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Rubisco小亚基基因片段的亚克隆及其瞬时表达载体的构建 被引量:4
1
作者 麻鹏达 周晓馥 +2 位作者 秦波 董春光 王兴智 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第4期527-530,共4页
1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶位于植物叶绿体中,是绿色植物中含量最丰富的蛋白,它催化CO2固定和光呼吸作用的第一步。从含Rubisco小亚基基因片段的pGR107-rbcS质粒中亚克隆出Rubisco小亚基基因片段,将PCR产物与pGEM-T Easy载体连接,用... 1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶位于植物叶绿体中,是绿色植物中含量最丰富的蛋白,它催化CO2固定和光呼吸作用的第一步。从含Rubisco小亚基基因片段的pGR107-rbcS质粒中亚克隆出Rubisco小亚基基因片段,将PCR产物与pGEM-T Easy载体连接,用EcoRI酶切鉴定酶切重组载体,利用低溶点胶回收大约300bp大小的Rubisco小亚基基因片段,将其回收片段与pSLJ75515瞬时表达载体连接,用EcoRI酶切鉴定,筛选出阳性重组体,即为pSLJ75515-rbcS瞬时表达载体。本实验为进一步研究Rubisco小亚基基因功能和基因沉默机制奠定了基础。 展开更多
关键词 Rubisco小亚基基因 基因片段 亚克隆 瞬时表达载体 基因构建 植物 叶绿体
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香蕉RuBPCase小亚基基因全长cDNA的克隆和分析 被引量:5
2
作者 刘德兵 魏军亚 +1 位作者 李绍鹏 彭明 《热带作物学报》 CSCD 2007年第3期57-61,共5页
利用RACE和RT-PCR技术,从香蕉中克隆出编码RuBPCase小亚基的全长cDNA,并与GenBank中已经报道的其他部分香蕉rbcS基因的核苷酸和推导的氨基酸序列进行同源性分析,为进一步研究香蕉RUBPCase的功能与结构提供依据。
关键词 香蕉 RUBPCase小亚基基因 克隆 分析
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几种水稻Rubis CO小亚基基因在大肠杆菌中表达方法的比较与产物的纯化 被引量:1
3
作者 李霞 戴传超 +2 位作者 焦德茂 陈根云 李立人 《生物技术》 CAS CSCD 1998年第3期13-15,共3页
本文采用常规IB液体培养基37℃培养;增加0.66MM甜菜碱,0.33M山梨醇+0.33M甜菜碱,0.66MM山梨醇,25℃培养于常规LB液体培养基培养以及更换温敏表达载体PBV200等三种方法,比较RubisCO小亚基基因在大肠杆菌中表达。结果表明,采... 本文采用常规IB液体培养基37℃培养;增加0.66MM甜菜碱,0.33M山梨醇+0.33M甜菜碱,0.66MM山梨醇,25℃培养于常规LB液体培养基培养以及更换温敏表达载体PBV200等三种方法,比较RubisCO小亚基基因在大肠杆菌中表达。结果表明,采用降低温度和增加培养介质的方法,目的基因以可溶性蛋白形成表达,且表达量与常远规LB培养基表达量相同;而以温敏表达载体PBV200质粒,表达总量增加且培养周期大大缩短。 展开更多
关键词 RUBISCO 小亚基基因 表达 比较产物纯化
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水稻RuBPCase小亚基基因(rbcS)全长cDNA的克隆和分析 被引量:2
4
作者 向太和 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期314-319,共6页
