发展。
文摘目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7 m RNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36、48、60、72及84μmol/L),处理24 h后提取总RNA,进行RT-PCR检测SRSF7 m RNA剪接异构体,并选取NCBI中未确定的异构体进行TA克隆后测序并分析鉴定异构体类型;用56μmol/L的CDDP处理人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞24 h,提取总RNA后验证新发现的SRSF7 m RNA剪切异构体是否存在这些细胞中。结果:发现3种新的SRSF7 m RNA剪接异构体(分别标记为New1、New2及New3),在肺癌细胞A549、H1299,人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞Ca Ski、Si Ha、C33A细胞等多种肿瘤细胞中均存在,根据NCBI的预测New1,New2,New3异构体均为非编码蛋白的m RNA异构体,随着处理CDDP浓度的增加,其比例明显上升;而编码蛋白的m RNA异构体a和(或)b所占比例明显下降;同时SRSF7的总m RNA水平逐渐降低。结论:新发现的3种非编码的m RNA异构体的变化揭示细胞可能通过SRSF7自身的m RNA选择性剪接来应对DNA损伤。