sORFs及其编码的微肽的发现和鉴定方法研究进展

小开放阅读框(small open reading frames,sORFs)是指含有不多于100个密码子的开放阅读框。由sORFs编码的肽被称作微肽(micropeptide)或小开放阅读框编码的肽(sORFs-encoded peptide,SEP)。随着生物信息学、计算机科学以及高通量测序技术的发展,已在多个物种的多种转录产物中发现大量的小开放阅读框(sORFs),一些由sORFs编码的微肽/SEPs也被鉴定出来。这些微肽/SEPs的发现说明生物体内蛋白质编码基因组的注释是不完整的,ORFs的任意大小限制和作为翻译唯一起始密码子的甲硫氨酸的绝对要求限制了具有非经典蛋白质编码潜力的重要转录本的鉴定。目前发现的几种微肽在基本生理活动和保持细胞代谢稳态方面都发挥着重要作用。本文综述了发掘sORFs编码的微肽的技术和研究微肽生物功能的方法的最新进展,并详述这些技术的优缺点。