枳、富民枳与枳橙RAPD分析与分类(亲缘)关系探讨

对枳、富民枳与枳橙进行了RAPD分析。17个引物对3个材料PCR扩增得52条谱带,从相似系数、多态性比较和聚类结果看:各材料之间具有不同的遗传距离,供试材料聚为2个类群(富民枳和枳橙聚为一群,枳单独聚为一类)。从分类(亲缘)关系看:作者认为富民枳与枳橙的亲缘关系更近,而与枳的关系较远。

富民枳的生物学特性及利用研究初报

富民枳树体大小与普通枳相当 ,其发育正常的两性花少 ,结实率低 ;种子或分株繁殖均易 ;作砧嫁接柑桔 ,结果早 ,株型矮化 。

富民枳与枳的花粉形态与分类位置探讨

对富民枳、枳的花粉进行了扫描电镜、光学显微镜观察．

富民枳种质资源的SSR遗传多样性研究

以野外已经灭绝的极小种群植物富民枳为对象,基于当前建立的种质资源收集圃开展群体遗传分析研究,探讨种质资源收集保存和野外回归的有效途径,为极小种群植物的拯救保护提供科学依据。利用毛细管电泳检测,从已发表的51个柑橘属SSR引物中,筛选出特异性高和多态性好的,对采集自10个种质资源收集地的170份富民枳样本进行遗传多样性分析,采用POPGENE、PIC_Calc、Populations、Fig Tree和Origin软件分别进行遗传参数估计、引物多态性信息含量计算、邻接树构建和聚类图的绘制。结果显示:SSR引物的多态性信息含量(PIC)平均为0.337 8;Shannon信息指数(I)平均为0.642 8;有效等位基因数(Ne)平均为1.798 7;Nei’s遗传多样性指数(Nei)平均为0.430 0;平均期望杂合度(He)为0.430 0;平均观测杂合度(Ho)为0.568 7。聚类分析显示,170个富民枳样本共聚类了65个分支末梢,属于同一个分支末梢的被默认为同等的遗传关系,我们称这65个样本为"有效样本"。综合评价结果表明:富民枳现存种质资源的遗传多样性水平较低,只有C2和C7在遗传水平上的保护是有效的,即有效样本量大于10,Shannon信息指数又达到该物种遗传多样性水平的90%以上。本研究结果为该物种有效的遗传管理奠定了理论基础。

应用简化基因组技术对富民枳遗传多样性检测

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5、次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点41 077个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对富民枳完成了群体的遗传多样性分析,研究分析了富民枳天然种群和回归种群的私人等位基因数目、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(FIS)5个遗传多样性参数。结果表明,富民枳现存植株的遗传多样性较高,具有很高的遗传资源保存价值,但是回归种群的Ho值、He值、π值分别为0.398 3、0.291和0.330 6,分别仅是天然种群遗传多样性的87%、78%和73%,并未达到90%以上遗传多样性的标准。

富民枳的核型与分类位置探讨

报道了富民枳(Ponciruspolyandra)的染色体核型。间期核和有丝分裂前期染色体分别为球状前染色体型和中间型;体细胞中期染色体数目为2n=18,核型公式为2n=2x=18=12m+6sm(2SAT);核型不对称性类型为1A。将上述结果与前人报道过的枳和枳橙的核型进行比较。根据富民枳、枳和枳橙之间的核型差异,并结合富民枳形态学、孢粉学、叶片同工酶和分子系统学等方面的研究成果进行综合分析,我们认为富民枳能够以种的地位存在于枳属中,且是较枳更为原始的种类。

基于SSR分析的富民枳样本量对其遗传多样性指标的影响

为了对极小种群野生植物富民枳(Poncirus polyandra)采取合理有效的保护措施,采用SSR分子标记作为遗传完整性检测标记,研究不同梯度的有效样本量对微卫星分析中遗传多样性指标的影响。本研究利用5对SSR引物,对65份富民枳种质材料进行遗传完整性检测,并对富民枳种植资源遗传多样性的微卫星数据进行分析。结果表明:随着有效样本量的增加,有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态性信息量和Shannon信息指数等遗传指标均随之增加,有效样本量与遗传多样性指标呈显著正相关。当以有效等位基因数、多态性信息量(PI,C)和Shannon多样性指数等来衡量时,有效样本量29株为曲线的拐点,此时代表了95%以上的遗传多样性水平;而以观测杂合度和期望杂合度来衡量时,有效样本量为25株时,便达到了该总体遗传多样性水平的95%以上。综合分析表明,富民枳的有效样本量以25~29株较为合适,目前富民枳的种质保存是合理有效的。

6-BA、NAA植物激素对富民枳组织培养的影响

对富民枳Poncirus polyandra茎段分别采用MS+不同浓度的6-BA和NAA植物激素进行分化培养,结果表明,MS培养基6-BA浓度为1.0mg.L-1,NAA浓度为2.56mg.L-1时富民枳茎段生长、分化、愈伤情况最佳。