根据国际核酸数据库中不同植物的Ru BPCase小亚基基因(rbc S)保守序列设计PCR引物,首先扩增出约35 0 bp的c DNA短片段,以此作为分子杂交探针对构建的水稻c DNA文库进行杂交筛选,同时结合PCR分析确定阳性克隆中c DNA片段的大小,选取插入... 根据国际核酸数据库中不同植物的Ru BPCase小亚基基因(rbc S)保守序列设计PCR引物,首先扩增出约35 0 bp的c DNA短片段,以此作为分子杂交探针对构建的水稻c DNA文库进行杂交筛选,同时结合PCR分析确定阳性克隆中c DNA片段的大小,选取插入的c DNA片段最长的阳性克隆进行测序分析验证,从而克隆了水稻中编码Ru BPCase小亚基的全长c DNA(Gen Bank登记号:AY4 4 5 6 2 7) .该c DNA片段从第5 2 bp开始至5 79bp含有编码175个氨基酸的开放阅读框(ORF,Gen Bank登记号:AAR192 6 8.1)和一个终止密码子.AY 4 4 5 6 2 7在3′端有一个长2 6 4 bp的非编码区,而在3′末段有poly(T) 1 7.经Compute p I /Mw软件预测,AAR192 6 8.1的等电点p I和分子量Mw 分别为9.0 3和196 30 .6 6 Da.通过与国际核酸和蛋白质数据库的blast比较分析,AY4 4 5 6 2 7序列与Gen Bank登记号D0 0 6 4 4 .1(水稻rbc S)、U 4 3493.1(大麦rbc S)、AF10 4 2 5 0 .1(燕麦rbc S)和M374 77.1(小麦rbc S)的序列相似性分别为99% (6 5 0 /6 5 5 )、84 % (436 /5 15 )、84 % (42 7/5 0 6 )和84 % (386 /4 5 6 ) .而AAR192 6 8.1氨基酸序列与Gen Bank登记号P185 6 6 (水稻rbc S)、AAF0 794 7.1(燕麦rbc S)、BAA35 16 2 .1(大麦rbc S)和BAB19812 .1(小麦rbc S)的氨基酸序列相似性分别为98% (173/175 )、84 % (14 3/16 9)、84 % (14 0 /16 6 )和83% (14 4 /173) .生物信息学的分析还表明rbc S基因不仅在水稻不同品种基因型之间非常保守,而且在水稻、小麦、大麦和燕麦等禾本科不同物种之间也高度同源. 展开更多
关键词 水稻 RuBPCase小亚基基因 克隆 分析
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利用改良RACE方法克隆木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因的研究
5
作者 郭雅静 罗兴录 +1 位作者 钟建崑 陈会鲜 《中国农学通报》 CSCD 2014年第27期252-257,共6页
首次从木薯中分离克隆出AGPase小亚基的基因5’端cDNA序列,最终为进一步成功获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因的cDNA全长序列提供依据。本研究以木薯作为试验材料,设计锚定引物,并根据木薯AGPase小亚基基因已知序列设计PCR特异引... 首次从木薯中分离克隆出AGPase小亚基的基因5’端cDNA序列,最终为进一步成功获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因的cDNA全长序列提供依据。本研究以木薯作为试验材料,设计锚定引物,并根据木薯AGPase小亚基基因已知序列设计PCR特异引物,利用逆转录引物AUP1反转录总RNA,然后分离纯化反转录产物,通过对三大酶促反应(逆转录反应,TdT加尾,巢式及降落PCR技术)的具体改良,并将其与传统方法进行比较。利用改良后方法,首次成功获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因5’端cDNA序列。同时,本研究通过对RACE技术的改良与传统方法相比,在操作上更加简单、快速;在序列获得上更加高效;在试验成本上更加低廉。本研究可以高效且快速的成功获得木薯淀粉关键酶AGPase小亚基基因5’端序列,具有一定的实用性及简便性。 展开更多
关键词 木薯 AGPase小亚基基因 克隆 5’端 改良RACE方法
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普通白菜1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因Bcrbc S的克隆及表达分析 被引量:1
6
作者 刘东让 侯喜林 肖栋 《中国蔬菜》 北大核心 2019年第1期20-25,共6页
