摄食低钠盐对三高病人局部基因网络模式的共同影响

应用局部基因网络模式(Local gene network pattern)研究摄食低钠盐在高血压、高脂血及高血糖三种疾病人群血液基因表达谱引起的若干共同差异。测试人群包含19个样本(8正常,11三高疾病),经过检测食用低钠盐前后的基因表达芯片,在监测的150个高血压候选基因中,有17个有明显表达,其中的14个发现可以通过明确的信号通路相互连通成包含约60个基因的局部基因网络。该局部基因网络相对于正常组在三高疾病组中的共同变化表现在4个基因上。结果表明,局部基因网络可在分子水平上研究营养因子对不同人群的营养效应。上述三高病人响应低钠盐的共同局部基因网络可以从方法学上作为进一步研发功能食品的基础,也为低钠盐作为针对三高人群的非药物保健因子在基因表达上提供了进一步研究所需的素材。

乳腺癌局部基因网络模型及其与营养代谢模块的耦联

利用局部基因网络模式方法构建了乳腺癌的局部基因网络与若干营养代谢模块的耦联图,初步展示了脂类代谢(其中包括酒精代谢)、多糖代谢、能量代谢和氨基酸代谢与乳腺癌易感基因之间的复杂联系,为研究复杂疾病与营养代谢失调之间的关系提供一个方法平台,也为乳腺癌病人个体化饮食营养配伍研究奠定分子基础。

影响长寿的局部基因网络模型及其与营养代谢模块的相关性

利用酵母、线虫等模式生物寿命相关基因及其与人类基因的同源性构建了人类寿命相关的局部基因网络。该局部网络包含了mTOR signaling pathway,Insulin signaling pathway,MAPK signaling pathway等信号传导通路,包含了大约17个基因。进一步分析发现该局部网络主要耦联的营养代谢模块是氨基酸代谢、多糖代谢、能量代谢和脂类代谢。

Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响

研究基因网络的非线性行为特征是研制基因网络技术的基础。Tup1基因是酵母中作用最为广泛的转录抑制因子之一,利用酵母生物信息学数据库中蛋白相互作用关系,构建一个以Tup1为中心,4个层次741个基因的局部基因网络。统计分析六张Tup1不同突变的基因表达芯片数据,将局部基因网络中的全部基因按照3个网络特征进行统计分析:必需\非必需基因、网络层次和网络节点,并研究这些特征与基因表达之间的关系。初步发现基因表达变化的强度与节点数目成一定的反比关系,必需基因的平均变化程度较非必需基因为低,且由Tup1突变引发的其他基因的表达变化在以Tup1为中心的局部基因网络中近层次网络变化程度较大,远层次网络变化程度较低。

基于蛋白质相互作用网络局部相似度的肝癌疾病基因预测

基于人类蛋白质相互作用网络,该文采纳拓扑局部相似度去实现肝癌疾病基因的预测.交叉检验测试结果表明:有22%~29%的目标基因在候选基因中排名前5%,且预测精度均能达到0.7以上.归因于低的计算复杂度和相对高的预测精度,这类疾病基因预测方法可为发现和鉴定疾病基因提供有力的线索.

文化基因粒子群算法在换热网络连续变量全局优化中的应用

在换热网络的综合优化中,连续变量的优化通常采用确定性方法。相比于整型变量优化,连续变量优化相对容易处理,但存在容易陷入局部最优和无法收敛到全局最优的问题。针对这一问题,提出一种在标准粒子群算法中结合局部搜索策略的文化基因粒子群算法;结合换热网络最小年综合费用小和计算时间短的优点,提出Ring+Random粒子种群拓扑结构;结合算法控制参数的设置与粒子种群拓扑结构的改进,使文化基因粒子群算法具有更好的全局收敛性能。采用6个10股流体算例验证文化基因粒子群算法在给定换热网络结构下的连续变量全局收敛性能,与文献值相比,换热网络最小年综合费用最大减少了26 025$/a。

北欧基因库

北欧基因库(Nodic Gene Bank)是一个地区性的农业和园艺植物遗传资源服务机构。于1979年1月1日正式成立。地点设在瑞典南部城市马尔默(Malmo),成员国,为丹麦、芬兰、冰岛、挪威和瑞典,其经费由五国共同负担,现有工作人员7人。 建立北欧基因库的目的是:收集、整理、登记和保存北欧地区的植物遗传品种资源,