水产养殖巢式设计遗传力计算及其在SPSS上的实现

巢式设计是水产育种中重要的遗传设计之一,其遗传力计算涉及平方和类型的选择、固定模型或随机模型的选择及模型修改等,如果处理因素纳入顺序不对,则通过SPSS图形对话框操作不能完成巢式设计方差分析。文章以教材数据为例,介绍巢式设计方差分析的基本原理,利用SPSS软件中对话框粘贴程序进行编程,并通过一般线性模型过程进行方差组分估计及遗传力计算操作演示,并对模型选择、平方和类型选择及巢式设计方差分析SPSS编程的必要性等进行讨论说明,可为教学和科研提供实践参考。

不平衡巢式设计遗传模型分析

虽然巢式试验设计在动植物育种中得到广泛应用,但是在不平衡数据条件下有关遗传参数估计和假设检验统计量的计算还存在着很多问题。文中针对不平衡数据条件下的巢式试验设计,使用固定效应模型和随机效应模型估计相关的遗传参数并进行相应的统计假设检验。对于固定效应模型,使用约束线性模型方法推导出亲本配合力估计及亲本间配合力假设检验统计量的计算公式。对于随机效应模型,采用混合线性模型中的方差分析法,推导出方差分量估计的计算公式,并给出方差分量估计标准误以及方差分量假设检验统计量的计算方法,进而给出遗传力计算公式及其标准误的近似计算方法。最后,用VC++编写多种形式巢式设计遗传模型的各种遗传参数估计和假设检验统计量计算的Windows应用软件,供林木遗传育种工作者使用。

巢式设计的多元分析

本文把经典巢式设计的统计分析方法由单变量推广到多变量，使得试验或调查的多性状数据能综合在一起进行分析，以得出考虑了性状间相关性在内的统计结论并用一烟草栽培试验数据示明具体步骤。

四阶巢式设计分组随区组试验的非平衡数据处理的理论研究

本文研究了林木遗传育种中的非平衡、非规则的四阶巢式设计,采用分组随机区组的田间试验,获得的非平衡试验数据的方差分析方法,采用转化分析法的思想来构建统计分析的线性模型,以此为基础,进行了参试因子的平方和分解,推道了期望均方结构,计算了参试因子的自由度和方差分量的调节系数,进而推导了参试因子的F检验和遗传力的计算公式。这一研究结果可应用到林木选择育种中去。

油茶巢式交配子代油脂相关性状的遗传分析

【目的】探究油茶种内杂交和种间杂交的亲本选配机制,为油茶高含油率杂交育种选育提供指导。【方法】以油茶巢式交配设计的种内、种间杂交子代为材料,分别测定种仁含油率、木质素、纤维素和半纤维素含量,分析母本的一般配合力(GCA)、杂交组合的特殊配合力(SCA),解析重要性状的遗传效应。【结果】12个家系的种仁含油率为17.83%~53.55%,木质素含量为4.68%~18.12%,纤维素含量为3.66%~13.04%,半纤维素含量0.54%~12.20%。种仁含油率、木质素、纤维素和半纤维素含量的差异在组合间和母本内父本间达到了显著水平。含油率和木质素、半纤维素含量呈显著负相关关系,其相关系数为-0.489和-0.297。长林4号种仁含油率的GCA最高,达到1.57。各组合的SCA分析表明,含油率SCA为-6.38~4.28,其中含油率SCA高且其余3个性状SCA低的种内杂交组合有40×95和4×18。种间杂交组合含油率的SCA普遍较低,仅53×小2较高,为2.77。除木质素外,含油率、纤维素、半纤维素含量主要受显性效应控制,非加性方差大于加性方差,说明以这3个性状为目标的杂交育种中评估亲本的SCA比GCA更重要。4个性状的单株遗传力范围为10.84%~58.35%,家系遗传力为4.23%~.21.35%,均受到较强的环境效应影响。【结论】以配合力为参考指标,结合各组合的表型数据,选出可用于油茶高含油杂交种质创制的优良种内杂交组合40×95和4×18,种间杂交组合53×小2。

