一步法RT-LAMP-HNB检测兰花建兰花叶病毒和齿舌兰环斑病毒方法的建立

【目的】全世界兰花病毒有50余种,建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)和齿舌兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)是其中最常见的两种病毒。目前仍没有有效的措施能够控制病毒病,因此建立针对病毒的高效监测、检测方法,对控制兰花病毒感染具有至关重要的意义。【方法】以兰花病毒CymMV和ORSV为试验材料,采用反转录-环介导等温扩增方法(RT-LAMP)进行病毒RNA的扩增,从而建立CymMV和ORSV的快速检测方法。分别根据两种病毒的cp基因序列保守区设计RT-LAMP引物,在一步法RT-LAMP反应体系中加入羟基萘酚蓝(HNB,终浓度200 μmol/L)作为扩增产物指示剂,不需开盖进行凝胶电泳检测,便可直接根据体系颜色变化判读反应结果。【结果】利用该检测方法能够在2 h测出样品中是否存在CymMV和ORSV病毒RNA,其灵敏度是RT-PCR的10倍。对20株田间样品进行一步法RT-LAMP-HNB检测,根据田间检测结果显示,CymMV检出率为70%,ORSV检出率为55%,与RT-PCR结果保持一致,该法适用于田间样品检测。【结论】建立的一步法RT-LAMP-HNB是一种灵敏、快速、特异、便捷的CymMV和ORSV检测方法,仅需要简单控温设备如水浴锅便可进行核酸扩增,适用于在基层或不便利地区推广使用。

对羟基萘酚兰二钠盐敏化共振光散射法测定DNA的研究

在pH10.23的Tris-HCl缓冲溶液中,阴离子主体小分子对羟基萘酚兰二钠盐(HNB)对阳离子表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵(CTMAB)与脱氧核糖核酸(DNA:fsDNA、ctDNA)的共振光散射光谱有协同增强作用.考察了共振光散射(RLS)光谱的影响因素,在优化条件下共振光散射强度增加值(ΔI)与DNA浓度之间呈良好的关系,据此建立了一种测定DNA的新方法,该方法具有反应速度快(只须1min)、稳定性好、灵敏度高等特点.对于fsDNA、ctDNA的线性范围分别为0.05～2.5 mg/L,0.04～2.0 mg/L,检出限分别为25.9 ng/mL,24.9 ng/mL.用于fsDNA合成样测定效果较好.