利用RACE技术,从普通白菜抗霜霉病品种苏州青叶片克隆到1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit,Bcrbc S)基因的全长c DNA序列。采用q RT-PCR分析该基因在普通白菜不同组织... 利用RACE技术,从普通白菜抗霜霉病品种苏州青叶片克隆到1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit,Bcrbc S)基因的全长c DNA序列。采用q RT-PCR分析该基因在普通白菜不同组织的表达模式。利用SDS-PAGE技术分析了该基因的原核表达特征。序列分析结果表明,Bcrbc S基因的c DNA序列全长为733 bp,其中开放阅读框长度为543 bp,共编码181个氨基酸,分子质量为20.3×10~3 Da,理论等电点为8.23。氨基酸同源系统进化分析表明,普通白菜Bcrbc S基因与同科植物的进化关系相近。实时定量分析结果表明,Bcrbc S基因在普通白菜叶中表达最强;在SA和Na Cl处理下,Bcrbc S基因表达量均在处理24 h后达到峰值。原核表达载体经IPTG诱导表达出分子质量约为20×10~3 Da的融合蛋白。 展开更多
关键词 普通白菜 1 5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因 序列分析 QRT-PCR 原核表达
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大豆1,5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基基因的转录表达分析 被引量:13
7
作者 贺超英 王伟权 +3 位作者 东方阳 张劲松 盖钧镒 陈受宜 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第16期1375-1380,共6页
1,5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基基因rbcS在植物基因组中呈多基因家族存在. 大豆中分离的3个全长的rbcS cDNA在核苷酸和氨基酸序列上具有极高的相似性. Southern杂交分析表明1,5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基(EC4.1.1.39)在大豆中由4~8个成... 1,5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基基因rbcS在植物基因组中呈多基因家族存在. 大豆中分离的3个全长的rbcS cDNA在核苷酸和氨基酸序列上具有极高的相似性. Southern杂交分析表明1,5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基(EC4.1.1.39)在大豆中由4~8个成员的基因家族编码. Northern分析表明rbcS的表达具有明显的器官特异性. 在叶片中表达量极高而在根中检测不到. rbcS基因对许多外界因子如水杨酸、 盐胁迫和干旱处理具有明显的应答反应. 但不同浓度的水杨酸和NaCl对rbcS基因的转录有不同程度的诱导. rbcS基因表达量分别在2.0 mmol/L的水杨酸和0.4% NaCl处理24 h时最高, 为相应对照的2.5~3.0倍. rbcS的转录具有明显的昼夜节律变化, 而且这种节律受低温和光照的影响. 展开更多
关键词 大豆 1 5-二磷酸核酮糖羧化酶小亚基基因 小杨酸 水分胁迫 昼夜节律 基因表达
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过表达NtAGPase小亚基基因提高烟叶淀粉含量和生物量 被引量:1
8
作者 陈莹 高宇 +4 位作者 李腾 邢志 蔡桂萍 薛金爱 李润植 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2845-2855,共11页
发展以非粮食作物为原料制备乙醇等生物燃料既可缓解全球能源危机,又能减低粮食作物用于生物燃料对粮食安全的威胁。烟草Nicotiana tabacum是一种生物量较高的经济作物,培育富含淀粉的新型烟草,可专用于燃料乙醇生产。文中克隆了烟草控... 发展以非粮食作物为原料制备乙醇等生物燃料既可缓解全球能源危机,又能减低粮食作物用于生物燃料对粮食安全的威胁。烟草Nicotiana tabacum是一种生物量较高的经济作物,培育富含淀粉的新型烟草,可专用于燃料乙醇生产。文中克隆了烟草控制淀粉生物合成的ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(ADP-glucose pyrophosphorylase,NtAGPase)小亚基基因NtSSU,并构建了NtSSU基因植物表达载体。通过农杆菌介导叶盘转化法在烟草中超表达NtSSU基因。转基因烟草植株表型鉴定显示,过表达NtSSU基因促进烟叶淀粉富集,烟叶淀粉含量从野生型17.5%升高到41.7%。转基因烟草的生长速率和生物量也显著增加。研究结果揭示,过表达NtSSU基因能有效调动光合产物碳通量更多地进入淀粉合成途径,提高生物质产量,且未对其他农艺性状产生负效应。因此,NtSSU基因可作为优异靶标基因应用于植物代谢工程以促进营养器官中淀粉的合成积累,从而开发专用于生产燃料乙醇的新种质。 展开更多
