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基于RNA-Seq高通量测序技术的菠萝洁粉蚧转录组研究
被引量:
3
1
作者
何衍彪
詹儒林
+1 位作者
赵艳龙
常金梅
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期3912-3918,共7页
为了探索调节昆虫世代历期的相关基因,研究了菠萝洁粉蚧在转录水平上对温度的响应。组装后获得49898个Unigenes,其平均长度为1007bp;其中有15015(30.10%)个Unigenes被成功注释到Nr、SwissProt、KOG和KO等功能数据库中。DEG分析表明,7960...
为了探索调节昆虫世代历期的相关基因,研究了菠萝洁粉蚧在转录水平上对温度的响应。组装后获得49898个Unigenes,其平均长度为1007bp;其中有15015(30.10%)个Unigenes被成功注释到Nr、SwissProt、KOG和KO等功能数据库中。DEG分析表明,7960个Unigenes被诱导差异表达,其中MIX21相对于MIX27表达量上调的有5080个,下调的有2880个。差异基因代谢通路分析表明,差异表达基因中涉及长寿调节途径(Longevity regulating pathway)的有3个通路,其中21℃饲养下的菠萝洁粉蚧种群胰岛素/IFG-1信号通路关键因子DAF-2、雷帕霉素靶标TOR信号通路关键因子RSK-1和S6K显著下调,相关因子被抑制表达,很好地解释了其世代发育历期比27℃饲养下长的现象。21℃饲养下的菠萝洁粉蚧种群HSP60较27℃饲养下的显著上调,而HSPs有上调也有下调,显示热休克蛋白HSP对温度的反应呈现一定的多样性、复杂性。这些发现将有助于今后昆虫寿命分子调节机制的研究,DAF-2、S6K、RSK-1等相关基因未来或将应用于调节一些经济昆虫的生长周期。
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关键词
菠萝洁粉蚧
RNA-Seq高通量测序
寿命调节通路
温度
原文传递
题名
基于RNA-Seq高通量测序技术的菠萝洁粉蚧转录组研究
被引量:
3
1
作者
何衍彪
詹儒林
赵艳龙
常金梅
机构
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所农业部热带果树生物学重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期3912-3918,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31300348)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.1630062017026)
“一带一路”沿线国家热带农业资源联合调查与开发评价项目(No.ZYLH2018010305)共同资助
文摘
为了探索调节昆虫世代历期的相关基因,研究了菠萝洁粉蚧在转录水平上对温度的响应。组装后获得49898个Unigenes,其平均长度为1007bp;其中有15015(30.10%)个Unigenes被成功注释到Nr、SwissProt、KOG和KO等功能数据库中。DEG分析表明,7960个Unigenes被诱导差异表达,其中MIX21相对于MIX27表达量上调的有5080个,下调的有2880个。差异基因代谢通路分析表明,差异表达基因中涉及长寿调节途径(Longevity regulating pathway)的有3个通路,其中21℃饲养下的菠萝洁粉蚧种群胰岛素/IFG-1信号通路关键因子DAF-2、雷帕霉素靶标TOR信号通路关键因子RSK-1和S6K显著下调,相关因子被抑制表达,很好地解释了其世代发育历期比27℃饲养下长的现象。21℃饲养下的菠萝洁粉蚧种群HSP60较27℃饲养下的显著上调,而HSPs有上调也有下调,显示热休克蛋白HSP对温度的反应呈现一定的多样性、复杂性。这些发现将有助于今后昆虫寿命分子调节机制的研究,DAF-2、S6K、RSK-1等相关基因未来或将应用于调节一些经济昆虫的生长周期。
关键词
菠萝洁粉蚧
RNA-Seq高通量测序
寿命调节通路
温度
Keywords
Dysmicoccus brevipes (Cockerell)
RNA-Seq high throughput sequencing
Longevity regulating pathway
Temperature
分类号
S433.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于RNA-Seq高通量测序技术的菠萝洁粉蚧转录组研究
何衍彪
詹儒林
赵艳龙
常金梅
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
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