小RNA病毒调控宿主cGAS-STING信号通路的机制研究

天然免疫系统在宿主早期发挥抗病毒反应中具有重要作用。宿主模式识别受体(PRRs,如RIG-I、NOD2、cGAS样等受体)识别病原微生物结构上保守组分病原相关分子模式(PAMPs),进而激活下游级联信号通路,诱导干扰素或细胞因子等的产生,激活宿主的抗病毒天然免疫反应。病毒也可降解宿主的天然免疫信号通路分子或抑制其的激活.

茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析

用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。

参与小RNA病毒感染和复制的宿主及病毒蛋白功能研究进展

阐明宿主和病毒间的相互作用对于理解病毒的复制、致病性和毒力至关重要,本文对小RNA病毒感染和复制过程中参与的宿主蛋白和病毒蛋白的功能最新研究进展做一综述。首先讨论病毒衣壳蛋白和宿主细胞受体间的相互作用,然后详述病毒复制过程中参与的病毒蛋白和宿主细胞蛋白。

昆虫小RNA病毒研究进展

昆虫小RNA病毒依据基因组结构特点分为家蚕软化病毒组、蟋蟀痹病毒组和豌豆蚜病毒组。昆虫小RNA病毒蛋白质翻译具有独特性 :不依赖于帽子结构 ,不需要启始因子eIF1、eIF1A和帽子结合蛋白eIF4E ;而且蟋蟀痹病毒组和豌豆蚜病毒组结构蛋白翻译从内部核糖体进入位点独立启始 ,启始密码子是CUU。该文还简介了昆虫小RNA病毒复制机理及与其它动。

小RNA病毒基因表达调控研究进展

小RNA病毒科属于正链RNA病毒,该科各属病毒基因组结构和基因表达机制具有保守性。文章对小RNA病毒科病毒基因表达调控,包括非依赖帽状结构的翻译起始、宿主细胞翻译的关闭、病毒多聚蛋白的加工处理和RNA的复制研究进行综述,为阐明该科病毒的致病机理和研究真核生物的基因表达调控提供可借鉴的资料。

小RNA病毒致病机理的研究

很多小RNA科病毒感染宿主细胞后可通过自身的核酸序列或病毒性蛋白产物控制靶细胞的生命活动,而被感染细胞也会通过自身的调控机制对侵染的病毒进行有限的反击,这种现象被认为是宿主细胞对抗小RNA科病毒侵染的防御机制。这种侵染与抵抗的互作机制可由某些病毒蛋白对细胞产生信号干扰或细胞自身翻译合成的细胞因子对病毒的复制路径进行封堵来实现。虽然这些信号通路的上游事件是不同的,但最后的效应却很统一,即使细胞崩解或者细胞将自身按照一定程序与所侵入的病毒同归于尽。此外,一些病毒蛋白具有抑制细胞程序性自杀的功能,它们能够令感染病毒后的细胞不死亡,形成病毒与宿主细胞共存的持续性感染状态。

肠道小RNA病毒组所致脑膜炎的病原体特点及其诊断

目的探索肠道小RNA病毒组所致病毒性脑膜炎的病原体特点及诊断方法。方法病毒性脑膜炎患者(病脑组)和非病毒性脑膜炎患者(对照组)为观测对象,应用反转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)检测脑脊液标本肠道小RNA病毒组及柯萨奇病毒(COX)。结果病脑组肠道小RNA病毒组总检出率为34.5%,其中COX为29.1%;对照组未检出此类病毒。结论RT-PCR是检测肠道小RNA病毒较实用的方法,肠道小RNA病毒组尤其是其中的COX是导致病脑的重要病原体,应列为病脑病原体常规检测。