关键词 烟草 NtAGPase小亚基基因NtSSU 淀粉合成 生物量 非粮燃料乙醇
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血吸虫种株间18S小亚基单位核糖体核酸基因的同源性及其PCR法检测单个尾蚴的敏感性 被引量:5
9
作者 李洪军 梁幼生 +4 位作者 戴建荣 陶永辉 汪伟 曲国立 魏剑英 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2008年第6期418-422,共5页
目的探索日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸基因(18S-rRNA)序列的同源性及采用该基因建立PCR法检测水体中低密度血吸虫尾蚴的可能性。方法提取日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫基因组DNA,... 目的探索日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸基因(18S-rRNA)序列的同源性及采用该基因建立PCR法检测水体中低密度血吸虫尾蚴的可能性。方法提取日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫基因组DNA,采用PCR方法检测上述基因组中同一目的DNA片段,比较其同源性;分别以经沸水加热处理、氨水处理及NaOH、HCl、乙醇沉淀处理和未经处理的单个尾蚴标本为模板,采用PCR法扩增,比较对单个尾蚴的检出率。结果以日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株和曼氏血吸虫基因组DNA为模板,均能扩增出长度为469bp的DNA片段。经氨水处理和NaOH、HCl、乙醇沉淀法处理的单个尾蚴标本,PCR方法均能扩增到目的基因。在未经处理或沸水加热处理的单个尾蚴标本中,仅有50%标本能扩增到目的基因。结论血吸虫不同种株间18S-rRNA基因具有广泛同源性。经氨水处理或NaOH、HCl、乙醇沉淀法处理的标本,采用PCR法对低密度尾蚴的检出率高于未经处理或经沸水加热处理的标本。 展开更多
关键词 日本血吸虫 曼氏血吸虫 尾蚴 PCR 18S小亚单位核糖体核酸基因 敏感性
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利用核糖体DNA限制性酶切谱(ARDRA)分子技术和小亚基单位核糖体RNA(SSrRNA)基因序列分析对五种双眉虫(原生动物,纤毛门,游仆目)种内及种间关系的探讨 被引量:3
10
作者 张倩倩 伊珍珍 +4 位作者 王艳刚 马洪钢 朱明壮 陈子桂 宋微波 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期542-548,共7页
从12种限制性内切酶中筛选出6种可获得种间多样性的内切酶:Alu Ⅰ,Taq Ⅰ,Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ,Msp Ⅰ,Xba Ⅰ,对广义双眉虫Diophrys-complex5个种(伪寡毛双眉虫Diophrys apoligothrix、悬游双眉虫D.appendiculata、盾圆双眉虫D.scutum、秀... 从12种限制性内切酶中筛选出6种可获得种间多样性的内切酶:Alu Ⅰ,Taq Ⅰ,Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ,Msp Ⅰ,Xba Ⅰ,对广义双眉虫Diophrys-complex5个种(伪寡毛双眉虫Diophrys apoligothrix、悬游双眉虫D.appendiculata、盾圆双眉虫D.scutum、秀丽拟双眉虫Paradiophrys irmgard、针毛类双眉虫Diophryopsis hystrix)共7个种群的核糖体基因(18S小亚基、部分23S大亚基及其内转录间隔区域)进行多位点酶切。结果显示,种间差异明显大于种内差异。利用RAPDistance1.04软件构建的邻接树表明,盾圆双眉虫的3个种群表现出高度的同源性;3个近缘属(双眉虫属、拟双眉虫属、类双眉虫属)可以被明确区分,并支持类双眉虫属与拟双眉虫属的独立性。从GenBank/EMBL数据库中获得广义双眉虫及相近种的小亚基单位核糖体RNA(SSrRNA)基因序列,利用邻接法(NJ),贝叶斯法(Bayesian)和最大简约法(MP)构建的系统发生树具有基本一致的拓扑结构,结果显示:狭义双眉虫属Diophrys为单源发生系,并与类双眉虫属Diophryopsis组成姐妹群;尽管拟双眉虫属Paradiophrys具有广义双眉虫典型的形态学特征,但与尾刺虫属Uronychia有着较近的亲缘关系。本工作同时表明,核糖体DNA限制性酶切(ARDRA)技术可靠地区分纤毛虫的形态相似种,并在双眉虫属间水平的系统关系推定中存在一定的适用性。 展开更多
