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题名用动态扣分策略消除序列局部联配中的马赛克问题
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作者
佘堃
黄均才
周明天
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机构
电子科技大学计算机学院
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出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2003年第11期44-47,共4页
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基金
电子科学基金51415010101DZo2
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文摘
1引言
生物信息学中,对各种生物大分子序列进行分析是一件非常基本的工作,Paul A.Rota[1]通过测定SARS(又名非典型性肺炎)病毒的基因组序列,找到了含有制造蛋白质指令的部分基因,其中包括公认的制造四种蛋白质的基因,证实了非典病毒是一种全新的冠状病毒,这一成果将有助于加快诊断、治疗和预防非典的步伐.
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关键词
生物信息学
动态扣分策略
序列
局部联配算法
马赛克问题
SMITH-WATERMAN算法
相似性
记分函数
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Keywords
Sequence alignment, Smith-Waterman algorithm, Mosaic effect, Dynamic penalty strategy
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分类号
Q811.4
[生物学—生物工程]
TP311.5
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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