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ABEEMσπ模型中计算分子电荷分布加速方法的比较
1
作者
杨忠志
马丽
《商丘师范学院学报》
CAS
2014年第6期1-6,共6页
基于ABEEMσπ模型计算分子的电荷分布时,求解线性方程组是最为耗时的环节.本文针对不同硬件环境下,系数矩阵是稠密、对称非正定矩阵的线性方程组的求解方法进行了比较.详细介绍了串行求解库LAPACK以及基于GPU的CULA库的使用,并给出了基...
基于ABEEMσπ模型计算分子的电荷分布时,求解线性方程组是最为耗时的环节.本文针对不同硬件环境下,系数矩阵是稠密、对称非正定矩阵的线性方程组的求解方法进行了比较.详细介绍了串行求解库LAPACK以及基于GPU的CULA库的使用,并给出了基于Bunch-Kaufman方法的串行改进算法以及MPI多机并行求解方法,并分别给出了几种方法的运行时间.用户可以根据不同的硬件条件选择不同的加速算法,以求解系数矩阵是对称非正定矩阵的线性方程组,进而加快分子体系中电荷分布的计算速度.
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关键词
ABEEMΣΠ模型
MPI
GPU
LAPACK
CULA
对称非正定矩阵
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职称材料
题名
ABEEMσπ模型中计算分子电荷分布加速方法的比较
1
作者
杨忠志
马丽
机构
辽宁师范大学化学化工学院
出处
《商丘师范学院学报》
CAS
2014年第6期1-6,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.21133005)
文摘
基于ABEEMσπ模型计算分子的电荷分布时,求解线性方程组是最为耗时的环节.本文针对不同硬件环境下,系数矩阵是稠密、对称非正定矩阵的线性方程组的求解方法进行了比较.详细介绍了串行求解库LAPACK以及基于GPU的CULA库的使用,并给出了基于Bunch-Kaufman方法的串行改进算法以及MPI多机并行求解方法,并分别给出了几种方法的运行时间.用户可以根据不同的硬件条件选择不同的加速算法,以求解系数矩阵是对称非正定矩阵的线性方程组,进而加快分子体系中电荷分布的计算速度.
关键词
ABEEMΣΠ模型
MPI
GPU
LAPACK
CULA
对称非正定矩阵
Keywords
ABEEMσπ model
MPI
GPU
LAPACK
CULA
Bunch - Kaufman
symmetric indefinite matrix
分类号
O627 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ABEEMσπ模型中计算分子电荷分布加速方法的比较
杨忠志
马丽
《商丘师范学院学报》
CAS
2014
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