关键词 ARDRA 双眉虫属 拟双眉虫属 类双眉虫属 种间区分 小亚单位核糖体RNA基因 系统关系
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香蕉rbcS基因启动子的克隆及序列分析 被引量:10
11
作者 刘德兵 魏军亚 +4 位作者 李飞 贺军虎 魏守兴 谢子四 陈业渊 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期237-242,共6页
以巴西香蕉为材料,根据已经获得的香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因的全长cDNA序列设计1对专一引物,通过PCR扩增得到了香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基的基因组全长,序列长811 bp,含有2个内含子。根据其基因组序列设... 以巴西香蕉为材料,根据已经获得的香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因的全长cDNA序列设计1对专一引物,通过PCR扩增得到了香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基的基因组全长,序列长811 bp,含有2个内含子。根据其基因组序列设计引物,采用SEFA-PCR方法,以总DNA为模板克隆了香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因的启动子序列,长1 681 bp。用PLACE软件分析发现该序列具有启动子的基本元件TATA-box、CAAT-box,包含多个胁迫诱导元件,如光诱导元件、赤霉素、低温诱导元件、昼夜节律调控元件等。该序列的克隆与分析为进一步研究香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因的表达调控奠定了基础。 展开更多
关键词 香蕉1 5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因 启动子 序列分析
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香蕉枯萎病菌线粒体小亚基(mtSSU)rDNA的克隆及序列分析 被引量:1
12
作者 郑荔 兰成忠 +2 位作者 姚锦爱 阮宏椿 陈福如 《福建农业学报》 CAS 2012年第8期826-830,共5页
为探讨镰刀菌属的系统发育情况,采用真核生物线粒体中核糖体小亚基基因(mtSSU rDNA)的通用引物,PCR扩增了2株不同生理小种(小种4和小种1)的香蕉枯萎病菌mtSSU rDNA序列,并对PCR产物进行了序列分析,同时利用MEGA4软件中的Neighbor-joinin... 为探讨镰刀菌属的系统发育情况,采用真核生物线粒体中核糖体小亚基基因(mtSSU rDNA)的通用引物,PCR扩增了2株不同生理小种(小种4和小种1)的香蕉枯萎病菌mtSSU rDNA序列,并对PCR产物进行了序列分析,同时利用MEGA4软件中的Neighbor-joining(N-J)法,对2个样品序列以及GenBank中登陆的镰刀菌属不同种及尖镰孢种不同专化型的mtSSU rDNA序列,构建聚类分析树状图。结果显示,所测的2株香蕉枯萎病菌mtSSU rDNA全长685bp,两者之间同源性为99.70%。聚类分析表明,所测的2个样品和Fusarium oxysporumf.sp.cubense专化型在一个聚类组中,镰刀菌不同种及同种不同专化型间的mtSSU rDNA序列变异较大,说明该菌不同种及同种不同专化型间的遗传多样性丰富。 展开更多
关键词 香蕉枯萎病菌 线粒体小亚基基因 基因克隆 序列分析 同源性
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加拉帕戈斯似殖口虫的形态学、细胞发生学与分子系统学
13