基于巢式设计的热毒宁注射液不良反应特征及影响因素分析

目的观察热毒宁注射液不良反应的特征及影响因素。方法收集全国5家医院使用热毒宁注射液患者的临床信息,以不良反应为结局指标,进行巢式病例对照设计,采用单因素及多因素条件Logistic回归模型,分析热毒宁注射液不良反应发生的可能影响因素。结果 3000例热毒宁注射液患者中16例发生不良反应,以儿童居多,平均年龄10.12岁,男性11例,女性5例;以消化系统胃肠道症状(如腹痛、腹泻、胃脘痛)发生较多,占87.5%。以年龄、性别、用药季节、药品批次相同为匹配条件,按照1∶4比例匹配未发生不良反应的患者64例,多因素条件Logistic结果显示,滴速是不良反应发生的影响因素(P=0.043),注射前是否冲管是不良反应发生的重要因素(P=0.027)。结论热毒宁注射液不良反应以儿童居多,注射前未冲管及滴速过快是不良发应发生的重要影响因素。

使用Matlab 7.0处理林木育种非平衡试验数据——以三阶巢式设计为例说明之

为了解决林木遗传育种中,平衡不平衡,规则不规则的试验数据的统计处理问题,笔者利用杉木三阶巢式设计的非平衡试验数据为研究对象,采用M语言,编写该试验数据处理程序.该试验有8个种源,每个种源6个家系,造林时每个家系40个样株,家系密集型设计.经研究发现,Matlab7.0处理平衡不平衡、规则不规则的试验数据方面效果极好,值得推广应用.

因子与巢式交配设计群体近交率的比较研究

探讨了因子和巢式交配设计群体近交率的形成机理，结果表明，这两种交配设计群体结构本身并不导致其近交率累积的差异。在育种选择情况下因子交配设计比巢式设计群体的近交率上升慢，而在完全随机留种和限制随机留种情形这两种交配设计对群体近交率的影响没有差异。但在交配设计情况下，限制随机留种比完全随机留种能有效地控制群体近交率的提高。这一结果显示，在动物和家畜遗传资源保存中，除了考虑群体大小和留种的雌雄比例外，引入交配设计并辅以适当的留种方式，可以有效减缓繁育群体近交系数的上升，从而达到推迟或者避免基因消失或固定的目的。

基于巢式试验设计的金秋工夫红茶加工工艺比较研究

为探究不同加工工艺对红茶品质的影响以改善和提升红茶品质,在传统工夫红茶工艺基础上,基于巢式试验设计,分别进行不同萎凋程度(轻萎凋和重萎凋)、不同揉捻程度(轻揉捻和重揉捻)以及不同干燥温度(低温和高温)处理,对制成的工夫红茶分别进行感官审评和理化成分分析。结果表明,轻萎凋+重揉捻+高温干燥处理加工的红茶品质较好,轻萎凋+轻揉捻+低温干燥处理制得的红茶茶黄素含量较高。

甜菜品种区域试验的交叉──巢式混合设计模型

本文提出了适用于多年又点品种区域试验的3因素交叉──果式混合设计模型，并对一甜菜品种区域试验资料进行了品种的差异显著性和稳定性分析。此模型克服了普通的3因素交叉设计试验模型的不足，突出了年份变异对品种的影响，提高了分析的准确性和客观性。

油茶巢式交配子代果实和油脂性状的遗传分析

[目的]为选配油茶杂交育种最优亲本和最佳亲本组合,探索种间杂交策略,提升育种效率,获得最大遗传增益。[方法]以巢式交配的种内、种间杂交子代林为试材,测定单果质量、鲜果出籽率、干籽出仁率、种仁含油率以及脂肪酸成分含量等11个经济性状,分析母本的一般配合力(GCA)和杂交组合的特殊配合力(SCA),解析各性状的遗传控制模式。[结果]11个经济性状在12个杂交组合间均存在极显著差异,且变异主要来源于父本效应(P<0.01),母本效应仅硬脂酸和亚油酸含量差异显著(P<0.05)。综合分析亲本主要经济性状的GCA与SCA表明,普通油茶种内杂交组合4×23在以单果质量、鲜果出籽率、干籽出仁率、种仁含油率和油酸含量等性状为育种目标时可作为优选杂交组合。普通油茶和小果油茶的种间杂交组合53×小3可在单果质量、棕榈酸、亚油酸和α-亚麻酸含量育种中加以利用;组合53×小2在鲜果出籽率、干籽出仁率、种仁含油率和油酸含量上具有育种优势。遗传效应分析表明,硬脂酸、油酸和亚油酸含量主要受加性遗传控制,其余8个经济性状的非加性遗传方差显著高于加性遗传方差。11个经济性状的单株遗传力大于家系遗传力,油茶杂交育种中应采用全同胞家系内选择优良单株的育种策略。[结论]油茶成林的经济性状主要受遗传控制,受环境影响较小。单果质量、鲜果出籽率、干籽出仁率、种仁含油率、棕榈酸、棕榈烯酸、α-亚麻酸和顺-11-二十碳烯酸含量等8个性状均以非加性基因效应控制为主,加性基因效应影响程度较低。在开展种间杂交工作时,双亲的SCA评估应放在首位。本研究首次以油茶杂交子代成林为材料,探索了普通油茶与小果油茶种间杂交的亲本配置及遗传效应规律,对指导油茶种间杂交育种奠定了理论基础。

