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筛选差别表达基因的方法及其应用新进展
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作者 孙敬 陈宏 彭景楩 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期96-100,共5页
筛选差别表达基因是进行生物个体生长、发育调控和病理等研究工作的关键步骤之一 ,对基因组学、蛋白质组学以及更深层次的生命科学研究都具有重要意义。目前 ,筛选差别表达基因常用的方法主要有DDRT PCR、SSH、SAGE和基因芯片等方法。... 筛选差别表达基因是进行生物个体生长、发育调控和病理等研究工作的关键步骤之一 ,对基因组学、蛋白质组学以及更深层次的生命科学研究都具有重要意义。目前 ,筛选差别表达基因常用的方法主要有DDRT PCR、SSH、SAGE和基因芯片等方法。本文就这些方法最新的应用进展进行了综述 ,并重点介绍了近年问世的Megaclone、Megasort和MPSS等新方法。 展开更多
关键词 差别基因表达 大量平行测序技术
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利用mRNA差别显示技术分析枸杞体细胞胚发生早期基因的差别表达 被引量:24
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作者 崔凯荣 邢更生 +1 位作者 秦琳 王亚馥 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期16-19,共4页
本研究选用枸杞体细胞胚发生体系中的继代愈伤组织(对照)、胚性愈伤组织和早期胚体为实验材料,提取细胞总RNA,在12种锚定真核生物mRNA3′末端的OligodT12VN中,随机选用OligodT12GA为引物合成了以... 本研究选用枸杞体细胞胚发生体系中的继代愈伤组织(对照)、胚性愈伤组织和早期胚体为实验材料,提取细胞总RNA,在12种锚定真核生物mRNA3′末端的OligodT12VN中,随机选用OligodT12GA为引物合成了以上三种材料的cDNA第一链,以此cDNA为模板,用随机引物进行PCR扩增,选择差别表达的片段。我们选用了OPA、OPH、OPK和OPB四组的60个随机引物对所得的cDNA进行了PCR扩增,得到了三个在体细胞胚发生早期组织中基因特异表达的片段。结果表明,在体细胞胚发生早期有胚胎发生特异性基因的表达,而且这种特异表达的基因在继代愈伤组织中没有表达。 展开更多
关键词 MRNA 基因差别表达 PCR 体细胞胚发生 枸杞
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几种差别表达基因显示技术及其在植物方面的应用 被引量:8
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作者 宁顺斌 王玲 宋运淳 《生命科学》 CSCD 1999年第3期140-143,144,共5页
90年代以来,先后出现了DD、RDA、cDNA-RDA、SAGE、GEF、RFD、SSH以及ATAC-PCR等数种未知产物的差别表达基因显示技术。本文对这些技术的异同、各自的优缺点以及它们在植物方面的应用现状和前景作... 90年代以来,先后出现了DD、RDA、cDNA-RDA、SAGE、GEF、RFD、SSH以及ATAC-PCR等数种未知产物的差别表达基因显示技术。本文对这些技术的异同、各自的优缺点以及它们在植物方面的应用现状和前景作了简单综述。 展开更多
关键词 RT-PCR 差别表达基因 基因克隆
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植入前期与分娩前期子宫差别表达基因筛选及表达 被引量:1
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作者 孙敬 陈宏 +2 位作者 杨颖 夏红飞 彭景楩 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第2期133-139,共7页
采用抑制消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH),以SD大鼠为实验材料,选取妊娠过程中植入前期(第5天,D5) 和分娩前期(第19天,D19) 子宫分别作为驱动方(driver) 和实验方(tester),进行抑制消减杂交,获得的消减文库经... 采用抑制消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH),以SD大鼠为实验材料,选取妊娠过程中植入前期(第5天,D5) 和分娩前期(第19天,D19) 子宫分别作为驱动方(driver) 和实验方(tester),进行抑制消减杂交,获得的消减文库经差异筛选得到70个阳性克隆. 序列测定和同源对比分析表明,这些克隆所代表的基因在大鼠基因库中分别与8个已知基因有90%~100%不等的同源性. 这些基因均差别表达于分娩前期子宫组织中,其中首次发现尿鸟苷蛋白和干扰素诱导蛋白16在SD大鼠妊娠子宫中有表达. RT-PCR及半定量分析显示,尿鸟苷蛋白基因在妊娠第19天子宫中的表达显著高于妊娠第5天(P<0.001),而干扰素诱导蛋白16差异表达不明显. 在妊娠D6、D9和D12的子宫中尿鸟苷蛋白基因自胚泡植入后其表达逐渐上升,妊娠D15下降,在妊娠D19表达量最高. 结果提示特异表达的尿鸟苷蛋白基因可能与分娩有关. 展开更多
关键词 SD大鼠 抑制消减杂交 子宫 差别表达基因 尿鸟苷蛋白
