湖北野生天麻的遗传分化及栽培天麻种质评价

采用7条ISSR引物对天麻(Gastrodiaelata)8个自然居群和6个人工栽培居群共483个样本的居群遗传多样性进行了初步检测,共检测出清晰、重复性好的DNA带77条,其中64条为多态性带,总多态位点百分比PPB=83.12%。遗传多样性分析结果表明:天麻自然居群的遗传多样性参数分别为:多态位点百分比PPB=59.09%,有效等位基因数Ae=1.29,Nei’s遗传多样度H=0.176,Shannon’s多态信息指数I=0.270,明显高于人工栽培居群(PPB=35.71%,Ae=1.16,H=0.100,I=0.155),揭示出栽培居群存在明显的遗传基础狭窄和遗传均质性问题。UPGMA聚类分析表明,自然居群与栽培居群存在明显的分化而分别聚为两大类群。自然居群间基因分化系数GST=0.2558,与AMOVA分析所揭示的居群间遗传变异量占总变异的27.25%的结果相近,说明天麻自然居群间亦存在一定程度的遗传分化;居群间基因流(Nm)为1.4547,相对较弱,可能对自然居群的遗传分化有一定影响。自然居群聚类结果显示出一定程度的地理区域聚类趋势,但Mantel检验表明自然居群间遗传距离与地理距离并不存在显著相关(r=0.1669,P=0.2110),揭示出天麻自然居群的分化现状可能是其生活史特性、地理隔离与人为破坏综合作用的结果。栽培居群的遗传均质化趋势,揭示了引种驯化的瓶颈效应和长期无性繁育所导致的遗传多样性丧失,也反映出栽培天麻种质的遗传基础狭窄。而栽培居群与自然居群间存在着明显的遗传分化,反映天麻栽培居群与自然居群间可能存在基因流的阻断。

灰肉红菇遗传多样性及遗传分化

基于基因间隔序列(internal transcript space,ITS)分析中国12个不同地理居群的125份灰肉红菇(Russula griseocarnosa)样品的遗传多样性、居群遗传分化程度和遗传变异情况。结果表明:125份样品中检测到32个单倍型,不同地理居群的遗传距离与地理距离之间没有对应关系,二者无明显相关性;同一地理居群内单倍型多样性较高,核苷酸多样性较低;整体的遗传分化指数F_(st)为0.59955,基因流N_m为0.17,这些结果表明125份灰肉红菇样品基因交流水平低,分化程度较高;分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)结果表明,居群间遗传变异占总变异的22%,居群内的遗传变异占总变异的78%,因此遗传分化主要来自于居群内部。

多叶重楼遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术检测了多叶重楼 (Parispolyphylla) 2个变种 4个居群的遗传多样性 ,并与 1个凌云重楼 (P .cronquistii)居群进行了比较。选择的 16个随机引物在 5个居群中共检测到 2 4 6个多态位点。在居群水平上 ,滇重楼 2个居群的多态位点百分比 (PPB)分别为 5 7.4 3%和 5 4 .6 7% ,Shannon指数分别为 0 .30 80和 0 .2 830 ;七叶一枝花2个居群的PPB分别为 5 6 .33%和 5 7.75 % ,Shannon指数分别为 0 .30 80和 0 .32 93。在变种水平上 ,滇重楼的PPB为75 .14 % ,Shannon指数为 0 .392 2 ,遗传分化系数 (Gst)为 0 .30 85 ;七叶一枝花的PPB为 80 .31% ,Shannon指数为 0 .3992 ,遗传分化系数 (Gst)为 0 .372 6 ;在种的水平PPB达 92 .0 5 % ,遗传分化系数Gst达 0 .5 15 1。聚类分析显示滇重楼和七叶一枝花有较近的亲缘关系 ,而与凌云重楼遗传距离较远。此结果从分子水平上支持了过去将滇重楼和七叶一枝花划分为 1个种下