作者 王丽 韩海峰 +3 位作者 王春慧 杜海峰 陈凌云 宁应之 《兰州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期222-232,共11页
利用活体观察和蛋白银染色技术对采自甘肃省永昌县马铃薯农田的加拉帕戈斯似殖口虫形态学和细胞发生学特征进行研究,通过提取物种的DNA信息,获得该种的核糖体小亚基基因(SSUrDNA)序列,通过序列比对和构建系统发育树对殖口虫科属间的系... 利用活体观察和蛋白银染色技术对采自甘肃省永昌县马铃薯农田的加拉帕戈斯似殖口虫形态学和细胞发生学特征进行研究,通过提取物种的DNA信息,获得该种的核糖体小亚基基因(SSUrDNA)序列,通过序列比对和构建系统发育树对殖口虫科属间的系统发育关系进行探讨.结果表明,该种形态学特征为:活体大小约为(60~85μm)×(20~25μm),虫体呈长椭圆形,两端收缩钝圆,3列额腹棘毛列,1根口棘毛,横前棘毛、横棘毛和尾棘毛均缺失,大核6~8枚,小核1~4枚附着于大核附近.细胞发生学特征为:老口围带被前仔虫完整保留;第ⅡI~V列棘毛原基以初级发生式发生,第I列棘毛原基单独发生;无横棘毛、横前棘毛和尾棘毛的形成;左右缘棘毛原基产生于老结构;3列背触毛原基产生于老结构.分子系统学分析表明加拉帕戈斯似殖口虫与中华殖口虫和殖口虫属未定种以较高的置信值聚为一支,与殖口虫科其他属形成姐妹支,分子信息再次印证殖口虫科为非单元发生。 展开更多
关键词 加拉帕戈斯似殖口虫 形态学 细胞发生 分子系统学 核糖体小亚基基因
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一株寄生于大黄鱼的盾纤毛虫分子鉴定与系统进化分析
14
作者 池洪树 江秋欢 +1 位作者 潘滢 林能锋 《福建畜牧兽医》 2023年第4期1-6,共6页
在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU rDNA和线粒体cox1序列进... 在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU rDNA和线粒体cox1序列进行同源性分析并构建系统发育树。结果显示,该盾纤毛虫874 bp的SSU rDNA部分序列与显赫针口虫(Porpostoma notata)同源性最高,相似性为98.97%。在基于SSU rDNA构建系统发育树中与显赫针口虫(P.notata)聚为一支,并独立于嗜污科(Philasteridae)的分支;获得该虫1 086 bp的cox1部分序列,与其SSU rDNA序列相比表现出更大的遗传变异度,在基于cox1部分序列构建系统发育树中,该虫株与嗜污科(Philasteridae)、尾丝虫科(Uronematidae)的分支也有一定距离。综上,该盾纤毛虫应是嗜污目(Philasterida)、针口虫属(Porpostoma)的显赫针口虫(P.notata)或其近缘种。 展开更多
关键词 盾纤毛虫 核糖体小亚基基因序列 线粒体细胞色素c氧化酶第I亚 大黄鱼
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近藤虫疠霉分类地位的分子证据
15
作者 黄勃 李振刚 +1 位作者 樊美珍 李增智 《菌物系统》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期373-377,共5页
对近藤虫疠霉和伊萨卡虫瘴霉的18SrRNA基因进行克隆测序(登录号分别为AF351133和AF351134),并于GenBank中的新蚜虫疠霉相应序列(登录号AF052405)进行比较。近藤虫疠霉有43个碱基差异,而伊萨卡虫瘴霉仅有38个碱基差异。这证明近藤虫疠... 对近藤虫疠霉和伊萨卡虫瘴霉的18SrRNA基因进行克隆测序(登录号分别为AF351133和AF351134),并于GenBank中的新蚜虫疠霉相应序列(登录号AF052405)进行比较。近藤虫疠霉有43个碱基差异,而伊萨卡虫瘴霉仅有38个碱基差异。这证明近藤虫疠霉作为一个独立的种存在是合理的。系统发育进化树发现近藤虫疠霉和伊萨卡虫瘴霉的亲缘关系比它和新蚜虫疠霉更近。这对Humber的新系统提出了异议。 展开更多
关键词 近藤虫疠霉 伊萨卡虫章霉 新蚜虫疠霉 核糖体小亚基基因 分类地位
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多重聚合酶链反应系统快速诊断结核和其他细菌感染 被引量:5
16
作者 向稚丹 方峰 +3 位作者 陈如 聂兴草 董永绥 李革 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期429-430,共2页