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外泌体来源的长链非编码RNA结直肠肿瘤差别表达基因在胶质瘤中的表达 被引量:2
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作者 雷蕾 周志斌 +1 位作者 彭军 姜丹 《中日友好医院学报》 2016年第6期348-351,共4页
目的:通过基因芯片分析长链非编码RNA(lnc RNA)-结直肠肿瘤差别表达基因(CRNDE)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达,比较lnc RNA CRNDE差异表达与组织之间的表达谱差异。方法:应用基因芯片技术检测lnc RNA在GBM和正常脑组织的表达谱差异... 目的:通过基因芯片分析长链非编码RNA(lnc RNA)-结直肠肿瘤差别表达基因(CRNDE)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达,比较lnc RNA CRNDE差异表达与组织之间的表达谱差异。方法:应用基因芯片技术检测lnc RNA在GBM和正常脑组织的表达谱差异,并筛选出差异表达lnc RNA CRNDE进行分析。结果 :lnc RNA芯片的数据:GBM与正常脑组织比较,lnc RNA CRNDE表达上调3倍基因1201个,lnc RNA CRNDE表达下调3倍基因1206个(P<0.05)。其中5个lnc RNA CRNDE上调30倍以上,1个lnc RNAs下调超过30倍(P<0.01)。结论 :与正常脑组织相比,GBM组织lnc RNA CRNDE表达谱发生明显变化,其在胶质瘤的发生发展中可能具有重要作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 结直肠肿瘤差别表达基因 胶质瘤 基因芯片
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cDNA微阵列技术:一种有效的差别表达基因克隆新方法 被引量:1
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作者 郑琳 赵明光 毕玉蓉 《生命的化学》 CAS CSCD 2003年第1期73-75,共3页
cDNA微阵列技术是以Northern印记杂交为基础 ,采用大规模集成电路点样技术的一种DNA杂交微阵列技术 ,是基因分离鉴定的最有效的方法之一。本文通过对其原理和工艺流程的简单介绍 。
关键词 cDNA微阵列技术 差别表达基因 分离鉴定 基因克隆
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差别表达基因片段的克隆策略 被引量:1
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作者 晏猛 《河南职业技术师范学院学报》 2004年第4期50-52,共3页
克隆差异表达的基因可为分化细胞与祖细胞、激活细胞与静止细胞、突变细胞(如肿瘤细胞)与正常细胞提供某些有意义的信息,本文综述了差异表达基因克隆的一些策略。
关键词 克隆 差别表达基因 祖细胞 差异表达基因 正常细胞 突变细胞 肿瘤细胞 分化细胞 活细胞 片段
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抑制性底物杂交(SSH)技术研究BXSB小鼠的差异表达基因 被引量:1
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作者 李莹 韩文玲 +5 位作者 杨高云 宋朱声 张颖妹 狄春辉 邓鸿业 马大龙 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第11期481-483,共3页
目的:利用抑制性底物杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH),以BXSB 狼疮小鼠为模型,研究系统性红斑狼疮(SLE) 发病相关基因。方法:分离BXSB和C57BL... 目的:利用抑制性底物杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH),以BXSB 狼疮小鼠为模型,研究系统性红斑狼疮(SLE) 发病相关基因。方法:分离BXSB和C57BL6 小鼠骨髓细胞,提取mRNA,反转录构建cDNA 文库,利用SSH 技术研究BXSB小鼠差异表达基因。结果:获得了12 个阳性克隆,其中有3 个克隆编码TCR、MHC Ⅱ类分子及逆转录病毒基因表达产物,均在BXSB狼疮小鼠高表达,表明其与系统性红斑狼疮发病有关;1 个在BXSB狼疮小鼠高表达的基因可能为新的cDNA片段,已被GenBank 收录,登记号码为AF093453。结论:TCR、MHC Ⅱ类分子及逆转录病毒基因表达产物与系统性红斑狼疮发病有关。 展开更多
关键词 SLE 抑制性底物杂交 BXSB小鼠 差别表达基因
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甲状腺乳头状癌组织中CRNDE的表达变化及对甲状腺癌细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响 被引量:16
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作者 关善斌 黄新若 +1 位作者 李加伟 黄天斌 《山东医药》 CAS 2018年第3期89-92,共4页
