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小片蝽线粒体基因组及蝽科系统发育分析
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作者 刘迎香 赵清 《山西农业科学》 2024年第2期78-88,共11页
为了从线粒体基因组水平探讨小片蝽Sciocoris lateralis在蝽科的分类地位,丰富蝽科线粒体基因组基本数据,为蝽科系统发育进化研究提供一定的理论依据,通过高通量测序,首次测定并分析了小片蝽完整线粒体基因组(Genbank登录号:OP531920),... 为了从线粒体基因组水平探讨小片蝽Sciocoris lateralis在蝽科的分类地位,丰富蝽科线粒体基因组基本数据,为蝽科系统发育进化研究提供一定的理论依据,通过高通量测序,首次测定并分析了小片蝽完整线粒体基因组(Genbank登录号:OP531920),提取蝽科物种的13个蛋白编码串联序列(PCGs),使用最大似然法、贝叶斯法构建系统发育树。结果显示,小片蝽昆虫的线粒体全基因组长度为15 445 bp,包括13个蛋白编码基因(Protein-codinggenes,PCGs)、2个rRNA基因(ribosomeRNAs,rRNAs)、22个tRNA基因(transferRNAs,tRNAs)和1个控制区(Control region)。小片蝽线粒体基因组结构排序与其他蝽科物种一致,均无基因重排现象。小片蝽线粒体全序列AT含量为74.26%,GC含量为25.74%。13个蛋白编码基因中,cox1、nad1和nad6的起始密码子为TTG,其余10个蛋白编码基因的起始密码子是ATT、ATA、ATG。在所测得的tRNA基因中,trnS1和trnV缺失DHU臂,其他20个tRNA均能折叠形成典型的三叶草结构。基因错配方式主要为G-U错配。基于13个PCGs构建的蝽科系统发育树结果显示,小片蝽与斑须蝽的亲缘关系最近并且位于蝽亚科分支,支持二星蝽族Eysarcorini和Strachiini族的单系性,而棕蝽族Caystrini和腹沟族Halyini互为姐妹群,这与传统形态学分类结果一致;益蝽亚科与蝽亚科曼蝽属(Menida)形成姐妹群关系,该系统发育关系与传统形态分类学研究结果不一致。 展开更多
关键词 小片蝽 线粒体基因组 系统发育
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