三种贝母的核基因(ITS)序列分析

对野外采集和GenBank数据库下载的川贝母、华西贝母、峨眉贝母的ITS序列进行比较分析,对三个种进行分类鉴定。对采集样本的nrITS序列片段进行PCR扩增并双向测序,所得序列经Seqman软件拼接后,上传GenBank获得序列号,利用MEGA6.0软件分析序列特征,结合从GenBank下载的共21条ITS序列进行分析比对,采用邻接法(NJ)构建系统发育树。结果发现,所采集的川贝母与GenBank上释放的川贝母的ITS序列间存在较多的变异位点,而华西贝母与川贝母之间的变异位点较少;川贝母并不聚为一支,华西贝母嵌套进川贝母种间;峨眉贝母能有效鉴别。表明川贝母种内遗传变异较大,华西贝母与川贝母具有非常近的亲缘关系,利用ITS序列能够有效区分峨眉贝母。