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微卫星位点筛选方法综述
被引量:
22
1
作者
曾庆国
陈艺燕
《生态科学》
CSCD
2005年第4期368-372,共5页
微卫星标记因其丰富的多态性和共显性等特点,已得到了广泛的应用。应用微卫星标记首先需要获得微卫星位点的序列信息,用来设计引物。获得微卫星位点的方法有多种,本文综述了获得和富集微卫星位点的常用方法。最简便、最省时的方法是从...
微卫星标记因其丰富的多态性和共显性等特点,已得到了广泛的应用。应用微卫星标记首先需要获得微卫星位点的序列信息,用来设计引物。获得微卫星位点的方法有多种,本文综述了获得和富集微卫星位点的常用方法。最简便、最省时的方法是从公共数据库(如EMBL、Genbank、EST数据库等)或已发表的文献中查找到微卫星位点,但只限于已经有序列数据发布的物种。第二种方法是种间转移扩增,即从相近物种的数据库中查找微卫星位点,或使用已有数据发表的遗传距离相近物种的微卫星标记。第三种方法是从基因组DNA中筛选微卫星位点,其中用于富集微卫星的方法有引物法、磁珠杂交法、尼龙膜杂交法以及RAPD技术法。
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关键词
微卫星
EST-SSRS
种间转移扩增
磁珠
杂交
尼龙膜杂交
RAPD
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职称材料
题名
微卫星位点筛选方法综述
被引量:
22
1
作者
曾庆国
陈艺燕
机构
宁波市海洋渔业研究院
暨南大学水生生物研究所
出处
《生态科学》
CSCD
2005年第4期368-372,共5页
基金
宁波科技局青年基金资助项目(No.2005A620026)
文摘
微卫星标记因其丰富的多态性和共显性等特点,已得到了广泛的应用。应用微卫星标记首先需要获得微卫星位点的序列信息,用来设计引物。获得微卫星位点的方法有多种,本文综述了获得和富集微卫星位点的常用方法。最简便、最省时的方法是从公共数据库(如EMBL、Genbank、EST数据库等)或已发表的文献中查找到微卫星位点,但只限于已经有序列数据发布的物种。第二种方法是种间转移扩增,即从相近物种的数据库中查找微卫星位点,或使用已有数据发表的遗传距离相近物种的微卫星标记。第三种方法是从基因组DNA中筛选微卫星位点,其中用于富集微卫星的方法有引物法、磁珠杂交法、尼龙膜杂交法以及RAPD技术法。
关键词
微卫星
EST-SSRS
种间转移扩增
磁珠
杂交
尼龙膜杂交
RAPD
Keywords
Microsatellite (SSR)
EST-SSRs. Interspecific transfer amplification
Magnetic bead hybridization
Nylon membrane hybridization RAPD
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
微卫星位点筛选方法综述
曾庆国
陈艺燕
《生态科学》
CSCD
2005
22
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