目的观察甲状腺乳头状癌(PTC)组织中lncRNA结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)的表达变化,及CRNDE对甲状腺癌细胞TPC-1增殖、迁移、侵袭能力的影响。方法采用荧光定量PCR法检测30例PTC组织及其相应癌旁正常组织中的CRNDE。培养TPC-1细胞并... 目的观察甲状腺乳头状癌(PTC)组织中lncRNA结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)的表达变化,及CRNDE对甲状腺癌细胞TPC-1增殖、迁移、侵袭能力的影响。方法采用荧光定量PCR法检测30例PTC组织及其相应癌旁正常组织中的CRNDE。培养TPC-1细胞并分为敲低组、阴性对照组、空白对照组。合成3个CRNDEsiRNA序列即CRNDE-siRNA-1/2/3。敲低组转染CRNDE-siRNA-1/2/3并筛选敲低效果最好的CRNDE-siRNA序列进入下一步实验;阴性对照组转染NC-siRNA;空白对照组不做特殊处理。分别于转染后0、12、24、48、72 h检测细胞增殖能力。转染48 h后检测细胞迁移、侵袭能力。转染72 h后检测各组细胞中的上皮间充质转化(EMT)相关蛋白。结果 PTC组织与癌旁正常组织中CRNDE相对表达量分别为31.99±38.05、4.33±3.30,两组相比,P<0.05。转染后24、36、48、60、72 h敲低组细胞增殖能力低于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05)。敲低组迁移细胞数、侵袭细胞数均少于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05)。敲低组上皮细胞标志物E-cadherin蛋白相对表达量高于阴性对照组和空白对照组,间质细胞标志物N-cadherin蛋白、Vimentin蛋白相对表达量低于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05)。结论 CRNDE在PTC癌组织中呈高表达。敲低CRNDE后,TPC-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力减弱,EMT相关蛋白表达发生变化。CRNDE表达异常可能与PTC的发生发展有关,其机制可能涉及调节肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭能力及EMT特性。 展开更多
关键词 甲状腺癌 甲状腺乳头状癌 结直肠肿瘤差别表达基因 细胞增殖 细胞迁移 细胞侵袭 上皮间充质转化
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单个植入前胚胎构建cDNA文库 被引量:5
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作者 郁卫东 李文雍 陈清轩 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2002年第6期9-12,共4页
以PCR为基础的单个植入前胚胎cDNA文库构建是一种快速、可重复和高效的建库方法。单个植入前胚胎cDNA文库作为一种重要的新兴基因资源库 ,为新基因的克隆和鉴定奠定了坚实的基础 ,不仅解决了胚胎研究材料受限的问题 ,而且在时间上更加精... 以PCR为基础的单个植入前胚胎cDNA文库构建是一种快速、可重复和高效的建库方法。单个植入前胚胎cDNA文库作为一种重要的新兴基因资源库 ,为新基因的克隆和鉴定奠定了坚实的基础 ,不仅解决了胚胎研究材料受限的问题 ,而且在时间上更加精确 ,更符合胚胎发育的规律。是研究早期胚胎发育基因表达的一种有效手段。随着这一技术的不断改进和与其它技术的有机结合 ,必然为人们进一步揭示胚胎发育的分子机制开创一个崭新的局面。 展开更多
关键词 单个植入前胚胎 CDNA文库 基因差别表达 早期胚胎
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长链非编码RNA CRNDE在结直肠癌中的研究进展
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作者 郝东明 《西北国防医学杂志》 CAS 2017年第12期834-837,共4页
根据DNA元件百科全书计划(encyclopedia of DNA elements,ENCODE)报道显示,人类基因组中能够有效编码蛋白的基因〈2%,其余大部分为非编码基因[1]。非编码基因根据核苷酸长度分为长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)和短链非编... 根据DNA元件百科全书计划(encyclopedia of DNA elements,ENCODE)报道显示,人类基因组中能够有效编码蛋白的基因〈2%,其余大部分为非编码基因[1]。非编码基因根据核苷酸长度分为长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)和短链非编码RNA(ncRNA、siRNA、microRNA)。 展开更多
关键词 结直肠癌 长链非编码RNA 差别表达基因 信号通路
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为提高肉鸡品质和强壮程度进行昼夜孵化
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作者 陶莉 罗静如 Marleen Boerjan 《国外畜牧学(猪与禽)》 2014年第8期6-7,共2页
商业性孵化场中的热调节是指在孵化的第2周或第3周,使鸡胚在白天接受短暂的1℃~2℃热或冷刺激的方法。这一过程被称为"昼夜孵化(Circadioan incubation)"法,它可提高种蛋的孵化率和孵出雏鸡的饲料转化率。