微小RNA病毒的研究进展

微小RNA（miRNA）是小分子RNA家族中的一员，内源性非编码基因构成的21～23nt单链小RNA分子，在生物进化过程中保持了高度的保守性，通常由Dicer酶从具有发夹二级结构的RNA前体加工而来，miRNA虽然微小，但它在真核生物发育和基因表达中通过与靶mRNA形成完全或不完全互补配对从而扮演着重要角色。2004年，发现了编码和表达miRNA的第一个病毒——埃博拉病毒（epstein-barrvirus，EBV），最近，miRNA又从肉瘤相关疱疹病毒（kaposi’s sarcoma-as-sociated herpesvirus，KSHV）和人巨细胞病毒（human cytomegalovirus，HCMV）中克隆到，此外，SV40 miRNA被认为负调控T抗原（1arge T-antigen，T Ag）表达，作者对病毒编码的miRNA及miRNA在最近研究中的预测、表达和功能作一综述。

茶尺蠖小RNA病毒全长cDNA克隆的构建

为了初步研究茶尺蠖小RNA病毒(Ectropis oblique picorna-like virus,EoPV)的复制机制,从被EoPV感染致死的茶尺蠖幼虫中分离并纯化病毒粒子,提取病毒RNA,根据已公布的EoPV核苷酸序列,利用基因组上单一的酶切位点,设计特异性引物,应用RT-PCR扩增出5个覆盖全长的片段。随后采用融合PCR将5个片段拼接,最终将全长定向克隆到低拷贝质粒载体上,成功构建cDNA全长克隆p-EoPV。双酶切及测序鉴定证明全长克隆构建成功。与原序列比较发现,该克隆在氨基酸水平上有8个突变和1个缺失。本研究为深入探讨EoPV病毒生物学特性、病毒复制机理等奠定了基础。

反转录聚合酶链反应方法诊断肠道小RNA病毒性脑膜炎

目的评估RT-PCR方法诊断肠道小RNA病毒性脑膜炎的应用价值。方法对象包括脑膜炎组104例和对照组39例,检测脑脊液中肠道小RNA病毒应用RT-PCR方法。结果脑膜炎组的肠道小RNA病毒阳性率为41.3%(43/104),对照组未测出肠道小RNA病毒阳性结果。结论肠道小RNA病毒是导致脑膜炎的重要病原体,RT-PCR方法诊断肠道小RNA病毒性脑膜炎具有较高的应用价值。

转译过程中小RNA病毒与宿主细胞的相互作用

小RNA病毒的转译机制不同于真核细胞mRNA的转译机制,该类病毒是借助于内部核糖体进入位点来启动内部翻译过程的,同时还伴随着宿主细胞蛋白质合成的抑制过程。在此过程中,小RNA病毒与宿主细胞间发生了一系列复杂的相互作用和信息交流,本文对该领域的研究进展作了综述。

小RNA病毒和小DNA病毒的三维结构模型

本文综述了小RNA病毒和小DNA病毒的主要结构特征,绘制出了它们的三维结构模型,从中找出了两者间的共同点和差异,为进一步研究两种病毒提供了依据。

禽脑脊髓炎病毒与其他小RNA病毒基因组序列比较分析

利用生物信息学方法对在基因文库中有完整注释信息的禽脑脊髓炎病毒(AEV)和其他小RNA病毒进行了基因组结构比较,发现小RNA病毒基因组结构的共性和个性;利用DNAMAN 5.0软件对小RNA病毒进行了基因组和蛋白多序列比对,并建立了蛋白质系统进化树。结果表明,AEV与甲肝病毒(HAV)的基因组结构最为相似;它们的基因组序列和蛋白序列的同源性最大,蛋白系统进化树的构建更进一步证明AEV与HAV的亲源关系最近;另外,经多序列比对发现猪肠道病毒A、鸭小RNA病毒TW90A型与猿猴小RNA病毒1型三者之间具有最大的序列同源性,并处于同一个进化树分枝,因此,建议将它们划分为一个新的小RNA病毒属,同时也为其他小RNA病毒科属种的划分提供了参考。

