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省沽油ISSR引物筛选及居群遗传多样性初探
被引量:
3
1
作者
陈龙灿
王颖
+5 位作者
王业中
张远海
束庆龙
王勤
张良富
曹翠萍
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期462-467,共6页
测试和筛选出14条多态性较高的省沽油ISSR有效引物,并对安徽省野生省沽油的遗传多样性进行初步调查分析。共扩增出143个多态性位点,居群水平平均有效等位基因数ne为1.271,期望杂合度He为0.165,Shannon多态性信息指数I为0.257,物种水平...
测试和筛选出14条多态性较高的省沽油ISSR有效引物,并对安徽省野生省沽油的遗传多样性进行初步调查分析。共扩增出143个多态性位点,居群水平平均有效等位基因数ne为1.271,期望杂合度He为0.165,Shannon多态性信息指数I为0.257,物种水平遗传多样性参数分别为ne=1.341,He=0.227,I=0.370;居群间遗传分化系数为Gst=0.271。初步揭示了野生省沽油的遗传多样性,同时表明ISSR标记对于研究省沽油遗传多样性的适用性和可靠性,研究结果将为进一步深入研究省沽油多居群的遗传多样性和资源保护提供帮助。
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关键词
省沽油
ISSR标记
引物筛选
居群遗传多样性
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职称材料
珍稀濒危观赏竹种筇竹遗传多样性研究
被引量:
7
2
作者
王波
高素萍
陈其兵
《竹子研究汇刊》
北大核心
2016年第1期13-16,21,共5页
对筇竹Qiongzhuea tumidinoda居群间及居群内遗传多样性进行了研究。通过基因组多态性分析,筛选出13个随机引物对筇竹样品进行扩增,得到清晰可重复且多态性明显的条带,多态位点率为76.38%。在NTSYS程序中,统计这些扩增产物用来计算遗传...
对筇竹Qiongzhuea tumidinoda居群间及居群内遗传多样性进行了研究。通过基因组多态性分析,筛选出13个随机引物对筇竹样品进行扩增,得到清晰可重复且多态性明显的条带,多态位点率为76.38%。在NTSYS程序中,统计这些扩增产物用来计算遗传相似性系数和遗传距离,建立UMPGA(不加权算术平均法)聚类图,得出筇竹居群间的基因多样性大于居群内的结论,在此基础上,探讨筇竹保护对策和建议。
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关键词
珍稀濒危
观赏竹
RAPD
居群遗传多样性
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职称材料
肋果沙棘北缘居群的遗传多样性与遗传结构
被引量:
9
3
作者
李霓
蒋严妃
+3 位作者
苏雪
陈纹
张辉
孙坤
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期557-563,共7页
该研究利用SSR分子标记,对肋果沙棘(Hippophaeneurocarpa)分布区北缘青海祁连地区5个自然居群进行分析,旨在了解小地理尺度下肋果沙棘北缘居群的遗传多样性和片段化分布居群的遗传结构,为肋果沙棘居群的资源保护提供了依据。采用6...
该研究利用SSR分子标记,对肋果沙棘(Hippophaeneurocarpa)分布区北缘青海祁连地区5个自然居群进行分析,旨在了解小地理尺度下肋果沙棘北缘居群的遗传多样性和片段化分布居群的遗传结构,为肋果沙棘居群的资源保护提供了依据。采用6对微卫星引物对107个样本UNA进行扩增,共检测到27个等位变异,变幅为2~9个,平均每个位点有4.67个,平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.142和0.230,Shannon信息指数(/)的变幅介于0.280~0.567之间,平均值为0.374,说明肋果沙棘北缘居群的遗传多样性较为丰富。遗传分化系数=0.483,分子方差分析(AM0VA)表明肋果沙棘有48.33%的变异存在于居群间,51.67%存在于居群内。对5个居群之间的遗传距离与地理距离做Mental检验,结果表明遗传距离与地理距离相关性不显著,对基因流检测发现居群间的iVm为0.328,推测遗传漂变是居群分化的关键因素之一。Structure分析把5个居群分为2组。LPGMA聚类分析表明5个居群聚为2个分支,其中居群ARX为单独的一支,与主坐标分析的结果一致。基于分布区北缘青海祁连肋果沙棘自然居群的遗传结构分析,建议应尽可能多地保护不同的地方居群。
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关键词
肋果沙棘
SSR标记
边缘
居群
遗传
多样性
遗传
结构
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职称材料
题名
省沽油ISSR引物筛选及居群遗传多样性初探
被引量:
3
1
作者
陈龙灿
王颖
王业中
张远海
束庆龙
王勤
张良富
曹翠萍
机构
