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实现输出统一排名的差异共表达双聚类算法
1
作者
孙俊玲
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014年第5期159-164,共6页
提出了差异共表达框架和一个差异共表达评分函数,以观察到的一个双聚类基因在所属双聚类的条件下共表达和在其他条件下非共表达为基础,客观量化基因双聚类的质量.此外,还提出了一个评分函数把双聚类分层为三种类型的共表达.在实现双聚...
提出了差异共表达框架和一个差异共表达评分函数,以观察到的一个双聚类基因在所属双聚类的条件下共表达和在其他条件下非共表达为基础,客观量化基因双聚类的质量.此外,还提出了一个评分函数把双聚类分层为三种类型的共表达.在实现双聚类输出统一排名中,使用提出的评分函数对这4个公认的双聚类算法在不同区域的6个实际数据集上的性能和行为进行测试.实验结果表明,在鉴别共表达双聚类方面,差异共表达框架能有效提高共表达基因双聚类质量和双聚类算法的性能.
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关键词
共表达
双聚类
差异共表达框架
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职称材料
题名
实现输出统一排名的差异共表达双聚类算法
1
作者
孙俊玲
机构
郑州大学信息工程学院
河南财政税务高等专科学校信息工程系
出处
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014年第5期159-164,共6页
基金
国家自然科学基金(60970063)
文摘
提出了差异共表达框架和一个差异共表达评分函数,以观察到的一个双聚类基因在所属双聚类的条件下共表达和在其他条件下非共表达为基础,客观量化基因双聚类的质量.此外,还提出了一个评分函数把双聚类分层为三种类型的共表达.在实现双聚类输出统一排名中,使用提出的评分函数对这4个公认的双聚类算法在不同区域的6个实际数据集上的性能和行为进行测试.实验结果表明,在鉴别共表达双聚类方面,差异共表达框架能有效提高共表达基因双聚类质量和双聚类算法的性能.
关键词
共表达
双聚类
差异共表达框架
Keywords
co-expression
bicluster
differential co-expression framework
分类号
TS251 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
实现输出统一排名的差异共表达双聚类算法
孙俊玲
《河南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014
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