桉树巢式交配设计子代配合力效应分析

[目的]筛选桉树优良杂交组合。[方法]从东门林场矮化种子园中选取15个无性系作母本,从第一代种子园中选取21个桉树家系作父本,采用巢式遗传交配设计方式进行人工控制授粉,获得的杂交种子育苗建立试验,对桉树巢式交配2.5年生杂交子代的树高、胸径和单株材积3个生长性状进行遗传分析。[结果]树高、胸径和单株材积的差异在母本间、母本内父本间都达到显著水平;母本间一般配合力有差异,表现较好的有5个,最好的是无性系DH33-27,其胸径、树高、材积的GCA效应值分别为1.220、0.870、0.011,其次为DH207-3、DH107-1、DH86-1、DH187-10;杂交组合SCA也有差异,说明GCA与SCA有一定的关联又相对独立。[结论]以单株材积为选择目标,根据单株材积GCA、SCA 2个效应值分析,优选出6个组合,分别为519、473、447、442、526、497。

桉树巢式交配设计子代林早期生长性状的遗传分析

在东门林场，以桉树巢式交配设计杂交组合种子为研究材料，调查桉树杂交子代2．5年生幼林的胸径、树高和材积等生长性状，并对其进行遗传分析。结果表明，树高、胸径和单株材积3个性状差异在母本间、母本内、父本间达到显著或极显著水平。父本和母本对子代胸径性状的影响差异不大，树高、单株材积较多地受父本效应的影响，树高母本效应为47．63％、父本效应为52．37％，单株材积母本效应为45．90％、父本效应为54．10％。子代的家系遗传力和单株遗传力在0．5689～0．9168之间，属中等至高强度遗传，生长性状主要受遗传基因控制，环境条件影响较小。

矩形区组方“RBS”设计及其在树木育种中的应用 Ⅳ.“RBS”-NCI设计统计分析

介绍矩形区组方“ＲＢＳ”设计在树木配合力交配设计中的应用、“ＲＢＳ”－ＮＣＩ设计方差分析和遗传分析的数学模型，并举例介绍其计算过程。

马尾松巢式交配子代生长和木材基本密度遗传分析

以浙江淳安县富溪林场马尾松巢式交配设计的12年生遗传测定林为试材,分析其生长和木材基本密度等主要经济性状父本/母本效应和加性/显性效应。结果表明:除树干通直度外,不同杂交组合间、父本间以及相同父本不同母本间的生长与木材基本密度等存在显著的遗传差异。胸径、树高和单株材积及树干圆满度同时受到父本和母本效应的影响,且二者效应差异较小,而木材基本密度则主要受母本效应的影响,其母本效应是父本效应的1.56倍。马尾松胸径和木材基本密度以加性效应控制为主,显性效应次之,而树高、单株材积和树干圆满度几乎完全由加性效应控制,可依据亲本表现对其子代进行预测。然而比较分析发现,不同杂交组合和父本无性系其生长与木材基本密度的相关性较小,速生的杂交组合和父本无性系并不一定具有较低木材基本密度。各杂交组合生长表现与父本无性系GCA之间相关性不明显,但选配GCA高的父本无性系将会提高获得优良组合的机率。以干物质积累量和胸径等为选择指标,分别选出纸浆纤维材和锯材各10个优良杂交组合,及17个和13个优良单株。