肠道小RNA病毒在151例脑膜炎患者脑脊液中的检测分析

目的：分析脑脊液中肠道小RNA病毒的检测结果，了解所检测的RNA病毒在脑膜炎中的致病作用。方法：检测脑脊液标本肠道小RNA病毒用聚合酶链反应方法（PCR）。结果：肠道小RNA病毒的阳性率分别为：小RNA病毒31.3%(47/151)、B组柯萨奇病毒（COXB）30.5%(46/151）。37例对照组的脑脊液中，未检出肠道小RNA病毒。结论：肠道小RNA病毒和COXB是导致脑膜炎的重要病原体。PCR方法可以用于脑膜炎的临床病因学诊断。

小RNA病毒蛋白的系统命名法——L_(434)法则

小RNA病毒(Picornavirus)蛋白是根据病毒在SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳上的电泳图谱而命名(Summers et al,1965)。这种方法不仅在不同病毒中相应病毒蛋白产生出不同的名称,如病毒聚合酶在脊髓灰质炎(Polio)病毒、口蹄疫病毒(FMDV)和脑心肌炎(EMC)

小RNA病毒基因组3′非编码区结构与功能研究进展

小RNA病毒属于单股正链RNA病毒,包括肠道病毒属、鼻病毒属、心脏病毒属、口疮病毒属和肝病毒属等几个主要的属。口蹄疫病毒(FMDV)、脊髓灰质炎病毒(PV)、丙型肝炎病毒(HCV)、脑心肌炎病毒(EMCV)是该科病毒的典型代表。小RNA基因组的末端具有非编码区(UTR),是病毒基因组复制的主要调控位点,3′非编码(3′UTR)区是复制酶的第一结合位点,其二级结构在病毒的翻译与复制过程中具有重要作用,该区是病毒复制酶识别并结合的位点,主要起始负链RNA的合成,3′UTR在病毒的翻译过程及感染性病毒粒子的形成过程中起着十分重要的作用。因此,研究小RNA基因组的3′端结构和功能可为确定复制与表达位点在非编码区的具体位置和主要特征,以及其他正链小RNA病毒基因组复制的研究奠定了理论基础。

小RNA病毒3C蛋白酶及其裂解底物

小RNA病毒科是一类大的动物病毒科,小RNA病毒蛋白的合成需要自身蛋白酶裂解形成多个结构蛋白和功能蛋白,3C蛋白酶是一些小RNA病毒的自身蛋白水解酶之一,3C蛋白酶还可以裂解一些宿主的蛋白,利于病毒的复制。3C蛋白酶结构特点、活性中心、酶切位点如何,裂解的底物功能怎样,是进一步了解3C蛋白酶作用机制的关键。就这些问题进行综述。

小RNA病毒3A基因及其编码蛋白研究进展

小RNA病毒3A蛋白是病毒的非结构蛋白,本文主要介绍3A基因以及其编码蛋白的特点,3A蛋白对细胞蛋白转运中的作用以及与其他蛋白的相互作用,3A蛋白与ARF家族在囊泡运输中作用的机制等。

小RNA病毒蛋白与细胞凋亡的关系

很多小RNA病毒科病毒感染宿主细胞后可引发宿主细胞凋亡,这种现象被认为是宿主细胞对抗小RNA病毒侵染的防御机制。凋亡机制可由某些病毒蛋白对细胞产生信号干扰来实现多种凋亡通路。虽然这些凋亡通路的上游事件是不同的,但最后的效应却很一致。此外,一些病毒蛋白具有抑制细胞凋亡的功能,它们能够令感染病毒后的细胞不死亡,形成病毒与宿主细胞共存的持续性感染状态。

小RNA病毒与细胞凋亡

在小RNA病毒科中,口蹄疫病毒等不同病毒的不同基因可诱导宿主细胞发生凋亡,其作用机制也不完全相同。论文对小RNA病毒诱导细胞凋亡的机制进行了综述,并对相关研究进行了展望。