富民枳的分类地位及其在进化中的作用研究——叶片同工酶证据(英文)

富民枳(Poncirus polyandra S.Q.Ding et al.)是分布于云南省富民县的一个新枳属类型。在形态上,它不同于普通枳(P.trifoliata Raf.)。富民枳为常绿类型,子房10室,花瓣5—9,花丝35—43,一年开花2—3次。通过对富民枳、普通枳、金柑属及柑桔属的叶片谷氨酸草酰乙酸转氨酶(GOT)、6-磷酸葡萄糖变位酶(PGM)、6-磷酸葡萄糖异构酶(PGI)、过氧化物酶(PX)、苹果酸酶(ME)、超氧化物歧化酶(SOD)以及四唑氧化酶(TO)同工酶的比较后发现,富民枳独具Sod-1-M基因,具有稀有的To-2-R基因,在To-1及Got-3位点上,存在无效基因,这些结果表明,富民枳能够以种的地位存在于枳属中。在进化过程中,富民枳可能是联结枳属与柑桔属的“桥梁”。

利用DNA片段测序方法探究枳属和富民枳的分类地位

富民枳(Poncirus polyandra)属于芸香科(Rutaceae)枳属(Poncirus Raf.)。自发表以来,分类地位一直备受争议,其中在Flora of China中认为富民枳为柑橘杂交种(Poncirus polyandra),把枳属归并于柑橘属(Citrus)。该研究选取枳属的富民枳、枳(Poncirus trifoliata)及柑橘属下8个种共10个种47个个体作为研究材料,以九里香(Murraya exotica)为外类群,利用3个叶绿体片段(trn L-trn F、trn S-trn G、rbc L)、ITS片段和1个单拷贝核基因(Chr 5)数据构建系统发育树,探究枳属和富民枳的分类地位。结果表明:基于3个叶绿体片段数据构建的最大似然树(ML)和贝叶斯树(BI)的拓扑结构基本一致,10个物种聚为两大分支,即柑橘属的8个物种聚为一大分支,富民枳和枳聚为另一大分支。其中,富民枳所有个体聚为一小单系分支,枳的所有个体聚为一小单系分支,支持枳属和富民枳独立存在。2个核DNA片段数据结果显示,枳属的两个种与柑橘属的8个物种聚在一个大分支里,无法确立枳属的单系地位,但富民枳的9个个体聚在一起,暗示富民枳在遗传上是一个独立的类群。综上研究认为,无论是叶绿体DNA数据还是核DNA数据均支持富民枳是一个独立的物种,但核DNA数据不支持枳属成立。

富民枳树绝后重生

富民枳树是昆明市富民县特有物种,属国家二级重点保护野生植物、云南省二级重点保护野生植物。1984年,中国科学院昆明植物研究所开展调查时,在富民县老青山首次发现富民枳树新种。2008年,经调查发现,富民枳树在原生地已无分布,属野生灭绝。

浅谈富民枳生存现状与保护发展

探明富民枳野外生存种群数量,了解富民枳分布区域内的生境条件和植被种类,为富民枳的野生种群保护和人工培育苗木提供依据,也为富民枳的有效保护提供科学依据。通过开展现地调查,了解富民枳可能分布区域的生境条件、植被概况以及富民枳野外种群数量,为后期开展富民枳的有效保护、种植区域选择及种植后的管护等提供科学参考。

用SSR标记研究柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系(英文)

用SSR标记分析了 2 9份柑橘属及近缘属植物的亲缘关系。 7对SSR引物在 2 9个样品中扩增得到 114个等位基因 ,平均每个位点有 16 3个等位基因。计算匹配系数后用邻接法进行聚类 ,结果表明 ,澳洲指橘与柑橘属的亲缘关系很近 ;SSR位点的高纯合频率支持富民枳种的地位 ;枳与柑橘属的关系较远 ,枳不大可能是从柑橘属衍生而来 ;Swingle的亚属的划分以及田中的原生柑橘类和后生柑橘类的划分界线都不清晰 ;现代栽培柑橘的起源与大翼橙关系密切 ;柑橘属的枸橼、柚和宽皮橘都能很好地分离 ,支持其为现代栽培柑橘的 3个基本种的观点。

濒危的柑橘类“水果后备役”

你知道吗,常见的柑橘水果通过DNA只能凑出3个种—香橼、柚和柑橘。三个野生种就能培育出五花八门的柑橘类水果,再来几种野生柑橘会怎样?野生柑橘属植物的重要性不言而喻。作者聚焦三种芸香科极小种群植物——红河橙、大翼厚皮橙和富民枳,认为它们极具“水果后备役”的基因潜质。