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基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
1
作者
赵敏
张薇
+2 位作者
孙琳
王玉鹏
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2022年第3期329-334,共6页
目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白...
目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论 补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。
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关键词
小麦不耐受
差异表达蛋白
变量筛选
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职称材料
题名
基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
1
作者
赵敏
张薇
孙琳
王玉鹏
刘美娜
机构
哈尔滨医科大学卫生统计学教研室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2022年第3期329-334,共6页
基金
国家重大专项课题(2016ZX08011005)
国家自然科学基金青年科学基金(82003556)。
文摘
目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论 补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。
关键词
小麦不耐受
差异表达蛋白
变量筛选
Keywords
Wheat intolerance
Differentially expressed protein
Variable screening
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
赵敏
张薇
孙琳
王玉鹏
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2022
0
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