海南黑山羊小分子热休克蛋白9cDNA克隆及其生物信息学分析

本研究以海南黑山羊睾丸组织为材料,利用RT-PCR和RACE技术获得海南黑山羊小分子热休克蛋白9(small heat shock protein 9,Hspb9)基因完整的CDS序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到山羊Hspb9cDNA长549bp,CDS区471bp,共编码157个氨基酸,提交至GenBank数据库中,登录号为:JX088726。生物信息学分析结果表明,Hspb9编码的蛋白无跨膜区和信号肽,存在多个磷酸化位点;预测Hspb9蛋白二级结构α-螺旋占15.28%,β-折叠占30.57%,无规则卷曲占54.15%;存在1个UBQ结构域;Clustel W方法比对山羊Hspb9与绵羊、牛的同源性最高。