关键词 热调节 饲料转化率 冷刺激 INCUBATION 差别基因表达 胚胎细胞 壳腺 孵化技术 细胞环境
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长链非编码RNA CRNDE在恶性肿瘤中的研究进展 被引量:3
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作者 刘芳腾 曲强冠 +2 位作者 朱正明 黄传喜 胡白娥 《广东医学》 CAS 北大核心 2017年第11期1767-1769,1773,共4页
近年来,一类长度大于200个核苷酸但不具备编码蛋白质功能的RNA分子——长链非编码RNA ( longnoncoding RNA, LncRNA)日益受到人们的关注。越来越多的证据表明,长链非编码RNA在细胞发育、分化以及许多其他生物过程中扮演重要角色,... 近年来,一类长度大于200个核苷酸但不具备编码蛋白质功能的RNA分子——长链非编码RNA ( longnoncoding RNA, LncRNA)日益受到人们的关注。越来越多的证据表明,长链非编码RNA在细胞发育、分化以及许多其他生物过程中扮演重要角色,与肿瘤等多种人类疾病密切相关。而结直肠肿瘤差别表达基因 ( colorectal neoplasia differentially expressed, CRNDE )作为长链非编码RNA中新近发现的一员,已被证实在多种肿瘤中存在异常表达,可影响癌细胞的增殖、凋亡和侵袭转移,参与肿瘤的发生进展。因此,本文就CRNDE在多种人类肿瘤中的研究进展作简要综述。 展开更多
关键词 非编码RNA 恶性肿瘤 长链 差别表达基因 RNA分子 蛋白质功能 结直肠肿瘤 细胞发育
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Identification of differentially expressed genes in human uterine leiomyomas using differential display 被引量:2
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作者 BIN LI, MEI SUN, BIN HE, JIN YU, You DUAN ZHANG, YONG LIAN ZHANG, State Key Laboratory of Molecular Biology, Institute of Biochemistry and Cell Biology, Shanghai Institute for Biological Science, Chinese Academy of Sciences, 820, Yue- Yang Road, Shanghai, 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第1期39-45,共7页
In searching of differentially expressed genes in human uterine leiomyomas, differential display was used with twelve pairs of primers to compare human uterine leiomyomas with matched myometrium. False positives were ... In searching of differentially expressed genes in human uterine leiomyomas, differential display was used with twelve pairs of primers to compare human uterine leiomyomas with matched myometrium. False positives were eliminated by reverse Northern analysis. Positives were confirmed by Northern blot analysis. RESULTS: [1] Four of 69 cDNA fragments (3 up-regulated named L1, L2 and L3 and 1 down-regulated named Mi in leiomyoma) were confirmed by Northern analysis. [2] Sequence comparison and Northern analysis proved that Li is exactly the human ribosomal protein Si9. [3] It was present ubiquitously in i3 tissues tested but in various levels and even in different size. [4] Li was highly expressed in parotidean cystadenocarcinoma, pancreatic cancer and breast cancer examined. [5] No mutations have been found in human uterine leiomyomas (n=6). CONCLUSIONS: hRPSi9 overexpression might be a universal signal in rapid cell growth tissues. 展开更多
关键词 差别表达基因 鉴定 人子宫平滑肌瘤 核蛋白体 hRPS19
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