目的探讨多重聚合酶链反应(PCR)系统用于诊断细菌感染,并区分结核和其他细菌感染。方法多重PCR系统检测129份临床样本包括脑脊液108份、胸水10份、腹水11份,与培养结果比较,分别评估该系统检测普通细菌和结核杆菌敏感性和特异性。结果... 目的探讨多重聚合酶链反应(PCR)系统用于诊断细菌感染,并区分结核和其他细菌感染。方法多重PCR系统检测129份临床样本包括脑脊液108份、胸水10份、腹水11份,与培养结果比较,分别评估该系统检测普通细菌和结核杆菌敏感性和特异性。结果本系统检测临床样本中普通细菌和结核杆菌的敏感性均达100%,特异性分别为86%和81%。结论多重PCR系统可成功地用于临床快速诊断细菌感染,并有效区分结核和其他细菌感染。 展开更多
关键词 核糖体小亚核糖核酸基因 多重聚合酶链反应 细菌 结核杆菌
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检测日本血吸虫感染性钉螺PCR方法的建立 被引量:22
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作者 陈军虎 闻礼永 +3 位作者 张旭照 张剑锋 俞丽玲 洪林娣 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期204-207,共4页
目的建立灵敏、特异的检测日本血吸虫感染性钉螺的PCR方法。方法根据日本血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸(18S-rRNA)基因设计1对引物,建立检测日本血吸虫感染性钉螺的PCR方法。测定PCR产物的DNA序列,稀释血吸虫毛蚴DNA进行PCR方法的灵敏... 目的建立灵敏、特异的检测日本血吸虫感染性钉螺的PCR方法。方法根据日本血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸(18S-rRNA)基因设计1对引物,建立检测日本血吸虫感染性钉螺的PCR方法。测定PCR产物的DNA序列,稀释血吸虫毛蚴DNA进行PCR方法的灵敏性试验,扩增单尾尾蚴感染的钉螺DNA进行交叉反应试验,并根据不同稀释度的感染性钉螺DNA的扩增结果来验证PCR的群体检测效果。结果PCR扩增日本血吸虫感染性钉螺,得到了与靶DNA片段位置相同的产物,测序片段长度为469bp,与靶DNA相同且序列一致,并将序列登录GenBank(注册号:DQ442999)。扩增阴性钉螺无产物出现。灵敏性试验提示,PCR可检出日本血吸虫毛蚴DNA的最低浓度为40pg/μl;交叉反应试验显示,PCR方法不能扩增出单尾尾蚴感染钉螺的DNA;群体检测试验表明,PCR可检出感染性钉螺提取的DNA最高稀释度为1∶640。结论初步建立的检测日本血吸虫感染性钉螺的PCR方法灵敏、特异且具有良好的群体检测效果。 展开更多
关键词 日本血吸虫 湖北钉螺 聚合酶链反应 18S小亚单位核塘体核酸基因
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利什曼原虫中国分离株SSU rDNA多变区序列分析 被引量:7
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作者 卜玲毅 胡孝素 +2 位作者 敬保迁 马莹 易桃林 《实用寄生虫病杂志》 CAS 2001年第1期1-3,共3页
目的分析我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株的 SSU r DNA多变区序列差异。方法 n DNA进行PCR扩增 ,将扩增出的 SSU r DNA基因的特异片段克隆于 p GEMR-T Easy Vector上 ,采用通用引物 M1 3进行 PCR扩增 ,全自动测序仪测序。结果序列... 目的分析我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株的 SSU r DNA多变区序列差异。方法 n DNA进行PCR扩增 ,将扩增出的 SSU r DNA基因的特异片段克隆于 p GEMR-T Easy Vector上 ,采用通用引物 M1 3进行 PCR扩增 ,全自动测序仪测序。结果序列分析显示本文报道的荒漠、山丘疫区的 2株利什曼原虫 (L.d.XJ771、L.d.SC6)的 SSU r DNA序列大小均为 3 92 bp;序列差异发生在两个独特序列区 (UQ- 和 UQ- ) ,无移码突变 ;与 Gene Bank中的利什曼原虫比较分析 ,同源性在 98%以上。结论我国荒漠、山丘疫区利什曼原虫分离株之间的 SSU r DNA多变区的碱基序列有差异 ;荒漠疫区分离株 L.d.XJ771与国际标准株 L.d.DD8的 SSU r 展开更多