安徽农业大学林学与园林学院
岳西枯井园省级自然保护区
金寨县林业局
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期462-467,共6页
文摘
测试和筛选出14条多态性较高的省沽油ISSR有效引物,并对安徽省野生省沽油的遗传多样性进行初步调查分析。共扩增出143个多态性位点,居群水平平均有效等位基因数ne为1.271,期望杂合度He为0.165,Shannon多态性信息指数I为0.257,物种水平遗传多样性参数分别为ne=1.341,He=0.227,I=0.370;居群间遗传分化系数为Gst=0.271。初步揭示了野生省沽油的遗传多样性,同时表明ISSR标记对于研究省沽油遗传多样性的适用性和可靠性,研究结果将为进一步深入研究省沽油多居群的遗传多样性和资源保护提供帮助。
关键词
省沽油
ISSR标记
引物筛选
居群遗传多样性
Keywords
Staphylea bumalda
ISSR markers
primer selection
genetic diversity
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
珍稀濒危观赏竹种筇竹遗传多样性研究
被引量:
7
2
作者
王波
高素萍
陈其兵
机构
四川农业大学
四川工程职业技术学院
出处
《竹子研究汇刊》
北大核心
2016年第1期13-16,21,共5页
基金
四川省教育厅项目(2004A030)
文摘
对筇竹Qiongzhuea tumidinoda居群间及居群内遗传多样性进行了研究。通过基因组多态性分析,筛选出13个随机引物对筇竹样品进行扩增,得到清晰可重复且多态性明显的条带,多态位点率为76.38%。在NTSYS程序中,统计这些扩增产物用来计算遗传相似性系数和遗传距离,建立UMPGA(不加权算术平均法)聚类图,得出筇竹居群间的基因多样性大于居群内的结论,在此基础上,探讨筇竹保护对策和建议。
关键词
珍稀濒危
观赏竹
RAPD
居群遗传多样性
Keywords
Rare and endangered
Ornamental bamboo
RAPD
Population genetic diversity
分类号
S795 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
肋果沙棘北缘居群的遗传多样性与遗传结构
被引量:
9
3
作者
李霓
蒋严妃
苏雪
陈纹
张辉
孙坤
机构
西北师范大学生命科学学院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期557-563,共7页
基金
国家自然科学基金(31160046
31270429)~~
文摘
该研究利用SSR分子标记,对肋果沙棘(Hippophaeneurocarpa)分布区北缘青海祁连地区5个自然居群进行分析,旨在了解小地理尺度下肋果沙棘北缘居群的遗传多样性和片段化分布居群的遗传结构,为肋果沙棘居群的资源保护提供了依据。采用6对微卫星引物对107个样本UNA进行扩增,共检测到27个等位变异,变幅为2~9个,平均每个位点有4.67个,平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.142和0.230,Shannon信息指数(/)的变幅介于0.280~0.567之间,平均值为0.374,说明肋果沙棘北缘居群的遗传多样性较为丰富。遗传分化系数=0.483,分子方差分析(AM0VA)表明肋果沙棘有48.33%的变异存在于居群间,51.67%存在于居群内。对5个居群之间的遗传距离与地理距离做Mental检验,结果表明遗传距离与地理距离相关性不显著,对基因流检测发现居群间的iVm为0.328,推测遗传漂变是居群分化的关键因素之一。Structure分析把5个居群分为2组。LPGMA聚类分析表明5个居群聚为2个分支,其中居群ARX为单独的一支,与主坐标分析的结果一致。基于分布区北缘青海祁连肋果沙棘自然居群的遗传结构分析,建议应尽可能多地保护不同的地方居群。
关键词
肋果沙棘
SSR标记
边缘
居群
遗传
多样性
遗传
结构
Keywords
Hippophae neurocarpa, SSR markers, marginal populations, genetic diversity, genetic structure
分类号
Q948.1 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
省沽油ISSR引物筛选及居群遗传多样性初探
陈龙灿
王颖
王业中
张远海
束庆龙
王勤
张良富
曹翠萍
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
下载PDF
职称材料
2
珍稀濒危观赏竹种筇竹遗传多样性研究
王波
高素萍
陈其兵
《竹子研究汇刊》
北大核心
2016
7
下载PDF
职称材料
3
肋果沙棘北缘居群的遗传多样性与遗传结构
李霓
蒋严妃
苏雪
陈纹
张辉
孙坤
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016
9
下载PDF
职称材料
已选择
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