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基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
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作者 安笑叶 毛秋月 +4 位作者 刘泽宇 鲁程锦 张冰 林志健 王雨 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第13期1896-1901,共6页
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制。方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的miRNA。利用TargetS... 目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制。方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的miRNA。利用TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4个数据库预测miRNA的靶基因,通过DAVID和Metascape数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络。结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p和miR-212-5p为排名前5的HUB基因。结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路。 展开更多
关键词 尿酸盐肾沉积 miRNA测序 miRNA lncRNA ceRNA 生信预测 作用机制 细胞衰老
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