马尾松巢式交配子代产脂力、生长和木材密度遗传分析

以浙江省淳安县富溪林场马尾松巢式交配设计的15年生遗传测定林为试验材料,分析其生长、木材基本密度和产脂力主要经济性状父本/母本效应和加性/显性效应.结果表明,不同杂交组合间、父本间以及父本内母本间的生长、木材基本密度和产脂力皆存在显著的遗传差异.各性状受母本效应影响较大,母本效应方差分量约为父本的1.29～2.19倍.马尾松胸径、木材基本密度和产脂力同时受加性效应和显性效应控制,其中加性效应略高于显性效应.而树高和单株材积则主要受加性效应控制,加性效应方差分量约为显性效应的2.7倍和3.4倍.估算各性状广义遗传力发现,胸径、树高、单株材积和产脂力受中度遗传控制,广义遗传力在0.48～0.69之间,木材基本密度广义遗传力相对较低,为0.31.胸径、树高和单株材积与产脂力呈中度正遗传相关,遗传相关系数在0.475 5～0.553 2之间,表明生长和产脂力可同时得到遗传改良.以产脂量作为选择指标,共选出14个优良杂交组合和14个优良单株,其产脂量分别比对照高出43.31％～93.01％和125.47％～252.64％.

基于产污观点的人体排泄试验

采用巢式设计进行了人体排泄试验,着重考察了影响污染物排泄系数的若干相关因素.结果表明:TN和TP的排泄系数比CODCr和BOD5要高得多,反映了人体对氮、磷元素的吸收率较低,说明摄入相同数量的"污染物",人体粪尿排泄物中氮、磷排泄量较多;除CODCr外,其他污染物的排泄系数均是女性明显高于男性(P<0.05),这可能与男女之间的体质量、消化能力以及体力消耗等差异有关;膳食结构与食物搭配也是影响污染物排泄系数的重要因素,这可能与不同种类的食物中表征的CODCr,BOD5,TP和TN指标及其存在形式有关,因此应关注膳食结构的变迁所引发的潜在的环境问题.

黄淮野生大豆表型性状多样性研究

以黄淮地区具有代表性的4个野生大豆居群为研究试材,对百粒重、生育期、荚果长、荚果宽、株高、每荚粒数、分枝数、茸毛色、主茎、粒色、萌发时间、叶形12个重要农艺性状进行系统比较分析,运用变异系数、多重比较和巢式方差分析研究了居群间和居群内的表型变异;应用相关分析揭示了表型性状间及其与地理、气候因子间的相关性以及表型变异的地理格局;并且运用主成分分析、非加权配对算数平均分(UPGMA)聚类分析进行了居群分类。结果表明:居群间的变异远大于居群内的变异,居群分化较大,百粒重与纬度显著正相关、生育期与纬度显著负相关,粒色与经度、年降水量显著相关,其它9个性状没有特别明显的相关关系;表型性状的欧式距离与地理距离相关不显著。百粒重、荚果长、荚果宽、茸毛色、叶形5个表型性状指标是造成表型差异的主要形态性状。分枝数与百粒重呈显著负相关,荚果宽与每荚粒数、萌发时间呈显著相关水平。利用群体间欧式距离表明,在欧式距离4.67处可以将居群分为3类,在欧式距离5.12处可以将居群分为2类。

医院集中监测嵌套巢式病例对照设计的30026例参芪扶正注射液上市后临床安全性研究

该文采取大样本、多中心、前瞻性、注册登记式医院集中监测嵌套前瞻性巢式病例对照设计方法,从参芪扶正注射液上市后临床应用真实世界着眼,监测使用参芪扶正注射液患者30 026例,共发生药品不良反应(adverse drug reaction,ADR)51例,包括1例严重不良反应,计算ADR发生率为0.17%;采集发生过敏反应的患者及其匹配患者的血液样本,对过敏反应相关生物指标进行统一检测与分析,以探讨过敏反应发生机制,从而促进临床安全合理用药。

中国蛤蜊幼虫及稚贝壳长性状遗传力估计

为完善中国蛤蜊育种养殖方法,本研究对中国蛤蜊幼虫及稚贝生长性状遗传力进行估计。本试验采用巢式设计,建立7个父系半同胞家系、21个全同胞家系,估算早期生长性状遗传力。结果表明,中国蛤蜊幼虫及稚贝3、6、9、40日龄壳长遗传力分别为0.360±0.211、0.449±0.252、0.972±0.442、0.783±0.382。本研究可为中国蛤蜊遗传育种提供参考。