富含鸟嘌呤序列的RNA结合因子(GRSF1)研究进展

富含鸟嘌呤序列的RNA结合因子1(GRSF1)是RNA结合蛋白,属于异质核核糖核酸蛋白(hnRNP)F/H家族,该蛋白家族成员均含有两个以上类RNA识别基序(qRRMs)和至少一个辅助结构域。qRRM(类RNA识别基序)与RRM(RNA识别基序)相似但作用方式不同。在发育、衰老、肿瘤等领域,GRSF1发挥着重要作用。随着生物信息学和测序技术的发展,GRSF1的功能和作用机制被逐渐揭示,但并未得到充分解析。该文对GRSF1结构特点、表达调控和作用机制进行了概述,并总结了其在发育、细胞衰老、肿瘤发生等领域的研究进展,为深入探究GRSF1的作用机制及挖掘其生物功能奠定基础。

AUF1在病毒感染及相关炎症反应中的调控作用

富含AU元件的RNA结合蛋白1(AU-rich element binding factor 1,AUF1)具有剪接加工前体mRNA、转运和降解成熟mRNA的功能,同时调节带有富含AU元件(AU-rich element,ARE)的mRNA翻新。AUF1通过介导炎性细胞因子及其反应从而控制炎症进程。研究表明,AUF1与肠道病毒71型的内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)结合并与其交互负性调节病毒翻译与复制,它还可被募集到柯萨奇病毒B3型和肠道病毒71型诱导的应激颗粒中。

GRSF1在结肠癌组织中的表达及其与预后的关系

目的:本研究旨在讨论富含鸟嘌呤的序列结合因子1(G-rich RNA sequence binding factor 1,GRSF1)在结肠癌组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。方法:从基因表达综合数据库(GEO,包括GSE39582、GSE110225、GSE113513三个数据集)以及癌症基因组图谱(TCGA)中下载相关数据,收集565例结肠癌组织的基因表达谱以及相关临床数据,利用Graphpad prism 5分析GRSF1在结肠癌与癌旁组织中的表达情况,并将其分为GRSF1低表达组(n=396)及GRSF1高表达组(n=169)。利用IBM SPSS Statistics 25对样本中GRSF1基因表达数据及对应的临床信息进行统计分析。计量资料和计数资料的组间比较分别采用t检验和χ2检验;生存分析采用log-rank检验;生存资料单因素及多因素分析采用Cox比例风险模型。利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测GRSF1可能的相关功能及基因通路。结果:TCGA、CPTAC及GEO数据库分析提示,与正常组织相比,结肠癌组织GRSF1的mRNA及蛋白表达水平显著高于癌旁组织(P <0.000 1)。GRSF1表达水平与T分期(χ^(2)=5.797,P=0.016)、M分期(χ^(2)=7.365,P=0.007)、N分期(χ^(2)=6.664,P=0.010)、临床TNM分期(χ^(2)=4.264,P=0.039)有关,GRSF1高表达组总生存率及无复发生存率显著高于GRSF1低表达组(P=0.031,P=0.039)。Cox单因素分析结果显示,结肠癌患者预后和GRSF1表达水平(P=0.001)、T分期(P=0.002)、M分期(P=0.000)、N分期(P=0.000)、临床TNM分期(P=0.000)相关;Cox多因素分析结果显示,结肠癌患者预后与GRSF1表达水平(P=0.033)、T分期(P=0.012)、M分期(P=0.000)、临床TNM分期(P=0.023)相关。基因相互作用分析热图提示,与GRSF1正相关的基因中,EIF4E(r=0.854 2)、LARP1B(r=0.847 6)、ABCE1(r=0.843 0)、SRP72(r=0.839 5)、MRPL1(r=0.829 3)关联较为密切(P <0.000 1,FDR <0.000 1);与GRSF1负相关的基因中,RAB11B(r=-0.727 4)、E4F1(r=-0.715 7),KLHL36(r=-0.710 9)、CORO1B(r=-0.709 5)、WDR24(r=-0.704 0)关联较为密切(P <0.000 1,FDR <0.000 1)。基因富集分析结果显示,GRSF1高表达样本富集于核糖体构成(P=0.000,FDR=0.000)、RNA催化活性(P=0.000,FDR=0.000)、氧化磷酸化(P=0.000,FDR=0.000)等基因集。结论:GRSF1高表达与结肠癌患者预后不良相关,可作为结肠癌患者判断预后、早期诊断的潜在生物标志物以及早期治疗的分子靶点。

结肠癌组织SATB2、SIRT1、HOTAIR表达及与预后的相关性

目的研究结肠癌组织特定富含AT碱基DNA序列结合蛋白2(SATB2)、沉默信息调节因子1(SIRT1)和同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)表达水平及与预后的关系。方法选取2014年1月—2016年6月我院102例结肠癌,根据患者预后分为死亡组和存活组,检测2组肿瘤组织SATB2、SIRT1及HOTAIR表达水平,并分析其与患者预后的关系。结果本组中位随访时间为72个月,102例随访期间死亡67例(65.69%),中位总体生存期(OS)为63个月。死亡组肿瘤最大径和AJCC分期Ⅲ+Ⅳ期患者占比均大于存活组,肿瘤分化程度低于存活组,差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。死亡组SATB2阳性率低于存活组,SIRT1阳性率和HOTAIR mRNA相对表达量高于存活组,差异有统计学意义(P<0.01)。多因素Cox回归分析显示,肿瘤低分化、AJCC分期Ⅲ+Ⅳ期、SIRT1阳性和HOTAIR mRNA为结肠癌患者死亡的危险因素,SATB2阳性为结肠癌患者死亡的保护因素(P<0.05,P<0.01)。SATB2阳性患者中位OS(69个月)长于SATB2阴性患者(54个月),SIRT1阳性患者中位OS(57个月)短于SIRT1阴性患者(78个月),HOTAIR mRNA≥47.85患者中位OS(57个月)短于HOTAIR mRNA<47.85患者(78个月),差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。结论结肠癌组织SATB2、SIRT1和HOTAIR表达均为影响患者预后的重要因素。