关键词 利什曼原虫 小亚核糖体核酸基因 聚合酶链反应 克隆 序列分析 基因变异
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下毛目分子系统进化研究和鬃棘尾虫再描述(纤毛动物门:下毛目:尖毛虫科) 被引量:5
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作者 朱飞云 余育和 沈韫芬 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2002年第1期24-32,共9页
作者自武汉东湖采集的样本中分离出鬃棘尾虫Stylonychiapustulata ,利用活体观察与蛋白银染色技术进行了形态学研究 ,并测定了核糖体小亚基RNA基因全序列 ;以邻接法 (Neighbor Joining ,NJ)和最大简约性法 (MaximumParsimonyMethod ,MP... 作者自武汉东湖采集的样本中分离出鬃棘尾虫Stylonychiapustulata ,利用活体观察与蛋白银染色技术进行了形态学研究 ,并测定了核糖体小亚基RNA基因全序列 ;以邻接法 (Neighbor Joining ,NJ)和最大简约性法 (MaximumParsimonyMethod ,MP)对该物种与GenBank中所有其它下毛目物种进行了分子系统发育分析。结果显示 :所研究下毛目种类皆聚为一支 ,支持下毛目为单系观点 ;尖毛虫属和棘尾虫属物种聚类相互交错 ,因此结合形态学上分类标志的分析 ,对这两个属存在的合理性提出异议。根据本文对同种不同种群的小腔游仆虫Euplotesaedicalatus、尖毛虫Oxytrichagranulifera以及鬃棘尾虫Stylonychiapustulata分子进化分析 。 展开更多
关键词 下毛目 鬃棘尾虫 核糖体小亚RNA基因 形态学 系统进化 分子系统发育
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Advances in Low-Molecular-Weight Glutenin Subunits
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作者 武晓蓓 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第2期183-187,194,共6页
The low-molecular-weight glutenin subunits(LMW-GS)account for 40% of gross glutenins of wheat,usually used as a major indicator for wheat quality improvement.Here,I comprehensively reviewed the advances in LMW-GS fr... The low-molecular-weight glutenin subunits(LMW-GS)account for 40% of gross glutenins of wheat,usually used as a major indicator for wheat quality improvement.Here,I comprehensively reviewed the advances in LMW-GS from their classification,coding gene loci on chromosomes and structural features,polypeptide chains composition,gene sequences accessed in Genbank,molecular markers saturation level,and their impacts on wheat process quality,in order to provide a theoretical basis for the utilization of LMW-GS in genetic improvement of wheat quality. 展开更多
关键词 WHEAT LMW-GS GENE QUALITY
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